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OPENSEQ.org

FLHB - FLIR
UniProt: P76299 - P33135
Length: 643
Sequences: 691
Seq/Len: 1.10
I_Prob: 0.98

FLHB - Flagellar biosynthetic protein FlhB
Paralog alert: 0.33 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLHB
FLIR - Flagellar biosynthetic protein FliR
Paralog alert: 0.33 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIR
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
181_A 188_L 2.45 0.98
185_A 192_T 1.53 0.64
294_G 20_L 1.25 0.36
154_L 202_G 1.22 0.33
140_Q 103_G 1.18 0.30
263_D 135_L 1.18 0.29
103_A 228_L 1.16 0.28
213_F 193_L 1.15 0.27
31_E 194_L 1.14 0.26
31_E 17_F 1.14 0.26
133_I 57_S 1.13 0.25
192_C 196_T 1.11 0.23
272_Y 52_F 1.10 0.23
34_S 159_I 1.10 0.23
116_S 84_L 1.10 0.23
158_V 226_I 1.10 0.23
219_L 50_I 1.10 0.22
328_G 98_A 1.08 0.21
159_T 200_A 1.08 0.21
37_I 142_G 1.06 0.20
108_V 141_N 1.06 0.19
273_S 229_M 1.06 0.19
225_D 211_L 1.06 0.19
223_R 103_G 1.04 0.18
343_L 179_I 1.03 0.18
335_L 20_L 1.03 0.17
349_L 200_A 1.02 0.17
339_V 154_F 1.02 0.17
126_K 25_A 1.02 0.17
93_L 202_G 1.01 0.16
350_K 90_F 1.01 0.16
92_L 247_I 1.00 0.16
243_I 135_L 1.00 0.16
132_G 214_F 1.00 0.15
52_L 190_L 1.00 0.15
273_S 158_P 1.00 0.15
227_R 171_A 1.00 0.15
133_I 36_R 0.99 0.15
12_P 39_P 0.98 0.14
38_L 226_I 0.97 0.14
324_H 191_I 0.97 0.14
127_L 20_L 0.97 0.14
273_S 219_P 0.97 0.13
266_V 114_V 0.96 0.13
331_I 54_I 0.96 0.13
174_M 43_K 0.96 0.13
31_E 84_L 0.96 0.13
336_Y 133_A 0.96 0.13
12_P 193_L 0.95 0.13
15_H 131_M 0.95 0.13
249_A 102_I 0.95 0.12
144_E 214_F 0.95 0.12
16_R 206_R 0.95 0.12
220_R 115_D 0.94 0.12
112_G 154_F 0.94 0.12
266_V 184_L 0.94 0.12
127_L 97_T 0.94 0.12
47_F 51_T 0.93 0.12
123_K 111_A 0.93 0.12
130_L 23_V 0.93 0.11
309_V 52_F 0.92 0.11
186_M 51_T 0.92 0.11
236_D 133_A 0.92 0.11
116_S 41_R 0.92 0.11
26_I 84_L 0.92 0.11
13_T 168_A 0.92 0.11
14_P 183_G 0.92 0.11
126_K 226_I 0.92 0.11
101_L 165_N 0.92 0.11
98_G 183_G 0.91 0.11
34_S 121_N 0.91 0.11
223_R 195_L 0.91 0.11
42_V 172_L 0.91 0.10
43_S 187_A 0.91 0.10
257_A 191_I 0.91 0.10
112_G 99_G 0.90 0.10
106_S 30_A 0.90 0.10
154_L 74_A 0.90 0.10
193_A 176_G 0.90 0.10
154_L 121_N 0.90 0.10
170_M 187_A 0.90 0.10
174_M 90_F 0.90 0.10
282_K 147_I 0.90 0.10
197_V 54_I 0.90 0.10
210_F 213_I 0.90 0.10
217_K 214_F 0.89 0.10
92_L 78_I 0.89 0.10
130_L 53_A 0.89 0.10
232_Q 211_L 0.89 0.10
115_F 195_L 0.89 0.10
105_I 177_S 0.89 0.09
128_N 27_I 0.89 0.09
260_P 20_L 0.88 0.09
315_P 19_P 0.88 0.09
285_A 222_L 0.88 0.09
153_I 42_V 0.88 0.09
275_A 34_S 0.88 0.09
342_V 176_G 0.88 0.09
94_P 107_G 0.88 0.09
45_I 211_L 0.87 0.09
140_Q 80_I 0.87 0.09
134_K 221_T 0.87 0.09
126_K 250_L 0.87 0.09
133_I 129_M 0.87 0.09
128_N 33_L 0.87 0.09
31_E 179_I 0.86 0.09
130_L 179_I 0.86 0.09
19_K 103_G 0.86 0.09
232_Q 94_A 0.86 0.08
217_K 221_T 0.86 0.08
309_V 227_S 0.86 0.08
224_Q 26_L 0.86 0.08
259_V 202_G 0.86 0.08
133_I 15_L 0.86 0.08
215_H 35_E 0.86 0.08
266_V 64_P 0.86 0.08
4_E 147_I 0.86 0.08
244_R 237_A 0.86 0.08
334_Q 199_L 0.86 0.08
363_P 126_A 0.85 0.08
15_H 103_G 0.85 0.08
152_T 218_F 0.85 0.08
25_Q 128_I 0.85 0.08
77_I 251_L 0.85 0.08
94_P 31_P 0.85 0.08
193_A 199_L 0.85 0.08
148_A 151_V 0.84 0.08
120_L 51_T 0.84 0.08
277_Q 38_V 0.84 0.08
320_A 217_G 0.84 0.08
131_P 195_L 0.84 0.08
170_M 192_T 0.84 0.07
121_Q 82_I 0.84 0.07
285_A 143_H 0.84 0.07
245_Q 201_L 0.84 0.07
106_S 206_R 0.83 0.07
3_D 150_L 0.83 0.07
101_L 184_L 0.83 0.07
222_S 94_A 0.83 0.07
160_G 110_F 0.83 0.07
244_R 42_V 0.83 0.07
228_D 24_L 0.83 0.07
287_K 74_A 0.83 0.07
16_R 164_L 0.83 0.07
11_A 240_C 0.83 0.07
217_K 103_G 0.83 0.07
145_L 126_A 0.83 0.07
34_S 232_L 0.83 0.07
53_A 88_M 0.83 0.07
249_A 44_L 0.83 0.07
128_N 50_I 0.83 0.07
300_I 108_L 0.83 0.07
239_V 194_L 0.82 0.07
39_L 27_I 0.82 0.07
336_Y 180_F 0.82 0.07
22_E 15_L 0.82 0.07
170_M 50_I 0.82 0.07
217_K 111_A 0.82 0.07
13_T 59_P 0.82 0.07
322_Y 68_F 0.82 0.07
211_Q 38_V 0.82 0.07
39_L 43_K 0.82 0.07
173_L 135_L 0.82 0.07
289_V 41_R 0.81 0.07
99_V 117_A 0.81 0.07
335_L 137_F 0.81 0.07
353_R 240_C 0.81 0.07
12_P 37_S 0.81 0.07
92_L 136_L 0.81 0.07
31_E 204_L 0.81 0.07
61_S 69_F 0.81 0.07
336_Y 211_L 0.81 0.07
222_S 236_I 0.81 0.07
199_G 32_I 0.81 0.07
27_P 25_A 0.81 0.07
190_G 48_M 0.81 0.07
288_V 141_N 0.81 0.07
247_Q 143_H 0.81 0.07
155_V 33_L 0.81 0.07
228_D 161_G 0.81 0.07
225_D 155_H 0.81 0.07
8_K 196_T 0.81 0.07
296_V 43_K 0.81 0.06
199_G 125_L 0.81 0.06
105_I 75_V 0.81 0.06
89_M 33_L 0.81 0.06
246_M 82_I 0.81 0.06
174_M 206_R 0.81 0.06
225_D 138_L 0.81 0.06
122_P 75_V 0.81 0.06
141_T 137_F 0.80 0.06
260_P 198_N 0.80 0.06
136_M 164_L 0.80 0.06
306_E 64_P 0.80 0.06
176_E 213_I 0.80 0.06
311_T 101_I 0.80 0.06
189_V 195_L 0.80 0.06
138_S 92_F 0.80 0.06
206_F 199_L 0.80 0.06
330_Q 148_S 0.80 0.06
343_L 194_L 0.80 0.06
182_M 40_K 0.80 0.06
267_N 210_Q 0.80 0.06
128_N 142_G 0.80 0.06
265_I 128_I 0.80 0.06
105_I 245_S 0.80 0.06
48_G 15_L 0.79 0.06
95_L 34_S 0.79 0.06
238_H 27_I 0.79 0.06
83_L 177_S 0.79 0.06
195_L 196_T 0.79 0.06
7_D 119_H 0.79 0.06
315_P 106_M 0.79 0.06
247_Q 217_G 0.79 0.06
126_K 101_I 0.79 0.06
314_A 88_M 0.79 0.06
128_N 160_G 0.79 0.06
14_P 208_A 0.79 0.06
249_A 43_K 0.78 0.06
335_L 104_L 0.78 0.06
212_I 46_L 0.78 0.06
285_A 108_L 0.78 0.06
205_G 43_K 0.78 0.06
163_L 220_L 0.78 0.06
266_V 132_L 0.78 0.06
122_P 92_F 0.78 0.06
28_R 77_Q 0.78 0.06
341_E 201_L 0.78 0.06
133_I 52_F 0.78 0.06
220_R 75_V 0.78 0.06
299_R 129_M 0.78 0.06
343_L 32_I 0.78 0.06
8_K 119_H 0.78 0.06
124_F 40_K 0.77 0.05
222_S 175_A 0.77 0.05
275_A 143_H 0.77 0.05
334_Q 48_M 0.77 0.05
185_A 195_L 0.77 0.05
149_I 48_M 0.77 0.05
182_M 203_L 0.77 0.05
150_L 136_L 0.77 0.05
346_V 127_R 0.77 0.05
125_S 145_W 0.77 0.05
318_A 91_A 0.76 0.05
236_D 121_N 0.76 0.05
306_E 197_L 0.76 0.05
126_K 232_L 0.76 0.05
161_F 122_M 0.76 0.05
249_A 204_L 0.76 0.05
283_M 211_L 0.76 0.05
188_L 23_V 0.76 0.05
23_E 84_L 0.76 0.05
219_L 138_L 0.76 0.05
315_P 103_G 0.76 0.05
254_R 143_H 0.76 0.05
238_H 206_R 0.76 0.05
81_I 8_Q 0.76 0.05
148_A 150_L 0.76 0.05
44_V 9_W 0.76 0.05
124_F 204_L 0.76 0.05
96_I 235_L 0.75 0.05
12_P 164_L 0.75 0.05
303_I 67_S 0.75 0.05
206_F 63_V 0.75 0.05
337_A 115_D 0.75 0.05
254_R 214_F 0.75 0.05
216_L 208_A 0.75 0.05
312_L 205_N 0.75 0.05
243_I 111_A 0.75 0.05
173_L 50_I 0.75 0.05
16_R 26_L 0.75 0.05
137_F 216_I 0.75 0.05
98_G 90_F 0.75 0.05
249_A 93_A 0.75 0.05
214_S 213_I 0.75 0.05
181_A 192_T 0.75 0.05
266_V 187_A 0.75 0.05
238_H 212_S 0.75 0.05
347_W 86_F 0.75 0.05
25_Q 194_L 0.75 0.05
92_L 101_I 0.75 0.05
136_M 46_L 0.74 0.05
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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