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OPENSEQ.org

CDSA - RSEP
UniProt: P0ABG1 - P0AEH1
Length: 735
Sequences: 721
Seq/Len: 1.01
I_Prob: 0.50

CDSA - Phosphatidate cytidylyltransferase
Paralog alert: 0.03 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: CDSA YNBB
RSEP - Regulator of sigma E protease
Paralog alert: 0.01 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: RSEP
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
266_S 257_W 1.84 0.50
221_L 246_I 1.30 0.14
171_F 63_L 1.27 0.12
163_G 19_I 1.20 0.10
189_T 411_I 1.18 0.09
155_L 416_G 1.17 0.09
275_A 424_Q 1.16 0.09
272_P 18_L 1.16 0.09
163_G 388_V 1.15 0.08
10_F 253_P 1.14 0.08
184_V 27_F 1.13 0.08
272_P 390_L 1.13 0.08
201_A 250_D 1.11 0.07
154_L 355_L 1.10 0.07
251_G 396_F 1.09 0.07
160_L 406_L 1.06 0.06
181_A 27_F 1.06 0.06
2_L 335_W 1.05 0.06
250_S 375_G 1.05 0.06
43_W 424_Q 1.04 0.06
38_L 326_A 1.03 0.05
97_I 114_F 1.03 0.05
150_G 276_I 1.03 0.05
9_A 70_V 1.02 0.05
206_G 114_F 1.02 0.05
247_I 330_A 1.01 0.05
272_P 35_V 1.01 0.05
170_M 357_N 1.01 0.05
162_W 429_R 1.01 0.05
132_F 125_P 1.01 0.05
269_A 427_C 1.01 0.05
125_V 327_I 1.01 0.05
166_S 274_L 1.00 0.05
180_L 264_V 1.00 0.05
45_Q 115_A 1.00 0.05
60_V 154_V 0.99 0.05
251_G 55_L 0.99 0.04
6_L 236_S 0.99 0.04
275_A 427_C 0.99 0.04
231_S 351_G 0.99 0.04
169_Y 391_G 0.98 0.04
222_I 327_I 0.98 0.04
191_Q 72_M 0.98 0.04
199_T 15_L 0.97 0.04
166_S 51_R 0.97 0.04
66_L 274_L 0.97 0.04
170_M 36_R 0.97 0.04
17_I 17_V 0.97 0.04
233_L 355_L 0.97 0.04
231_S 439_M 0.96 0.04
184_V 330_A 0.96 0.04
241_F 118_L 0.96 0.04
184_V 13_V 0.95 0.04
189_T 53_D 0.95 0.04
37_M 430_I 0.95 0.04
64_L 327_I 0.94 0.04
142_H 8_L 0.94 0.04
12_L 369_G 0.94 0.04
221_L 82_P 0.94 0.04
35_V 380_L 0.94 0.04
16_V 119_V 0.94 0.04
240_M 368_A 0.93 0.04
272_P 72_M 0.93 0.04
33_L 223_E 0.93 0.04
41_W 13_V 0.92 0.03
160_L 441_L 0.91 0.03
39_A 60_V 0.91 0.03
261_L 367_G 0.91 0.03
39_A 72_M 0.90 0.03
178_H 147_P 0.90 0.03
70_L 111_F 0.90 0.03
181_A 363_S 0.90 0.03
9_A 69_Y 0.90 0.03
182_P 34_G 0.90 0.03
264_I 100_I 0.89 0.03
92_S 414_I 0.89 0.03
175_F 426_F 0.89 0.03
43_W 220_P 0.89 0.03
63_G 248_K 0.89 0.03
44_G 19_I 0.89 0.03
13_I 234_A 0.89 0.03
63_G 233_S 0.89 0.03
204_S 50_R 0.88 0.03
161_V 326_A 0.88 0.03
161_V 269_G 0.88 0.03
173_K 155_D 0.88 0.03
221_L 295_N 0.88 0.03
105_F 93_S 0.88 0.03
171_F 250_D 0.87 0.03
5_R 387_S 0.87 0.03
226_V 407_L 0.87 0.03
195_G 30_A 0.87 0.03
6_L 438_L 0.87 0.03
241_F 416_G 0.86 0.03
43_W 31_R 0.86 0.03
273_V 82_P 0.86 0.03
271_V 64_I 0.86 0.03
276_C 306_P 0.86 0.03
38_L 254_L 0.86 0.03
98_V 253_P 0.86 0.03
196_G 431_G 0.86 0.03
274_F 115_A 0.85 0.03
170_M 384_A 0.85 0.03
195_G 42_I 0.85 0.03
132_F 27_F 0.85 0.03
43_W 56_G 0.85 0.03
161_V 19_I 0.85 0.03
18_A 240_L 0.85 0.03
268_T 129_P 0.85 0.03
180_L 354_K 0.85 0.02
231_S 406_L 0.85 0.02
168_A 389_N 0.85 0.02
138_L 21_V 0.85 0.02
32_T 116_Y 0.85 0.02
179_K 61_I 0.85 0.02
264_I 386_I 0.84 0.02
37_M 98_A 0.84 0.02
221_L 254_L 0.84 0.02
191_Q 39_R 0.84 0.02
111_A 180_I 0.84 0.02
177_K 59_Y 0.84 0.02
184_V 367_G 0.84 0.02
131_F 348_L 0.84 0.02
98_V 181_T 0.84 0.02
191_Q 59_Y 0.83 0.02
191_Q 53_D 0.83 0.02
177_K 75_E 0.83 0.02
19_A 115_A 0.83 0.02
10_F 320_Q 0.83 0.02
204_S 341_T 0.83 0.02
202_V 61_I 0.83 0.02
269_A 31_R 0.83 0.02
173_K 71_K 0.83 0.02
238_E 11_F 0.83 0.02
237_T 432_S 0.83 0.02
121_L 27_F 0.82 0.02
39_A 75_E 0.82 0.02
171_F 136_A 0.82 0.02
135_M 386_I 0.82 0.02
170_M 351_G 0.82 0.02
254_I 227_E 0.82 0.02
179_K 27_F 0.82 0.02
200_A 100_I 0.82 0.02
33_L 380_L 0.81 0.02
17_I 110_I 0.81 0.02
180_L 70_V 0.81 0.02
182_P 251_G 0.81 0.02
225_I 334_T 0.81 0.02
272_P 435_L 0.81 0.02
175_F 79_P 0.81 0.02
100_L 48_L 0.81 0.02
88_S 136_A 0.81 0.02
164_A 429_R 0.80 0.02
8_S 16_G 0.80 0.02
171_F 327_I 0.80 0.02
167_G 390_L 0.80 0.02
59_A 396_F 0.80 0.02
157_V 106_V 0.80 0.02
179_K 18_L 0.80 0.02
190_W 8_L 0.80 0.02
121_L 20_T 0.79 0.02
202_V 154_V 0.79 0.02
201_A 247_V 0.79 0.02
15_V 224_P 0.79 0.02
204_S 116_Y 0.79 0.02
130_P 393_I 0.79 0.02
180_L 94_V 0.79 0.02
150_G 44_F 0.79 0.02
253_L 59_Y 0.79 0.02
67_A 330_A 0.79 0.02
151_A 444_F 0.79 0.02
91_A 249_V 0.79 0.02
251_G 274_L 0.79 0.02
31_V 48_L 0.78 0.02
231_S 102_A 0.78 0.02
203_I 341_T 0.78 0.02
257_H 70_V 0.78 0.02
139_R 406_L 0.78 0.02
162_W 351_G 0.78 0.02
175_F 298_A 0.78 0.02
39_A 30_A 0.78 0.02
23_L 257_W 0.78 0.02
196_G 353_V 0.78 0.02
113_W 56_G 0.78 0.02
163_G 96_Q 0.78 0.02
20_L 364_I 0.78 0.02
76_Y 250_D 0.78 0.02
159_I 345_L 0.78 0.02
266_S 32_R 0.78 0.02
150_G 92_K 0.78 0.02
34_V 253_P 0.78 0.02
274_F 49_W 0.78 0.02
254_I 338_M 0.78 0.02
250_S 69_Y 0.77 0.02
245_A 385_L 0.77 0.02
17_I 157_I 0.77 0.02
202_V 281_S 0.77 0.02
230_A 119_V 0.77 0.02
189_T 55_L 0.77 0.02
177_K 27_F 0.77 0.02
64_L 299_I 0.77 0.02
194_I 414_I 0.77 0.02
124_G 120_F 0.77 0.02
16_V 88_A 0.77 0.02
14_P 340_L 0.77 0.02
46_L 7_D 0.77 0.02
150_G 425_D 0.77 0.02
156_Y 11_F 0.77 0.02
181_A 383_L 0.77 0.02
268_T 53_D 0.77 0.02
136_L 386_I 0.76 0.02
171_F 233_S 0.76 0.02
241_F 398_L 0.76 0.02
166_S 53_D 0.76 0.02
10_F 263_L 0.76 0.02
181_A 77_A 0.76 0.02
60_V 48_L 0.76 0.02
38_L 165_V 0.76 0.02
177_K 91_N 0.76 0.02
114_R 131_V 0.76 0.02
14_P 419_V 0.76 0.02
39_A 390_L 0.76 0.02
124_G 44_F 0.76 0.02
31_V 269_G 0.76 0.02
162_W 406_L 0.76 0.02
33_L 440_G 0.76 0.02
2_L 391_G 0.76 0.02
43_W 55_L 0.76 0.02
194_I 281_S 0.76 0.02
173_K 70_V 0.76 0.02
122_I 409_L 0.75 0.02
199_T 93_S 0.75 0.02
221_L 422_R 0.75 0.02
219_T 237_K 0.75 0.02
161_V 33_C 0.75 0.02
21_F 260_F 0.75 0.02
28_F 444_F 0.75 0.02
159_I 296_G 0.75 0.02
163_G 44_F 0.75 0.02
216_A 110_I 0.75 0.02
230_A 447_F 0.75 0.01
191_Q 75_E 0.75 0.01
228_A 80_V 0.75 0.01
94_G 146_A 0.75 0.01
179_K 92_K 0.75 0.01
91_A 192_D 0.75 0.01
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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