May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org

met -force run Return to Main Page

Instructions
  • Use the menu to the right to browse the coupling matrix.

Coupling matrix for [H:0113] and [R:0119]
- A F I L V M W Y D E K R H N Q S T G P C
A 0 0 0 0 0 0 0 0 0.4 -0.1 -0.1 0.7 -0.1 -0.1 0 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 0
F 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 -0.1 -0.2 0.5 0 0 0 0 0 0 0
I 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 0 0 0 0 0 0 0
L 0.5 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 -0.1 -0.2 -0.1 0 0 0 0 0 0 0
V 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 -0.1 0.3 0 0 0 0 0 0 0 0
M 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 -0.1 0.3 0 0 0 0 0 0 0 0
W 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 0 0 0 0 0 0 0
Y 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 0 0 0 0 0 0 0
D 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 -0.1 -0.2 0 0 0 0 0 0.5 0 0
E -0.1 0 0 0 -0.1 0 0 0 1.2 0.4 -0.2 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 0
K 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 -0.1 0.4 -0.3 -0.1 -0.1 0 0 0.5 -0.1 0 0
R 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 -0.1 -0.1 0 0.4 -0.1 0 0.5 -0.1 -0.1 -0.1 0
H -0.1 0 0 0 -0.1 0 0 0 -0.2 -0.1 -0.2 2.2 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 0
N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 0 0 0 0 0 0 0
Q -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 0 -0.1 -0.3 -0.3 1.9 1.4 -0.3 -0.2 -0.1 -0.2 -0.3 0.2 -0.2 -0.1
S 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0.5 -0.1 -0.2 0 0 0 0 0 0 0 0
T -0.1 0 0 0 -0.1 0 0 0 -0.1 -0.1 -0.2 -0.4 -0.1 0.4 -0.1 0.4 -0.1 0.4 0.4 0
G 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 0 0 0 0 0 0 0
P -0.1 0 0 0 0.5 0 0 0 0.3 0.3 0.2 -0.6 0.7 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 -0.1 0
C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.1 0 0 0 0 0 0 0 0

Conservation matrix (aka PSSM)
- A F I L V M W Y D E K R H N Q S T G P C
0113 0.2 -0.3 -0.6 -0.3 -0.3 -0.3 -0.6 -0.6 -0.3 0.5 -0.1 0.1 0.7 -0.6 1.6 -0.3 0.4 -0.6 0.7 -0.6
0119 -0.3 -0.6 -0.6 -0.6 -0.3 -0.6 -0.5 -0.6 0.5 0.3 0.9 2.1 0.4 0.1 -0.3 0 0.2 0.2 -0.1 -0.6
Select residue pair below:
i_j Score Prob
0007_0011 3.202 1.00
0005_0011 2.960 0.99
0005_0009 2.941 0.99
0150_0155 2.002 0.85
0004_0007 1.816 0.76
0151_0161 1.811 0.75
0024_0027 1.801 0.75
0153_0157 1.780 0.74
0007_0012 1.702 0.69
0161_0164 1.664 0.66
0069_0074 1.591 0.61
0150_0163 1.543 0.58
0008_0011 1.504 0.55
0174_0228 1.502 0.55
0151_0164 1.496 0.54
0150_0164 1.492 0.54
0046_0155 1.477 0.53
0222_0258 1.458 0.51
0019_0044 1.457 0.51
0229_0254 1.442 0.50
0195_0200 1.439 0.50
0232_0257 1.412 0.48
0224_0228 1.411 0.48
0006_0009 1.395 0.46
0086_0258 1.392 0.46
0107_0264 1.373 0.45
0213_0248 1.369 0.44
0232_0239 1.353 0.43
0187_0213 1.350 0.43
0151_0155 1.339 0.42
0004_0009 1.335 0.42
0174_0224 1.332 0.42
0075_0105 1.314 0.40
0005_0008 1.306 0.40
0226_0245 1.305 0.40
0150_0161 1.301 0.39
0195_0239 1.292 0.39
0149_0155 1.290 0.39
0171_0230 1.288 0.39
0106_0122 1.267 0.37
0191_0223 1.263 0.37
0149_0228 1.245 0.35
0016_0020 1.241 0.35
0066_0121 1.230 0.34
0226_0230 1.226 0.34
0188_0255 1.226 0.34
0232_0263 1.218 0.34
0026_0037 1.218 0.34
0022_0196 1.213 0.33
0176_0183 1.209 0.33
0161_0165 1.202 0.33
0060_0173 1.202 0.33
0046_0164 1.200 0.32
0178_0270 1.199 0.32
0174_0221 1.195 0.32
0073_0096 1.189 0.32
0211_0229 1.179 0.31
0215_0221 1.176 0.31
0088_0222 1.176 0.31
0123_0230 1.175 0.31
0024_0227 1.172 0.31
0136_0139 1.166 0.30
0151_0163 1.164 0.30
0231_0249 1.164 0.30
0149_0226 1.156 0.30
0187_0230 1.152 0.29
0137_0270 1.147 0.29
0005_0012 1.144 0.29
0009_0012 1.143 0.29
0221_0231 1.143 0.29
0155_0163 1.142 0.29
0179_0182 1.135 0.28
0030_0167 1.133 0.28
0171_0187 1.131 0.28
0239_0254 1.130 0.28
0025_0109 1.128 0.28
0108_0189 1.126 0.28
0214_0260 1.124 0.28
0073_0109 1.119 0.27
0221_0245 1.117 0.27
0047_0197 1.114 0.27
0023_0250 1.109 0.27
0150_0157 1.108 0.27
0027_0110 1.108 0.27
0155_0161 1.104 0.26
0107_0116 1.098 0.26
0157_0164 1.092 0.26
0118_0246 1.091 0.26
0240_0247 1.089 0.26
0169_0230 1.086 0.25
0110_0127 1.085 0.25
0010_0070 1.084 0.25
0216_0253 1.084 0.25
0228_0245 1.081 0.25
0023_0254 1.081 0.25
0229_0250 1.080 0.25
0053_0202 1.078 0.25
0034_0116 1.078 0.25
0057_0108 1.078 0.25
0117_0123 1.073 0.25
0060_0183 1.071 0.24
0229_0232 1.071 0.24
0064_0071 1.070 0.24
0023_0236 1.068 0.24
0042_0217 1.066 0.24
0095_0125 1.065 0.24
0045_0104 1.063 0.24
0037_0224 1.063 0.24
0155_0164 1.063 0.24
0168_0171 1.056 0.24
0049_0209 1.055 0.24
0080_0226 1.051 0.23
0250_0254 1.051 0.23
0239_0250 1.048 0.23
0211_0250 1.045 0.23
0258_0270 1.044 0.23
0088_0108 1.043 0.23
0151_0165 1.042 0.23
0022_0249 1.040 0.23
0097_0158 1.039 0.23
0012_0123 1.032 0.22
0042_0226 1.031 0.22
0191_0232 1.027 0.22
0082_0236 1.027 0.22
0060_0093 1.024 0.22
0088_0162 1.022 0.22
0060_0206 1.020 0.22
0176_0217 1.018 0.22
0004_0011 1.018 0.22
0108_0192 1.018 0.22
0181_0217 1.017 0.22
0019_0262 1.014 0.21
0033_0106 1.013 0.21
0034_0115 1.011 0.21
0224_0245 1.010 0.21
0215_0231 1.008 0.21
0063_0183 1.007 0.21
0229_0257 1.006 0.21
0173_0189 1.004 0.21
0018_0160 1.002 0.21
0240_0250 1.001 0.21
0070_0107 1.000 0.21
0081_0222 0.999 0.21
0068_0123 0.998 0.21
0022_0160 0.996 0.21
0025_0047 0.994 0.20
0083_0123 0.993 0.20
0071_0259 0.989 0.20
0006_0011 0.989 0.20
0023_0126 0.989 0.20
0046_0150 0.987 0.20
0051_0130 0.986 0.20
0027_0127 0.982 0.20
0198_0203 0.980 0.20
0104_0251 0.979 0.20
0017_0020 0.977 0.20
0013_0026 0.977 0.20
0041_0080 0.976 0.20
0058_0126 0.976 0.20
0231_0235 0.972 0.19
0014_0107 0.972 0.19
0009_0013 0.970 0.19
0085_0253 0.970 0.19
0065_0085 0.969 0.19
0048_0249 0.968 0.19
0167_0235 0.961 0.19
0138_0259 0.960 0.19
0043_0104 0.958 0.19
0227_0247 0.958 0.19
0138_0181 0.957 0.19
0107_0169 0.955 0.19
0039_0104 0.954 0.19
0112_0118 0.954 0.19
0048_0160 0.952 0.18
0019_0024 0.950 0.18
0236_0254 0.949 0.18
0061_0249 0.945 0.18
0153_0164 0.945 0.18
0024_0198 0.945 0.18
0051_0213 0.942 0.18
0211_0231 0.941 0.18
0053_0178 0.939 0.18
0247_0250 0.939 0.18
0193_0230 0.937 0.18
0069_0203 0.933 0.18
0066_0109 0.931 0.17
0167_0178 0.930 0.17
0075_0185 0.929 0.17
0040_0267 0.929 0.17
0228_0244 0.928 0.17
0064_0192 0.926 0.17
0048_0060 0.925 0.17
0165_0232 0.923 0.17
0023_0077 0.920 0.17
0032_0058 0.917 0.17
0149_0206 0.917 0.17
0126_0159 0.917 0.17
0096_0244 0.916 0.17
0027_0047 0.915 0.17
0165_0247 0.915 0.17
0173_0186 0.915 0.17
0054_0099 0.915 0.17
0077_0254 0.914 0.17
0045_0156 0.913 0.17
0226_0246 0.912 0.17
0047_0145 0.912 0.17
0213_0255 0.912 0.17
0192_0253 0.911 0.17
0042_0127 0.911 0.17
0183_0213 0.910 0.17
0080_0245 0.910 0.17
0117_0204 0.909 0.17
0157_0232 0.908 0.17
0023_0037 0.906 0.16
0125_0138 0.906 0.16
0037_0096 0.903 0.16
0135_0138 0.903 0.16
0029_0258 0.903 0.16
0151_0157 0.902 0.16
0217_0222 0.901 0.16
0096_0110 0.900 0.16
0113_0119 0.899 0.16
0046_0237 0.898 0.16
0030_0177 0.897 0.16
0162_0173 0.896 0.16
0236_0240 0.896 0.16
0223_0268 0.893 0.16
0077_0264 0.890 0.16
0058_0098 0.889 0.16
0033_0086 0.887 0.16
0149_0224 0.887 0.16
0037_0068 0.885 0.16
0024_0131 0.884 0.16
0154_0215 0.884 0.16
0043_0098 0.884 0.16
0075_0240 0.881 0.15
0068_0230 0.881 0.15
0033_0067 0.880 0.15
0039_0045 0.879 0.15
0016_0121 0.878 0.15
0025_0099 0.877 0.15
0094_0170 0.874 0.15
0014_0017 0.874 0.15
0025_0040 0.874 0.15
0087_0183 0.873 0.15
0150_0153 0.873 0.15
0042_0165 0.871 0.15
0032_0133 0.871 0.15
0215_0241 0.871 0.15
0054_0106 0.870 0.15
0241_0244 0.869 0.15
0067_0256 0.868 0.15
0073_0120 0.868 0.15
0242_0254 0.867 0.15
0143_0213 0.866 0.15
0169_0187 0.866 0.15
0050_0058 0.865 0.15
0101_0225 0.865 0.15
0069_0166 0.865 0.15
0085_0180 0.863 0.15
0110_0261 0.863 0.15
0068_0232 0.862 0.15
0085_0183 0.861 0.15
0150_0156 0.860 0.15
0061_0155 0.859 0.15
0155_0244 0.858 0.15
0062_0116 0.857 0.14
0163_0241 0.857 0.14
0121_0261 0.856 0.14
0061_0096 0.856 0.14
0101_0252 0.855 0.14
0017_0022 0.855 0.14
0157_0165 0.854 0.14
0056_0185 0.853 0.14
0062_0082 0.853 0.14
0052_0089 0.851 0.14
0037_0127 0.850 0.14
0149_0217 0.850 0.14
0017_0034 0.849 0.14
0020_0109 0.848 0.14
0231_0247 0.848 0.14
0040_0073 0.848 0.14
0191_0251 0.846 0.14
0067_0133 0.845 0.14
0160_0250 0.845 0.14
0011_0014 0.844 0.14
0157_0257 0.844 0.14
0033_0196 0.842 0.14
0149_0165 0.842 0.14
0040_0162 0.842 0.14
0094_0180 0.842 0.14
0053_0252 0.841 0.14
0232_0254 0.837 0.14
0069_0149 0.836 0.14
0014_0020 0.836 0.14
0156_0206 0.834 0.14
0147_0156 0.833 0.14
0259_0270 0.833 0.14
0087_0262 0.833 0.14
0211_0232 0.832 0.14
0179_0183 0.832 0.14
0029_0102 0.832 0.14
0166_0194 0.831 0.14
0048_0077 0.831 0.14
0115_0195 0.831 0.14
0159_0213 0.830 0.14
0185_0226 0.829 0.13
0239_0257 0.829 0.13
0174_0245 0.829 0.13
0221_0226 0.828 0.13
0240_0254 0.828 0.13
0195_0232 0.828 0.13
0223_0241 0.827 0.13
0032_0211 0.826 0.13
0039_0121 0.826 0.13
0040_0252 0.826 0.13
0007_0161 0.826 0.13
0200_0257 0.826 0.13
0049_0249 0.826 0.13
0017_0233 0.826 0.13
0236_0250 0.825 0.13
0027_0096 0.825 0.13
0045_0100 0.825 0.13
0109_0177 0.825 0.13
0073_0220 0.823 0.13
0041_0125 0.823 0.13
0174_0213 0.823 0.13
0027_0037 0.820 0.13
0062_0110 0.819 0.13
0075_0109 0.819 0.13
0244_0265 0.819 0.13
0134_0139 0.819 0.13
0190_0253 0.818 0.13
0213_0236 0.818 0.13
0042_0183 0.818 0.13
0014_0220 0.818 0.13
0217_0245 0.818 0.13
0126_0236 0.817 0.13
0126_0235 0.817 0.13
0071_0233 0.816 0.13
0029_0036 0.815 0.13
0159_0231 0.815 0.13
0085_0108 0.813 0.13
0023_0026 0.813 0.13
0082_0200 0.812 0.13
0191_0229 0.812 0.13
0152_0216 0.811 0.13
0242_0250 0.811 0.13
0033_0089 0.811 0.13
0172_0184 0.810 0.13
0254_0257 0.810 0.13
0157_0163 0.810 0.13
0109_0158 0.809 0.13
0077_0102 0.809 0.13
0015_0106 0.808 0.13
0071_0080 0.808 0.13
0042_0215 0.807 0.13
0042_0069 0.807 0.13
0062_0242 0.807 0.13
0015_0147 0.807 0.13
0200_0249 0.806 0.13
0186_0212 0.806 0.13
0018_0067 0.805 0.13
0225_0253 0.804 0.13
0239_0263 0.804 0.13
0046_0153 0.803 0.13
0044_0062 0.802 0.13
0111_0185 0.801 0.13
0085_0124 0.801 0.13
0107_0117 0.801 0.13
0152_0197 0.800 0.12
0036_0122 0.800 0.12
0022_0107 0.798 0.12
0072_0082 0.797 0.12
0165_0191 0.797 0.12
0022_0034 0.796 0.12
0177_0192 0.795 0.12
0022_0039 0.795 0.12
0171_0195 0.794 0.12
0075_0250 0.793 0.12
0095_0106 0.793 0.12
0179_0225 0.792 0.12
0023_0247 0.791 0.12
0077_0250 0.790 0.12
0167_0181 0.790 0.12
0126_0254 0.790 0.12
0004_0016 0.790 0.12
0217_0226 0.789 0.12
0160_0267 0.789 0.12
0108_0187 0.789 0.12
0060_0222 0.788 0.12
0221_0228 0.788 0.12
0229_0239 0.787 0.12
0096_0248 0.786 0.12
0004_0008 0.786 0.12
0165_0239 0.786 0.12
0081_0109 0.785 0.12
Local Interactions:
i_j Score Prob
0007_0009 4.223 1.00
0009_0011 4.075 1.00
0005_0007 3.219 1.00
0008_0009 2.471 0.96
0007_0008 2.113 0.88
0226_0228 1.769 0.73
0012_0013 1.705 0.69
0025_0027 1.680 0.67
0060_0061 1.634 0.64
0215_0217 1.569 0.59
0150_0151 1.471 0.52
0024_0025 1.470 0.52
0137_0138 1.459 0.51
0006_0008 1.455 0.51
0012_0014 1.421 0.48
0224_0226 1.411 0.48
0042_0043 1.394 0.46
0163_0164 1.369 0.44
0084_0086 1.367 0.44
0004_0005 1.359 0.44
0006_0007 1.344 0.43
0014_0015 1.274 0.38
0228_0230 1.272 0.37
0136_0138 1.223 0.34
0244_0246 1.211 0.33
0244_0245 1.190 0.32
0135_0136 1.180 0.31
0013_0014 1.171 0.31
0043_0045 1.170 0.30
0155_0157 1.149 0.29
0239_0240 1.145 0.29
0161_0163 1.144 0.29
0011_0012 1.131 0.28
0116_0117 1.125 0.28
0108_0109 1.105 0.26
0115_0116 1.061 0.24
0048_0050 1.050 0.23
0181_0182 1.045 0.23
0056_0058 1.034 0.22
0057_0058 1.027 0.22
0014_0016 1.022 0.22
0008_0010 1.018 0.22
0010_0011 1.013 0.21
0259_0260 1.011 0.21
0056_0057 1.009 0.21
0068_0069 1.006 0.21
0026_0027 1.005 0.21
0245_0246 0.978 0.20
0231_0232 0.975 0.20
0261_0263 0.968 0.19
0236_0238 0.963 0.19
0261_0262 0.953 0.18
0005_0006 0.940 0.18
0110_0112 0.938 0.18
0137_0139 0.937 0.18
0011_0013 0.925 0.17
0066_0068 0.919 0.17
0229_0231 0.913 0.17
0164_0165 0.898 0.16
0152_0154 0.894 0.16
0125_0127 0.885 0.16
0015_0016 0.883 0.15
0009_0010 0.881 0.15
0132_0134 0.872 0.15
0201_0202 0.871 0.15
0134_0136 0.870 0.15
0199_0200 0.858 0.15
0055_0056 0.858 0.15
0266_0267 0.845 0.14
0140_0141 0.838 0.14
0179_0181 0.826 0.13
0092_0094 0.818 0.13
0136_0137 0.815 0.13
0135_0137 0.805 0.13
0138_0139 0.797 0.12
0102_0103 0.796 0.12
0125_0126 0.793 0.12
0157_0158 0.790 0.12
0151_0152 0.788 0.12
See all coupling residues
Download raw data
Renumber residues to start with:
Position: 1 2 3 4 5 ...
Sequence: G Y S E E ...

Page generated in 0.0193 seconds.