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OPENSEQ.org

HFLX - MIAA
UniProt: P25519 - P16384
Length: 742
Sequences: 453
Seq/Len: 0.63
I_Prob: 0.00

HFLX - GTPase HflX
Paralog alert: 0.05 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: HFLX
MIAA - tRNA dimethylallyltransferase
Paralog alert: 0.04 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: MIAA
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
143_L 43_S 1.54 0.00
243_D 50_M 1.38 0.00
101_I 103_L 1.32 0.00
152_L 109_M 1.31 0.00
134_T 109_M 1.26 0.00
60_E 27_A 1.22 0.00
133_A 109_M 1.21 0.00
63_A 295_L 1.21 0.00
220_A 228_A 1.20 0.00
90_R 183_T 1.20 0.00
197_V 231_R 1.20 0.00
202_L 24_T 1.19 0.00
132_L 124_S 1.18 0.00
236_L 109_M 1.17 0.00
226_D 71_D 1.17 0.00
268_K 202_I 1.17 0.00
79_L 82_A 1.14 0.00
150_I 279_A 1.13 0.00
90_R 133_I 1.10 0.00
186_E 60_E 1.10 0.00
150_I 207_R 1.10 0.00
250_A 249_V 1.09 0.00
265_A 38_L 1.09 0.00
290_R 248_C 1.09 0.00
150_I 84_F 1.09 0.00
394_M 242_D 1.08 0.00
114_R 280_K 1.08 0.00
297_A 283_I 1.07 0.00
16_I 160_I 1.07 0.00
313_L 163_N 1.07 0.00
57_F 84_F 1.04 0.00
187_Q 116_L 1.03 0.00
303_E 100_R 1.03 0.00
304_E 150_Q 1.02 0.00
177_R 115_L 1.02 0.00
266_A 37_E 1.02 0.00
219_E 150_Q 1.02 0.00
174_I 289_W 1.01 0.00
355_Q 86_R 1.00 0.00
278_T 259_E 1.00 0.00
306_D 48_K 1.00 0.00
415_C 307_V 0.99 0.00
361_L 270_R 0.99 0.00
80_F 284_T 0.99 0.00
10_Q 223_A 0.99 0.00
281_L 154_P 0.99 0.00
39_V 13_I 0.99 0.00
200_V 222_L 0.99 0.00
280_L 115_L 0.99 0.00
212_T 108_T 0.98 0.00
287_A 223_A 0.98 0.00
177_R 114_A 0.98 0.00
138_R 253_Q 0.98 0.00
280_L 77_Q 0.98 0.00
81_D 289_W 0.97 0.00
269_A 38_L 0.97 0.00
418_E 306_E 0.97 0.00
417_Q 305_D 0.96 0.00
261_H 243_L 0.96 0.00
200_V 114_A 0.96 0.00
234_P 294_W 0.96 0.00
357_L 100_R 0.96 0.00
83_A 266_E 0.96 0.00
309_E 60_E 0.96 0.00
279_L 92_M 0.96 0.00
184_Q 252_R 0.95 0.00
176_S 86_R 0.95 0.00
45_I 33_I 0.95 0.00
81_D 132_R 0.94 0.00
140_W 123_P 0.94 0.00
117_T 289_W 0.94 0.00
404_V 15_L 0.94 0.00
70_V 54_T 0.94 0.00
79_L 227_E 0.93 0.00
80_F 161_H 0.93 0.00
258_H 254_M 0.93 0.00
132_L 300_P 0.93 0.00
63_A 50_M 0.93 0.00
248_V 270_R 0.93 0.00
393_W 72_I 0.93 0.00
310_I 62_L 0.93 0.00
117_T 113_K 0.93 0.00
3_D 180_K 0.93 0.00
83_A 112_F 0.92 0.00
279_L 100_R 0.92 0.00
373_P 50_M 0.92 0.00
339_R 162_P 0.92 0.00
287_A 235_A 0.92 0.00
202_L 178_S 0.92 0.00
282_H 67_H 0.92 0.00
91_N 84_F 0.91 0.00
361_L 156_A 0.91 0.00
178_L 46_I 0.91 0.00
277_A 146_H 0.91 0.00
296_E 196_Q 0.91 0.00
11_A 75_P 0.91 0.00
162_T 160_I 0.91 0.00
417_Q 300_P 0.91 0.00
101_I 155_V 0.91 0.00
387_Q 288_G 0.91 0.00
350_I 223_A 0.90 0.00
402_L 263_S 0.90 0.00
272_Q 254_M 0.90 0.00
214_F 249_V 0.90 0.00
96_C 80_S 0.90 0.00
197_V 81_A 0.89 0.00
404_V 41_V 0.89 0.00
197_V 227_E 0.89 0.00
341_W 57_P 0.89 0.00
199_T 242_D 0.89 0.00
248_V 109_M 0.89 0.00
54_P 131_A 0.89 0.00
150_I 161_H 0.89 0.00
56_Y 245_S 0.89 0.00
236_L 113_K 0.88 0.00
397_D 116_L 0.88 0.00
91_N 249_V 0.88 0.00
275_R 268_V 0.88 0.00
71_K 202_I 0.88 0.00
147_K 252_R 0.88 0.00
37_A 82_A 0.88 0.00
92_L 49_G 0.88 0.00
14_V 30_L 0.87 0.00
384_Y 275_T 0.87 0.00
372_L 13_I 0.87 0.00
6_D 58_N 0.87 0.00
261_H 119_L 0.87 0.00
131_H 277_Q 0.87 0.00
151_G 276_R 0.87 0.00
143_L 116_L 0.86 0.00
55_K 214_I 0.86 0.00
245_G 244_P 0.86 0.00
301_V 275_T 0.86 0.00
264_V 151_E 0.86 0.00
302_L 278_L 0.86 0.00
201_S 50_M 0.86 0.00
281_L 247_R 0.86 0.00
146_Q 247_R 0.86 0.00
67_A 223_A 0.86 0.00
335_N 279_A 0.86 0.00
189_R 67_H 0.86 0.00
316_M 246_I 0.86 0.00
145_R 67_H 0.86 0.00
412_R 13_I 0.86 0.00
134_T 41_V 0.86 0.00
28_Q 219_H 0.86 0.00
361_L 266_E 0.86 0.00
195_A 58_N 0.86 0.00
194_K 137_A 0.86 0.00
226_D 224_S 0.86 0.00
371_R 228_A 0.86 0.00
143_L 28_I 0.86 0.00
79_L 81_A 0.86 0.00
385_Q 77_Q 0.85 0.00
417_Q 303_A 0.85 0.00
302_L 257_Y 0.85 0.00
390_E 148_Q 0.85 0.00
399_S 303_A 0.85 0.00
372_L 156_A 0.85 0.00
23_D 219_H 0.85 0.00
403_Q 223_A 0.85 0.00
82_H 211_H 0.85 0.00
226_D 118_G 0.85 0.00
248_V 164_D 0.84 0.00
155_P 67_H 0.84 0.00
144_E 286_L 0.84 0.00
340_V 84_F 0.84 0.00
369_T 32_K 0.84 0.00
91_N 95_I 0.84 0.00
10_Q 70_L 0.84 0.00
163_D 130_R 0.84 0.00
122_L 79_Y 0.84 0.00
30_F 12_A 0.84 0.00
225_A 81_A 0.84 0.00
389_I 33_I 0.84 0.00
268_K 133_I 0.83 0.00
117_T 176_F 0.83 0.00
55_K 20_A 0.83 0.00
383_F 284_T 0.83 0.00
134_T 226_F 0.83 0.00
226_D 210_L 0.83 0.00
143_L 272_V 0.83 0.00
9_E 82_A 0.83 0.00
39_V 164_D 0.83 0.00
294_N 289_W 0.83 0.00
245_G 288_G 0.83 0.00
351_P 94_D 0.83 0.00
221_R 208_E 0.83 0.00
238_R 129_V 0.83 0.00
6_D 303_A 0.83 0.00
87_A 121_P 0.83 0.00
91_N 252_R 0.83 0.00
302_L 103_L 0.83 0.00
138_R 123_P 0.83 0.00
242_A 198_H 0.82 0.00
129_L 119_L 0.82 0.00
268_K 82_A 0.82 0.00
225_A 200_F 0.82 0.00
371_R 15_L 0.82 0.00
395_E 175_F 0.82 0.00
257_R 85_R 0.82 0.00
302_L 105_V 0.82 0.00
277_A 289_W 0.82 0.00
160_L 252_R 0.82 0.00
281_L 74_D 0.82 0.00
383_F 84_F 0.82 0.00
113_Q 253_Q 0.82 0.00
195_A 133_I 0.82 0.00
280_L 73_R 0.82 0.00
382_R 158_A 0.81 0.00
216_R 115_L 0.81 0.00
242_A 80_S 0.81 0.00
315_V 150_Q 0.81 0.00
417_Q 308_L 0.81 0.00
68_E 206_S 0.81 0.00
418_E 178_S 0.81 0.00
125_E 119_L 0.81 0.00
262_D 45_L 0.81 0.00
315_V 292_V 0.81 0.00
187_Q 43_S 0.81 0.00
14_V 227_E 0.81 0.00
92_L 45_L 0.81 0.00
280_L 263_S 0.81 0.00
396_E 208_E 0.81 0.00
150_I 283_I 0.81 0.00
408_I 206_S 0.80 0.00
314_L 307_V 0.80 0.00
77_V 166_Q 0.80 0.00
201_S 230_V 0.80 0.00
6_D 306_E 0.80 0.00
301_V 247_R 0.80 0.00
314_L 263_S 0.80 0.00
87_A 73_R 0.80 0.00
34_V 174_V 0.80 0.00
146_Q 277_Q 0.80 0.00
250_A 75_P 0.79 0.00
316_M 234_F 0.79 0.00
194_K 215_E 0.79 0.00
217_I 48_K 0.79 0.00
101_I 91_E 0.79 0.00
394_M 249_V 0.79 0.00
65_E 27_A 0.79 0.00
129_L 199_Q 0.79 0.00
146_Q 253_Q 0.79 0.00
168_R 296_D 0.79 0.00
401_S 223_A 0.79 0.00
248_V 218_F 0.79 0.00
372_L 158_A 0.79 0.00
1_M 155_V 0.79 0.00
49_R 37_E 0.79 0.00
225_A 79_Y 0.79 0.00
92_L 182_L 0.78 0.00
117_T 160_I 0.78 0.00
399_S 307_V 0.78 0.00
359_E 223_A 0.78 0.00
360_R 267_M 0.78 0.00
112_A 67_H 0.78 0.00
408_I 147_R 0.78 0.00
417_Q 302_Q 0.78 0.00
314_L 262_I 0.78 0.00
6_D 308_L 0.78 0.00
191_S 113_K 0.78 0.00
233_D 20_A 0.78 0.00
176_S 151_E 0.78 0.00
272_Q 200_F 0.78 0.00
140_W 112_F 0.78 0.00
213_L 141_G 0.78 0.00
399_S 300_P 0.78 0.00
180_R 206_S 0.78 0.00
277_A 25_A 0.78 0.00
60_E 68_R 0.77 0.00
40_E 144_S 0.77 0.00
370_L 164_D 0.77 0.00
348_A 33_I 0.77 0.00
186_E 33_I 0.77 0.00
357_L 224_S 0.77 0.00
288_D 113_K 0.77 0.00
105_G 211_H 0.77 0.00
240_D 236_R 0.77 0.00
399_S 189_S 0.77 0.00
143_L 91_E 0.77 0.00
404_V 164_D 0.77 0.00
256_I 184_E 0.76 0.00
226_D 66_P 0.76 0.00
405_R 294_W 0.76 0.00
143_L 83_D 0.76 0.00
64_V 100_R 0.76 0.00
132_L 95_I 0.76 0.00
404_V 253_Q 0.76 0.00
155_P 105_V 0.76 0.00
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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