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OPENSEQ.org

FLIG - FLIR
UniProt: P0ABZ1 - P33135
Length: 592
Sequences: 360
Seq/Len: 0.61
I_Prob: 0.01

FLIG - Flagellar motor switch protein FliG
Paralog alert: 0.15 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIG
FLIR - Flagellar biosynthetic protein FliR
Paralog alert: 0.33 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIR
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
289_D 186_L 1.61 0.01
161_I 227_S 1.49 0.00
143_A 75_V 1.44 0.00
224_E 34_S 1.44 0.00
55_V 202_G 1.41 0.00
135_V 92_F 1.34 0.00
308_I 200_A 1.32 0.00
25_V 243_L 1.32 0.00
27_K 32_I 1.31 0.00
137_L 217_G 1.29 0.00
200_A 144_L 1.27 0.00
22_A 144_L 1.25 0.00
310_L 25_A 1.24 0.00
56_L 183_G 1.21 0.00
28_H 216_I 1.20 0.00
229_I 143_H 1.18 0.00
12_I 25_A 1.18 0.00
118_A 56_P 1.17 0.00
18_G 92_F 1.17 0.00
129_I 110_F 1.17 0.00
34_V 54_I 1.17 0.00
179_L 244_F 1.15 0.00
224_E 191_I 1.14 0.00
264_K 115_D 1.14 0.00
88_E 108_L 1.13 0.00
131_A 31_P 1.13 0.00
122_I 217_G 1.12 0.00
298_L 212_S 1.12 0.00
275_L 72_W 1.12 0.00
266_A 58_L 1.12 0.00
142_A 82_I 1.12 0.00
167_V 214_F 1.12 0.00
29_L 206_R 1.11 0.00
232_E 198_N 1.11 0.00
16_T 213_I 1.11 0.00
17_I 220_L 1.11 0.00
275_L 226_I 1.11 0.00
16_T 20_L 1.11 0.00
84_A 206_R 1.10 0.00
211_E 214_F 1.10 0.00
205_L 218_F 1.10 0.00
173_A 196_T 1.10 0.00
250_L 42_V 1.09 0.00
311_I 231_A 1.09 0.00
215_I 187_A 1.07 0.00
196_V 49_M 1.07 0.00
116_Q 131_M 1.07 0.00
130_I 204_L 1.06 0.00
32_R 150_L 1.06 0.00
131_A 189_P 1.05 0.00
93_L 181_L 1.05 0.00
183_L 191_I 1.05 0.00
252_Q 212_S 1.05 0.00
156_D 30_A 1.04 0.00
271_R 122_M 1.04 0.00
272_E 80_I 1.04 0.00
216_T 154_F 1.04 0.00
289_D 233_M 1.03 0.00
161_I 188_L 1.03 0.00
156_D 154_F 1.02 0.00
312_V 26_L 1.02 0.00
202_I 104_L 1.01 0.00
286_L 56_P 1.01 0.00
222_D 142_G 1.01 0.00
18_G 189_P 1.01 0.00
151_E 137_F 1.01 0.00
178_V 234_P 1.01 0.00
33_E 31_P 1.01 0.00
266_A 173_T 1.00 0.00
327_E 203_L 1.00 0.00
43_N 196_T 1.00 0.00
311_I 160_G 0.99 0.00
25_V 106_M 0.99 0.00
320_E 95_V 0.99 0.00
308_I 218_F 0.99 0.00
317_E 203_L 0.99 0.00
145_I 159_I 0.99 0.00
145_I 172_L 0.99 0.00
330_Y 103_G 0.99 0.00
287_R 75_V 0.99 0.00
132_T 113_F 0.99 0.00
85_L 47_A 0.99 0.00
142_A 50_I 0.98 0.00
299_S 186_L 0.98 0.00
198_T 24_L 0.98 0.00
34_V 222_L 0.98 0.00
131_A 107_G 0.98 0.00
203_I 51_T 0.98 0.00
223_G 128_I 0.98 0.00
37_L 80_I 0.98 0.00
27_K 43_K 0.97 0.00
191_S 50_I 0.97 0.00
199_A 23_V 0.97 0.00
100_T 216_I 0.97 0.00
20_D 71_L 0.97 0.00
149_F 187_A 0.97 0.00
252_Q 205_N 0.97 0.00
69_L 94_A 0.97 0.00
300_Q 128_I 0.97 0.00
122_I 173_T 0.96 0.00
130_I 118_S 0.96 0.00
78_R 204_L 0.96 0.00
16_T 37_S 0.96 0.00
56_L 126_A 0.96 0.00
133_I 223_T 0.96 0.00
23_A 79_L 0.96 0.00
174_E 214_F 0.95 0.00
73_A 23_V 0.95 0.00
308_I 227_S 0.95 0.00
12_I 3_Q 0.95 0.00
162_A 116_P 0.95 0.00
14_L 30_A 0.95 0.00
63_A 34_S 0.94 0.00
161_I 152_D 0.94 0.00
255_D 167_N 0.94 0.00
229_I 148_S 0.94 0.00
158_M 34_S 0.94 0.00
244_D 114_V 0.94 0.00
247_I 183_G 0.94 0.00
165_G 174_K 0.94 0.00
37_L 36_R 0.94 0.00
174_E 217_G 0.94 0.00
25_V 128_I 0.93 0.00
51_Q 78_I 0.93 0.00
135_V 54_I 0.93 0.00
75_D 9_W 0.93 0.00
33_E 189_P 0.93 0.00
136_H 204_L 0.93 0.00
157_V 39_P 0.93 0.00
133_I 54_I 0.92 0.00
164_F 213_I 0.92 0.00
30_S 185_M 0.92 0.00
272_E 195_L 0.92 0.00
146_L 206_R 0.92 0.00
328_D 40_K 0.92 0.00
34_V 124_V 0.92 0.00
320_E 77_Q 0.92 0.00
250_L 224_V 0.92 0.00
224_E 126_A 0.92 0.00
78_R 44_L 0.92 0.00
239_L 32_I 0.92 0.00
156_D 148_S 0.91 0.00
143_A 232_L 0.91 0.00
255_D 142_G 0.91 0.00
240_V 183_G 0.91 0.00
145_I 55_A 0.91 0.00
323_I 184_L 0.91 0.00
269_P 38_V 0.91 0.00
246_S 220_L 0.91 0.00
297_R 45_G 0.91 0.00
14_L 197_L 0.91 0.00
151_E 54_I 0.91 0.00
226_A 103_G 0.91 0.00
23_A 17_F 0.91 0.00
251_L 186_L 0.91 0.00
12_I 213_I 0.91 0.00
254_V 234_P 0.90 0.00
137_L 138_L 0.90 0.00
45_T 25_A 0.90 0.00
153_L 204_L 0.90 0.00
289_D 195_L 0.90 0.00
254_V 172_L 0.90 0.00
27_K 124_V 0.90 0.00
112_F 19_P 0.90 0.00
274_F 91_A 0.90 0.00
141_Q 201_L 0.90 0.00
215_I 223_T 0.90 0.00
200_A 198_N 0.90 0.00
242_V 240_C 0.90 0.00
34_V 144_L 0.90 0.00
115_P 236_I 0.90 0.00
319_G 219_P 0.90 0.00
47_I 128_I 0.89 0.00
20_D 134_L 0.89 0.00
193_M 211_L 0.89 0.00
254_V 11_S 0.89 0.00
6_G 180_F 0.89 0.00
291_A 226_I 0.89 0.00
20_D 104_L 0.89 0.00
141_Q 24_L 0.89 0.00
181_G 75_V 0.89 0.00
160_R 219_P 0.89 0.00
86_G 115_D 0.89 0.00
181_G 220_L 0.89 0.00
326_G 150_L 0.89 0.00
121_L 139_T 0.89 0.00
179_L 114_V 0.89 0.00
66_F 132_L 0.88 0.00
44_V 251_L 0.88 0.00
162_A 142_G 0.88 0.00
274_F 132_L 0.88 0.00
298_L 145_W 0.88 0.00
147_A 126_A 0.88 0.00
170_A 188_L 0.88 0.00
287_R 139_T 0.88 0.00
75_D 248_F 0.88 0.00
230_I 119_H 0.88 0.00
272_E 153_T 0.88 0.00
216_T 45_G 0.88 0.00
33_E 86_F 0.88 0.00
25_V 96_R 0.88 0.00
37_L 3_Q 0.88 0.00
277_N 99_G 0.87 0.00
199_A 234_P 0.87 0.00
294_G 219_P 0.87 0.00
106_G 198_N 0.87 0.00
161_I 226_I 0.87 0.00
84_A 203_L 0.87 0.00
306_K 110_F 0.87 0.00
96_D 17_F 0.87 0.00
118_A 216_I 0.87 0.00
28_H 74_A 0.86 0.00
242_V 51_T 0.86 0.00
278_M 138_L 0.86 0.00
175_L 217_G 0.86 0.00
89_R 109_S 0.86 0.00
298_L 82_I 0.86 0.00
290_L 254_I 0.86 0.00
156_D 196_T 0.86 0.00
147_A 53_A 0.86 0.00
312_V 13_L 0.85 0.00
6_G 133_A 0.85 0.00
176_T 212_S 0.85 0.00
15_M 202_G 0.85 0.00
42_A 225_G 0.85 0.00
290_L 250_L 0.85 0.00
268_Q 50_I 0.85 0.00
254_V 28_S 0.85 0.00
172_L 73_L 0.85 0.00
88_E 145_W 0.85 0.00
126_H 56_P 0.85 0.00
108_E 198_N 0.85 0.00
280_Q 225_G 0.85 0.00
7_T 78_I 0.85 0.00
159_L 80_I 0.85 0.00
292_N 254_I 0.84 0.00
203_I 126_A 0.84 0.00
53_T 32_I 0.84 0.00
171_A 204_L 0.84 0.00
122_I 79_L 0.84 0.00
75_D 195_L 0.84 0.00
12_I 50_I 0.84 0.00
293_R 106_M 0.84 0.00
230_I 43_K 0.84 0.00
145_I 102_I 0.84 0.00
256_S 172_L 0.84 0.00
230_I 192_T 0.84 0.00
258_S 7_E 0.84 0.00
6_G 149_L 0.84 0.00
132_T 2_L 0.83 0.00
284_D 109_S 0.83 0.00
24_E 193_L 0.83 0.00
13_L 44_L 0.83 0.00
61_Q 43_K 0.83 0.00
256_S 86_F 0.83 0.00
175_L 113_F 0.83 0.00
272_E 183_G 0.83 0.00
73_A 18_W 0.83 0.00
164_F 212_S 0.83 0.00
158_M 51_T 0.83 0.00
56_L 90_F 0.83 0.00
15_M 25_A 0.83 0.00
254_V 126_A 0.83 0.00
277_N 210_Q 0.83 0.00
112_F 213_I 0.83 0.00
271_R 192_T 0.83 0.00
288_D 251_L 0.82 0.00
206_M 33_L 0.82 0.00
108_E 213_I 0.82 0.00
93_L 239_F 0.82 0.00
212_E 254_I 0.82 0.00
310_L 254_I 0.82 0.00
25_V 145_W 0.82 0.00
26_F 35_E 0.82 0.00
271_R 94_A 0.82 0.00
317_E 183_G 0.82 0.00
286_L 90_F 0.82 0.00
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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