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OPENSEQ.org

FLIM - FLIR
UniProt: P06974 - P33135
Length: 595
Sequences: 459
Seq/Len: 0.79
I_Prob: 0.03

FLIM - Flagellar motor switch protein FliM
Paralog alert: 0.23 [within 20: 0.11] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIM
FLIR - Flagellar biosynthetic protein FliR
Paralog alert: 0.33 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIR
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
321_I 147_I 1.62 0.03
200_V 75_V 1.57 0.02
149_T 188_L 1.56 0.02
180_V 183_G 1.53 0.02
127_V 34_S 1.42 0.01
57_I 206_R 1.38 0.01
317_I 40_K 1.36 0.01
319_H 34_S 1.33 0.01
298_G 186_L 1.31 0.01
72_L 141_N 1.26 0.01
198_I 38_V 1.24 0.01
275_I 63_V 1.22 0.01
315_L 51_T 1.22 0.01
276_L 231_A 1.21 0.01
42_T 159_I 1.21 0.01
179_Y 147_I 1.19 0.01
261_L 233_M 1.18 0.01
273_S 160_G 1.18 0.01
283_V 83_A 1.17 0.01
176_E 84_L 1.17 0.01
154_I 18_W 1.17 0.01
305_Q 126_A 1.16 0.01
135_G 217_G 1.16 0.01
157_M 184_L 1.15 0.01
290_D 52_F 1.15 0.01
287_E 105_Q 1.13 0.01
108_K 206_R 1.13 0.01
275_I 126_A 1.13 0.01
140_K 124_V 1.13 0.01
259_L 123_P 1.12 0.01
291_R 108_L 1.12 0.01
264_N 6_S 1.12 0.01
68_G 100_E 1.11 0.01
219_L 167_N 1.11 0.01
128_D 217_G 1.11 0.01
284_L 134_L 1.10 0.01
210_N 43_K 1.10 0.01
317_I 74_A 1.10 0.01
261_L 47_A 1.09 0.01
286_I 119_H 1.09 0.01
294_A 201_L 1.08 0.01
317_I 43_K 1.08 0.01
284_L 132_L 1.07 0.01
271_R 227_S 1.06 0.01
270_L 126_A 1.06 0.01
103_N 187_A 1.06 0.01
206_V 254_I 1.06 0.01
70_F 108_L 1.05 0.01
310_N 184_L 1.04 0.01
286_I 43_K 1.04 0.01
209_G 217_G 1.04 0.01
296_V 34_S 1.04 0.01
145_E 91_A 1.04 0.01
297_D 35_E 1.04 0.01
128_D 219_P 1.04 0.01
85_R 21_L 1.03 0.01
284_L 50_I 1.03 0.01
316_R 76_Q 1.03 0.01
217_I 200_A 1.03 0.01
277_K 39_P 1.03 0.01
160_L 212_S 1.03 0.01
286_I 159_I 1.02 0.01
274_Q 253_D 1.02 0.01
290_D 23_V 1.02 0.01
317_I 194_L 1.02 0.01
78_D 184_L 1.01 0.01
275_I 150_L 1.01 0.01
86_I 248_F 1.01 0.01
258_Q 214_F 1.01 0.01
182_S 108_L 1.01 0.01
115_L 203_L 1.00 0.01
126_A 126_A 1.00 0.00
72_L 244_F 1.00 0.00
227_L 240_C 1.00 0.00
18_D 207_M 1.00 0.00
206_V 213_I 0.99 0.00
57_I 128_I 0.99 0.00
215_F 79_L 0.99 0.00
148_H 213_I 0.99 0.00
117_V 233_M 0.99 0.00
117_V 197_L 0.98 0.00
35_I 40_K 0.98 0.00
254_V 43_K 0.98 0.00
153_V 89_Q 0.98 0.00
271_R 91_A 0.98 0.00
111_R 141_N 0.98 0.00
128_D 216_I 0.97 0.00
321_I 91_A 0.97 0.00
294_A 146_L 0.97 0.00
121_S 231_A 0.97 0.00
90_H 138_L 0.97 0.00
36_R 95_V 0.97 0.00
283_V 186_L 0.97 0.00
209_G 119_H 0.96 0.00
32_E 128_I 0.96 0.00
274_Q 90_F 0.96 0.00
91_E 32_I 0.96 0.00
23_D 155_H 0.96 0.00
198_I 104_L 0.96 0.00
317_I 187_A 0.96 0.00
214_E 249_N 0.96 0.00
118_F 82_I 0.96 0.00
317_I 242_H 0.96 0.00
315_L 19_P 0.96 0.00
60_R 198_N 0.96 0.00
84_I 27_I 0.95 0.00
89_Y 160_G 0.95 0.00
266_A 146_L 0.95 0.00
268_I 192_T 0.95 0.00
151_Q 226_I 0.95 0.00
284_L 33_L 0.94 0.00
255_Q 141_N 0.94 0.00
292_I 49_M 0.94 0.00
308_T 206_R 0.94 0.00
275_I 95_V 0.94 0.00
122_L 17_F 0.94 0.00
292_I 20_L 0.94 0.00
251_V 7_E 0.93 0.00
53_A 128_I 0.93 0.00
160_L 187_A 0.93 0.00
118_F 206_R 0.93 0.00
292_I 45_G 0.93 0.00
172_I 109_S 0.93 0.00
20_E 226_I 0.93 0.00
77_P 201_L 0.93 0.00
270_L 58_L 0.92 0.00
181_R 136_L 0.92 0.00
315_L 172_L 0.92 0.00
166_S 27_I 0.92 0.00
265_F 44_L 0.92 0.00
316_R 73_L 0.92 0.00
200_V 188_L 0.92 0.00
258_Q 199_L 0.92 0.00
105_I 206_R 0.92 0.00
241_N 124_V 0.92 0.00
278_L 29_T 0.92 0.00
316_R 125_L 0.91 0.00
277_K 52_F 0.91 0.00
168_A 23_V 0.91 0.00
182_S 218_F 0.91 0.00
305_Q 231_A 0.91 0.00
274_Q 224_V 0.91 0.00
228_R 198_N 0.91 0.00
130_L 201_L 0.91 0.00
2_G 43_K 0.91 0.00
235_P 218_F 0.91 0.00
269_S 75_V 0.91 0.00
265_F 109_S 0.90 0.00
270_L 197_L 0.90 0.00
111_R 88_M 0.90 0.00
219_L 235_L 0.90 0.00
271_R 17_F 0.90 0.00
218_C 154_F 0.90 0.00
15_L 105_Q 0.90 0.00
69_L 6_S 0.89 0.00
206_V 251_L 0.89 0.00
317_I 96_R 0.89 0.00
275_I 71_L 0.89 0.00
33_S 213_I 0.89 0.00
296_V 36_R 0.88 0.00
292_I 86_F 0.88 0.00
116_V 192_T 0.88 0.00
126_A 46_L 0.88 0.00
24_E 90_F 0.88 0.00
149_T 159_I 0.88 0.00
95_N 58_L 0.88 0.00
69_L 181_L 0.88 0.00
284_L 219_P 0.88 0.00
154_I 84_L 0.88 0.00
175_L 4_V 0.88 0.00
191_I 202_G 0.88 0.00
266_A 107_G 0.87 0.00
215_F 141_N 0.87 0.00
113_T 80_I 0.87 0.00
78_D 108_L 0.87 0.00
46_V 221_T 0.87 0.00
83_A 109_S 0.87 0.00
172_I 183_G 0.87 0.00
321_I 245_S 0.87 0.00
231_L 202_G 0.87 0.00
251_V 129_M 0.87 0.00
9_A 46_L 0.87 0.00
270_L 66_F 0.86 0.00
123_V 108_L 0.86 0.00
23_D 78_I 0.86 0.00
180_V 46_L 0.86 0.00
168_A 28_S 0.86 0.00
11_I 146_L 0.86 0.00
276_L 73_L 0.86 0.00
270_L 43_K 0.86 0.00
32_E 57_S 0.86 0.00
56_I 43_K 0.86 0.00
170_K 6_S 0.86 0.00
292_I 199_L 0.86 0.00
196_N 186_L 0.85 0.00
83_A 223_T 0.85 0.00
1_M 26_L 0.85 0.00
227_L 123_P 0.85 0.00
152_R 110_F 0.85 0.00
316_R 48_M 0.85 0.00
305_Q 5_T 0.85 0.00
287_E 213_I 0.85 0.00
123_V 110_F 0.85 0.00
163_E 2_L 0.85 0.00
263_A 216_I 0.85 0.00
317_I 184_L 0.85 0.00
157_M 227_S 0.85 0.00
134_D 200_A 0.85 0.00
272_L 178_L 0.85 0.00
301_V 106_M 0.84 0.00
20_E 39_P 0.84 0.00
110_L 29_T 0.84 0.00
240_R 148_S 0.84 0.00
79_I 123_P 0.84 0.00
69_L 89_Q 0.84 0.00
141_V 51_T 0.84 0.00
167_D 226_I 0.84 0.00
12_D 179_I 0.84 0.00
175_L 8_Q 0.84 0.00
284_L 141_N 0.84 0.00
200_V 165_N 0.84 0.00
162_L 109_S 0.84 0.00
274_Q 181_L 0.84 0.00
65_F 103_G 0.84 0.00
279_N 156_T 0.84 0.00
53_A 73_L 0.84 0.00
176_E 39_P 0.84 0.00
178_E 154_F 0.84 0.00
279_N 26_L 0.84 0.00
23_D 84_L 0.84 0.00
316_R 228_L 0.84 0.00
94_R 224_V 0.84 0.00
199_V 176_G 0.84 0.00
173_N 43_K 0.84 0.00
177_V 175_A 0.83 0.00
261_L 68_F 0.83 0.00
310_N 195_L 0.83 0.00
175_L 39_P 0.83 0.00
251_V 103_G 0.83 0.00
122_L 103_G 0.83 0.00
83_A 231_A 0.83 0.00
204_F 111_A 0.83 0.00
105_I 198_N 0.83 0.00
276_L 92_F 0.83 0.00
91_E 42_V 0.83 0.00
153_V 206_R 0.83 0.00
320_L 146_L 0.82 0.00
219_L 213_I 0.82 0.00
284_L 27_I 0.82 0.00
86_I 87_T 0.82 0.00
292_I 172_L 0.82 0.00
122_L 225_G 0.82 0.00
62_A 23_V 0.82 0.00
20_E 27_I 0.82 0.00
103_N 205_N 0.82 0.00
196_N 43_K 0.82 0.00
172_I 57_S 0.82 0.00
219_L 84_L 0.82 0.00
148_H 104_L 0.81 0.00
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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