May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
ecKM
Genes: A B A+B
Length: 912 445 1224
Sequences: 814 807 649
Seq/Len: 0.89 1.81 0.53
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.87
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show HHblits results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.00 0.00 0.01
2 0.00 0.00 0.29
5 0.00 0.00 0.33
10 0.00 0.00 0.41
20 0.02 0.00 0.48
100 0.04 0.02 0.48
∞ 0.13 0.11 0.50
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
798_V 162_W 1.68 0.71 0.01
775_L 154_M 1.55 0.62 0.01
144_E 14_L 1.52 0.59 0.00
673_R 168_T 1.52 0.59 0.00
381_F 67_R 1.46 0.55 0.00
798_V 387_I 1.45 0.54 0.00
143_Q 415_A 1.44 0.54 0.00
797_Q 387_I 1.44 0.53 0.00
146_Q 397_I 1.43 0.53 0.00
540_L 206_H 1.41 0.51 0.00
847_E 395_A 1.40 0.50 0.00
180_V 145_V 1.33 0.45 0.00
387_L 5_R 1.31 0.44 0.00
432_W 436_K 1.31 0.43 0.00
125_G 290_Y 1.28 0.41 0.00
678_F 351_S 1.27 0.41 0.00
444_L 248_P 1.27 0.40 0.00
360_R 167_V 1.26 0.40 0.00
497_R 399_L 1.25 0.39 0.00
798_V 153_R 1.24 0.38 0.00
297_L 259_R 1.22 0.37 0.00
293_V 60_N 1.21 0.36 0.00
904_A 346_W 1.19 0.34 0.00
125_G 261_P 1.19 0.34 0.00
689_L 329_M 1.19 0.34 0.00
270_I 243_L 1.19 0.34 0.00
619_P 102_A 1.18 0.34 0.00
315_S 85_V 1.18 0.34 0.00
586_M 269_A 1.18 0.34 0.00
903_D 49_F 1.18 0.34 0.00
725_Q 151_T 1.18 0.33 0.00
906_L 104_P 1.17 0.33 0.00
678_F 22_Q 1.16 0.33 0.00
362_L 167_V 1.16 0.32 0.00
206_V 430_A 1.16 0.32 0.00
798_V 243_L 1.15 0.32 0.00
639_I 262_E 1.15 0.31 0.00
455_N 161_A 1.15 0.31 0.00
565_S 145_V 1.15 0.31 0.00
718_L 397_I 1.13 0.30 0.00
622_F 204_L 1.13 0.30 0.00
313_V 378_V 1.12 0.30 0.00
621_M 361_K 1.12 0.30 0.00
879_W 188_L 1.12 0.30 0.00
380_S 238_W 1.12 0.29 0.00
460_L 137_G 1.11 0.29 0.00
619_P 157_Q 1.11 0.29 0.00
890_A 167_V 1.10 0.28 0.00
577_N 321_I 1.10 0.28 0.00
558_D 257_P 1.09 0.28 0.00
214_G 263_L 1.09 0.28 0.00
122_L 213_Q 1.09 0.28 0.00
339_P 250_L 1.09 0.28 0.00
569_L 237_F 1.09 0.27 0.00
599_L 334_L 1.08 0.27 0.00
650_L 441_A 1.08 0.27 0.00
440_Q 339_L 1.08 0.27 0.00
151_L 163_L 1.08 0.27 0.00
855_V 429_P 1.08 0.27 0.00
649_V 262_E 1.08 0.27 0.00
179_I 127_S 1.08 0.27 0.00
462_D 443_L 1.08 0.27 0.00
677_D 266_R 1.07 0.27 0.00
693_K 61_A 1.06 0.26 0.00
460_L 378_V 1.06 0.26 0.00
143_Q 374_V 1.06 0.26 0.00
513_F 1_M 1.06 0.26 0.00
844_L 314_L 1.05 0.26 0.00
735_V 284_V 1.05 0.25 0.00
626_A 429_P 1.05 0.25 0.00
523_Q 99_I 1.04 0.25 0.00
788_L 324_K 1.04 0.25 0.00
219_L 178_W 1.04 0.25 0.00
209_C 86_C 1.04 0.25 0.00
344_Q 61_A 1.04 0.24 0.00
497_R 221_E 1.03 0.24 0.00
310_A 277_T 1.03 0.24 0.00
339_P 387_I 1.03 0.24 0.00
541_A 264_L 1.02 0.24 0.00
156_P 14_L 1.02 0.24 0.00
322_E 149_N 1.02 0.24 0.00
468_L 61_A 1.02 0.24 0.00
285_R 336_D 1.02 0.24 0.00
806_A 413_D 1.02 0.24 0.00
412_L 237_F 1.02 0.24 0.00
593_Q 334_L 1.02 0.24 0.00
863_A 378_V 1.02 0.24 0.00
536_G 170_L 1.02 0.24 0.00
622_F 266_R 1.02 0.23 0.00
875_L 154_M 1.01 0.23 0.00
539_L 328_V 1.01 0.23 0.00
327_H 76_T 1.01 0.23 0.00
468_L 413_D 1.01 0.23 0.00
287_R 85_V 1.01 0.23 0.00
438_M 441_A 1.01 0.23 0.00
147_G 165_C 1.01 0.23 0.00
362_L 389_P 1.01 0.23 0.00
199_L 310_L 1.00 0.23 0.00
219_L 56_L 1.00 0.23 0.00
351_P 207_H 1.00 0.23 0.00
845_G 440_F 1.00 0.23 0.00
460_L 426_F 1.00 0.23 0.00
851_F 389_P 1.00 0.22 0.00
381_F 77_E 1.00 0.22 0.00
314_F 44_V 1.00 0.22 0.00
134_T 362_F 1.00 0.22 0.00
726_G 67_R 0.99 0.22 0.00
251_L 374_V 0.99 0.22 0.00
366_A 67_R 0.99 0.22 0.00
452_Y 358_L 0.99 0.22 0.00
699_D 126_K 0.99 0.22 0.00
461_R 313_S 0.99 0.22 0.00
203_S 383_S 0.98 0.21 0.00
204_R 428_T 0.98 0.21 0.00
709_D 165_C 0.98 0.21 0.00
675_F 77_E 0.98 0.21 0.00
854_T 434_D 0.98 0.21 0.00
677_D 408_L 0.98 0.21 0.00
513_F 307_N 0.98 0.21 0.00
129_E 60_N 0.98 0.21 0.00
897_F 434_D 0.98 0.21 0.00
773_L 112_N 0.98 0.21 0.00
879_W 158_E 0.98 0.21 0.00
514_S 291_H 0.98 0.21 0.00
670_L 76_T 0.98 0.21 0.00
125_G 292_H 0.98 0.21 0.00
545_S 68_F 0.98 0.21 0.00
125_G 398_P 0.98 0.21 0.00
118_I 265_Y 0.97 0.21 0.00
363_A 61_A 0.97 0.21 0.00
556_T 5_R 0.97 0.21 0.00
154_G 261_P 0.97 0.21 0.00
418_S 203_E 0.96 0.21 0.00
313_V 71_G 0.96 0.20 0.00
595_A 68_F 0.96 0.20 0.00
353_R 415_A 0.96 0.20 0.00
851_F 102_A 0.96 0.20 0.00
170_R 84_P 0.96 0.20 0.00
818_L 334_L 0.96 0.20 0.00
206_V 362_F 0.96 0.20 0.00
162_A 426_F 0.96 0.20 0.00
319_V 402_E 0.96 0.20 0.00
290_I 17_Q 0.96 0.20 0.00
564_Q 99_I 0.96 0.20 0.00
682_W 384_G 0.95 0.20 0.00
302_R 362_F 0.95 0.20 0.00
128_S 294_T 0.95 0.20 0.00
459_L 167_V 0.95 0.20 0.00
622_F 333_A 0.95 0.20 0.00
180_V 298_V 0.95 0.20 0.00
182_V 165_C 0.95 0.20 0.00
500_L 42_W 0.95 0.20 0.00
903_D 235_S 0.95 0.20 0.00
312_I 121_R 0.95 0.20 0.00
588_A 68_F 0.95 0.20 0.00
648_W 367_K 0.95 0.20 0.00
809_S 321_I 0.94 0.20 0.00
207_S 393_V 0.94 0.20 0.00
879_W 248_P 0.94 0.19 0.00
796_T 87_D 0.94 0.19 0.00
130_V 290_Y 0.94 0.19 0.00
262_L 190_T 0.94 0.19 0.00
213_L 391_T 0.94 0.19 0.00
155_D 107_N 0.94 0.19 0.00
698_S 59_L 0.94 0.19 0.00
511_A 67_R 0.94 0.19 0.00
817_L 85_V 0.94 0.19 0.00
682_W 394_P 0.94 0.19 0.00
718_L 257_P 0.94 0.19 0.00
452_Y 70_D 0.94 0.19 0.00
626_A 102_A 0.94 0.19 0.00
660_P 356_H 0.94 0.19 0.00
282_L 374_V 0.94 0.19 0.00
788_L 275_L 0.94 0.19 0.00
225_Q 40_H 0.94 0.19 0.00
438_M 277_T 0.94 0.19 0.00
686_L 185_I 0.94 0.19 0.00
210_C 162_W 0.94 0.19 0.00
912_Y 259_R 0.94 0.19 0.00
203_S 33_V 0.93 0.19 0.00
603_T 368_A 0.93 0.19 0.00
360_R 243_L 0.93 0.19 0.00
679_G 335_H 0.93 0.19 0.00
503_A 23_A 0.93 0.19 0.00
798_V 163_L 0.93 0.19 0.00
578_S 347_L 0.93 0.19 0.00
154_G 290_Y 0.93 0.19 0.00
678_F 52_S 0.93 0.19 0.00
516_T 423_R 0.93 0.19 0.00
793_T 442_V 0.93 0.19 0.00
875_L 439_L 0.93 0.19 0.00
569_L 442_V 0.93 0.19 0.00
350_Q 438_E 0.93 0.19 0.00
875_L 59_L 0.93 0.19 0.00
456_A 393_V 0.93 0.19 0.00
543_Y 397_I 0.92 0.18 0.00
468_L 178_W 0.92 0.18 0.00
891_F 306_L 0.92 0.18 0.00
673_R 184_F 0.92 0.18 0.00
804_Q 44_V 0.92 0.18 0.00
610_R 351_S 0.92 0.18 0.00
562_V 148_H 0.92 0.18 0.00
181_W 308_R 0.92 0.18 0.00
120_I 10_D 0.92 0.18 0.00
707_M 434_D 0.92 0.18 0.00
174_R 424_C 0.92 0.18 0.00
903_D 269_A 0.92 0.18 0.00
464_A 170_L 0.92 0.18 0.00
736_T 402_E 0.92 0.18 0.00
119_R 18_Q 0.92 0.18 0.00
350_Q 237_F 0.92 0.18 0.00
701_T 12_A 0.92 0.18 0.00
381_F 403_N 0.92 0.18 0.00
623_T 384_G 0.92 0.18 0.00
622_F 438_E 0.92 0.18 0.00
219_L 37_G 0.92 0.18 0.00
162_A 302_L 0.92 0.18 0.00
795_V 19_F 0.92 0.18 0.00
680_N 321_I 0.91 0.18 0.00
841_A 349_V 0.91 0.18 0.00
338_L 60_N 0.91 0.18 0.00
180_V 196_S 0.91 0.18 0.00
282_L 210_A 0.91 0.18 0.00
705_T 298_V 0.91 0.18 0.00
910_A 211_R 0.91 0.18 0.00
457_H 99_I 0.91 0.18 0.00
718_L 293_E 0.91 0.18 0.00
565_S 314_L 0.91 0.18 0.00
213_L 102_A 0.91 0.18 0.00
225_Q 19_F 0.91 0.18 0.00
897_F 268_L 0.91 0.18 0.00
879_W 381_A 0.91 0.18 0.00
179_I 48_E 0.91 0.18 0.00
622_F 386_I 0.91 0.18 0.00
875_L 271_L 0.91 0.18 0.00
618_V 395_A 0.90 0.18 0.00
559_E 295_P 0.90 0.18 0.00
122_L 280_L 0.90 0.18 0.00
618_V 273_G 0.90 0.18 0.00
599_L 330_W 0.90 0.17 0.00
867_V 49_F 0.90 0.17 0.00
205_A 290_Y 0.90 0.17 0.00
713_S 243_L 0.90 0.17 0.00
802_L 55_P 0.90 0.17 0.00
648_W 290_Y 0.90 0.17 0.00
461_R 245_S 0.90 0.17 0.00
388_V 123_R 0.90 0.17 0.00
621_M 56_L 0.90 0.17 0.00
769_F 240_L 0.90 0.17 0.00
703_Q 442_V 0.90 0.17 0.00
386_S 98_D 0.90 0.17 0.00
214_G 401_L 0.90 0.17 0.00
151_L 68_F 0.90 0.17 0.00
772_V 377_V 0.90 0.17 0.00
351_P 441_A 0.90 0.17 0.00
499_Y 369_G 0.90 0.17 0.00
149_L 18_Q 0.90 0.17 0.00
562_V 266_R 0.90 0.17 0.00
219_L 145_V 0.90 0.17 0.00
887_W 385_V 0.90 0.17 0.00
541_A 55_P 0.89 0.17 0.00
713_S 397_I 0.89 0.17 0.00
502_L 374_V 0.89 0.17 0.00
620_G 186_P 0.89 0.17 0.00
377_M 269_A 0.89 0.17 0.00
269_Q 273_G 0.89 0.17 0.00
855_V 316_S 0.89 0.17 0.00
180_V 268_L 0.89 0.17 0.00
895_Y 278_F 0.89 0.17 0.00
270_I 153_R 0.89 0.17 0.00
677_D 302_L 0.89 0.17 0.00
622_F 285_D 0.89 0.17 0.00
883_V 141_S 0.89 0.17 0.00
566_R 283_N 0.89 0.17 0.00
891_F 79_A 0.89 0.17 0.00
372_A 368_A 0.89 0.17 0.00
408_R 439_L 0.89 0.17 0.00
115_G 76_T 0.89 0.17 0.00
882_A 424_C 0.89 0.17 0.00
679_G 381_A 0.89 0.17 0.00
251_L 385_V 0.89 0.17 0.00
242_L 86_C 0.89 0.17 0.00
363_A 157_Q 0.89 0.17 0.00
462_D 440_F 0.89 0.17 0.00
464_A 362_F 0.89 0.17 0.00
176_A 399_L 0.89 0.17 0.00
329_W 18_Q 0.89 0.17 0.00
249_D 46_A 0.88 0.17 0.00
438_M 244_N 0.88 0.17 0.00
581_M 77_E 0.88 0.17 0.00
864_W 443_L 0.88 0.17 0.00
312_I 160_A 0.88 0.17 0.00
209_C 377_V 0.88 0.17 0.00
270_I 126_K 0.88 0.17 0.00
619_P 55_P 0.88 0.17 0.00
301_L 397_I 0.88 0.17 0.00
372_A 99_I 0.88 0.17 0.00
438_M 427_Y 0.88 0.17 0.00
686_L 408_L 0.88 0.17 0.00
151_L 335_H 0.88 0.17 0.00
671_T 232_A 0.88 0.17 0.00
539_L 395_A 0.88 0.17 0.00
903_D 155_A 0.88 0.17 0.00
201_R 39_A 0.88 0.17 0.00
133_L 211_R 0.88 0.17 0.00
719_M 63_R 0.88 0.17 0.00
912_Y 268_L 0.88 0.17 0.00
577_N 109_N 0.88 0.16 0.00
377_M 238_W 0.88 0.16 0.00
408_R 201_L 0.88 0.16 0.00
236_Q 50_D 0.88 0.16 0.00
270_I 160_A 0.88 0.16 0.00
765_L 150_L 0.88 0.16 0.00
235_T 302_L 0.87 0.16 0.00
555_L 334_L 0.87 0.16 0.00
638_V 99_I 0.87 0.16 0.00
690_H 45_V 0.87 0.16 0.00
708_A 193_A 0.87 0.16 0.00
354_T 176_G 0.87 0.16 0.00
215_W 319_V 0.87 0.16 0.00
351_P 385_V 0.87 0.16 0.00
775_L 424_C 0.87 0.16 0.00
317_A 208_L 0.87 0.16 0.00
666_L 382_L 0.87 0.16 0.00
193_P 165_C 0.87 0.16 0.00
671_T 154_M 0.87 0.16 0.00
116_R 13_F 0.87 0.16 0.00
590_V 103_L 0.87 0.16 0.00
497_R 439_L 0.87 0.16 0.00
682_W 405_Y 0.87 0.16 0.00
512_W 19_F 0.87 0.16 0.00
501_M 290_Y 0.87 0.16 0.00
248_S 48_E 0.87 0.16 0.00
318_T 415_A 0.87 0.16 0.00
701_T 391_T 0.87 0.16 0.00
648_W 261_P 0.87 0.16 0.00
151_L 185_I 0.87 0.16 0.00
892_S 157_Q 0.87 0.16 0.00
182_V 213_Q 0.86 0.16 0.00
583_Y 437_L 0.86 0.16 0.00
156_P 321_I 0.86 0.16 0.00
237_P 359_Q 0.86 0.16 0.00
673_R 142_E 0.86 0.16 0.00
539_L 440_F 0.86 0.16 0.00
181_W 298_V 0.86 0.16 0.00
464_A 319_V 0.86 0.16 0.00
586_M 275_L 0.86 0.16 0.00
314_F 181_D 0.86 0.16 0.00
648_W 323_L 0.86 0.16 0.00
146_Q 422_G 0.86 0.16 0.00
444_L 52_S 0.86 0.16 0.00
708_A 362_F 0.86 0.16 0.00
189_T 378_V 0.86 0.16 0.00
286_F 288_P 0.86 0.16 0.00
498_L 64_L 0.86 0.16 0.00
131_E 10_D 0.86 0.16 0.00
517_L 189_L 0.86 0.16 0.00
618_V 317_R 0.86 0.16 0.00
569_L 16_P 0.86 0.16 0.00
452_Y 398_P 0.86 0.16 0.00
497_R 165_C 0.86 0.16 0.00
905_S 234_V 0.86 0.16 0.00
159_P 96_L 0.86 0.15 0.00
569_L 235_S 0.86 0.15 0.00
219_L 289_A 0.86 0.15 0.00
467_H 131_N 0.86 0.15 0.00
622_F 272_A 0.85 0.15 0.00
283_A 14_L 0.85 0.15 0.00
591_A 193_A 0.85 0.15 0.00
236_Q 167_V 0.85 0.15 0.00
437_G 323_L 0.85 0.15 0.00
700_V 361_K 0.85 0.15 0.00
758_E 265_Y 0.85 0.15 0.00
767_T 37_G 0.85 0.15 0.00
452_Y 244_N 0.85 0.15 0.00
888_N 332_G 0.85 0.15 0.00
256_Q 391_T 0.85 0.15 0.00
718_L 27_V 0.85 0.15 0.00
344_Q 81_N 0.85 0.15 0.00
734_A 165_C 0.85 0.15 0.00
682_W 43_G 0.85 0.15 0.00
872_A 442_V 0.85 0.15 0.00
349_L 102_A 0.85 0.15 0.00
604_G 24_A 0.85 0.15 0.00
700_V 295_P 0.85 0.15 0.00
907_P 248_P 0.85 0.15 0.00
319_V 77_E 0.85 0.15 0.00
586_M 66_V 0.85 0.15 0.00
912_Y 99_I 0.85 0.15 0.00
409_L 385_V 0.85 0.15 0.00
676_A 184_F 0.85 0.15 0.00
893_G 167_V 0.85 0.15 0.00
392_Q 167_V 0.85 0.15 0.00
649_V 268_L 0.85 0.15 0.00
570_L 326_K 0.85 0.15 0.00
789_Q 53_L 0.85 0.15 0.00
776_M 380_V 0.85 0.15 0.00
911_K 360_T 0.85 0.15 0.00
201_R 176_G 0.84 0.15 0.00
413_L 327_G 0.84 0.15 0.00
369_L 289_A 0.84 0.15 0.00
558_D 397_I 0.84 0.15 0.00
258_M 104_P 0.84 0.15 0.00
214_G 264_L 0.84 0.15 0.00
150_L 126_K 0.84 0.15 0.00
270_I 13_F 0.84 0.15 0.00
147_G 340_R 0.84 0.15 0.00
345_L 185_I 0.84 0.15 0.00
689_L 266_R 0.84 0.15 0.00
735_V 23_A 0.84 0.15 0.00
338_L 49_F 0.84 0.15 0.00
627_W 178_W 0.84 0.15 0.00
648_W 262_E 0.84 0.15 0.00
446_A 145_V 0.84 0.15 0.00
185_G 238_W 0.84 0.15 0.00
841_A 279_S 0.84 0.15 0.00
673_R 233_D 0.84 0.15 0.00
300_L 243_L 0.84 0.15 0.00
360_R 212_R 0.84 0.15 0.00
181_W 402_E 0.84 0.15 0.00
190_L 368_A 0.84 0.15 0.00
171_L 68_F 0.84 0.15 0.00
686_L 437_L 0.84 0.15 0.00
155_D 14_L 0.84 0.15 0.00
872_A 68_F 0.84 0.15 0.00
112_R 385_V 0.83 0.15 0.00
424_Y 232_A 0.83 0.15 0.00
851_F 348_S 0.83 0.15 0.00
894_R 232_A 0.83 0.15 0.00
863_A 285_D 0.83 0.15 0.00
878_R 361_K 0.83 0.15 0.00
236_Q 259_R 0.83 0.15 0.00
408_R 295_P 0.83 0.15 0.00
202_V 48_E 0.83 0.15 0.00
391_V 385_V 0.83 0.15 0.00
145_E 271_L 0.83 0.15 0.00
254_Q 178_W 0.83 0.14 0.00
660_P 255_D 0.83 0.14 0.00
412_L 104_P 0.83 0.14 0.00
469_E 23_A 0.83 0.14 0.00
789_Q 174_A 0.83 0.14 0.00
316_P 261_P 0.83 0.14 0.00
670_L 104_P 0.83 0.14 0.00
638_V 264_L 0.83 0.14 0.00
456_A 374_V 0.83 0.14 0.00
499_Y 70_D 0.83 0.14 0.00
217_L 362_F 0.83 0.14 0.00
321_G 285_D 0.83 0.14 0.00
677_D 85_V 0.83 0.14 0.00
544_A 84_P 0.83 0.14 0.00
222_W 49_F 0.83 0.14 0.00
855_V 87_D 0.83 0.14 0.00
879_W 184_F 0.83 0.14 0.00
475_F 143_V 0.82 0.14 0.00
903_D 329_M 0.82 0.14 0.00
237_P 331_E 0.82 0.14 0.00
370_M 169_R 0.82 0.14 0.00
439_N 365_L 0.82 0.14 0.00
315_S 178_W 0.82 0.14 0.00
590_V 361_K 0.82 0.14 0.00
772_V 276_L 0.82 0.14 0.00
148_T 415_A 0.82 0.14 0.00
696_T 344_D 0.82 0.14 0.00
133_L 402_E 0.82 0.14 0.00
788_L 265_Y 0.82 0.14 0.00
571_R 200_E 0.82 0.14 0.00
627_W 207_H 0.82 0.14 0.00
122_L 176_G 0.82 0.14 0.00
715_L 124_R 0.82 0.14 0.00
796_T 167_V 0.82 0.14 0.00
722_L 185_I 0.82 0.14 0.00
351_P 99_I 0.82 0.14 0.00
765_L 52_S 0.82 0.14 0.00
279_L 207_H 0.82 0.14 0.00
222_W 147_R 0.82 0.14 0.00
176_A 309_L 0.82 0.14 0.00
175_P 367_K 0.82 0.14 0.00
131_E 236_L 0.82 0.14 0.00
879_W 415_A 0.82 0.14 0.00
897_F 424_C 0.82 0.14 0.00
316_P 21_Q 0.82 0.14 0.00
381_F 299_F 0.82 0.14 0.00
142_W 423_R 0.82 0.14 0.00
188_E 16_P 0.82 0.14 0.00
870_P 238_W 0.82 0.14 0.00
903_D 397_I 0.82 0.14 0.00
326_R 77_E 0.82 0.14 0.00
347_V 61_A 0.82 0.14 0.00
907_P 5_R 0.82 0.14 0.00
596_D 412_T 0.82 0.14 0.00
553_W 44_V 0.81 0.14 0.00
775_L 107_N 0.81 0.14 0.00
557_A 23_A 0.81 0.14 0.00
897_F 273_G 0.81 0.14 0.00
646_M 381_A 0.81 0.14 0.00
645_E 19_F 0.81 0.14 0.00
130_V 261_P 0.81 0.14 0.00
635_I 190_T 0.81 0.14 0.00
875_L 3_I 0.81 0.14 0.00
388_V 136_A 0.81 0.14 0.00
650_L 80_D 0.81 0.14 0.00
845_G 382_L 0.81 0.14 0.00
770_G 26_D 0.81 0.14 0.00
482_S 244_N 0.81 0.14 0.00
508_M 381_A 0.81 0.14 0.00
692_R 165_C 0.81 0.14 0.00
891_F 33_V 0.81 0.14 0.00
419_L 358_L 0.81 0.14 0.00
381_F 271_L 0.81 0.14 0.00
310_A 125_W 0.81 0.14 0.00
206_V 431_S 0.81 0.14 0.00
853_Q 58_R 0.81 0.14 0.00
713_S 42_W 0.81 0.14 0.00
313_V 180_R 0.81 0.14 0.00
182_V 48_E 0.81 0.14 0.00
621_M 185_I 0.81 0.14 0.00
370_M 29_L 0.81 0.14 0.00
628_E 5_R 0.81 0.14 0.00
586_M 374_V 0.81 0.14 0.00
664_E 149_N 0.81 0.14 0.00
912_Y 203_E 0.80 0.14 0.00
154_G 398_P 0.80 0.14 0.00
378_V 265_Y 0.80 0.14 0.00
801_R 376_E 0.80 0.14 0.00
352_S 53_L 0.80 0.14 0.00
447_V 324_K 0.80 0.14 0.00
376_G 145_V 0.80 0.13 0.00
189_T 47_A 0.80 0.13 0.00
117_K 201_L 0.80 0.13 0.00
562_V 99_I 0.80 0.13 0.00
149_L 418_M 0.80 0.13 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
Page generated in 0.3769 seconds.