May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
maca-b
Genes: A B A+B
Length: 371 648 969
Sequences: 15016 450 64
Seq/Len: 40.47 0.69 0.07
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.95
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show HHblits results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.02 0.02 0.06
2 0.02 0.02 0.06
5 0.04 0.02 0.06
10 0.05 0.02 0.06
20 0.07 0.02 0.07
100 0.13 0.03 0.08
∞ 0.20 0.05 0.13
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
229_V 292_V 1.92 0.29 0.00
229_V 525_L 1.89 0.28 0.00
72_L 296_A 1.84 0.27 0.00
237_L 296_A 1.81 0.25 0.00
182_D 630_W 1.74 0.23 0.00
358_D 9_D 1.67 0.21 0.00
89_L 557_I 1.67 0.21 0.00
350_I 259_T 1.66 0.21 0.00
111_L 433_V 1.66 0.20 0.00
224_L 269_K 1.65 0.20 0.00
257_G 631_L 1.52 0.17 0.00
46_L 67_V 1.52 0.17 0.00
172_A 598_L 1.51 0.17 0.00
87_Q 33_A 1.47 0.15 0.00
201_Q 18_D 1.42 0.14 0.00
349_E 348_A 1.42 0.14 0.00
36_Y 221_I 1.42 0.14 0.00
264_P 506_N 1.40 0.14 0.00
218_A 163_G 1.39 0.14 0.00
291_D 109_V 1.38 0.14 0.00
270_N 296_A 1.37 0.13 0.00
215_L 511_L 1.37 0.13 0.00
191_A 433_V 1.36 0.13 0.00
274_F 525_L 1.36 0.13 0.00
96_Q 296_A 1.36 0.13 0.00
101_I 405_D 1.35 0.13 0.00
349_E 102_T 1.35 0.13 0.00
180_N 570_Q 1.33 0.12 0.00
328_L 216_I 1.33 0.12 0.00
87_Q 197_V 1.33 0.12 0.00
89_L 511_L 1.33 0.12 0.00
89_L 297_K 1.32 0.12 0.00
274_F 605_W 1.32 0.12 0.00
108_L 109_V 1.31 0.12 0.00
199_T 580_C 1.31 0.12 0.00
248_L 538_I 1.30 0.12 0.00
348_V 135_E 1.30 0.12 0.00
199_T 200_V 1.28 0.11 0.00
243_A 613_A 1.27 0.11 0.00
290_L 28_S 1.27 0.11 0.00
246_T 213_V 1.27 0.11 0.00
345_D 607_I 1.27 0.11 0.00
199_T 530_V 1.26 0.11 0.00
358_D 259_T 1.26 0.11 0.00
30_N 177_S 1.25 0.11 0.00
225_V 261_A 1.25 0.11 0.00
56_L 257_A 1.25 0.11 0.00
135_L 269_K 1.25 0.11 0.00
109_M 627_L 1.24 0.11 0.00
309_I 358_L 1.24 0.11 0.00
72_L 292_V 1.23 0.11 0.00
363_G 646_A 1.23 0.11 0.00
184_T 301_L 1.23 0.11 0.00
210_Q 297_K 1.23 0.11 0.00
298_I 283_I 1.23 0.10 0.00
188_A 208_A 1.22 0.10 0.00
205_V 580_C 1.22 0.10 0.00
217_L 443_M 1.22 0.10 0.00
215_L 646_A 1.22 0.10 0.00
279_F 296_A 1.21 0.10 0.00
160_I 197_V 1.21 0.10 0.00
225_V 553_R 1.21 0.10 0.00
46_L 5_L 1.20 0.10 0.00
264_P 285_S 1.20 0.10 0.00
101_I 591_S 1.20 0.10 0.00
229_V 605_W 1.19 0.10 0.00
272_A 322_D 1.19 0.10 0.00
237_L 292_V 1.19 0.10 0.00
243_A 112_V 1.19 0.10 0.00
272_A 405_D 1.18 0.10 0.00
172_A 290_V 1.18 0.10 0.00
298_I 405_D 1.18 0.10 0.00
261_D 18_D 1.18 0.10 0.00
294_A 108_E 1.18 0.10 0.00
188_A 206_V 1.17 0.10 0.00
205_V 441_Q 1.17 0.10 0.00
274_F 289_I 1.17 0.10 0.00
298_I 98_L 1.16 0.10 0.00
173_S 602_L 1.16 0.10 0.00
234_V 296_A 1.16 0.10 0.00
163_I 373_S 1.16 0.10 0.00
60_R 269_K 1.16 0.10 0.00
310_P 29_L 1.16 0.10 0.00
270_N 348_A 1.16 0.09 0.00
350_I 222_V 1.15 0.09 0.00
360_V 196_T 1.15 0.09 0.00
205_V 407_N 1.15 0.09 0.00
137_Q 102_T 1.15 0.09 0.00
99_N 283_I 1.14 0.09 0.00
276_Y 11_R 1.14 0.09 0.00
289_R 405_D 1.14 0.09 0.00
298_I 276_M 1.14 0.09 0.00
265_T 268_N 1.13 0.09 0.00
272_A 200_V 1.13 0.09 0.00
68_V 165_V 1.13 0.09 0.00
46_L 199_I 1.13 0.09 0.00
190_M 489_L 1.13 0.09 0.00
257_G 258_L 1.13 0.09 0.00
176_T 303_D 1.13 0.09 0.00
282_P 454_L 1.13 0.09 0.00
172_A 607_I 1.12 0.09 0.00
58_A 28_S 1.12 0.09 0.00
135_L 40_V 1.12 0.09 0.00
214_I 285_S 1.12 0.09 0.00
205_V 200_V 1.12 0.09 0.00
101_I 626_I 1.12 0.09 0.00
314_L 75_L 1.12 0.09 0.00
63_D 208_A 1.12 0.09 0.00
210_Q 376_Y 1.11 0.09 0.00
363_G 640_D 1.11 0.09 0.00
298_I 289_I 1.11 0.09 0.00
357_G 433_V 1.11 0.09 0.00
46_L 79_A 1.11 0.09 0.00
215_L 297_K 1.11 0.09 0.00
300_L 475_R 1.11 0.09 0.00
89_L 605_W 1.11 0.09 0.00
257_G 184_M 1.11 0.09 0.00
163_I 608_G 1.11 0.09 0.00
274_F 405_D 1.11 0.09 0.00
72_L 605_W 1.10 0.09 0.00
72_L 10_I 1.10 0.09 0.00
215_L 525_L 1.10 0.09 0.00
236_H 582_V 1.10 0.09 0.00
306_V 434_I 1.10 0.09 0.00
197_I 473_T 1.10 0.09 0.00
263_L 457_S 1.10 0.09 0.00
313_A 155_I 1.09 0.09 0.00
56_L 637_A 1.09 0.09 0.00
140_A 642_V 1.09 0.09 0.00
177_A 311_T 1.09 0.08 0.00
234_V 469_L 1.09 0.08 0.00
298_I 200_V 1.09 0.08 0.00
350_I 112_V 1.09 0.08 0.00
314_L 272_T 1.08 0.08 0.00
43_P 414_P 1.08 0.08 0.00
248_L 291_V 1.08 0.08 0.00
366_K 402_V 1.08 0.08 0.00
276_Y 214_I 1.08 0.08 0.00
352_K 102_T 1.08 0.08 0.00
232_A 81_A 1.07 0.08 0.00
205_V 400_Q 1.07 0.08 0.00
364_E 204_P 1.07 0.08 0.00
358_D 245_S 1.07 0.08 0.00
58_A 586_L 1.07 0.08 0.00
307_L 134_L 1.07 0.08 0.00
210_Q 340_Q 1.07 0.08 0.00
57_D 40_V 1.07 0.08 0.00
272_A 276_M 1.07 0.08 0.00
178_K 15_P 1.07 0.08 0.00
94_P 300_V 1.06 0.08 0.00
224_L 189_Q 1.06 0.08 0.00
263_L 426_V 1.06 0.08 0.00
286_G 357_R 1.06 0.08 0.00
307_L 27_I 1.06 0.08 0.00
46_L 578_L 1.06 0.08 0.00
279_F 466_Q 1.05 0.08 0.00
99_N 200_V 1.05 0.08 0.00
306_V 62_S 1.05 0.08 0.00
227_A 42_A 1.05 0.08 0.00
271_D 351_A 1.05 0.08 0.00
311_L 582_V 1.05 0.08 0.00
99_N 91_I 1.05 0.08 0.00
100_Q 165_V 1.05 0.08 0.00
101_I 339_I 1.05 0.08 0.00
34_P 513_T 1.05 0.08 0.00
97_A 605_W 1.05 0.08 0.00
270_N 466_Q 1.05 0.08 0.00
211_A 593_L 1.05 0.08 0.00
215_L 605_W 1.05 0.08 0.00
185_R 390_F 1.04 0.08 0.00
313_A 183_V 1.04 0.08 0.00
99_N 405_D 1.04 0.08 0.00
174_L 528_V 1.04 0.08 0.00
134_R 71_D 1.04 0.08 0.00
173_S 302_A 1.04 0.08 0.00
342_A 312_I 1.04 0.08 0.00
72_L 507_M 1.04 0.08 0.00
340_I 199_I 1.04 0.08 0.00
306_V 27_I 1.04 0.08 0.00
197_I 18_D 1.04 0.08 0.00
109_M 424_I 1.04 0.08 0.00
96_Q 348_A 1.04 0.08 0.00
298_I 321_G 1.04 0.08 0.00
163_I 61_T 1.04 0.08 0.00
177_A 621_S 1.03 0.08 0.00
356_A 105_Q 1.03 0.08 0.00
270_N 586_L 1.03 0.08 0.00
108_L 196_T 1.03 0.08 0.00
346_T 559_M 1.03 0.08 0.00
64_V 465_G 1.03 0.08 0.00
348_V 600_L 1.03 0.08 0.00
326_K 14_Y 1.03 0.08 0.00
349_E 504_T 1.02 0.07 0.00
173_S 586_L 1.02 0.07 0.00
229_V 480_F 1.02 0.07 0.00
72_L 397_G 1.02 0.07 0.00
140_A 206_V 1.02 0.07 0.00
47_Q 166_I 1.02 0.07 0.00
314_L 567_D 1.02 0.07 0.00
199_T 18_D 1.02 0.07 0.00
350_I 433_V 1.02 0.07 0.00
232_A 272_T 1.02 0.07 0.00
341_G 159_L 1.02 0.07 0.00
110_E 8_K 1.02 0.07 0.00
165_A 54_L 1.02 0.07 0.00
205_V 26_G 1.01 0.07 0.00
185_R 259_T 1.01 0.07 0.00
293_T 190_L 1.01 0.07 0.00
298_I 561_V 1.01 0.07 0.00
232_A 359_R 1.01 0.07 0.00
56_L 206_V 1.01 0.07 0.00
87_Q 221_I 1.01 0.07 0.00
196_Q 445_G 1.01 0.07 0.00
215_L 557_I 1.01 0.07 0.00
293_T 133_G 1.01 0.07 0.00
205_V 605_W 1.01 0.07 0.00
91_V 433_V 1.00 0.07 0.00
134_R 54_L 1.00 0.07 0.00
358_D 227_A 1.00 0.07 0.00
342_A 184_M 1.00 0.07 0.00
264_P 538_I 1.00 0.07 0.00
250_D 453_W 1.00 0.07 0.00
274_F 283_I 1.00 0.07 0.00
289_R 200_V 1.00 0.07 0.00
266_P 359_R 1.00 0.07 0.00
300_L 42_A 1.00 0.07 0.00
365_A 601_F 1.00 0.07 0.00
188_A 189_Q 1.00 0.07 0.00
56_L 618_F 1.00 0.07 0.00
222_A 214_I 1.00 0.07 0.00
168_K 648_E 1.00 0.07 0.00
285_N 197_V 1.00 0.07 0.00
45_D 296_A 1.00 0.07 0.00
58_A 272_T 1.00 0.07 0.00
247_V 200_V 1.00 0.07 0.00
217_L 361_N 1.00 0.07 0.00
178_K 123_L 1.00 0.07 0.00
282_P 361_N 1.00 0.07 0.00
229_V 510_V 0.99 0.07 0.00
291_D 319_D 0.99 0.07 0.00
219_D 404_L 0.99 0.07 0.00
197_I 412_L 0.99 0.07 0.00
296_V 359_R 0.99 0.07 0.00
222_A 469_L 0.99 0.07 0.00
56_L 620_C 0.99 0.07 0.00
287_L 298_Q 0.99 0.07 0.00
39_L 410_R 0.99 0.07 0.00
51_L 561_V 0.99 0.07 0.00
232_A 35_E 0.99 0.07 0.00
172_A 268_N 0.99 0.07 0.00
84_K 334_D 0.99 0.07 0.00
309_I 138_T 0.99 0.07 0.00
218_A 195_H 0.99 0.07 0.00
176_T 591_S 0.98 0.07 0.00
282_P 312_I 0.98 0.07 0.00
274_F 268_N 0.98 0.07 0.00
219_D 292_V 0.98 0.07 0.00
249_G 165_V 0.98 0.07 0.00
311_L 648_E 0.98 0.07 0.00
232_A 261_A 0.98 0.07 0.00
360_V 296_A 0.98 0.07 0.00
298_I 621_S 0.98 0.07 0.00
358_D 222_V 0.98 0.07 0.00
199_T 296_A 0.98 0.07 0.00
140_A 416_K 0.97 0.07 0.00
249_G 579_V 0.97 0.07 0.00
350_I 485_A 0.97 0.07 0.00
51_L 475_R 0.97 0.07 0.00
94_P 457_S 0.97 0.07 0.00
349_E 425_L 0.97 0.07 0.00
30_N 494_S 0.97 0.07 0.00
35_T 198_I 0.97 0.07 0.00
285_N 422_E 0.97 0.07 0.00
239_P 209_Q 0.97 0.07 0.00
294_A 261_A 0.97 0.07 0.00
295_Q 4_L 0.97 0.07 0.00
87_Q 525_L 0.97 0.07 0.00
38_T 91_I 0.97 0.07 0.00
340_I 557_I 0.97 0.07 0.00
342_A 267_A 0.97 0.07 0.00
177_A 98_L 0.97 0.07 0.00
296_V 426_V 0.97 0.07 0.00
225_V 81_A 0.96 0.07 0.00
202_G 190_L 0.96 0.07 0.00
71_Q 163_G 0.96 0.07 0.00
160_I 68_A 0.96 0.07 0.00
46_L 527_L 0.96 0.07 0.00
298_I 322_D 0.96 0.07 0.00
274_F 432_R 0.96 0.07 0.00
294_A 462_R 0.96 0.07 0.00
309_I 433_V 0.96 0.07 0.00
103_E 459_M 0.96 0.07 0.00
257_G 136_D 0.96 0.07 0.00
356_A 580_C 0.96 0.07 0.00
274_F 292_V 0.96 0.07 0.00
256_E 586_L 0.96 0.07 0.00
237_L 581_L 0.96 0.07 0.00
326_K 64_T 0.96 0.07 0.00
301_T 231_V 0.96 0.07 0.00
221_S 184_M 0.96 0.07 0.00
279_F 61_T 0.96 0.07 0.00
109_M 30_D 0.95 0.07 0.00
196_Q 404_L 0.95 0.07 0.00
101_I 292_V 0.95 0.07 0.00
190_M 345_V 0.95 0.07 0.00
218_A 552_T 0.95 0.07 0.00
305_N 28_S 0.95 0.07 0.00
225_V 440_K 0.95 0.07 0.00
172_A 602_L 0.95 0.07 0.00
327_L 336_L 0.95 0.07 0.00
66_A 335_D 0.95 0.07 0.00
165_A 85_R 0.95 0.07 0.00
277_A 364_D 0.95 0.07 0.00
260_K 51_M 0.95 0.07 0.00
51_L 530_V 0.95 0.07 0.00
171_Q 390_F 0.95 0.07 0.00
272_A 283_I 0.95 0.07 0.00
220_M 295_A 0.95 0.07 0.00
323_Y 314_V 0.95 0.07 0.00
289_R 283_I 0.94 0.07 0.00
177_A 321_G 0.94 0.07 0.00
164_D 8_K 0.94 0.07 0.00
198_T 191_R 0.94 0.07 0.00
191_A 30_D 0.94 0.07 0.00
81_D 567_D 0.94 0.07 0.00
39_L 433_V 0.94 0.07 0.00
236_H 514_V 0.94 0.07 0.00
298_I 423_V 0.94 0.07 0.00
315_G 319_D 0.94 0.07 0.00
205_V 283_I 0.94 0.07 0.00
236_H 375_D 0.94 0.07 0.00
193_E 336_L 0.94 0.07 0.00
211_A 595_A 0.93 0.07 0.00
307_L 180_G 0.93 0.07 0.00
342_A 404_L 0.93 0.07 0.00
340_I 181_E 0.93 0.07 0.00
260_K 18_D 0.93 0.06 0.00
78_A 192_D 0.93 0.06 0.00
60_R 445_G 0.93 0.06 0.00
272_A 407_N 0.93 0.06 0.00
101_I 283_I 0.93 0.06 0.00
289_R 423_V 0.93 0.06 0.00
48_Q 14_Y 0.93 0.06 0.00
81_D 363_V 0.93 0.06 0.00
47_Q 180_G 0.93 0.06 0.00
79_I 28_S 0.93 0.06 0.00
169_R 594_I 0.93 0.06 0.00
263_L 618_F 0.93 0.06 0.00
162_T 30_D 0.93 0.06 0.00
243_A 513_T 0.93 0.06 0.00
295_Q 60_A 0.93 0.06 0.00
298_I 311_T 0.93 0.06 0.00
81_D 102_T 0.93 0.06 0.00
266_P 462_R 0.93 0.06 0.00
185_R 123_L 0.92 0.06 0.00
255_Y 434_I 0.92 0.06 0.00
245_F 128_L 0.92 0.06 0.00
215_L 40_V 0.92 0.06 0.00
85_K 434_I 0.92 0.06 0.00
215_L 262_W 0.92 0.06 0.00
274_F 527_L 0.92 0.06 0.00
276_Y 469_L 0.92 0.06 0.00
43_P 302_A 0.92 0.06 0.00
162_T 640_D 0.92 0.06 0.00
233_D 149_Q 0.92 0.06 0.00
298_I 450_L 0.92 0.06 0.00
88_L 23_V 0.92 0.06 0.00
274_F 322_D 0.92 0.06 0.00
89_L 262_W 0.92 0.06 0.00
296_V 54_L 0.92 0.06 0.00
193_E 432_R 0.92 0.06 0.00
217_L 312_I 0.92 0.06 0.00
339_T 468_W 0.92 0.06 0.00
164_D 452_V 0.92 0.06 0.00
106_A 459_M 0.92 0.06 0.00
108_L 267_A 0.92 0.06 0.00
298_I 449_V 0.92 0.06 0.00
274_F 276_M 0.92 0.06 0.00
272_A 561_V 0.92 0.06 0.00
33_V 608_G 0.91 0.06 0.00
359_E 73_A 0.91 0.06 0.00
173_S 292_V 0.91 0.06 0.00
290_L 512_K 0.91 0.06 0.00
210_Q 336_L 0.91 0.06 0.00
173_S 14_Y 0.91 0.06 0.00
306_V 463_V 0.91 0.06 0.00
325_V 546_V 0.91 0.06 0.00
168_K 208_A 0.91 0.06 0.00
169_R 25_K 0.91 0.06 0.00
210_Q 623_V 0.91 0.06 0.00
342_A 198_I 0.91 0.06 0.00
140_A 310_N 0.91 0.06 0.00
101_I 322_D 0.91 0.06 0.00
84_K 433_V 0.91 0.06 0.00
226_K 516_K 0.91 0.06 0.00
249_G 35_E 0.91 0.06 0.00
270_N 297_K 0.91 0.06 0.00
289_R 91_I 0.91 0.06 0.00
291_D 33_A 0.91 0.06 0.00
294_A 413_F 0.91 0.06 0.00
272_A 321_G 0.91 0.06 0.00
307_L 184_M 0.90 0.06 0.00
337_E 189_Q 0.90 0.06 0.00
58_A 139_E 0.90 0.06 0.00
230_S 595_A 0.90 0.06 0.00
242_K 71_D 0.90 0.06 0.00
136_A 380_Y 0.90 0.06 0.00
53_T 646_A 0.90 0.06 0.00
341_G 529_A 0.90 0.06 0.00
106_A 23_V 0.90 0.06 0.00
263_L 14_Y 0.90 0.06 0.00
160_I 348_A 0.90 0.06 0.00
228_Q 586_L 0.90 0.06 0.00
177_A 200_V 0.90 0.06 0.00
272_A 289_I 0.90 0.06 0.00
303_V 208_A 0.90 0.06 0.00
272_A 258_L 0.90 0.06 0.00
275_Y 308_G 0.90 0.06 0.00
89_L 428_N 0.90 0.06 0.00
176_T 200_V 0.90 0.06 0.00
350_I 217_R 0.90 0.06 0.00
73_K 258_L 0.90 0.06 0.00
228_Q 509_G 0.90 0.06 0.00
199_T 3_P 0.90 0.06 0.00
211_A 512_K 0.90 0.06 0.00
289_R 204_P 0.90 0.06 0.00
348_V 10_I 0.90 0.06 0.00
217_L 16_A 0.90 0.06 0.00
295_Q 412_L 0.90 0.06 0.00
177_A 280_I 0.90 0.06 0.00
72_L 616_L 0.90 0.06 0.00
346_T 223_R 0.90 0.06 0.00
357_G 29_L 0.90 0.06 0.00
101_I 598_L 0.90 0.06 0.00
366_K 368_S 0.90 0.06 0.00
51_L 647_R 0.90 0.06 0.00
348_V 336_L 0.90 0.06 0.00
55_K 64_T 0.90 0.06 0.00
39_L 524_F 0.89 0.06 0.00
71_Q 193_R 0.89 0.06 0.00
359_E 42_A 0.89 0.06 0.00
210_Q 77_A 0.89 0.06 0.00
188_A 85_R 0.89 0.06 0.00
89_L 300_V 0.89 0.06 0.00
247_V 613_A 0.89 0.06 0.00
75_L 91_I 0.89 0.06 0.00
173_S 454_L 0.89 0.06 0.00
50_V 182_E 0.89 0.06 0.00
61_K 475_R 0.89 0.06 0.00
57_D 199_I 0.89 0.06 0.00
85_K 177_S 0.89 0.06 0.00
98_E 217_R 0.89 0.06 0.00
364_E 213_V 0.89 0.06 0.00
138_T 597_T 0.89 0.06 0.00
87_Q 217_R 0.89 0.06 0.00
127_V 638_R 0.89 0.06 0.00
210_Q 511_L 0.89 0.06 0.00
100_Q 270_M 0.89 0.06 0.00
95_E 12_R 0.89 0.06 0.00
164_D 488_Q 0.89 0.06 0.00
217_L 447_S 0.89 0.06 0.00
262_V 567_D 0.89 0.06 0.00
81_D 18_D 0.89 0.06 0.00
73_K 509_G 0.89 0.06 0.00
274_F 507_M 0.88 0.06 0.00
97_A 512_K 0.88 0.06 0.00
46_L 362_N 0.88 0.06 0.00
54_G 533_L 0.88 0.06 0.00
282_P 205_Q 0.88 0.06 0.00
301_T 143_A 0.88 0.06 0.00
305_N 329_Q 0.88 0.06 0.00
78_A 474_V 0.88 0.06 0.00
342_A 592_L 0.88 0.06 0.00
220_M 524_F 0.88 0.06 0.00
341_G 455_P 0.88 0.06 0.00
46_L 122_L 0.88 0.06 0.00
192_G 335_D 0.88 0.06 0.00
211_A 192_D 0.88 0.06 0.00
110_E 452_V 0.88 0.06 0.00
298_I 377_F 0.88 0.06 0.00
303_V 402_V 0.88 0.06 0.00
328_L 476_V 0.88 0.06 0.00
217_L 504_T 0.88 0.06 0.00
84_K 214_I 0.88 0.06 0.00
129_Y 494_S 0.88 0.06 0.00
364_E 217_R 0.88 0.06 0.00
39_L 354_Q 0.88 0.06 0.00
199_T 642_V 0.88 0.06 0.00
37_Q 370_N 0.88 0.06 0.00
289_R 276_M 0.87 0.06 0.00
193_E 557_I 0.87 0.06 0.00
359_E 32_Y 0.87 0.06 0.00
326_K 396_N 0.87 0.06 0.00
309_I 196_T 0.87 0.06 0.00
325_V 547_S 0.87 0.06 0.00
190_M 246_G 0.87 0.06 0.00
219_D 299_M 0.87 0.06 0.00
214_I 86_E 0.87 0.06 0.00
243_A 614_L 0.87 0.06 0.00
55_K 515_E 0.87 0.06 0.00
35_T 500_K 0.87 0.06 0.00
127_V 23_V 0.87 0.06 0.00
279_F 588_I 0.87 0.06 0.00
31_A 222_V 0.87 0.06 0.00
125_A 359_R 0.87 0.06 0.00
272_A 98_L 0.87 0.06 0.00
72_L 586_L 0.87 0.06 0.00
260_K 127_E 0.87 0.06 0.00
348_V 609_F 0.87 0.06 0.00
50_V 573_L 0.87 0.06 0.00
190_M 61_T 0.87 0.06 0.00
214_I 557_I 0.87 0.06 0.00
270_N 292_V 0.87 0.06 0.00
365_A 306_S 0.87 0.06 0.00
305_N 77_A 0.87 0.06 0.00
85_K 341_K 0.87 0.06 0.00
72_L 299_M 0.87 0.06 0.00
272_A 377_F 0.87 0.06 0.00
298_I 647_R 0.87 0.06 0.00
211_A 363_V 0.87 0.06 0.00
217_L 398_R 0.86 0.06 0.00
218_A 553_R 0.86 0.06 0.00
71_Q 195_H 0.86 0.06 0.00
293_T 390_F 0.86 0.06 0.00
304_K 410_R 0.86 0.06 0.00
101_I 289_I 0.86 0.06 0.00
46_L 200_V 0.86 0.06 0.00
225_V 365_V 0.86 0.06 0.00
176_T 450_L 0.86 0.06 0.00
166_Q 60_A 0.86 0.06 0.00
188_A 112_V 0.86 0.06 0.00
217_L 188_H 0.86 0.06 0.00
45_D 328_Q 0.86 0.06 0.00
51_L 408_T 0.86 0.06 0.00
242_K 267_A 0.86 0.06 0.00
304_K 181_E 0.86 0.06 0.00
309_I 319_D 0.86 0.06 0.00
247_V 642_V 0.86 0.06 0.00
38_T 203_D 0.86 0.06 0.00
161_G 165_V 0.86 0.06 0.00
245_F 286_V 0.86 0.06 0.00
274_F 364_D 0.86 0.06 0.00
228_Q 585_A 0.85 0.06 0.00
34_P 566_S 0.85 0.06 0.00
104_V 345_V 0.85 0.06 0.00
365_A 648_E 0.85 0.06 0.00
43_P 135_E 0.85 0.06 0.00
276_Y 206_V 0.85 0.06 0.00
196_Q 411_Q 0.85 0.06 0.00
272_A 344_W 0.85 0.06 0.00
51_L 283_I 0.85 0.06 0.00
243_A 138_T 0.85 0.06 0.00
308_T 627_L 0.85 0.06 0.00
274_F 311_T 0.85 0.06 0.00
53_T 570_Q 0.85 0.06 0.00
316_D 590_L 0.85 0.06 0.00
312_S 102_T 0.85 0.06 0.00
306_V 401_V 0.85 0.06 0.00
245_F 537_G 0.85 0.06 0.00
182_D 565_A 0.85 0.06 0.00
73_K 392_Q 0.85 0.06 0.00
227_A 96_H 0.85 0.06 0.00
39_L 14_Y 0.85 0.06 0.00
297_H 449_V 0.85 0.06 0.00
211_A 596_F 0.85 0.06 0.00
138_T 380_Y 0.85 0.06 0.00
221_S 598_L 0.85 0.06 0.00
160_I 454_L 0.85 0.06 0.00
223_M 95_Y 0.85 0.06 0.00
252_L 312_I 0.85 0.06 0.00
202_G 106_N 0.85 0.06 0.00
277_A 348_A 0.85 0.06 0.00
160_I 140_Y 0.85 0.06 0.00
37_Q 225_P 0.85 0.06 0.00
99_N 576_A 0.85 0.06 0.00
177_A 283_I 0.85 0.06 0.00
166_Q 294_D 0.85 0.06 0.00
126_R 104_E 0.84 0.06 0.00
141_V 528_V 0.84 0.06 0.00
308_T 197_V 0.84 0.06 0.00
103_E 40_V 0.84 0.06 0.00
213_N 337_I 0.84 0.06 0.00
265_T 290_V 0.84 0.06 0.00
172_A 451_R 0.84 0.06 0.00
53_T 382_M 0.84 0.06 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
ID Seq/Len Name Options I_Prob Status
7576 0.07 maca-b Δgene:(1, 1) A:(1E-04, 8) B:(1E-02, 8) msa: HHblits (2015_06) 0.00 Done - Shared
7574 0.07 maca-b Δgene:(1, 1) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: HHblits (2015_06) 0.00 Done - Shared
Page generated in 0.0676 seconds.