May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
ABDUF
Genes: A B A+B
Length: 337 577 897
Sequences: 603 2923 579
Seq/Len: 1.79 5.07 0.65
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.94
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show HHblits results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.00 0.00 0.59
2 0.00 0.00 0.61
5 0.00 0.00 0.63
10 0.00 0.00 0.63
20 0.00 0.01 0.63
100 0.00 0.03 0.64
∞ 0.00 0.17 0.66
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
330_D 281_R 2.08 0.93 0.57
85_V 70_K 1.69 0.77 0.28
85_V 168_L 1.66 0.75 0.26
285_S 289_P 1.61 0.72 0.23
331_L 272_V 1.59 0.70 0.22
87_M 172_L 1.57 0.70 0.21
108_L 223_L 1.51 0.65 0.17
193_V 258_G 1.49 0.64 0.17
199_V 98_V 1.43 0.59 0.14
67_A 426_F 1.41 0.57 0.13
225_L 553_L 1.39 0.56 0.12
273_T 510_V 1.38 0.55 0.12
96_E 413_I 1.37 0.54 0.12
110_V 553_L 1.35 0.53 0.11
257_V 398_R 1.35 0.52 0.11
31_V 428_V 1.33 0.51 0.10
326_D 275_S 1.32 0.49 0.10
284_V 106_I 1.31 0.49 0.09
328_A 275_S 1.30 0.48 0.09
118_I 334_F 1.30 0.48 0.09
324_G 556_A 1.29 0.47 0.09
58_L 529_I 1.28 0.47 0.09
67_A 351_A 1.27 0.46 0.08
277_G 256_L 1.27 0.46 0.08
82_S 139_Q 1.25 0.44 0.08
69_I 24_V 1.23 0.42 0.07
122_G 69_L 1.22 0.42 0.07
108_L 489_A 1.21 0.41 0.07
331_L 555_F 1.21 0.41 0.07
45_P 72_L 1.21 0.41 0.07
39_V 467_R 1.20 0.40 0.06
118_I 445_F 1.19 0.40 0.06
86_V 167_Q 1.19 0.39 0.06
127_L 223_L 1.19 0.39 0.06
226_L 570_Y 1.18 0.39 0.06
45_P 142_Y 1.18 0.38 0.06
337_F 268_I 1.18 0.38 0.06
89_N 172_L 1.18 0.38 0.06
120_A 554_D 1.17 0.38 0.06
160_L 556_A 1.17 0.38 0.06
24_V 569_F 1.16 0.37 0.05
224_Y 142_Y 1.16 0.37 0.05
337_F 286_W 1.16 0.37 0.05
6_I 540_V 1.16 0.36 0.05
113_G 544_W 1.15 0.36 0.05
104_I 98_V 1.15 0.36 0.05
323_S 484_I 1.15 0.36 0.05
8_L 542_V 1.14 0.36 0.05
252_Q 538_T 1.14 0.35 0.05
49_F 439_L 1.13 0.34 0.05
58_L 331_Q 1.12 0.34 0.05
146_I 30_G 1.11 0.34 0.05
82_S 75_Y 1.11 0.33 0.05
223_S 332_G 1.11 0.33 0.04
299_G 323_P 1.11 0.33 0.04
330_D 549_G 1.10 0.33 0.04
330_D 296_H 1.10 0.33 0.04
200_T 274_Y 1.10 0.32 0.04
196_G 146_K 1.09 0.32 0.04
328_A 281_R 1.09 0.32 0.04
290_P 559_V 1.09 0.32 0.04
8_L 548_V 1.08 0.31 0.04
202_L 485_A 1.08 0.31 0.04
5_E 97_K 1.08 0.31 0.04
310_R 473_D 1.08 0.31 0.04
162_V 220_S 1.08 0.31 0.04
36_P 56_R 1.08 0.31 0.04
158_Q 326_Q 1.07 0.30 0.04
209_E 313_F 1.07 0.30 0.04
58_L 480_K 1.07 0.30 0.04
75_P 275_S 1.07 0.30 0.04
203_A 190_R 1.06 0.30 0.04
289_L 187_E 1.06 0.29 0.04
45_P 315_Y 1.05 0.29 0.04
73_D 494_K 1.05 0.29 0.04
287_Y 552_K 1.05 0.29 0.04
271_L 553_L 1.05 0.29 0.04
309_L 316_K 1.05 0.29 0.04
214_P 549_G 1.05 0.29 0.04
197_V 197_E 1.05 0.29 0.04
165_G 161_S 1.05 0.29 0.04
81_V 30_G 1.04 0.28 0.04
222_L 464_P 1.04 0.28 0.04
146_I 302_T 1.04 0.28 0.04
175_Q 224_A 1.04 0.28 0.03
12_A 223_L 1.04 0.28 0.03
85_V 255_P 1.04 0.28 0.03
14_W 518_V 1.03 0.28 0.03
244_M 144_N 1.03 0.28 0.03
153_F 465_D 1.03 0.28 0.03
292_L 103_P 1.03 0.27 0.03
80_G 218_Y 1.03 0.27 0.03
196_G 422_S 1.03 0.27 0.03
10_G 547_P 1.02 0.27 0.03
227_R 289_P 1.02 0.27 0.03
330_D 189_Y 1.02 0.27 0.03
65_P 361_W 1.02 0.27 0.03
320_E 277_D 1.02 0.27 0.03
286_G 355_W 1.02 0.27 0.03
122_G 101_G 1.01 0.27 0.03
178_L 542_V 1.01 0.27 0.03
72_H 416_S 1.01 0.26 0.03
237_D 515_W 1.01 0.26 0.03
133_V 55_R 1.01 0.26 0.03
213_D 239_V 1.01 0.26 0.03
280_S 386_F 1.01 0.26 0.03
115_N 98_V 1.01 0.26 0.03
45_P 467_R 1.01 0.26 0.03
337_F 288_K 1.00 0.26 0.03
164_K 475_S 1.00 0.26 0.03
110_V 383_T 1.00 0.26 0.03
122_G 476_I 1.00 0.26 0.03
58_L 449_G 1.00 0.26 0.03
287_Y 168_L 1.00 0.26 0.03
331_L 413_I 1.00 0.26 0.03
330_D 146_K 1.00 0.25 0.03
131_L 230_L 0.99 0.25 0.03
242_T 479_Y 0.99 0.25 0.03
116_V 450_T 0.99 0.25 0.03
76_E 111_V 0.99 0.25 0.03
48_V 282_V 0.99 0.25 0.03
145_Q 572_G 0.99 0.25 0.03
106_S 436_I 0.99 0.25 0.03
217_S 156_K 0.99 0.25 0.03
79_V 39_V 0.99 0.25 0.03
71_V 241_V 0.98 0.25 0.03
219_Q 570_Y 0.98 0.24 0.03
299_G 508_Y 0.98 0.24 0.03
321_A 291_M 0.98 0.24 0.03
229_Q 463_P 0.98 0.24 0.03
110_V 490_N 0.98 0.24 0.03
31_V 79_I 0.97 0.24 0.03
333_Y 65_I 0.97 0.24 0.03
309_L 484_I 0.97 0.24 0.03
116_V 253_V 0.97 0.24 0.03
69_I 98_V 0.97 0.24 0.03
221_A 71_A 0.97 0.24 0.03
286_G 297_S 0.97 0.24 0.03
46_D 467_R 0.97 0.24 0.03
9_N 80_E 0.97 0.23 0.03
58_L 271_G 0.97 0.23 0.03
108_L 181_I 0.97 0.23 0.03
245_L 286_W 0.96 0.23 0.03
107_N 568_Q 0.96 0.23 0.03
113_G 479_Y 0.96 0.23 0.03
199_V 468_F 0.96 0.23 0.03
44_S 104_V 0.96 0.23 0.03
197_V 261_S 0.96 0.23 0.03
133_V 214_E 0.96 0.23 0.03
8_L 479_Y 0.96 0.23 0.02
181_E 196_F 0.96 0.23 0.02
175_Q 559_V 0.96 0.23 0.02
195_A 148_S 0.96 0.23 0.02
208_A 573_L 0.96 0.23 0.02
307_L 318_P 0.95 0.23 0.02
87_M 170_I 0.95 0.23 0.02
80_G 294_Y 0.95 0.23 0.02
120_A 407_D 0.95 0.23 0.02
184_R 556_A 0.95 0.23 0.02
195_A 545_E 0.94 0.22 0.02
110_V 494_K 0.94 0.22 0.02
306_T 399_G 0.94 0.22 0.02
174_D 468_F 0.94 0.22 0.02
135_Q 507_Q 0.94 0.22 0.02
229_Q 416_S 0.94 0.22 0.02
127_L 235_W 0.94 0.22 0.02
209_E 373_H 0.94 0.22 0.02
45_P 68_G 0.94 0.22 0.02
208_A 77_P 0.94 0.22 0.02
13_D 111_V 0.94 0.22 0.02
220_A 113_L 0.93 0.22 0.02
262_E 241_V 0.93 0.22 0.02
284_V 553_L 0.93 0.22 0.02
284_V 169_G 0.93 0.22 0.02
37_P 469_F 0.93 0.22 0.02
275_G 473_D 0.93 0.22 0.02
127_L 61_V 0.93 0.22 0.02
197_V 257_T 0.93 0.22 0.02
202_L 59_A 0.93 0.22 0.02
84_D 463_P 0.93 0.22 0.02
178_L 314_S 0.93 0.21 0.02
211_F 515_W 0.93 0.21 0.02
180_I 439_L 0.93 0.21 0.02
167_L 307_P 0.93 0.21 0.02
169_F 109_T 0.93 0.21 0.02
47_V 135_T 0.92 0.21 0.02
329_L 449_G 0.92 0.21 0.02
5_E 207_Q 0.92 0.21 0.02
44_S 223_L 0.92 0.21 0.02
43_V 82_D 0.92 0.21 0.02
286_G 479_Y 0.92 0.21 0.02
286_G 289_P 0.92 0.21 0.02
29_S 274_Y 0.92 0.21 0.02
43_V 95_I 0.91 0.21 0.02
310_R 493_L 0.91 0.20 0.02
29_S 218_Y 0.91 0.20 0.02
85_V 225_E 0.91 0.20 0.02
84_D 556_A 0.91 0.20 0.02
330_D 273_G 0.91 0.20 0.02
289_L 513_K 0.91 0.20 0.02
6_I 515_W 0.91 0.20 0.02
273_T 394_R 0.91 0.20 0.02
327_Q 241_V 0.91 0.20 0.02
41_M 462_V 0.91 0.20 0.02
280_S 512_G 0.91 0.20 0.02
192_D 184_N 0.91 0.20 0.02
304_I 295_G 0.91 0.20 0.02
24_V 553_L 0.91 0.20 0.02
330_D 160_D 0.91 0.20 0.02
49_F 516_G 0.91 0.20 0.02
135_Q 436_I 0.90 0.20 0.02
197_V 49_D 0.90 0.20 0.02
219_Q 572_G 0.90 0.20 0.02
101_S 504_L 0.90 0.20 0.02
324_G 255_P 0.90 0.20 0.02
285_S 297_S 0.90 0.20 0.02
195_A 286_W 0.90 0.20 0.02
43_V 553_L 0.90 0.20 0.02
288_V 310_T 0.90 0.20 0.02
27_K 204_E 0.90 0.20 0.02
167_L 226_L 0.90 0.20 0.02
248_L 100_P 0.90 0.20 0.02
62_V 462_V 0.90 0.20 0.02
176_P 472_G 0.90 0.20 0.02
85_V 137_L 0.90 0.20 0.02
89_N 484_I 0.90 0.20 0.02
25_T 423_D 0.90 0.20 0.02
142_L 111_V 0.89 0.20 0.02
209_E 264_T 0.89 0.20 0.02
142_L 235_W 0.89 0.20 0.02
51_A 226_L 0.89 0.20 0.02
160_L 446_V 0.89 0.20 0.02
266_V 345_D 0.89 0.20 0.02
240_A 168_L 0.89 0.20 0.02
97_P 367_L 0.89 0.19 0.02
14_W 443_H 0.89 0.19 0.02
3_Q 447_T 0.89 0.19 0.02
71_V 286_W 0.89 0.19 0.02
164_K 256_L 0.89 0.19 0.02
15_S 481_Y 0.89 0.19 0.02
274_Q 537_G 0.89 0.19 0.02
167_L 216_D 0.89 0.19 0.02
72_H 262_P 0.89 0.19 0.02
225_L 535_K 0.89 0.19 0.02
225_L 57_F 0.89 0.19 0.02
311_Y 473_D 0.89 0.19 0.02
62_V 445_F 0.89 0.19 0.02
122_G 537_G 0.89 0.19 0.02
295_K 573_L 0.89 0.19 0.02
110_V 330_V 0.89 0.19 0.02
307_L 237_N 0.89 0.19 0.02
206_P 192_G 0.88 0.19 0.02
311_Y 227_N 0.88 0.19 0.02
293_Q 288_K 0.88 0.19 0.02
70_V 484_I 0.88 0.19 0.02
97_P 504_L 0.88 0.19 0.02
327_Q 449_G 0.88 0.19 0.02
47_V 181_I 0.88 0.19 0.02
136_D 106_I 0.88 0.19 0.02
28_G 142_Y 0.88 0.19 0.02
110_V 165_K 0.88 0.19 0.02
322_V 289_P 0.88 0.19 0.02
148_I 388_P 0.88 0.19 0.02
248_L 268_I 0.88 0.19 0.02
197_V 258_G 0.88 0.19 0.02
337_F 289_P 0.88 0.19 0.02
24_V 52_T 0.88 0.18 0.02
62_V 542_V 0.88 0.18 0.02
225_L 254_L 0.87 0.18 0.02
244_M 183_Y 0.87 0.18 0.02
217_S 172_L 0.87 0.18 0.02
102_I 573_L 0.87 0.18 0.02
199_V 79_I 0.87 0.18 0.02
184_R 463_P 0.87 0.18 0.02
88_L 120_D 0.87 0.18 0.02
230_G 454_I 0.87 0.18 0.02
58_L 66_R 0.87 0.18 0.02
314_M 485_A 0.87 0.18 0.02
87_M 70_K 0.87 0.18 0.02
227_R 290_W 0.87 0.18 0.02
211_F 157_G 0.87 0.18 0.02
58_L 67_E 0.87 0.18 0.02
113_G 571_I 0.87 0.18 0.02
271_L 121_K 0.87 0.18 0.02
58_L 98_V 0.87 0.18 0.02
320_E 467_R 0.87 0.18 0.02
182_A 218_Y 0.87 0.18 0.02
109_I 542_V 0.87 0.18 0.02
256_I 264_T 0.87 0.18 0.02
332_L 543_R 0.87 0.18 0.02
288_V 216_D 0.87 0.18 0.02
35_V 289_P 0.87 0.18 0.02
165_G 465_D 0.87 0.18 0.02
146_I 26_L 0.86 0.18 0.02
135_Q 395_T 0.86 0.18 0.02
81_V 197_E 0.86 0.18 0.02
228_G 495_G 0.86 0.18 0.02
227_R 398_R 0.86 0.18 0.02
286_G 515_W 0.86 0.18 0.02
195_A 218_Y 0.86 0.18 0.02
296_Y 473_D 0.86 0.18 0.02
81_V 184_N 0.86 0.18 0.02
178_L 335_K 0.86 0.18 0.02
282_V 375_T 0.86 0.18 0.02
302_D 512_G 0.86 0.18 0.02
211_F 292_N 0.86 0.18 0.02
285_S 290_W 0.86 0.18 0.02
222_L 35_L 0.86 0.18 0.02
154_H 570_Y 0.86 0.18 0.02
335_F 435_W 0.86 0.18 0.02
231_L 223_L 0.86 0.18 0.02
28_G 283_K 0.86 0.18 0.02
116_V 484_I 0.86 0.18 0.02
248_L 183_Y 0.86 0.18 0.02
31_V 522_S 0.86 0.18 0.02
184_R 514_W 0.86 0.18 0.02
248_L 199_S 0.86 0.18 0.02
125_A 57_F 0.86 0.18 0.02
222_L 74_Y 0.86 0.18 0.02
296_Y 453_W 0.86 0.18 0.02
336_E 286_W 0.86 0.18 0.02
178_L 504_L 0.86 0.18 0.02
34_T 219_E 0.86 0.18 0.01
319_L 184_N 0.86 0.18 0.01
219_Q 415_Y 0.86 0.18 0.01
208_A 135_T 0.85 0.18 0.01
197_V 171_A 0.85 0.17 0.01
118_I 56_R 0.85 0.17 0.01
225_L 65_I 0.85 0.17 0.01
164_K 229_R 0.85 0.17 0.01
264_F 525_A 0.85 0.17 0.01
160_L 473_D 0.85 0.17 0.01
31_V 271_G 0.85 0.17 0.01
290_P 216_D 0.85 0.17 0.01
110_V 229_R 0.85 0.17 0.01
84_D 177_A 0.85 0.17 0.01
28_G 577_L 0.85 0.17 0.01
234_D 570_Y 0.85 0.17 0.01
145_Q 559_V 0.85 0.17 0.01
129_G 318_P 0.85 0.17 0.01
30_K 135_T 0.85 0.17 0.01
211_F 473_D 0.85 0.17 0.01
9_N 99_T 0.85 0.17 0.01
248_L 446_V 0.85 0.17 0.01
133_V 242_A 0.85 0.17 0.01
227_R 436_I 0.85 0.17 0.01
170_S 420_W 0.85 0.17 0.01
149_P 359_S 0.85 0.17 0.01
199_V 162_E 0.85 0.17 0.01
6_I 102_V 0.85 0.17 0.01
246_I 515_W 0.84 0.17 0.01
309_L 206_L 0.84 0.17 0.01
305_A 275_S 0.84 0.17 0.01
65_P 38_N 0.84 0.17 0.01
146_I 236_F 0.84 0.17 0.01
248_L 238_S 0.84 0.17 0.01
267_S 515_W 0.84 0.17 0.01
108_L 513_K 0.84 0.17 0.01
215_A 223_L 0.84 0.17 0.01
115_N 276_T 0.84 0.17 0.01
6_I 69_L 0.84 0.17 0.01
162_V 270_T 0.84 0.17 0.01
111_H 213_K 0.84 0.17 0.01
23_R 468_F 0.84 0.17 0.01
298_V 573_L 0.84 0.17 0.01
219_Q 454_I 0.84 0.17 0.01
286_G 437_R 0.84 0.17 0.01
140_L 408_S 0.84 0.17 0.01
225_L 91_R 0.84 0.17 0.01
216_M 157_G 0.84 0.17 0.01
253_S 571_I 0.84 0.17 0.01
333_Y 328_Y 0.84 0.17 0.01
293_Q 289_P 0.84 0.17 0.01
2_Q 201_I 0.84 0.17 0.01
108_L 530_R 0.84 0.17 0.01
210_I 104_V 0.84 0.17 0.01
160_L 146_K 0.83 0.17 0.01
138_Q 79_I 0.83 0.17 0.01
167_L 513_K 0.83 0.17 0.01
30_K 98_V 0.83 0.17 0.01
45_P 436_I 0.83 0.17 0.01
307_L 295_G 0.83 0.17 0.01
218_Q 286_W 0.83 0.17 0.01
9_N 133_I 0.83 0.17 0.01
37_P 525_A 0.83 0.17 0.01
116_V 96_A 0.83 0.17 0.01
271_L 83_L 0.83 0.16 0.01
99_T 156_K 0.83 0.16 0.01
299_G 305_S 0.83 0.16 0.01
167_L 164_T 0.83 0.16 0.01
313_L 136_V 0.83 0.16 0.01
180_I 248_A 0.83 0.16 0.01
81_V 160_D 0.83 0.16 0.01
181_E 385_L 0.83 0.16 0.01
158_Q 506_Y 0.83 0.16 0.01
62_V 483_S 0.83 0.16 0.01
297_G 219_E 0.82 0.16 0.01
291_G 401_L 0.82 0.16 0.01
24_V 449_G 0.82 0.16 0.01
226_L 558_P 0.82 0.16 0.01
253_S 368_R 0.82 0.16 0.01
229_Q 434_V 0.82 0.16 0.01
40_R 265_E 0.82 0.16 0.01
125_A 553_L 0.82 0.16 0.01
213_D 99_T 0.82 0.16 0.01
324_G 101_G 0.82 0.16 0.01
281_Q 431_A 0.82 0.16 0.01
245_L 388_P 0.82 0.16 0.01
160_L 493_L 0.82 0.16 0.01
148_I 220_S 0.82 0.16 0.01
14_W 115_G 0.82 0.16 0.01
133_V 322_N 0.82 0.16 0.01
8_L 184_N 0.82 0.16 0.01
24_V 83_L 0.82 0.16 0.01
167_L 79_I 0.82 0.16 0.01
318_Y 289_P 0.82 0.16 0.01
226_L 233_T 0.82 0.16 0.01
300_I 403_P 0.82 0.16 0.01
295_K 262_P 0.82 0.16 0.01
43_V 533_D 0.82 0.16 0.01
156_Y 223_L 0.82 0.16 0.01
15_S 197_E 0.82 0.16 0.01
31_V 241_V 0.81 0.16 0.01
21_R 82_D 0.81 0.16 0.01
49_F 390_V 0.81 0.16 0.01
244_M 303_S 0.81 0.16 0.01
135_Q 142_Y 0.81 0.16 0.01
329_L 403_P 0.81 0.16 0.01
299_G 326_Q 0.81 0.16 0.01
211_F 290_W 0.81 0.16 0.01
221_A 142_Y 0.81 0.16 0.01
104_I 332_G 0.81 0.16 0.01
329_L 462_V 0.81 0.16 0.01
64_V 564_E 0.81 0.15 0.01
47_V 441_D 0.81 0.15 0.01
127_L 159_F 0.81 0.15 0.01
311_Y 281_R 0.81 0.15 0.01
45_P 296_H 0.81 0.15 0.01
282_V 271_G 0.81 0.15 0.01
34_T 569_F 0.81 0.15 0.01
155_A 517_A 0.81 0.15 0.01
194_I 274_Y 0.81 0.15 0.01
110_V 527_S 0.81 0.15 0.01
224_Y 473_D 0.81 0.15 0.01
156_Y 415_Y 0.81 0.15 0.01
293_Q 398_R 0.81 0.15 0.01
226_L 266_N 0.81 0.15 0.01
205_E 540_V 0.81 0.15 0.01
225_L 115_G 0.81 0.15 0.01
221_A 469_F 0.81 0.15 0.01
310_R 30_G 0.81 0.15 0.01
9_N 176_K 0.81 0.15 0.01
26_A 497_S 0.81 0.15 0.01
12_A 413_I 0.81 0.15 0.01
5_E 102_V 0.81 0.15 0.01
58_L 207_Q 0.80 0.15 0.01
195_A 480_K 0.80 0.15 0.01
58_L 187_E 0.80 0.15 0.01
309_L 130_R 0.80 0.15 0.01
66_W 98_V 0.80 0.15 0.01
176_P 549_G 0.80 0.15 0.01
316_K 57_F 0.80 0.15 0.01
319_L 203_D 0.80 0.15 0.01
263_T 37_K 0.80 0.15 0.01
234_D 558_P 0.80 0.15 0.01
67_A 217_E 0.80 0.15 0.01
263_T 181_I 0.80 0.15 0.01
113_G 525_A 0.80 0.15 0.01
287_Y 157_G 0.80 0.15 0.01
282_V 445_F 0.80 0.15 0.01
110_V 80_E 0.80 0.15 0.01
140_L 131_P 0.80 0.15 0.01
292_L 468_F 0.80 0.15 0.01
160_L 372_D 0.80 0.15 0.01
197_V 208_N 0.80 0.15 0.01
110_V 468_F 0.80 0.15 0.01
13_D 413_I 0.80 0.15 0.01
3_Q 84_R 0.80 0.15 0.01
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
ID Seq/Len Name Options I_Prob Status
2621 1.48 ABDUFEe-2jck Δgene:(1, 20) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.98 Done
2544 1.1 ABDUFEe-2 Δgene:(1, 20) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: HHblits (2015_06) 0.97 Done
2543 1.14 ABDUF Δgene:(1, 20) A:(1E-02, 8) B:(1E-04, 8) msa: HHblits (2015_06) 0.96 Done
1967 0.74 ABDUF Δgene:(1, 20) A:(1E-02, 8) B:(1E-04, 8) msa: HHblits (2013_03) 0.97 Done
1965 0.77 ABDUF Δgene:(1, 20) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: HHblits (2013_03) 0.96 Done
0521 0.65 ABDUF Δgene:(1, 20) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: HHblits (2013_03) 0.57 Done - Shared
Page generated in 0.0988 seconds.