May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
cI_1_20_1_cI_3_20_1_tt
Genes: A B A+B
Length: 438 783 1080
Sequences: 2151 198 178
Seq/Len: 4.91 0.25 0.16
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.96
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show Jackhmmer results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.01 0.00 0.14
2 0.01 0.00 0.14
5 0.01 0.00 0.14
10 0.02 0.00 0.14
20 0.02 0.00 0.14
100 0.04 0.00 0.14
∞ 0.11 0.00 0.15
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
101_F 24_F 1.68 0.36 0.00
42_K 318_V 1.58 0.32 0.00
125_I 212_G 1.53 0.29 0.00
231_M 627_A 1.46 0.26 0.00
135_R 270_R 1.44 0.25 0.00
227_V 92_V 1.41 0.24 0.00
87_H 43_G 1.40 0.23 0.00
101_F 21_D 1.39 0.23 0.00
192_L 22_A 1.38 0.23 0.00
414_L 390_L 1.38 0.22 0.00
268_M 573_P 1.37 0.22 0.00
89_L 11_V 1.35 0.21 0.00
343_N 52_I 1.34 0.21 0.00
177_A 89_D 1.33 0.20 0.00
348_Y 97_S 1.32 0.20 0.00
177_A 270_R 1.30 0.20 0.00
51_D 88_A 1.30 0.20 0.00
414_L 479_A 1.29 0.19 0.00
423_A 562_G 1.28 0.19 0.00
350_H 229_I 1.27 0.19 0.00
42_K 105_A 1.27 0.18 0.00
268_M 30_V 1.26 0.18 0.00
223_T 98_D 1.26 0.18 0.00
202_K 77_P 1.26 0.18 0.00
114_L 411_L 1.25 0.18 0.00
418_K 620_R 1.24 0.17 0.00
36_G 110_F 1.24 0.17 0.00
100_S 127_A 1.23 0.17 0.00
40_T 204_E 1.22 0.17 0.00
168_S 242_F 1.21 0.17 0.00
223_T 406_A 1.21 0.16 0.00
135_R 129_E 1.21 0.16 0.00
135_R 32_L 1.18 0.15 0.00
238_F 212_G 1.18 0.15 0.00
224_L 357_A 1.17 0.15 0.00
258_V 7_N 1.17 0.15 0.00
260_R 398_V 1.17 0.15 0.00
333_E 320_A 1.17 0.15 0.00
271_T 277_I 1.16 0.15 0.00
166_D 579_G 1.16 0.15 0.00
343_N 107_M 1.15 0.15 0.00
340_A 634_A 1.15 0.15 0.00
334_R 413_L 1.14 0.14 0.00
397_R 332_G 1.14 0.14 0.00
223_T 640_V 1.14 0.14 0.00
422_L 578_K 1.14 0.14 0.00
179_A 205_R 1.14 0.14 0.00
333_E 413_L 1.14 0.14 0.00
236_D 330_K 1.14 0.14 0.00
143_D 371_F 1.13 0.14 0.00
304_E 566_A 1.13 0.14 0.00
268_M 23_V 1.12 0.14 0.00
390_L 219_P 1.12 0.14 0.00
300_L 637_A 1.12 0.14 0.00
237_W 270_R 1.11 0.14 0.00
101_F 135_V 1.11 0.14 0.00
192_L 13_V 1.11 0.14 0.00
59_R 12_E 1.11 0.14 0.00
176_G 205_R 1.11 0.14 0.00
131_Y 47_M 1.10 0.14 0.00
138_Y 32_L 1.10 0.13 0.00
96_S 628_P 1.10 0.13 0.00
412_G 541_A 1.10 0.13 0.00
52_E 396_A 1.10 0.13 0.00
129_V 555_G 1.10 0.13 0.00
254_I 562_G 1.09 0.13 0.00
223_T 458_L 1.09 0.13 0.00
326_G 540_N 1.09 0.13 0.00
144_R 612_G 1.09 0.13 0.00
325_T 356_L 1.09 0.13 0.00
48_K 92_V 1.09 0.13 0.00
43_R 473_E 1.08 0.13 0.00
42_K 216_F 1.08 0.13 0.00
325_T 81_A 1.08 0.13 0.00
260_R 471_G 1.08 0.13 0.00
343_N 220_S 1.08 0.13 0.00
101_F 273_E 1.08 0.13 0.00
179_A 49_L 1.07 0.13 0.00
121_A 487_S 1.06 0.12 0.00
260_R 88_A 1.06 0.12 0.00
80_P 22_A 1.06 0.12 0.00
414_L 214_M 1.06 0.12 0.00
86_Q 555_G 1.06 0.12 0.00
122_G 330_K 1.06 0.12 0.00
163_F 88_A 1.05 0.12 0.00
403_A 195_P 1.05 0.12 0.00
300_L 399_L 1.05 0.12 0.00
101_F 79_L 1.05 0.12 0.00
322_M 103_A 1.05 0.12 0.00
189_M 298_H 1.05 0.12 0.00
381_E 486_G 1.05 0.12 0.00
56_E 345_L 1.05 0.12 0.00
218_I 353_E 1.05 0.12 0.00
267_P 612_G 1.05 0.12 0.00
314_E 221_G 1.04 0.12 0.00
114_L 51_R 1.04 0.12 0.00
398_S 171_S 1.04 0.12 0.00
230_I 79_L 1.04 0.12 0.00
83_D 13_V 1.04 0.12 0.00
160_K 557_S 1.04 0.12 0.00
327_G 249_M 1.04 0.12 0.00
381_E 588_S 1.04 0.12 0.00
41_A 133_R 1.04 0.12 0.00
279_W 397_L 1.04 0.12 0.00
275_L 232_V 1.04 0.12 0.00
161_N 437_I 1.04 0.12 0.00
96_S 639_Q 1.03 0.12 0.00
314_E 239_T 1.03 0.12 0.00
213_G 182_I 1.03 0.12 0.00
355_K 41_P 1.03 0.12 0.00
124_A 618_E 1.03 0.12 0.00
157_Y 255_T 1.03 0.12 0.00
246_S 121_T 1.03 0.12 0.00
391_L 59_P 1.03 0.12 0.00
55_E 606_T 1.03 0.12 0.00
390_L 79_L 1.02 0.11 0.00
214_K 9_R 1.02 0.11 0.00
86_Q 96_L 1.02 0.11 0.00
295_S 97_S 1.02 0.11 0.00
325_T 175_I 1.02 0.11 0.00
339_D 598_A 1.02 0.11 0.00
133_Y 205_R 1.02 0.11 0.00
423_A 645_A 1.02 0.11 0.00
223_T 586_H 1.02 0.11 0.00
274_E 166_K 1.01 0.11 0.00
157_Y 105_A 1.01 0.11 0.00
176_G 49_L 1.01 0.11 0.00
36_G 174_V 1.01 0.11 0.00
242_G 599_H 1.01 0.11 0.00
90_I 614_L 1.01 0.11 0.00
221_V 43_G 1.01 0.11 0.00
415_R 362_K 1.01 0.11 0.00
408_W 99_V 1.00 0.11 0.00
165_T 79_L 1.00 0.11 0.00
119_I 463_A 1.00 0.11 0.00
323_L 117_L 1.00 0.11 0.00
30_D 621_V 1.00 0.11 0.00
313_Y 350_T 1.00 0.11 0.00
39_E 321_T 1.00 0.11 0.00
121_A 449_A 1.00 0.11 0.00
101_F 32_L 1.00 0.11 0.00
177_A 129_E 1.00 0.11 0.00
333_E 472_E 1.00 0.11 0.00
86_Q 18_S 1.00 0.11 0.00
119_I 613_H 0.99 0.11 0.00
129_V 357_A 0.99 0.11 0.00
223_T 590_L 0.99 0.11 0.00
300_L 229_I 0.99 0.11 0.00
280_A 641_L 0.99 0.11 0.00
135_R 212_G 0.99 0.11 0.00
154_A 98_D 0.99 0.11 0.00
39_E 355_L 0.98 0.11 0.00
104_R 173_F 0.98 0.11 0.00
191_S 205_R 0.98 0.11 0.00
149_I 240_A 0.98 0.11 0.00
249_M 61_G 0.98 0.11 0.00
195_L 171_S 0.98 0.10 0.00
224_L 606_T 0.98 0.10 0.00
333_E 369_L 0.98 0.10 0.00
84_G 43_G 0.98 0.10 0.00
237_W 89_D 0.98 0.10 0.00
316_L 531_K 0.98 0.10 0.00
96_S 14_P 0.98 0.10 0.00
416_H 26_A 0.97 0.10 0.00
135_R 253_P 0.97 0.10 0.00
391_L 18_S 0.97 0.10 0.00
355_K 124_K 0.97 0.10 0.00
419_D 394_D 0.97 0.10 0.00
119_I 560_E 0.97 0.10 0.00
291_I 228_D 0.97 0.10 0.00
168_S 583_V 0.97 0.10 0.00
394_I 213_T 0.97 0.10 0.00
196_R 44_A 0.97 0.10 0.00
419_D 486_G 0.96 0.10 0.00
177_A 32_L 0.96 0.10 0.00
335_V 212_G 0.96 0.10 0.00
391_L 25_H 0.96 0.10 0.00
157_Y 550_L 0.96 0.10 0.00
268_M 273_E 0.96 0.10 0.00
196_R 259_C 0.96 0.10 0.00
415_R 296_F 0.96 0.10 0.00
402_L 614_L 0.95 0.10 0.00
104_R 132_D 0.95 0.10 0.00
288_Q 23_V 0.95 0.10 0.00
274_E 260_P 0.95 0.10 0.00
33_L 105_A 0.95 0.10 0.00
89_L 541_A 0.95 0.10 0.00
86_Q 99_V 0.95 0.10 0.00
39_E 102_E 0.95 0.10 0.00
51_D 588_S 0.95 0.10 0.00
414_L 413_L 0.95 0.10 0.00
166_D 584_V 0.95 0.10 0.00
417_F 620_R 0.95 0.10 0.00
196_R 222_F 0.95 0.10 0.00
242_G 205_R 0.95 0.10 0.00
260_R 437_I 0.95 0.10 0.00
177_A 293_A 0.95 0.10 0.00
308_D 367_P 0.95 0.10 0.00
196_R 201_D 0.95 0.10 0.00
213_G 540_N 0.95 0.10 0.00
263_V 35_S 0.94 0.10 0.00
34_R 627_A 0.94 0.10 0.00
127_A 451_F 0.94 0.10 0.00
101_F 413_L 0.94 0.10 0.00
310_P 399_L 0.94 0.10 0.00
331_I 9_R 0.94 0.10 0.00
399_F 222_F 0.94 0.10 0.00
232_E 98_D 0.94 0.10 0.00
30_D 381_L 0.94 0.10 0.00
417_F 162_R 0.94 0.10 0.00
175_R 268_D 0.94 0.10 0.00
236_D 645_A 0.94 0.10 0.00
273_R 471_G 0.94 0.10 0.00
237_W 32_L 0.94 0.10 0.00
43_R 397_L 0.94 0.10 0.00
370_L 102_E 0.94 0.10 0.00
369_N 207_V 0.94 0.10 0.00
96_S 611_R 0.94 0.10 0.00
26_S 15_P 0.94 0.10 0.00
268_M 599_H 0.94 0.10 0.00
107_L 264_G 0.94 0.10 0.00
143_D 314_E 0.94 0.10 0.00
391_L 99_V 0.94 0.10 0.00
334_R 357_A 0.94 0.10 0.00
292_P 225_N 0.94 0.10 0.00
161_N 472_E 0.93 0.10 0.00
97_E 225_N 0.93 0.10 0.00
180_Y 225_N 0.93 0.10 0.00
31_Y 405_E 0.93 0.10 0.00
268_M 314_E 0.93 0.10 0.00
179_A 232_V 0.93 0.10 0.00
299_P 639_Q 0.93 0.10 0.00
102_K 114_N 0.93 0.10 0.00
161_N 59_P 0.93 0.10 0.00
339_D 562_G 0.93 0.10 0.00
288_Q 350_T 0.93 0.09 0.00
238_F 510_G 0.93 0.09 0.00
163_F 550_L 0.93 0.09 0.00
81_K 298_H 0.93 0.09 0.00
34_R 369_L 0.93 0.09 0.00
414_L 375_T 0.93 0.09 0.00
350_H 79_L 0.93 0.09 0.00
170_D 437_I 0.93 0.09 0.00
153_R 266_T 0.93 0.09 0.00
119_I 378_P 0.93 0.09 0.00
314_E 642_A 0.93 0.09 0.00
268_M 501_K 0.92 0.09 0.00
30_D 339_E 0.92 0.09 0.00
128_T 369_L 0.92 0.09 0.00
323_L 232_V 0.92 0.09 0.00
260_R 615_V 0.92 0.09 0.00
367_M 203_I 0.92 0.09 0.00
157_Y 193_E 0.92 0.09 0.00
312_S 616_N 0.92 0.09 0.00
50_P 627_A 0.92 0.09 0.00
53_V 627_A 0.92 0.09 0.00
323_L 289_W 0.92 0.09 0.00
241_M 613_H 0.92 0.09 0.00
135_R 251_E 0.92 0.09 0.00
153_R 394_D 0.92 0.09 0.00
378_Q 452_A 0.92 0.09 0.00
135_R 202_F 0.92 0.09 0.00
268_M 564_L 0.92 0.09 0.00
264_Y 104_Q 0.92 0.09 0.00
114_L 89_D 0.92 0.09 0.00
231_M 204_E 0.92 0.09 0.00
191_S 49_L 0.92 0.09 0.00
43_R 458_L 0.92 0.09 0.00
261_P 33_F 0.92 0.09 0.00
251_L 324_E 0.92 0.09 0.00
373_K 195_P 0.91 0.09 0.00
121_A 450_L 0.91 0.09 0.00
327_G 265_I 0.91 0.09 0.00
109_D 30_V 0.91 0.09 0.00
122_G 480_L 0.91 0.09 0.00
244_E 321_T 0.91 0.09 0.00
335_V 398_V 0.91 0.09 0.00
25_G 487_S 0.91 0.09 0.00
337_M 85_T 0.91 0.09 0.00
401_P 108_V 0.91 0.09 0.00
140_R 311_V 0.91 0.09 0.00
179_A 112_L 0.91 0.09 0.00
231_M 80_A 0.91 0.09 0.00
260_R 361_A 0.91 0.09 0.00
138_Y 129_E 0.91 0.09 0.00
408_W 617_L 0.91 0.09 0.00
170_D 324_E 0.91 0.09 0.00
59_R 330_K 0.91 0.09 0.00
287_I 293_A 0.91 0.09 0.00
268_M 20_M 0.91 0.09 0.00
86_Q 511_V 0.91 0.09 0.00
51_D 567_Y 0.90 0.09 0.00
257_P 246_N 0.90 0.09 0.00
266_L 88_A 0.90 0.09 0.00
106_I 35_S 0.90 0.09 0.00
177_A 212_G 0.90 0.09 0.00
393_L 102_E 0.90 0.09 0.00
217_T 602_L 0.90 0.09 0.00
297_T 354_G 0.90 0.09 0.00
361_E 235_L 0.90 0.09 0.00
226_S 405_E 0.90 0.09 0.00
167_F 255_T 0.90 0.09 0.00
168_S 488_E 0.90 0.09 0.00
54_I 80_A 0.90 0.09 0.00
384_V 511_V 0.90 0.09 0.00
238_F 260_P 0.90 0.09 0.00
135_R 606_T 0.90 0.09 0.00
380_E 296_F 0.90 0.09 0.00
259_K 476_I 0.90 0.09 0.00
101_F 291_C 0.90 0.09 0.00
30_D 141_E 0.90 0.09 0.00
93_A 297_G 0.89 0.09 0.00
257_P 106_G 0.89 0.09 0.00
129_V 536_T 0.89 0.09 0.00
339_D 41_P 0.89 0.09 0.00
237_W 212_G 0.89 0.09 0.00
365_G 207_V 0.89 0.09 0.00
340_A 15_P 0.89 0.09 0.00
125_I 608_Y 0.89 0.09 0.00
395_E 106_G 0.89 0.09 0.00
121_A 548_G 0.89 0.09 0.00
169_F 40_S 0.89 0.09 0.00
405_A 248_E 0.89 0.09 0.00
233_R 358_S 0.89 0.09 0.00
283_P 26_A 0.89 0.09 0.00
168_S 518_A 0.89 0.09 0.00
334_R 389_D 0.89 0.09 0.00
61_G 413_L 0.89 0.09 0.00
229_P 293_A 0.89 0.09 0.00
410_V 182_I 0.89 0.09 0.00
414_L 170_L 0.89 0.09 0.00
39_E 9_R 0.89 0.09 0.00
292_P 286_N 0.89 0.09 0.00
317_Q 456_A 0.89 0.09 0.00
30_D 424_H 0.89 0.09 0.00
83_D 22_A 0.89 0.09 0.00
260_R 577_L 0.89 0.09 0.00
48_K 597_Y 0.88 0.09 0.00
89_L 220_S 0.88 0.09 0.00
237_W 579_G 0.88 0.09 0.00
145_L 43_G 0.88 0.09 0.00
119_I 505_L 0.88 0.09 0.00
176_G 232_V 0.88 0.09 0.00
97_E 286_N 0.88 0.09 0.00
180_Y 286_N 0.88 0.09 0.00
127_A 89_D 0.88 0.09 0.00
223_T 135_V 0.88 0.09 0.00
279_W 63_P 0.88 0.09 0.00
127_A 537_P 0.88 0.09 0.00
286_P 541_A 0.88 0.09 0.00
378_Q 524_L 0.88 0.09 0.00
147_Q 183_H 0.88 0.09 0.00
401_P 79_L 0.88 0.09 0.00
335_V 32_L 0.88 0.09 0.00
238_F 405_E 0.88 0.09 0.00
168_S 499_K 0.88 0.09 0.00
177_A 24_F 0.88 0.09 0.00
289_A 40_S 0.88 0.09 0.00
355_K 178_R 0.88 0.09 0.00
97_E 33_F 0.87 0.08 0.00
180_Y 33_F 0.87 0.08 0.00
333_E 475_E 0.87 0.08 0.00
313_Y 85_T 0.87 0.08 0.00
114_L 626_P 0.87 0.08 0.00
335_V 273_E 0.87 0.08 0.00
49_T 335_E 0.87 0.08 0.00
106_I 173_F 0.87 0.08 0.00
176_G 91_M 0.87 0.08 0.00
209_S 215_D 0.87 0.08 0.00
136_G 289_W 0.87 0.08 0.00
388_E 102_E 0.87 0.08 0.00
304_E 349_A 0.87 0.08 0.00
157_Y 418_R 0.87 0.08 0.00
304_E 342_G 0.87 0.08 0.00
355_K 185_K 0.87 0.08 0.00
168_S 553_A 0.87 0.08 0.00
323_L 234_A 0.87 0.08 0.00
403_A 297_G 0.87 0.08 0.00
398_S 259_C 0.87 0.08 0.00
402_L 203_I 0.87 0.08 0.00
328_V 211_I 0.87 0.08 0.00
355_K 179_E 0.87 0.08 0.00
138_Y 270_R 0.87 0.08 0.00
270_T 649_G 0.87 0.08 0.00
214_K 391_L 0.87 0.08 0.00
317_Q 383_P 0.87 0.08 0.00
201_L 268_D 0.86 0.08 0.00
123_Y 398_V 0.86 0.08 0.00
299_P 18_S 0.86 0.08 0.00
36_G 341_V 0.86 0.08 0.00
344_L 134_T 0.86 0.08 0.00
171_L 450_L 0.86 0.08 0.00
273_R 240_A 0.86 0.08 0.00
268_M 531_K 0.86 0.08 0.00
403_A 447_K 0.86 0.08 0.00
157_Y 518_A 0.86 0.08 0.00
133_Y 49_L 0.86 0.08 0.00
319_K 452_A 0.86 0.08 0.00
252_Y 435_L 0.86 0.08 0.00
411_K 398_V 0.86 0.08 0.00
238_F 89_D 0.86 0.08 0.00
336_S 261_V 0.86 0.08 0.00
373_K 297_G 0.86 0.08 0.00
100_S 236_L 0.86 0.08 0.00
131_Y 300_W 0.86 0.08 0.00
168_S 415_E 0.86 0.08 0.00
48_K 229_I 0.86 0.08 0.00
133_Y 78_K 0.86 0.08 0.00
225_A 254_T 0.86 0.08 0.00
412_G 25_H 0.86 0.08 0.00
177_A 253_P 0.86 0.08 0.00
131_Y 633_E 0.86 0.08 0.00
250_K 290_I 0.86 0.08 0.00
373_K 108_V 0.86 0.08 0.00
238_F 539_A 0.86 0.08 0.00
27_W 641_L 0.86 0.08 0.00
255_S 12_E 0.86 0.08 0.00
273_R 463_A 0.85 0.08 0.00
291_I 248_E 0.85 0.08 0.00
361_E 234_A 0.85 0.08 0.00
243_T 177_D 0.85 0.08 0.00
276_I 258_L 0.85 0.08 0.00
387_L 111_T 0.85 0.08 0.00
349_A 80_A 0.85 0.08 0.00
361_E 123_D 0.85 0.08 0.00
372_A 311_V 0.85 0.08 0.00
403_A 192_E 0.85 0.08 0.00
392_P 579_G 0.85 0.08 0.00
42_K 345_L 0.85 0.08 0.00
26_S 99_V 0.85 0.08 0.00
132_I 43_G 0.85 0.08 0.00
197_A 35_S 0.85 0.08 0.00
367_M 586_H 0.85 0.08 0.00
124_A 620_R 0.85 0.08 0.00
221_V 82_S 0.85 0.08 0.00
212_W 600_V 0.85 0.08 0.00
25_G 334_K 0.85 0.08 0.00
260_R 324_E 0.85 0.08 0.00
38_Y 241_R 0.85 0.08 0.00
414_L 215_D 0.85 0.08 0.00
289_A 353_E 0.85 0.08 0.00
29_L 648_L 0.85 0.08 0.00
196_R 291_C 0.85 0.08 0.00
58_K 205_R 0.85 0.08 0.00
341_M 643_L 0.85 0.08 0.00
236_D 519_E 0.85 0.08 0.00
146_E 264_G 0.85 0.08 0.00
250_K 247_W 0.85 0.08 0.00
131_Y 602_L 0.85 0.08 0.00
27_W 52_I 0.85 0.08 0.00
56_E 342_G 0.84 0.08 0.00
157_Y 505_L 0.84 0.08 0.00
160_K 1_M 0.84 0.08 0.00
127_A 15_P 0.84 0.08 0.00
312_S 543_G 0.84 0.08 0.00
35_H 268_D 0.84 0.08 0.00
29_L 296_F 0.84 0.08 0.00
226_S 104_Q 0.84 0.08 0.00
30_D 536_T 0.84 0.08 0.00
142_A 606_T 0.84 0.08 0.00
181_I 225_N 0.84 0.08 0.00
399_F 259_C 0.84 0.08 0.00
375_G 515_T 0.84 0.08 0.00
318_A 4_V 0.84 0.08 0.00
87_H 610_K 0.84 0.08 0.00
237_W 411_L 0.84 0.08 0.00
49_T 480_L 0.84 0.08 0.00
312_S 558_W 0.84 0.08 0.00
161_N 88_A 0.84 0.08 0.00
173_V 268_D 0.84 0.08 0.00
284_L 258_L 0.84 0.08 0.00
241_M 293_A 0.84 0.08 0.00
253_Q 408_I 0.84 0.08 0.00
41_A 614_L 0.84 0.08 0.00
106_I 211_I 0.84 0.08 0.00
376_T 450_L 0.84 0.08 0.00
396_G 33_F 0.84 0.08 0.00
326_G 136_E 0.84 0.08 0.00
384_V 632_G 0.84 0.08 0.00
260_R 476_I 0.84 0.08 0.00
355_K 259_C 0.84 0.08 0.00
417_F 161_R 0.84 0.08 0.00
398_S 221_G 0.84 0.08 0.00
96_S 269_T 0.84 0.08 0.00
396_G 195_P 0.84 0.08 0.00
138_Y 202_F 0.84 0.08 0.00
422_L 553_A 0.84 0.08 0.00
160_K 2_V 0.84 0.08 0.00
355_K 176_L 0.83 0.08 0.00
77_S 315_G 0.83 0.08 0.00
33_L 80_A 0.83 0.08 0.00
155_R 97_S 0.83 0.08 0.00
218_I 104_Q 0.83 0.08 0.00
127_A 106_G 0.83 0.08 0.00
126_R 173_F 0.83 0.08 0.00
264_Y 241_R 0.83 0.08 0.00
381_E 21_D 0.83 0.08 0.00
171_L 392_Q 0.83 0.08 0.00
135_R 29_D 0.83 0.08 0.00
268_M 580_K 0.83 0.08 0.00
136_G 33_F 0.83 0.08 0.00
404_D 103_A 0.83 0.08 0.00
291_I 247_W 0.83 0.08 0.00
207_A 322_W 0.83 0.08 0.00
286_P 482_G 0.83 0.08 0.00
108_E 565_Y 0.83 0.08 0.00
251_L 323_E 0.83 0.08 0.00
132_I 294_G 0.83 0.08 0.00
328_V 290_I 0.83 0.08 0.00
218_I 281_E 0.83 0.08 0.00
54_I 449_A 0.83 0.08 0.00
331_I 107_M 0.83 0.08 0.00
119_I 413_L 0.83 0.08 0.00
19_A 6_V 0.83 0.08 0.00
300_L 79_L 0.83 0.08 0.00
113_L 562_G 0.83 0.08 0.00
381_E 389_D 0.83 0.08 0.00
106_I 110_F 0.83 0.08 0.00
195_L 185_K 0.83 0.08 0.00
391_L 621_V 0.83 0.08 0.00
217_T 201_D 0.83 0.08 0.00
61_G 582_F 0.83 0.08 0.00
333_E 573_P 0.83 0.08 0.00
107_L 297_G 0.83 0.08 0.00
196_R 263_C 0.83 0.08 0.00
168_S 260_P 0.83 0.08 0.00
340_A 11_V 0.83 0.08 0.00
51_D 331_E 0.83 0.08 0.00
275_L 220_S 0.83 0.08 0.00
176_G 112_L 0.82 0.08 0.00
153_R 32_L 0.82 0.08 0.00
357_T 225_N 0.82 0.08 0.00
114_L 556_A 0.82 0.08 0.00
129_V 420_L 0.82 0.08 0.00
121_A 338_G 0.82 0.08 0.00
190_N 173_F 0.82 0.08 0.00
237_W 395_F 0.82 0.08 0.00
249_M 271_S 0.82 0.08 0.00
114_L 342_G 0.82 0.08 0.00
255_S 125_G 0.82 0.08 0.00
157_Y 606_T 0.82 0.08 0.00
164_G 421_K 0.82 0.08 0.00
367_M 311_V 0.82 0.08 0.00
125_I 357_A 0.82 0.07 0.00
368_V 291_C 0.82 0.07 0.00
403_A 584_V 0.82 0.07 0.00
157_Y 515_T 0.82 0.07 0.00
310_P 204_E 0.82 0.07 0.00
30_D 380_S 0.82 0.07 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
ID Seq/Len Name Options I_Prob Status
4770 0.74 cI_1_4_cI_3_4_d1_tt Δgene:(1, 1) A:(1E-04, 1) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done - Shared
4747 0.8 cI_1_60_1_cI_3_4_tt Δgene:(1, ∞) A:(1E-60, 1) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done - Shared
4746 0.16 cI_1_20_1_cI_3_20_1_tt Δgene:(1, ∞) A:(1E-20, 1) B:(1E-20, 1) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done - Shared
4745 0.86 cI_1_4_cI_3_2_tt Δgene:(1, ∞) A:(1E-04, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done - Shared
4744 0.84 cI_1_4_cI_3_4_tt Δgene:(1, ∞) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.02 Done - Shared
4742 0.77 cI_1_40_cI_3_40_tt Δgene:(1, ∞) A:(1E-40, 8) B:(1E-40, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done - Shared
Page generated in 0.2566 seconds.