May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
cIV_A_60_cI_L_80_1_human
Genes: A B A+B
Length: 513 603 1110
Sequences: 3039 2111 1227
Seq/Len: 5.92 3.5 1.11
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.81
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show Jackhmmer results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.00 0.00 0.01
2 0.00 0.00 0.01
5 0.01 0.00 0.06
10 0.01 0.00 1.06
20 0.01 0.00 1.08
100 0.02 0.00 1.08
∞ 0.05 0.00 1.10
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
413_H 387_T 2.45 0.99 0.98
338_V 375_I 2.19 0.98 0.95
109_L 96_V 1.72 0.90 0.78
74_M 554_D 1.66 0.88 0.75
295_V 234_P 1.64 0.87 0.73
320_V 103_F 1.60 0.85 0.70
295_V 222_G 1.50 0.79 0.61
296_G 234_P 1.48 0.78 0.59
83_V 375_I 1.44 0.76 0.56
279_S 530_P 1.39 0.72 0.51
117_M 167_A 1.34 0.68 0.46
109_L 418_L 1.33 0.67 0.45
295_V 165_N 1.31 0.65 0.42
338_V 551_L 1.30 0.65 0.42
332_M 496_L 1.30 0.64 0.42
505_F 96_V 1.30 0.64 0.41
468_M 587_Y 1.28 0.62 0.39
295_V 158_W 1.27 0.62 0.39
204_A 556_T 1.26 0.60 0.37
20_L 341_M 1.25 0.59 0.36
229_I 283_I 1.25 0.59 0.36
298_D 234_P 1.25 0.59 0.36
459_F 217_L 1.25 0.59 0.36
172_K 556_T 1.23 0.58 0.35
274_V 582_G 1.23 0.58 0.35
116_A 413_L 1.22 0.57 0.34
87_I 334_F 1.22 0.57 0.34
296_G 158_W 1.21 0.56 0.32
470_F 182_F 1.19 0.54 0.31
295_V 139_Q 1.19 0.54 0.30
296_G 284_T 1.18 0.53 0.30
172_K 535_R 1.18 0.53 0.30
357_V 565_T 1.18 0.53 0.30
139_P 372_S 1.18 0.53 0.29
453_L 167_A 1.17 0.52 0.29
296_G 222_G 1.17 0.52 0.28
168_I 525_M 1.15 0.50 0.27
168_I 553_L 1.15 0.50 0.27
423_L 431_L 1.15 0.50 0.27
390_M 188_W 1.15 0.50 0.27
307_S 326_F 1.14 0.50 0.26
357_V 173_L 1.14 0.49 0.26
109_L 431_L 1.14 0.49 0.26
334_W 157_W 1.13 0.49 0.26
363_L 158_W 1.13 0.48 0.25
298_D 165_N 1.12 0.47 0.24
275_W 556_T 1.12 0.47 0.24
229_I 363_L 1.11 0.47 0.24
265_K 356_I 1.10 0.46 0.23
465_V 66_W 1.10 0.46 0.23
174_P 281_G 1.10 0.46 0.23
262_S 570_Q 1.10 0.45 0.23
406_D 361_G 1.10 0.45 0.23
295_V 284_T 1.10 0.45 0.23
122_A 267_A 1.10 0.45 0.23
3_A 537_I 1.09 0.45 0.22
36_L 373_L 1.09 0.45 0.22
477_A 500_T 1.09 0.45 0.22
298_D 572_S 1.09 0.45 0.22
281_G 333_A 1.09 0.45 0.22
205_G 257_I 1.09 0.45 0.22
185_V 225_A 1.09 0.45 0.22
397_F 415_A 1.09 0.44 0.22
327_L 527_G 1.09 0.44 0.22
229_I 82_L 1.08 0.44 0.22
7_L 190_I 1.08 0.44 0.22
270_Y 252_M 1.08 0.44 0.22
172_K 106_W 1.08 0.44 0.21
350_V 528_F 1.08 0.44 0.21
64_V 420_S 1.08 0.44 0.21
168_I 530_P 1.08 0.43 0.21
390_M 556_T 1.08 0.43 0.21
394_I 312_L 1.08 0.43 0.21
477_A 566_I 1.08 0.43 0.21
189_L 375_I 1.07 0.43 0.21
492_L 418_L 1.07 0.43 0.20
404_T 495_F 1.07 0.42 0.20
477_A 283_I 1.06 0.42 0.20
116_A 375_I 1.06 0.42 0.20
356_I 576_I 1.06 0.42 0.20
50_N 203_L 1.06 0.42 0.20
254_I 96_V 1.06 0.42 0.20
254_I 472_I 1.06 0.42 0.20
29_L 597_L 1.05 0.41 0.19
116_A 458_A 1.05 0.41 0.19
109_L 182_F 1.05 0.41 0.19
363_L 139_Q 1.05 0.41 0.19
406_D 571_I 1.05 0.41 0.19
204_A 106_W 1.04 0.41 0.19
434_S 588_F 1.04 0.40 0.18
20_L 420_S 1.04 0.40 0.18
403_Y 130_I 1.03 0.40 0.18
468_M 555_L 1.03 0.40 0.18
218_T 257_I 1.03 0.39 0.18
7_L 515_S 1.03 0.39 0.18
190_I 591_F 1.03 0.39 0.18
229_I 600_L 1.03 0.39 0.18
8_F 136_N 1.03 0.39 0.17
146_T 80_F 1.02 0.39 0.17
173_P 275_T 1.02 0.38 0.17
109_L 330_C 1.02 0.38 0.17
48_L 524_N 1.02 0.38 0.17
505_F 235_S 1.02 0.38 0.17
332_M 555_L 1.02 0.38 0.17
428_Q 300_K 1.02 0.38 0.17
258_V 408_A 1.01 0.38 0.17
258_V 561_L 1.01 0.38 0.16
470_F 443_I 1.01 0.37 0.16
330_S 296_N 1.01 0.37 0.16
430_F 83_D 1.01 0.37 0.16
218_T 81_K 1.01 0.37 0.16
311_I 288_A 1.00 0.37 0.16
356_I 522_F 1.00 0.37 0.16
50_N 488_L 1.00 0.37 0.16
489_S 167_A 1.00 0.36 0.15
297_M 235_S 1.00 0.36 0.15
472_I 213_L 1.00 0.36 0.15
394_I 560_K 1.00 0.36 0.15
338_V 286_L 1.00 0.36 0.15
187_S 587_Y 0.99 0.36 0.15
318_V 182_F 0.99 0.36 0.15
229_I 319_I 0.99 0.36 0.15
122_A 485_Y 0.99 0.36 0.15
501_P 591_F 0.99 0.36 0.15
74_M 186_L 0.99 0.35 0.15
109_L 116_Q 0.99 0.35 0.15
74_M 196_W 0.99 0.35 0.15
33_L 326_F 0.99 0.35 0.15
270_Y 155_I 0.98 0.35 0.14
440_Y 300_K 0.98 0.35 0.14
404_T 501_A 0.98 0.35 0.14
258_V 315_V 0.98 0.35 0.14
187_S 404_T 0.98 0.35 0.14
297_M 135_N 0.98 0.35 0.14
109_L 329_I 0.98 0.35 0.14
406_D 351_N 0.98 0.34 0.14
298_D 390_Y 0.98 0.34 0.14
490_M 44_F 0.98 0.34 0.14
187_S 394_H 0.98 0.34 0.14
119_E 111_D 0.97 0.34 0.14
175_A 527_G 0.97 0.34 0.14
401_S 426_M 0.97 0.34 0.14
64_V 479_Q 0.97 0.34 0.14
270_Y 281_G 0.97 0.34 0.14
298_D 503_D 0.97 0.34 0.14
416_I 595_L 0.97 0.34 0.14
447_Y 280_L 0.97 0.34 0.14
189_L 188_W 0.97 0.34 0.14
100_M 249_S 0.97 0.34 0.14
100_M 250_S 0.97 0.34 0.14
36_L 182_F 0.97 0.34 0.14
492_L 580_Q 0.97 0.34 0.14
275_W 106_W 0.97 0.34 0.14
176_M 593_F 0.97 0.34 0.14
282_F 530_P 0.97 0.33 0.14
116_A 195_S 0.97 0.33 0.14
161_A 408_A 0.97 0.33 0.14
155_V 578_S 0.96 0.33 0.14
508_P 152_F 0.96 0.33 0.14
391_G 411_I 0.96 0.33 0.13
298_D 158_W 0.96 0.33 0.13
146_T 123_I 0.96 0.33 0.13
419_I 371_T 0.96 0.33 0.13
271_M 556_T 0.96 0.33 0.13
168_I 451_L 0.96 0.33 0.13
270_Y 145_E 0.96 0.33 0.13
168_I 330_C 0.96 0.33 0.13
270_Y 147_V 0.96 0.33 0.13
482_V 500_T 0.96 0.33 0.13
32_A 504_L 0.96 0.33 0.13
40_E 262_R 0.96 0.33 0.13
189_L 376_G 0.96 0.33 0.13
179_Y 535_R 0.96 0.33 0.13
472_I 510_K 0.96 0.33 0.13
416_I 500_T 0.96 0.33 0.13
134_G 418_L 0.96 0.33 0.13
21_L 491_L 0.96 0.33 0.13
459_F 574_S 0.96 0.33 0.13
139_P 387_T 0.95 0.33 0.13
133_A 346_I 0.95 0.32 0.13
133_A 458_A 0.95 0.32 0.13
87_I 51_T 0.95 0.32 0.13
465_V 581_K 0.95 0.32 0.13
270_Y 239_G 0.95 0.32 0.13
342_L 522_F 0.95 0.32 0.13
505_F 330_C 0.95 0.32 0.13
174_P 376_G 0.95 0.32 0.13
231_Y 426_M 0.95 0.32 0.13
257_I 113_N 0.95 0.32 0.12
413_H 370_S 0.95 0.32 0.12
20_L 492_A 0.94 0.32 0.12
5_R 164_A 0.94 0.32 0.12
40_E 83_D 0.94 0.32 0.12
179_Y 134_A 0.94 0.32 0.12
434_S 411_I 0.94 0.32 0.12
155_V 206_A 0.94 0.32 0.12
412_I 565_T 0.94 0.32 0.12
141_A 527_G 0.94 0.31 0.12
357_V 583_M 0.94 0.31 0.12
410_A 85_F 0.94 0.31 0.12
253_M 554_D 0.94 0.31 0.12
357_V 538_P 0.94 0.31 0.12
282_F 459_A 0.94 0.31 0.12
139_P 322_P 0.94 0.31 0.12
453_L 442_N 0.94 0.31 0.12
270_Y 171_A 0.94 0.31 0.12
447_Y 376_G 0.93 0.31 0.12
198_S 293_L 0.93 0.31 0.12
492_L 131_L 0.93 0.30 0.12
464_A 76_L 0.93 0.30 0.12
180_Q 556_T 0.93 0.30 0.12
187_S 215_G 0.93 0.30 0.12
218_T 566_I 0.93 0.30 0.12
297_M 234_P 0.93 0.30 0.11
218_T 194_N 0.93 0.30 0.11
314_I 564_K 0.93 0.30 0.11
359_A 494_T 0.93 0.30 0.11
53_I 115_N 0.92 0.30 0.11
334_W 254_V 0.92 0.30 0.11
97_M 502_L 0.92 0.30 0.11
139_P 579_T 0.92 0.30 0.11
403_Y 571_I 0.92 0.30 0.11
407_Q 578_S 0.92 0.30 0.11
223_A 331_T 0.92 0.30 0.11
7_L 589_L 0.92 0.30 0.11
501_P 497_G 0.92 0.30 0.11
174_P 68_W 0.92 0.29 0.11
270_Y 353_E 0.92 0.29 0.11
27_G 502_L 0.92 0.29 0.11
430_F 262_R 0.92 0.29 0.11
155_V 207_N 0.92 0.29 0.11
297_M 74_T 0.91 0.29 0.11
282_F 565_T 0.91 0.29 0.11
463_T 577_T 0.91 0.29 0.11
85_L 300_K 0.91 0.29 0.11
416_I 553_L 0.91 0.29 0.11
278_M 544_T 0.91 0.29 0.11
419_I 574_S 0.91 0.29 0.11
257_I 263_F 0.91 0.29 0.10
258_V 462_L 0.91 0.29 0.10
453_L 10_L 0.91 0.29 0.10
497_G 264_H 0.90 0.28 0.10
274_V 376_G 0.90 0.28 0.10
7_L 544_T 0.90 0.28 0.10
413_H 555_L 0.90 0.28 0.10
155_V 40_V 0.90 0.28 0.10
27_G 369_T 0.90 0.28 0.10
336_A 505_N 0.90 0.28 0.10
270_Y 295_Q 0.90 0.28 0.10
359_A 55_M 0.90 0.28 0.10
400_F 231_P 0.90 0.28 0.10
419_I 595_L 0.90 0.28 0.10
307_S 502_L 0.90 0.28 0.10
509_V 556_T 0.90 0.28 0.10
155_V 524_N 0.90 0.28 0.10
43_Q 322_P 0.90 0.28 0.10
193_V 449_T 0.90 0.28 0.10
175_A 574_S 0.90 0.28 0.10
506_E 539_Y 0.90 0.28 0.10
229_I 590_S 0.90 0.28 0.10
295_V 196_W 0.89 0.28 0.10
327_L 156_S 0.89 0.28 0.10
398_P 312_L 0.89 0.28 0.10
116_A 188_W 0.89 0.28 0.10
492_L 544_T 0.89 0.28 0.10
357_V 71_T 0.89 0.28 0.10
413_H 160_A 0.89 0.27 0.10
314_I 562_L 0.89 0.27 0.10
357_V 590_S 0.89 0.27 0.10
482_V 391_S 0.89 0.27 0.10
257_I 551_L 0.89 0.27 0.10
254_I 87_M 0.89 0.27 0.10
492_L 553_L 0.89 0.27 0.10
511_M 74_T 0.89 0.27 0.10
143_V 83_D 0.89 0.27 0.10
365_I 490_A 0.89 0.27 0.10
190_I 576_I 0.89 0.27 0.10
257_I 72_Q 0.89 0.27 0.10
338_V 264_H 0.89 0.27 0.10
187_S 539_Y 0.88 0.27 0.09
257_I 42_S 0.88 0.27 0.09
83_V 588_F 0.88 0.27 0.09
463_T 573_T 0.88 0.27 0.09
97_M 373_L 0.88 0.27 0.09
128_V 298_I 0.88 0.27 0.09
218_T 545_S 0.88 0.26 0.09
223_A 378_L 0.88 0.26 0.09
505_F 530_P 0.88 0.26 0.09
412_I 424_T 0.88 0.26 0.09
434_S 491_L 0.88 0.26 0.09
447_Y 493_V 0.88 0.26 0.09
479_K 106_W 0.87 0.26 0.09
155_V 555_L 0.87 0.26 0.09
448_T 565_T 0.87 0.26 0.09
403_Y 573_T 0.87 0.26 0.09
512_K 323_H 0.87 0.26 0.09
478_S 547_N 0.87 0.26 0.09
465_V 129_L 0.87 0.26 0.09
356_I 315_V 0.87 0.26 0.09
498_C 158_W 0.87 0.26 0.09
504_T 534_H 0.87 0.26 0.09
21_L 511_L 0.87 0.26 0.09
419_I 573_T 0.87 0.26 0.09
392_G 587_Y 0.87 0.26 0.09
306_T 262_R 0.87 0.26 0.09
223_A 68_W 0.87 0.26 0.09
391_G 580_Q 0.87 0.26 0.09
391_G 218_L 0.87 0.26 0.09
412_I 590_S 0.87 0.26 0.09
453_L 450_L 0.87 0.26 0.09
388_A 152_F 0.87 0.26 0.09
220_F 140_L 0.87 0.26 0.09
198_S 549_P 0.86 0.26 0.09
85_L 183_I 0.86 0.25 0.09
250_G 399_A 0.86 0.25 0.09
46_N 269_N 0.86 0.25 0.09
504_T 238_E 0.86 0.25 0.09
263_G 593_F 0.86 0.25 0.09
393_F 423_S 0.86 0.25 0.09
415_T 571_I 0.86 0.25 0.08
406_D 591_F 0.86 0.25 0.08
345_I 408_A 0.86 0.25 0.08
441_S 416_T 0.86 0.25 0.08
391_G 266_L 0.85 0.25 0.08
388_A 555_L 0.85 0.25 0.08
476_F 74_T 0.85 0.25 0.08
334_W 247_L 0.85 0.25 0.08
278_M 167_A 0.85 0.25 0.08
139_P 221_A 0.85 0.24 0.08
417_M 173_L 0.85 0.24 0.08
279_S 82_L 0.85 0.24 0.08
254_I 351_N 0.85 0.24 0.08
338_V 570_Q 0.85 0.24 0.08
274_V 252_M 0.85 0.24 0.08
363_L 480_T 0.85 0.24 0.08
297_M 524_N 0.85 0.24 0.08
253_M 599_L 0.85 0.24 0.08
42_G 411_I 0.85 0.24 0.08
510_Y 163_D 0.85 0.24 0.08
410_A 466_F 0.85 0.24 0.08
278_M 561_L 0.85 0.24 0.08
176_M 591_F 0.85 0.24 0.08
453_L 92_V 0.84 0.24 0.08
82_L 163_D 0.84 0.24 0.08
320_V 100_I 0.84 0.24 0.08
334_W 227_L 0.84 0.24 0.08
419_I 298_I 0.84 0.24 0.08
404_T 185_A 0.84 0.24 0.08
332_M 318_G 0.84 0.24 0.08
32_A 69_A 0.84 0.24 0.08
393_F 231_P 0.84 0.24 0.08
406_D 403_Y 0.84 0.24 0.08
146_T 345_S 0.84 0.24 0.08
262_S 424_T 0.84 0.24 0.08
469_I 264_H 0.84 0.24 0.08
44_P 337_A 0.84 0.24 0.08
469_I 489_T 0.84 0.24 0.08
7_L 378_L 0.84 0.24 0.08
298_D 573_T 0.84 0.24 0.08
253_M 182_F 0.84 0.24 0.08
281_G 83_D 0.84 0.24 0.08
330_S 563_P 0.84 0.24 0.08
465_V 566_I 0.84 0.24 0.08
335_S 546_Q 0.84 0.24 0.08
262_S 200_Q 0.84 0.24 0.08
7_L 555_L 0.84 0.24 0.08
399_L 249_S 0.84 0.24 0.08
20_L 523_S 0.84 0.24 0.08
250_G 415_A 0.84 0.24 0.08
399_L 250_S 0.84 0.24 0.08
279_S 204_L 0.84 0.24 0.08
57_I 510_K 0.84 0.23 0.08
483_L 368_L 0.84 0.23 0.08
109_L 338_M 0.84 0.23 0.08
459_F 588_F 0.84 0.23 0.08
441_S 300_K 0.84 0.23 0.07
25_W 342_C 0.84 0.23 0.07
295_V 187_A 0.83 0.23 0.07
460_I 532_I 0.83 0.23 0.07
281_G 556_T 0.83 0.23 0.07
330_S 120_Y 0.83 0.23 0.07
391_G 522_F 0.83 0.23 0.07
204_A 535_R 0.83 0.23 0.07
218_T 451_L 0.83 0.23 0.07
262_S 477_H 0.83 0.23 0.07
314_I 279_C 0.83 0.23 0.07
261_Y 149_I 0.83 0.23 0.07
258_V 323_H 0.83 0.23 0.07
4_D 594_P 0.83 0.23 0.07
337_A 274_Q 0.83 0.23 0.07
356_I 391_S 0.83 0.23 0.07
5_R 453_P 0.83 0.23 0.07
155_V 568_Q 0.83 0.23 0.07
161_A 91_P 0.83 0.23 0.07
509_V 545_S 0.83 0.23 0.07
469_I 581_K 0.83 0.23 0.07
363_L 435_P 0.83 0.23 0.07
2_F 390_Y 0.83 0.23 0.07
134_G 77_S 0.83 0.23 0.07
498_C 222_G 0.83 0.23 0.07
469_I 543_L 0.83 0.23 0.07
42_G 173_L 0.83 0.23 0.07
390_M 588_F 0.83 0.23 0.07
472_I 539_Y 0.83 0.23 0.07
298_D 570_Q 0.83 0.23 0.07
393_F 407_W 0.83 0.23 0.07
490_M 594_P 0.83 0.23 0.07
412_I 542_L 0.83 0.23 0.07
262_S 283_I 0.83 0.23 0.07
114_A 602_I 0.82 0.23 0.07
401_S 126_I 0.82 0.23 0.07
483_L 569_H 0.82 0.23 0.07
74_M 557_W 0.82 0.23 0.07
275_W 157_W 0.82 0.23 0.07
365_I 360_G 0.82 0.23 0.07
73_I 325_A 0.82 0.22 0.07
82_L 166_T 0.82 0.22 0.07
296_G 165_N 0.82 0.22 0.07
128_V 136_N 0.82 0.22 0.07
263_G 135_N 0.82 0.22 0.07
504_T 155_I 0.82 0.22 0.07
145_L 110_S 0.82 0.22 0.07
398_P 317_I 0.82 0.22 0.07
460_I 587_Y 0.82 0.22 0.07
407_Q 596_I 0.82 0.22 0.07
33_L 356_I 0.82 0.22 0.07
282_F 540_L 0.82 0.22 0.07
482_V 497_G 0.82 0.22 0.07
187_S 430_T 0.82 0.22 0.07
311_I 489_T 0.82 0.22 0.07
399_L 89_F 0.82 0.22 0.07
83_V 553_L 0.82 0.22 0.07
311_I 262_R 0.82 0.22 0.07
282_F 580_Q 0.82 0.22 0.07
492_L 464_A 0.82 0.22 0.07
453_L 492_A 0.82 0.22 0.07
146_T 427_I 0.82 0.22 0.07
176_M 283_I 0.81 0.22 0.07
155_V 551_L 0.81 0.22 0.07
472_I 560_K 0.81 0.22 0.07
134_G 558_L 0.81 0.22 0.07
69_M 469_T 0.81 0.22 0.07
399_L 292_A 0.81 0.22 0.07
481_K 375_I 0.81 0.22 0.07
274_V 304_F 0.81 0.22 0.07
182_P 367_P 0.81 0.22 0.07
274_V 118_F 0.81 0.22 0.07
356_I 275_T 0.81 0.22 0.07
306_T 83_D 0.81 0.22 0.07
282_F 69_A 0.81 0.22 0.07
386_V 385_F 0.81 0.22 0.07
297_M 9_T 0.81 0.22 0.07
404_T 566_I 0.81 0.22 0.07
307_S 316_T 0.81 0.22 0.07
413_H 153_L 0.81 0.22 0.07
263_G 530_P 0.81 0.22 0.07
42_G 597_L 0.81 0.22 0.07
118_V 389_F 0.81 0.22 0.07
460_I 386_L 0.81 0.22 0.07
388_A 314_M 0.81 0.22 0.07
229_I 163_D 0.81 0.22 0.07
63_F 364_K 0.81 0.22 0.07
337_A 566_I 0.81 0.22 0.07
473_W 249_S 0.81 0.22 0.07
175_A 598_T 0.81 0.22 0.07
334_W 100_I 0.81 0.22 0.07
473_W 250_S 0.81 0.22 0.07
261_Y 247_L 0.81 0.22 0.07
363_L 577_T 0.81 0.22 0.07
21_L 69_A 0.81 0.21 0.07
335_S 277_T 0.81 0.21 0.07
42_G 522_F 0.81 0.21 0.07
428_Q 140_L 0.81 0.21 0.07
168_I 533_T 0.81 0.21 0.07
505_F 553_L 0.81 0.21 0.07
327_L 327_L 0.81 0.21 0.07
356_I 96_V 0.81 0.21 0.07
187_S 518_C 0.81 0.21 0.07
258_V 132_V 0.81 0.21 0.07
145_L 490_A 0.81 0.21 0.07
270_Y 121_L 0.80 0.21 0.06
298_D 418_L 0.80 0.21 0.06
501_P 316_T 0.80 0.21 0.06
187_S 511_L 0.80 0.21 0.06
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
ID Seq/Len Name Options I_Prob Status
4654 2.53 cIV_A_80_cI_L_80_human Δgene:(1, ∞) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 2) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.03 Done - Shared
4652 3.11 cIV_A_80_cI_L_80_human Δgene:(1, ∞) A:(1E-40, 8) B:(1E-80, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.02 Done - Shared
4453 1.1 cIV_A_60_cI_L_80_1_human Δgene:(1, ∞) A:(1E-40, 8) B:(1E-80, 1) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.97 Done - Shared
4452 1.11 cIV_A_60_cI_L_80_1_human Δgene:(1, ∞) A:(1E-60, 8) B:(1E-80, 1) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.98 Done - Shared
4451 1.1 cIV_A_80_cI_L_80_1_human Δgene:(1, ∞) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 1) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.97 Done - Shared
Page generated in 0.0491 seconds.