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OPENSEQ.org

Av1alpha-Av1beta_31

Genes: A B A+B
Length: 477 522 936
Sequences: 2550 2133 2104
Seq/Len: 5.35 4.09 2.25
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.99
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show Jackhmmer results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.

Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.61 0.57 2.11
2 0.62 0.59 2.11
5 0.63 0.59 2.11
10 0.65 0.60 2.11
20 0.66 0.61 2.11
100 0.75 0.72 2.11
0.77 0.74 2.11
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!

GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.
Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
311_A 333_E 5.38 1.00 1.00
323_E 341_A 5.29 1.00 1.00
257_S 278_E 5.22 1.00 1.00
165_K 166_N 5.01 1.00 1.00
240_E 244_S 5.00 1.00 1.00
169_A 170_K 4.99 1.00 1.00
304_E 326_E 4.95 1.00 1.00
137_T 139_A 4.87 1.00 1.00
285_E 306_G 4.80 1.00 1.00
258_E 279_E 4.77 1.00 1.00
284_E 305_E 4.72 1.00 1.00
326_A 344_T 4.67 1.00 1.00
300_T 322_D 4.66 1.00 1.00
261_L 282_D 4.62 1.00 1.00
245_R 249_G 4.60 1.00 1.00
201_D 205_R 4.53 1.00 1.00
140_P 142_K 4.53 1.00 1.00
222_I 225_I 4.50 1.00 1.00
133_D 135_Q 4.49 1.00 1.00
370_E 388_E 4.48 1.00 1.00
209_E 213_D 4.45 1.00 1.00
130_K 132_D 4.44 1.00 1.00
260_E 281_K 4.44 1.00 1.00
464_L 500_I 4.42 1.00 1.00
281_R 302_K 4.38 1.00 1.00
166_V 167_N 4.38 1.00 1.00
161_E 162_N 4.38 1.00 1.00
286_K 307_T 4.37 1.00 1.00
208_D 212_M 4.37 1.00 1.00
269_L 290_V 4.35 1.00 1.00
308_A 330_K 4.33 1.00 1.00
412_R 435_T 4.33 1.00 1.00
220_V 223_I 4.33 1.00 1.00
126_K 128_Q 4.32 1.00 1.00
312_K 334_I 4.28 1.00 1.00
199_V 203_I 4.26 1.00 1.00
241_E 245_E 4.24 1.00 1.00
207_R 211_S 4.23 1.00 1.00
170_E 171_E 4.22 1.00 1.00
460_M 496_L 4.22 1.00 1.00
347_R 365_R 4.22 1.00 1.00
451_D 487_E 4.21 1.00 1.00
217_P 220_N 4.21 1.00 1.00
372_V 390_V 4.19 1.00 1.00
292_M 313_P 4.18 1.00 1.00
327_K 345_K 4.17 1.00 1.00
314_D 336_G 4.17 1.00 1.00
350_L 368_L 4.16 1.00 1.00
414_K 437_K 4.16 1.00 1.00
175_I 180_V 4.16 1.00 1.00
255_S 276_T 4.14 1.00 1.00
206_K 210_K 4.13 1.00 1.00
259_I 280_M 4.12 1.00 1.00
235_S 239_I 4.12 1.00 1.00
143_K 144_D 4.11 1.00 1.00
176_V 181_P 4.11 1.00 1.00
256_I 277_Q 4.09 1.00 1.00
408_E 431_S 4.09 1.00 1.00
160_I 161_L 4.05 1.00 1.00
238_L 242_M 4.04 1.00 1.00
315_E 337_Q 4.02 1.00 1.00
172_S 177_E 4.01 1.00 1.00
411_K 434_F 3.96 1.00 1.00
360_V 378_L 3.96 1.00 1.00
417_L 440_F 3.92 1.00 1.00
336_V 354_M 3.89 1.00 1.00
288_G 309_K 3.88 1.00 1.00
198_A 202_G 3.87 1.00 1.00
244_L 248_V 3.86 1.00 1.00
321_C 339_I 3.85 1.00 1.00
173_K 178_F 3.85 1.00 1.00
299_P 321_L 3.84 1.00 1.00
330_P 348_G 3.84 1.00 1.00
410_V 433_V 3.83 1.00 1.00
129_A 131_K 3.81 1.00 1.00
216_T 219_S 3.80 1.00 1.00
306_L 328_L 3.80 1.00 1.00
168_G 169_K 3.79 1.00 1.00
418_I 441_M 3.77 1.00 1.00
162_S 163_A 3.77 1.00 1.00
463_T 499_S 3.75 1.00 1.00
205_G 209_L 3.75 1.00 1.00
264_K 285_N 3.75 1.00 1.00
361_I 379_V 3.75 1.00 1.00
266_K 287_L 3.71 1.00 1.00
218_Y 221_K 3.71 1.00 1.00
239_L 243_L 3.70 1.00 1.00
236_R 240_K 3.66 1.00 1.00
132_I 134_L 3.66 1.00 1.00
237_I 241_R 3.64 1.00 1.00
262_T 283_A 3.64 1.00 1.00
337_A 355_T 3.61 1.00 1.00
309_I 331_V 3.60 1.00 1.00
291_W 312_V 3.58 1.00 1.00
367_L 385_L 3.57 1.00 1.00
419_G 442_I 3.56 1.00 1.00
147_V 148_V 3.56 1.00 1.00
202_W 206_Y 3.56 1.00 1.00
200_R 204_A 3.54 1.00 1.00
331_E 349_R 3.54 1.00 1.00
362_G 380_K 3.54 1.00 1.00
177_P 182_F 3.53 1.00 1.00
287_Y 308_W 3.52 1.00 1.00
454_A 490_M 3.52 1.00 1.00
369_M 387_C 3.52 1.00 1.00
76_I 85_M 3.51 1.00 1.00
164_S 165_I 3.49 1.00 1.00
310_A 332_S 3.48 1.00 1.00
282_H 303_F 3.47 1.00 1.00
72_I 81_F 3.47 1.00 1.00
427_I 450_I 3.46 1.00 1.00
232_A 236_F 3.46 1.00 1.00
136_E 138_K 3.46 1.00 1.00
135_V 137_C 3.46 1.00 1.00
374_T 392_I 3.46 1.00 1.00
448_H 484_L 3.45 1.00 1.00
118_K 120_D 3.43 1.00 1.00
307_R 329_M 3.40 1.00 1.00
409_F 432_L 3.40 1.00 1.00
358_R 376_M 3.39 1.00 1.00
359_H 377_G 3.39 1.00 1.00
116_Q 118_T 3.38 1.00 1.00
197_D 201_E 3.38 1.00 1.00
242_M 246_M 3.36 1.00 1.00
203_V 207_F 3.35 1.00 1.00
381_N 399_K 3.35 1.00 1.00
75_M 84_T 3.35 1.00 1.00
145_I 146_I 3.33 1.00 1.00
344_E 362_H 3.32 1.00 1.00
348_V 366_F 3.32 1.00 1.00
413_I 436_D 3.31 1.00 1.00
325_I 343_L 3.30 1.00 1.00
78_I 87_Y 3.29 1.00 1.00
406_F 429_L 3.28 1.00 1.00
219_D 222_K 3.27 1.00 1.00
455_I 491_Q 3.26 1.00 1.00
194_I 198_N 3.25 1.00 1.00
246_C 250_Y 3.25 1.00 1.00
121_V 123_V 3.24 1.00 1.00
144_G 145_M 3.24 1.00 1.00
163_V 164_F 3.23 1.00 1.00
293_E 314_K 3.23 1.00 1.00
271_H 292_L 3.23 1.00 1.00
278_Y 299_K 3.21 1.00 1.00
341_P 359_T 3.21 1.00 1.00
333_E 351_V 3.21 1.00 1.00
453_F 489_A 3.21 1.00 1.00
167_K 168_S 3.20 1.00 1.00
324_V 342_S 3.19 1.00 1.00
73_K 82_E 3.18 1.00 1.00
301_K 323_W 3.18 1.00 1.00
335_V 353_M 3.17 1.00 1.00
343_L 361_L 3.17 1.00 1.00
297_F 319_M 3.17 1.00 1.00
456_F 492_I 3.15 1.00 1.00
171_L 172_G 3.14 1.00 1.00
397_L 420_V 3.13 1.00 1.00
267_L 288_N 3.13 1.00 1.00
313_F 335_S 3.11 1.00 1.00
215_S 218_G 3.11 1.00 1.00
204_L 208_T 3.11 1.00 1.00
74_D 83_K 3.10 1.00 1.00
371_V 389_P 3.09 1.00 1.00
289_I 310_H 3.09 1.00 1.00
131_L 133_G 3.06 1.00 1.00
332_W 350_L 3.06 1.00 1.00
184_R 189_V 3.06 1.00 1.00
459_D 495_T 3.06 1.00 1.00
149_S 150_T 3.05 1.00 1.00
179_R 184_H 3.04 1.00 1.00
223_I 226_V 3.03 1.00 1.00
396_L 419_T 3.03 1.00 1.00
277_N 298_E 3.03 1.00 1.00
178_V 183_A 3.01 1.00 1.00
279_I 300_T 2.98 1.00 1.00
465_N 501_L 2.98 1.00 1.00
466_N 502_E 2.96 1.00 1.00
302_T 324_T 2.96 1.00 1.00
470_K 506_E 2.95 1.00 1.00
138_L 140_T 2.93 1.00 1.00
342_R 360_W 2.91 1.00 1.00
365_E 383_L 2.90 1.00 1.00
270_V 291_L 2.90 1.00 1.00
86_G 95_V 2.87 1.00 1.00
280_S 301_K 2.85 1.00 1.00
79_S 88_V 2.85 1.00 1.00
339_Y 357_S 2.83 1.00 1.00
404_Y 427_W 2.83 1.00 1.00
373_G 391_H 2.83 1.00 1.00
376_Y 394_C 2.83 1.00 1.00
394_S 417_N 2.82 1.00 1.00
364_Y 382_L 2.82 1.00 1.00
461_D 497_V 2.82 1.00 1.00
405_E 428_H 2.81 1.00 1.00
467_P 503_R 2.81 1.00 1.00
125_D 127_Q 2.81 1.00 1.00
457_A 493_L 2.80 1.00 1.00
115_F 117_M 2.80 1.00 1.00
357_P 375_V 2.79 1.00 1.00
351_Y 369_W 2.79 1.00 1.00
108_T 110_V 2.78 1.00 1.00
432_G 462_E 2.77 1.00 1.00
153_I 154_A 2.77 1.00 1.00
65_K 75_V 2.77 1.00 1.00
366_D 384_E 2.76 1.00 1.00
294_Y 315_L 2.76 1.00 1.00
263_P 284_P 2.76 1.00 1.00
346_K 364_K 2.76 1.00 1.00
247_V 251_S 2.75 1.00 1.00
349_M 367_A 2.75 1.00 1.00
196_N 200_F 2.74 1.00 1.00
234_S 238_V 2.71 1.00 1.00
273_Y 294_P 2.70 1.00 1.00
395_T 418_A 2.70 1.00 1.00
174_T 179_P 2.69 1.00 1.00
254_G 275_T 2.67 1.00 1.00
340_R 358_H 2.66 1.00 1.00
458_R 494_T 2.66 1.00 1.00
265_V 286_A 2.65 1.00 1.00
468_C 504_L 2.65 1.00 1.00
428_F 451_Q 2.64 1.00 1.00
119_D 121_A 2.63 1.00 1.00
190_L 194_T 2.63 1.00 1.00
290_P 311_E 2.63 1.00 1.00
87_Q 96_A 2.59 1.00 1.00
134_E 136_N 2.56 1.00 1.00
233_W 237_R 2.55 1.00 1.00
363_A 381_F 2.55 1.00 1.00
426_F 449_F 2.54 1.00 1.00
398_Y 421_Y 2.52 1.00 0.99
447_Y 483_T 2.52 1.00 0.99
139_F 141_Y 2.52 1.00 0.99
214_A 217_V 2.51 1.00 0.99
305_S 327_F 2.50 1.00 0.99
407_E 430_R 2.49 1.00 0.99
195_A 199_M 2.48 1.00 0.99
380_H 398_N 2.48 1.00 0.99
50_Q 60_A 2.48 1.00 0.99
120_I 122_A 2.48 1.00 0.99
445_G 481_S 2.47 1.00 0.99
303_I 325_D 2.46 1.00 0.99
334_A 352_D 2.46 1.00 0.99
112_T 114_S 2.45 1.00 0.99
148_Q 149_S 2.45 1.00 0.99
243_G 247_G 2.45 1.00 0.99
110_N 112_C 2.44 1.00 0.99
379_A 397_G 2.44 1.00 0.99
390_E 411_A 2.44 1.00 0.99
433_I 463_V 2.43 1.00 0.99
251_S 272_A 2.43 1.00 0.99
462_M 498_N 2.41 1.00 0.99
389_K 410_A 2.41 1.00 0.99
47_K 57_Q 2.40 1.00 0.99
187_S 191_S 2.40 1.00 0.99
415_P 438_P 2.39 1.00 0.99
283_M 304_V 2.38 1.00 0.99
328_Y 346_E 2.38 1.00 0.99
295_N 316_N 2.37 1.00 0.99
64_S 74_A 2.36 1.00 0.99
53_L 63_V 2.36 1.00 0.99
345_G 363_G 2.36 1.00 0.99
382_D 400_R 2.35 1.00 0.99
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309_I 248_V 0.18 0.03 0.00
324_V 242_M 0.18 0.03 0.00
113_S 89_H 0.18 0.03 0.00
290_P 305_E 0.18 0.03 0.00
49_S 60_A 0.18 0.03 0.00
399_D 424_K 0.18 0.03 0.00
235_S 327_F 0.18 0.03 0.00
406_F 367_A 0.18 0.03 0.00
142_N 146_I 0.18 0.03 0.00
305_S 239_I 0.18 0.03 0.00
205_G 284_P 0.18 0.03 0.00
241_E 343_L 0.18 0.03 0.00
216_T 221_K 0.18 0.03 0.00
420_S 447_G 0.17 0.03 0.00
243_G 249_G 0.17 0.03 0.00
31_V 45_W 0.17 0.03 0.00
43_I 54_L 0.17 0.03 0.00
212_T 216_V 0.17 0.03 0.00
214_A 216_V 0.17 0.03 0.00
79_S 95_V 0.17 0.03 0.00
424_E 443_G 0.17 0.03 0.00
396_L 421_Y 0.17 0.03 0.00
136_E 172_G 0.17 0.03 0.00
261_L 251_S 0.17 0.03 0.00
217_P 287_L 0.17 0.03 0.00
323_E 345_K 0.17 0.03 0.00
41_K 47_T 0.17 0.03 0.00
459_D 481_S 0.17 0.03 0.00
219_D 286_A 0.17 0.03 0.00
237_I 342_S 0.17 0.03 0.00
33_D 49_K 0.17 0.03 0.00
333_E 355_T 0.17 0.03 0.00
98_I 106_F 0.17 0.03 0.00
247_V 268_F 0.17 0.03 0.00
191_G 190_G 0.17 0.03 0.00
364_Y 366_F 0.17 0.03 0.00
105_A 106_F 0.17 0.03 0.00
33_D 48_T 0.17 0.03 0.00
301_K 380_K 0.17 0.03 0.00
44_I 53_E 0.17 0.03 0.00
362_G 323_W 0.17 0.03 0.00
463_T 466_I 0.17 0.03 0.00
445_G 495_T 0.17 0.03 0.00
267_L 335_S 0.17 0.03 0.00
245_R 247_G 0.17 0.03 0.00
214_A 215_K 0.17 0.03 0.00
337_A 351_V 0.17 0.03 0.00
177_P 161_L 0.17 0.03 0.00
205_G 307_T 0.17 0.03 0.00
302_T 489_A 0.17 0.03 0.00
30_A 49_K 0.17 0.03 0.00
171_L 138_K 0.17 0.03 0.00
457_A 357_S 0.17 0.03 0.00
348_V 382_L 0.17 0.03 0.00
309_I 243_L 0.17 0.03 0.00
86_G 88_V 0.17 0.03 0.00
453_F 324_T 0.17 0.03 0.00
245_R 221_K 0.17 0.03 0.00
39_S 45_W 0.17 0.03 0.00
204_L 207_F 0.17 0.03 0.00
411_K 431_S 0.17 0.03 0.00
216_T 220_N 0.17 0.03 0.00
165_K 162_N 0.17 0.03 0.00
226_Y 230_E 0.17 0.03 0.00
418_I 74_A 0.17 0.03 0.00
325_I 342_S 0.17 0.03 0.00
211_T 215_K 0.17 0.03 0.00
207_R 212_M 0.17 0.03 0.00
161_E 166_N 0.17 0.03 0.00
442_D 476_H 0.17 0.03 0.00
262_T 289_T 0.17 0.03 0.00
32_N 51_Y 0.17 0.03 0.00
33_D 43_F 0.17 0.03 0.00
381_N 398_N 0.17 0.03 0.00
64_S 441_M 0.16 0.03 0.00
29_L 41_E 0.16 0.03 0.00
217_P 219_S 0.16 0.03 0.00
43_I 52_Q 0.16 0.03 0.00
185_G 195_G 0.16 0.03 0.00
460_M 442_I 0.16 0.03 0.00
239_L 331_V 0.16 0.03 0.00
260_E 209_L 0.16 0.03 0.00
372_V 438_P 0.16 0.03 0.00
438_M 378_L 0.16 0.03 0.00
268_N 283_A 0.16 0.03 0.00
285_E 302_K 0.16 0.03 0.00
459_D 483_T 0.16 0.03 0.00
115_F 154_A 0.16 0.03 0.00
314_D 335_S 0.16 0.03 0.00
349_M 438_P 0.16 0.03 0.00
447_Y 495_T 0.16 0.03 0.00
174_T 180_V 0.16 0.03 0.00
22_R 32_E 0.16 0.03 0.00
238_L 342_S 0.16 0.03 0.00
325_I 329_M 0.16 0.03 0.00
45_S 56_F 0.16 0.03 0.00
34_P 44_Q 0.16 0.03 0.00
176_V 182_F 0.16 0.03 0.00
170_E 172_G 0.16 0.03 0.00
389_K 403_K 0.16 0.03 0.00
227_N 317_I 0.16 0.03 0.00
376_Y 405_V 0.16 0.03 0.00
371_V 379_V 0.16 0.03 0.00
314_D 338_P 0.16 0.03 0.00
384_Y 403_K 0.16 0.03 0.00
313_F 288_N 0.16 0.03 0.00
20_K 34_Y 0.16 0.03 0.00
272_C 371_D 0.16 0.03 0.00
341_P 362_H 0.16 0.03 0.00
353_G 293_Q 0.16 0.03 0.00
43_I 55_N 0.16 0.03 0.00
302_T 384_E 0.16 0.03 0.00
408_E 434_F 0.16 0.03 0.00
167_K 134_L 0.16 0.03 0.00
153_I 117_M 0.16 0.03 0.00
177_P 181_P 0.16 0.03 0.00
135_V 87_Y 0.16 0.03 0.00
157_G 157_I 0.16 0.03 0.00
231_D 230_E 0.16 0.03 0.00
156_I 158_G 0.16 0.03 0.00
324_V 343_L 0.16 0.03 0.00
313_F 336_G 0.16 0.03 0.00
40_K 45_W 0.16 0.03 0.00
381_N 400_R 0.16 0.03 0.00
286_K 209_L 0.16 0.03 0.00
205_G 281_K 0.16 0.03 0.00
78_I 137_C 0.16 0.03 0.00
32_N 42_V 0.16 0.03 0.00
387_T 412_S 0.16 0.03 0.00
383_D 404_A 0.16 0.03 0.00
35_A 47_T 0.16 0.03 0.00
265_V 222_K 0.16 0.03 0.00
218_Y 249_G 0.16 0.03 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

WARNING: The input alignment may be corrupted!
  • For sequence A, there is a high ratio (0.66 > 0.4) of paralogs.
  • For sequence B, there is a high ratio (0.61 > 0.4) of paralogs.
  • Sequence A is very similar to Sequence B (HHΔ = 0.108), these maybe paralogs! HHΔ is a measure (0 to 1) of how different two alignments are (the larger the value the more different they are).

ID Seq/Len Name Options I_Prob Status
3726 0 Av1alpha-Av1beta_48 Δgene:(1, ∞) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3725 0 Av1alpha-Av1beta_47 Δgene:(1, 100) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3724 0 Av1alpha-Av1beta_46 Δgene:(1, 20) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3723 2.29 Av1alpha-Av1beta_45 Δgene:(0, ∞) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3722 2.29 Av1alpha-Av1beta_44 Δgene:(0, 100) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3721 2.29 Av1alpha-Av1beta_43 Δgene:(0, 20) A:(1E-02, 8) B:(1E-02, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3720 0 Av1alpha-Av1beta_42 Δgene:(1, ∞) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3719 0 Av1alpha-Av1beta_41 Δgene:(1, 100) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3718 0 Av1alpha-Av1beta_40 Δgene:(1, 20) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3717 2.3 Av1alpha-Av1beta_39 Δgene:(0, ∞) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3716 2.3 Av1alpha-Av1beta_38 Δgene:(0, 100) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3715 2.3 Av1alpha-Av1beta_37 Δgene:(0, 20) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3714 0 Av1alpha-Av1beta_36 Δgene:(1, ∞) A:(1E-06, 8) B:(1E-06, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3713 0 Av1alpha-Av1beta_35 Δgene:(1, 100) A:(1E-06, 8) B:(1E-06, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3712 0 Av1alpha-Av1beta_34 Δgene:(1, 20) A:(1E-06, 8) B:(1E-06, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3711 2.25 Av1alpha-Av1beta_33 Δgene:(0, ∞) A:(1E-06, 8) B:(1E-06, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3710 2.25 Av1alpha-Av1beta_32 Δgene:(0, 100) A:(1E-06, 8) B:(1E-06, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3709 2.25 Av1alpha-Av1beta_31 Δgene:(0, 20) A:(1E-06, 8) B:(1E-06, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3708 0 Av1alpha-Av1beta_30 Δgene:(1, ∞) A:(1E-10, 8) B:(1E-10, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3707 0 Av1alpha-Av1beta_29 Δgene:(1, 100) A:(1E-10, 8) B:(1E-10, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3706 0 Av1alpha-Av1beta_28 Δgene:(1, 20) A:(1E-10, 8) B:(1E-10, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3705 2.31 Av1alpha-Av1beta_27 Δgene:(0, ∞) A:(1E-10, 8) B:(1E-10, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3704 2.31 Av1alpha-Av1beta_26 Δgene:(0, 100) A:(1E-10, 8) B:(1E-10, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3703 2.31 Av1alpha-Av1beta_25 Δgene:(0, 20) A:(1E-10, 8) B:(1E-10, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3702 0 Av1alpha-Av1beta_24 Δgene:(1, ∞) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3701 0 Av1alpha-Av1beta_23 Δgene:(1, 100) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3700 0 Av1alpha-Av1beta_22 Δgene:(1, 20) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3699 2.28 Av1alpha-Av1beta_21 Δgene:(0, ∞) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3698 2.28 Av1alpha-Av1beta Δgene:(0, 100) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3696 0 Av1alpha-Av1beta_18 Δgene:(1, ∞) A:(1E-40, 8) B:(1E-40, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed
3695 0 Av1alpha-Av1beta_17 Δgene:(1, 100) A:(1E-40, 8) B:(1E-40, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed
3693 0 Av1alpha-Av1beta_16 Δgene:(1, 20) A:(1E-40, 8) B:(1E-40, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed
3692 1.98 Av1alpha-Av1beta_14 Δgene:(0, ∞) A:(1E-40, 8) B:(1E-40, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3691 1.98 Av1alpha-Av1beta_14 Δgene:(0, 100) A:(1E-40, 8) B:(1E-40, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3690 1.98 Av1alpha-Av1beta_13 Δgene:(0, 20) A:(1E-40, 8) B:(1E-40, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3654 0 Av1alpha-Av1beta_12 Δgene:(1, ∞) A:(1E-60, 8) B:(1E-60, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed
3653 0 Av1alpha-Av1beta_11 Δgene:(1, 100) A:(1E-60, 8) B:(1E-60, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed
3652 0 Av1alpha-Av1beta_10 Δgene:(1, 20) A:(1E-60, 8) B:(1E-60, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed
3651 1.6 Av1alpha-Av1beta_9 Δgene:(0, ∞) A:(1E-60, 8) B:(1E-60, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3650 1.6 Av1alpha-Av1beta_8 Δgene:(0, 100) A:(1E-60, 8) B:(1E-60, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3649 1.6 Av1alpha-Av1beta_7 Δgene:(0, 20) A:(1E-60, 8) B:(1E-60, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3648 0.3 Av1alpha-Av1beta_6 Δgene:(1, ∞) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done
3647 0.3 Av1alpha-Av1beta_5 Δgene:(1, 100) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done
3646 0.3 Av1alpha-Av1beta_4 Δgene:(1, 20) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done
3645 0.65 Av1alpha-Av1beta_3 Δgene:(0, ∞) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3644 0.65 Av1alpha-Av1beta_2 Δgene:(0, 100) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done
3643 0.65 Av1alpha-Av1beta_1 Δgene:(0, 20) A:(1E-80, 8) B:(1E-80, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared
3642 2.28 Av1alpha-Av1beta Δgene:(0, 20) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) 1.00 Done - Shared

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