May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
murmurs
Genes: A B A+B
Length: 451 443 866
Sequences: 3405 8692 2793
Seq/Len: 7.55 19.62 3.23
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.98
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show HHblits results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.06 0.07 3.12
2 0.08 0.14 3.19
5 0.09 0.28 3.65
10 0.09 0.40 3.65
20 0.09 0.40 3.65
100 0.09 0.42 3.67
∞ 0.09 0.46 3.70
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
302_E 289_E 5.11 1.00 1.00
298_Q 285_A 4.90 1.00 1.00
306_N 293_T 4.87 1.00 1.00
296_S 283_D 4.76 1.00 1.00
227_G 209_P 4.75 1.00 1.00
231_E 213_E 4.73 1.00 1.00
205_A 189_N 4.72 1.00 1.00
90_K 80_A 4.69 1.00 1.00
308_G 295_S 4.68 1.00 1.00
407_H 404_N 4.65 1.00 1.00
305_S 292_K 4.63 1.00 1.00
411_E 408_L 4.61 1.00 1.00
408_K 405_V 4.53 1.00 1.00
299_V 286_L 4.52 1.00 1.00
212_N 196_K 4.49 1.00 1.00
94_E 84_E 4.42 1.00 1.00
403_R 400_V 4.40 1.00 1.00
135_N 126_K 4.39 1.00 1.00
30_K 24_Q 4.34 1.00 1.00
277_S 264_K 4.33 1.00 1.00
324_S 310_V 4.31 1.00 1.00
201_E 185_E 4.31 1.00 1.00
301_R 288_A 4.29 1.00 1.00
72_D 61_E 4.28 1.00 1.00
182_H 166_E 4.24 1.00 1.00
415_Q 412_D 4.24 1.00 1.00
404_D 401_T 4.21 1.00 1.00
91_K 81_Y 4.18 1.00 1.00
270_D 257_F 4.17 1.00 1.00
140_R 130_D 4.17 1.00 1.00
180_R 164_H 4.13 1.00 1.00
387_R 387_E 4.08 1.00 1.00
228_I 210_K 4.07 1.00 1.00
367_P 359_H 4.07 1.00 1.00
246_T 226_E 4.04 1.00 1.00
412_V 409_L 4.04 1.00 1.00
418_V 415_V 4.00 1.00 1.00
316_S 303_E 3.98 1.00 1.00
230_K 212_H 3.97 1.00 1.00
42_P 36_K 3.96 1.00 1.00
163_T 148_Y 3.95 1.00 1.00
29_A 23_H 3.93 1.00 1.00
93_L 83_I 3.93 1.00 1.00
400_L 397_S 3.93 1.00 1.00
95_K 85_K 3.92 1.00 1.00
318_G 305_I 3.90 1.00 1.00
74_C 63_L 3.90 1.00 1.00
130_I 121_L 3.89 1.00 1.00
202_D 186_D 3.89 1.00 1.00
297_N 284_M 3.89 1.00 1.00
136_A 127_N 3.87 1.00 1.00
11_K 4_T 3.86 1.00 1.00
219_F 201_G 3.83 1.00 1.00
76_M 65_I 3.83 1.00 1.00
34_I 28_N 3.83 1.00 1.00
75_Y 64_E 3.82 1.00 1.00
85_N 75_N 3.82 1.00 1.00
162_D 147_N 3.82 1.00 1.00
178_E 162_P 3.81 1.00 1.00
295_I 282_I 3.80 1.00 1.00
280_V 267_I 3.79 1.00 1.00
287_I 274_I 3.78 1.00 1.00
199_S 183_G 3.77 1.00 1.00
204_V 188_F 3.76 1.00 1.00
209_N 193_D 3.76 1.00 1.00
115_I 106_L 3.75 1.00 1.00
374_H 366_S 3.74 1.00 1.00
273_G 260_P 3.72 1.00 1.00
185_V 169_I 3.71 1.00 1.00
224_F 206_G 3.71 1.00 1.00
149_F 139_T 3.71 1.00 1.00
200_F 184_L 3.70 1.00 1.00
241_V 221_Y 3.70 1.00 1.00
410_Y 407_P 3.69 1.00 1.00
319_K 306_I 3.68 1.00 1.00
303_T 290_H 3.64 1.00 1.00
88_M 78_E 3.62 1.00 1.00
245_T 225_F 3.61 1.00 1.00
133_V 124_V 3.60 1.00 1.00
160_D 145_N 3.60 1.00 1.00
161_K 146_A 3.58 1.00 1.00
401_D 398_D 3.57 1.00 1.00
222_L 204_I 3.56 1.00 1.00
208_W 192_N 3.56 1.00 1.00
26_R 20_L 3.56 1.00 1.00
99_V 89_F 3.55 1.00 1.00
153_E 143_S 3.54 1.00 1.00
268_S 256_Q 3.54 1.00 1.00
221_V 203_F 3.52 1.00 1.00
31_L 25_M 3.52 1.00 1.00
349_V 338_I 3.52 1.00 1.00
73_F 62_D 3.52 1.00 1.00
363_D 355_D 3.51 1.00 1.00
291_K 278_Y 3.51 1.00 1.00
290_A 277_L 3.51 1.00 1.00
41_K 35_D 3.51 1.00 1.00
97_I 87_Y 3.50 1.00 1.00
364_E 356_E 3.50 1.00 1.00
89_V 79_L 3.49 1.00 1.00
288_A 275_A 3.49 1.00 1.00
311_K 298_K 3.49 1.00 1.00
432_K 429_R 3.48 1.00 1.00
293_A 280_M 3.48 1.00 1.00
348_K 337_E 3.47 1.00 1.00
113_Q 104_T 3.46 1.00 1.00
141_G 131_T 3.46 1.00 1.00
271_D 258_H 3.46 1.00 1.00
350_I 339_V 3.45 1.00 1.00
114_L 105_S 3.45 1.00 1.00
189_L 173_I 3.45 1.00 1.00
292_L 279_I 3.44 1.00 1.00
368_D 360_A 3.41 1.00 1.00
342_S 330_R 3.41 1.00 1.00
289_V 276_N 3.38 1.00 1.00
132_E 123_H 3.38 1.00 1.00
247_E 227_D 3.37 1.00 1.00
383_S 377_R 3.36 1.00 1.00
186_I 170_I 3.36 1.00 1.00
399_A 396_H 3.36 1.00 1.00
87_P 77_E 3.36 1.00 1.00
183_I 167_Y 3.35 1.00 1.00
128_T 119_G 3.35 1.00 1.00
366_I 358_A 3.34 1.00 1.00
77_I 66_I 3.34 1.00 1.00
67_E 56_P 3.34 1.00 1.00
96_Q 86_G 3.34 1.00 1.00
59_V 50_T 3.33 1.00 1.00
275_P 262_Y 3.33 1.00 1.00
36_T 30_Q 3.32 1.00 1.00
98_P 88_Q 3.30 1.00 1.00
376_V 368_Y 3.30 1.00 1.00
131_A 122_A 3.29 1.00 1.00
100_L 90_K 3.28 1.00 1.00
255_Q 234_K 3.27 1.00 1.00
71_E 60_S 3.26 1.00 1.00
213_Q 197_Q 3.25 1.00 1.00
12_V 5_Y 3.25 1.00 1.00
300_I 287_V 3.24 1.00 1.00
326_Y 312_I 3.23 1.00 1.00
322_G 308_D 3.23 1.00 1.00
272_I 259_V 3.23 1.00 1.00
43_F 37_Y 3.22 1.00 1.00
229_S 211_L 3.20 1.00 1.00
10_K 3_K 3.18 1.00 1.00
37_V 31_G 3.18 1.00 1.00
375_M 367_V 3.17 1.00 1.00
325_F 311_I 3.16 1.00 1.00
232_L 214_I 3.15 1.00 1.00
166_M 151_F 3.15 1.00 1.00
233_A 215_T 3.14 1.00 1.00
184_A 168_S 3.13 1.00 1.00
164_L 149_F 3.13 1.00 1.00
108_L 98_D 3.13 1.00 1.00
304_L 291_L 3.12 1.00 1.00
345_D 334_P 3.11 1.00 1.00
198_G 182_T 3.11 1.00 1.00
414_Q 411_H 3.11 1.00 1.00
211_Q 195_A 3.10 1.00 1.00
254_V 233_A 3.10 1.00 1.00
266_I 254_I 3.09 1.00 1.00
240_I 220_I 3.08 1.00 1.00
216_S 199_Q 3.06 1.00 1.00
267_M 255_G 3.06 1.00 1.00
55_E 46_Q 3.05 1.00 1.00
142_L 132_S 3.05 1.00 1.00
323_I 309_T 3.04 1.00 1.00
321_H 307_D 3.04 1.00 1.00
220_L 202_L 3.04 1.00 1.00
283_A 270_A 3.04 1.00 1.00
83_P 72_R 3.02 1.00 1.00
239_T 219_P 3.01 1.00 1.00
117_I 108_V 2.97 1.00 1.00
40_G 34_V 2.95 1.00 1.00
369_I 361_L 2.95 1.00 1.00
281_E 268_L 2.94 1.00 1.00
116_G 107_G 2.93 1.00 1.00
317_L 304_K 2.93 1.00 1.00
380_E 372_I 2.92 1.00 1.00
225_N 207_E 2.91 1.00 1.00
86_N 76_N 2.90 1.00 1.00
210_I 194_Y 2.89 1.00 1.00
9_N 2_S 2.89 1.00 1.00
294_G 281_G 2.88 1.00 1.00
109_V 99_F 2.87 1.00 1.00
58_K 49_V 2.87 1.00 1.00
390_Q 390_A 2.86 1.00 1.00
373_K 365_D 2.86 1.00 1.00
143_L 133_F 2.86 1.00 1.00
406_V 403_E 2.86 1.00 1.00
78_K 67_A 2.86 1.00 1.00
134_L 125_L 2.86 1.00 1.00
176_V 160_F 2.86 1.00 1.00
314_L 301_F 2.85 1.00 1.00
242_P 222_Y 2.85 1.00 1.00
51_S 42_R 2.84 1.00 1.00
386_K 382_G 2.84 1.00 1.00
338_Q 326_L 2.83 1.00 1.00
274_V 261_A 2.82 1.00 1.00
402_V 399_L 2.82 1.00 1.00
206_A 190_A 2.82 1.00 1.00
15_L 8_I 2.81 1.00 1.00
103_V 93_H 2.81 1.00 1.00
191_P 175_F 2.79 1.00 1.00
343_G 331_Q 2.79 1.00 1.00
253_Y 232_I 2.79 1.00 1.00
168_L 153_A 2.78 1.00 1.00
22_E 16_S 2.77 1.00 1.00
24_A 18_L 2.77 1.00 1.00
248_K 228_S 2.76 1.00 1.00
177_K 161_M 2.75 1.00 1.00
419_I 416_Y 2.74 1.00 1.00
154_V 144_A 2.73 1.00 1.00
179_F 163_Y 2.72 1.00 1.00
56_G 47_A 2.71 1.00 1.00
137_G 128_I 2.70 1.00 1.00
151_A 141_R 2.69 1.00 1.00
378_L 370_A 2.68 1.00 1.00
112_S 103_F 2.66 1.00 1.00
388_A 388_D 2.65 1.00 1.00
377_V 369_L 2.65 1.00 1.00
284_L 271_T 2.65 1.00 1.00
14_V 7_F 2.65 1.00 1.00
315_Q 302_T 2.64 1.00 1.00
52_L 43_G 2.62 1.00 1.00
413_A 410_N 2.62 1.00 1.00
398_D 395_K 2.59 1.00 1.00
107_Y 97_G 2.59 1.00 1.00
44_D 38_Y 2.58 1.00 1.00
372_L 364_A 2.55 1.00 1.00
60_V 51_I 2.54 1.00 1.00
25_A 19_A 2.54 1.00 1.00
190_M 174_D 2.53 1.00 1.00
352_I 341_I 2.52 1.00 1.00
82_I 71_F 2.51 1.00 1.00
416_G 413_N 2.51 1.00 1.00
27_L 21_M 2.51 1.00 1.00
218_D 200_K 2.51 1.00 1.00
17_L 10_I 2.50 1.00 1.00
361_E 353_L 2.49 1.00 1.00
13_L 6_H 2.48 1.00 1.00
33_A 27_H 2.48 1.00 1.00
244_S 224_G 2.48 1.00 1.00
417_D 414_A 2.48 1.00 1.00
23_A 17_A 2.46 1.00 1.00
110_S 100_M 2.46 1.00 1.00
165_V 150_V 2.45 1.00 1.00
309_G 296_G 2.44 1.00 1.00
260_F 244_D 2.44 1.00 1.00
252_A 231_F 2.43 1.00 1.00
337_T 322_I 2.43 1.00 1.00
61_C 52_L 2.42 1.00 1.00
261_Y 245_F 2.42 1.00 1.00
391_K 391_A 2.42 1.00 1.00
214_M 198_V 2.41 1.00 1.00
57_I 48_G 2.41 1.00 1.00
353_A 342_F 2.38 1.00 0.99
285_A 272_A 2.38 1.00 0.99
226_Q 208_D 2.37 1.00 0.99
384_R 378_E 2.37 1.00 0.99
243_F 223_Y 2.36 1.00 0.99
105_L 95_F 2.36 1.00 0.99
409_A 406_S 2.34 1.00 0.99
395_T 394_V 2.34 1.00 0.99
129_M 120_L 2.32 1.00 0.99
66_L 55_S 2.31 1.00 0.99
382_A 376_A 2.31 1.00 0.99
35_V 29_V 2.31 1.00 0.99
144_A 134_L 2.30 1.00 0.99
84_Y 74_D 2.28 1.00 0.99
127_T 118_T 2.27 1.00 0.99
385_V 381_N 2.27 1.00 0.99
152_S 142_G 2.26 1.00 0.99
92_A 82_V 2.26 1.00 0.99
45_E 39_F 2.26 1.00 0.99
50_Q 41_Q 2.25 1.00 0.99
38_N 32_S 2.25 1.00 0.99
286_T 273_V 2.23 1.00 0.99
194_L 178_P 2.21 1.00 0.99
356_L 347_F 2.19 1.00 0.99
150_P 140_G 2.17 1.00 0.99
181_P 165_P 2.13 1.00 0.99
310_V 297_V 2.13 1.00 0.99
175_G 159_H 2.12 1.00 0.99
19_R 12_G 2.11 1.00 0.99
334_I 319_P 2.10 1.00 0.99
195_D 179_D 2.09 1.00 0.99
339_K 327_D 2.08 1.00 0.99
336_A 321_E 2.07 1.00 0.99
101_T 91_R 2.06 1.00 0.99
335_L 320_T 2.05 1.00 0.99
250_D 229_N 2.05 1.00 0.99
351_L 340_A 2.04 1.00 0.99
32_G 26_G 2.04 1.00 0.98
187_T 171_T 2.02 1.00 0.98
420_L 417_V 2.01 1.00 0.98
389_A 389_L 2.00 1.00 0.98
126_T 117_T 2.00 1.00 0.98
344_F 333_Y 2.00 1.00 0.98
394_V 393_I 1.99 1.00 0.98
259_L 243_S 1.98 1.00 0.98
341_L 329_A 1.98 1.00 0.98
264_E 252_E 1.96 1.00 0.98
147_I 137_D 1.96 1.00 0.98
138_G 129_T 1.95 1.00 0.98
362_F 354_L 1.95 1.00 0.98
405_A 402_V 1.95 1.00 0.98
265_N 253_E 1.93 1.00 0.98
223_N 205_Y 1.90 0.99 0.98
431_Y 428_E 1.88 0.99 0.98
28_L 22_L 1.86 0.99 0.97
359_G 350_T 1.85 0.99 0.97
307_F 294_F 1.84 0.99 0.97
65_P 54_F 1.83 0.99 0.97
69_L 59_I 1.81 0.99 0.97
365_L 357_F 1.80 0.99 0.97
421_L 418_F 1.79 0.99 0.97
120_S 111_A 1.75 0.99 0.96
104_E 94_E 1.74 0.99 0.96
331_S 316_A 1.72 0.99 0.96
20_S 13_S 1.72 0.99 0.96
63_S 53_P 1.69 0.98 0.95
68_L 57_N 1.68 0.98 0.95
53_L 44_L 1.63 0.98 0.94
106_A 96_L 1.62 0.98 0.94
360_N 352_A 1.62 0.98 0.94
174_M 158_R 1.59 0.98 0.93
357_D 348_T 1.59 0.98 0.93
111_E 102_Q 1.57 0.97 0.93
392_A 392_K 1.56 0.97 0.92
428_W 425_Q 1.55 0.97 0.92
430_M 427_Y 1.54 0.97 0.92
425_N 422_G 1.52 0.97 0.91
196_Y 180_Y 1.50 0.96 0.90
340_A 328_A 1.48 0.96 0.90
278_H 265_H 1.47 0.96 0.89
39_D 33_D 1.44 0.95 0.88
79_N 68_G 1.44 0.95 0.88
426_A 423_D 1.44 0.95 0.88
251_G 230_D 1.43 0.95 0.88
49_A 40_T 1.43 0.95 0.88
424_A 421_A 1.41 0.94 0.87
234_K 216_S 1.41 0.94 0.87
235_T 217_E 1.39 0.93 0.86
327_N 313_D 1.38 0.93 0.85
18_A 11_K 1.35 0.92 0.84
381_S 375_S 1.30 0.90 0.80
171_F 156_Y 1.28 0.89 0.79
279_N 266_N 1.24 0.87 0.76
370_T 362_S 1.24 0.87 0.76
197_H 181_F 1.24 0.87 0.76
236_T 218_A 1.22 0.86 0.75
81_G 70_A 1.20 0.85 0.73
124_T 115_T 1.15 0.81 0.68
422_S 419_M 1.13 0.80 0.67
54_E 45_E 1.12 0.79 0.65
192_T 176_D 1.11 0.78 0.64
102_E 92_Y 1.08 0.76 0.61
333_N 318_H 1.07 0.74 0.60
320_V 307_D 1.07 0.74 0.60
347_T 336_K 1.07 0.74 0.59
276_G 263_G 1.03 0.71 0.56
125_T 116_S 1.02 0.69 0.54
80_P 69_N 0.98 0.65 0.49
121_N 112_H 0.98 0.64 0.48
338_Q 323_I 0.96 0.63 0.47
258_Q 242_G 0.88 0.52 0.36
342_S 327_D 0.87 0.52 0.36
282_N 269_N 0.86 0.50 0.35
70_D 59_I 0.82 0.45 0.30
188_N 172_N 0.80 0.42 0.27
346_N 331_Q 0.80 0.42 0.27
340_A 325_T 0.78 0.40 0.25
263_G 251_Q 0.73 0.34 0.20
118_T 109_A 0.72 0.33 0.20
339_K 324_A 0.70 0.31 0.18
343_G 328_A 0.70 0.30 0.17
345_D 330_R 0.70 0.30 0.17
429_D 426_L 0.69 0.30 0.17
148_G 138_G 0.69 0.30 0.17
344_F 329_A 0.67 0.28 0.15
256_D 239_T 0.66 0.26 0.14
436_V 429_R 0.65 0.26 0.14
328_D 314_D 0.64 0.24 0.13
383_S 381_N 0.64 0.24 0.13
215_S 199_Q 0.61 0.21 0.11
347_T 335_S 0.60 0.21 0.11
262_K 250_N 0.60 0.21 0.10
371_G 363_Q 0.59 0.20 0.10
440_E 428_E 0.58 0.19 0.09
382_A 379_V 0.57 0.18 0.09
69_L 58_N 0.57 0.18 0.09
172_Q 157_E 0.56 0.18 0.09
341_L 326_L 0.56 0.18 0.09
395_T 395_K 0.55 0.17 0.08
263_G 250_N 0.55 0.17 0.08
312_H 299_R 0.55 0.17 0.08
256_D 235_D 0.53 0.16 0.07
439_D 298_K 0.53 0.16 0.07
329_S 315_F 0.53 0.16 0.07
169_S 154_D 0.53 0.15 0.07
269_V 256_Q 0.52 0.15 0.06
268_S 255_G 0.52 0.15 0.06
170_S 155_E 0.51 0.14 0.06
131_A 133_F 0.51 0.14 0.06
332_T 317_H 0.51 0.14 0.06
143_L 122_A 0.51 0.14 0.06
98_P 86_G 0.50 0.14 0.06
442_I 302_T 0.49 0.13 0.06
289_V 169_I 0.49 0.13 0.05
185_V 276_N 0.49 0.13 0.05
22_E 15_M 0.49 0.13 0.05
385_V 384_V 0.49 0.13 0.05
267_M 254_I 0.47 0.12 0.05
95_K 83_I 0.47 0.12 0.05
378_L 341_I 0.47 0.12 0.04
361_E 355_D 0.46 0.12 0.04
21_G 14_G 0.45 0.11 0.04
203_Y 187_V 0.45 0.11 0.04
266_I 253_E 0.44 0.11 0.04
64_H 53_P 0.44 0.11 0.04
325_F 407_P 0.44 0.10 0.04
352_I 370_A 0.43 0.10 0.04
264_E 251_Q 0.43 0.10 0.04
363_D 353_L 0.43 0.10 0.04
358_R 349_R 0.43 0.10 0.04
103_V 91_R 0.42 0.10 0.03
11_K 28_N 0.42 0.10 0.03
410_Y 311_I 0.42 0.10 0.03
34_I 4_T 0.41 0.09 0.03
380_E 347_F 0.40 0.09 0.03
95_K 81_Y 0.40 0.09 0.03
391_K 392_K 0.39 0.09 0.03
384_R 383_E 0.39 0.09 0.03
381_S 378_E 0.39 0.08 0.03
106_A 94_E 0.39 0.08 0.03
380_E 377_R 0.39 0.08 0.03
289_V 167_Y 0.39 0.08 0.03
427_S 424_I 0.38 0.08 0.03
379_G 371_Q 0.38 0.08 0.03
97_I 85_K 0.38 0.08 0.03
183_I 276_N 0.38 0.08 0.02
100_L 88_Q 0.38 0.08 0.02
91_K 85_K 0.38 0.08 0.02
130_I 108_V 0.37 0.08 0.02
256_D 247_V 0.37 0.08 0.02
257_K 241_N 0.37 0.08 0.02
442_I 298_K 0.37 0.08 0.02
117_I 121_L 0.37 0.07 0.02
102_E 90_K 0.37 0.07 0.02
265_N 252_E 0.36 0.07 0.02
174_M 157_E 0.36 0.07 0.02
94_E 81_Y 0.36 0.07 0.02
46_N 40_T 0.36 0.07 0.02
174_M 190_A 0.36 0.07 0.02
337_T 325_T 0.36 0.07 0.02
91_K 84_E 0.35 0.07 0.02
206_A 158_R 0.35 0.07 0.02
257_K 242_G 0.35 0.07 0.02
140_R 147_N 0.34 0.07 0.02
313_R 300_R 0.34 0.07 0.02
363_D 354_L 0.34 0.07 0.02
96_Q 84_E 0.34 0.07 0.02
13_L 62_D 0.34 0.07 0.02
297_N 278_Y 0.34 0.07 0.02
73_F 6_H 0.34 0.07 0.02
162_D 130_D 0.34 0.07 0.02
283_A 291_L 0.33 0.06 0.02
83_P 75_N 0.33 0.06 0.02
145_G 135_I 0.33 0.06 0.02
85_N 72_R 0.33 0.06 0.02
323_I 410_N 0.33 0.06 0.02
132_E 126_K 0.33 0.06 0.02
413_A 309_T 0.33 0.06 0.02
135_N 123_H 0.33 0.06 0.02
364_E 355_D 0.33 0.06 0.02
129_M 261_A 0.32 0.06 0.01
423_P 420_G 0.32 0.06 0.01
291_K 284_M 0.32 0.06 0.01
212_N 193_D 0.32 0.06 0.01
209_N 196_K 0.32 0.06 0.01
388_A 392_K 0.32 0.06 0.01
356_L 372_I 0.32 0.06 0.01
124_T 297_V 0.32 0.06 0.01
310_V 115_T 0.32 0.06 0.01
168_L 107_G 0.32 0.06 0.01
350_I 368_Y 0.31 0.06 0.01
23_A 16_S 0.31 0.06 0.01
116_G 165_P 0.31 0.06 0.01
285_A 169_I 0.31 0.06 0.01
196_Y 158_R 0.31 0.06 0.01
181_P 107_G 0.31 0.06 0.01
262_K 248_F 0.31 0.06 0.01
304_L 270_A 0.31 0.06 0.01
376_V 339_V 0.31 0.06 0.01
204_V 173_I 0.31 0.06 0.01
255_Q 235_D 0.31 0.06 0.01
76_M 82_V 0.31 0.06 0.01
433_N 429_R 0.30 0.06 0.01
258_Q 243_S 0.30 0.06 0.01
324_S 306_I 0.30 0.06 0.01
174_M 180_Y 0.30 0.06 0.01
334_I 322_I 0.30 0.06 0.01
99_V 87_Y 0.30 0.06 0.01
185_V 272_A 0.30 0.06 0.01
367_P 356_E 0.30 0.06 0.01
286_T 124_V 0.30 0.06 0.01
262_K 246_K 0.30 0.06 0.01
27_L 142_G 0.30 0.05 0.01
412_V 366_S 0.30 0.05 0.01
37_V 10_I 0.30 0.05 0.01
336_A 324_A 0.30 0.05 0.01
287_I 287_V 0.30 0.05 0.01
257_K 248_F 0.30 0.05 0.01
116_G 153_A 0.30 0.05 0.01
417_D 365_D 0.30 0.05 0.01
255_Q 246_K 0.30 0.05 0.01
189_L 188_F 0.30 0.05 0.01
344_F 338_I 0.30 0.05 0.01
199_S 185_E 0.29 0.05 0.01
274_V 120_L 0.29 0.05 0.01
320_V 305_I 0.29 0.05 0.01
386_K 395_K 0.29 0.05 0.01
17_L 31_G 0.29 0.05 0.01
319_K 310_V 0.29 0.05 0.01
8_E 2_S 0.29 0.05 0.01
361_E 352_A 0.29 0.05 0.01
92_A 65_I 0.29 0.05 0.01
383_S 387_E 0.29 0.05 0.01
408_K 408_L 0.29 0.05 0.01
346_N 335_S 0.29 0.05 0.01
417_D 413_N 0.29 0.05 0.01
416_G 414_A 0.29 0.05 0.01
201_E 183_G 0.29 0.05 0.01
368_D 357_F 0.29 0.05 0.01
54_E 48_G 0.29 0.05 0.01
110_S 101_R 0.29 0.05 0.01
411_E 405_V 0.29 0.05 0.01
276_G 266_N 0.29 0.05 0.01
374_H 409_L 0.29 0.05 0.01
305_S 258_H 0.29 0.05 0.01
373_K 414_A 0.28 0.05 0.01
187_T 272_A 0.28 0.05 0.01
105_L 93_H 0.28 0.05 0.01
152_S 21_M 0.28 0.05 0.01
130_I 277_L 0.28 0.05 0.01
103_V 153_A 0.28 0.05 0.01
389_A 393_I 0.28 0.05 0.01
279_N 263_G 0.28 0.05 0.01
58_K 23_H 0.28 0.05 0.01
93_L 80_A 0.28 0.05 0.01
168_L 93_H 0.28 0.05 0.01
335_L 323_I 0.28 0.05 0.01
285_A 223_Y 0.28 0.05 0.01
318_G 304_K 0.28 0.05 0.01
238_A 218_A 0.28 0.05 0.01
300_I 274_I 0.28 0.05 0.01
386_K 390_A 0.28 0.05 0.01
261_Y 247_V 0.27 0.05 0.01
107_Y 95_F 0.27 0.05 0.01
133_V 273_V 0.27 0.05 0.01
364_E 353_L 0.27 0.05 0.01
218_D 166_E 0.27 0.05 0.01
317_L 305_I 0.27 0.05 0.01
289_V 121_L 0.27 0.05 0.01
271_D 292_K 0.27 0.05 0.01
285_A 171_T 0.27 0.05 0.01
207_K 191_F 0.27 0.05 0.01
316_S 310_V 0.27 0.05 0.01
186_I 173_I 0.27 0.05 0.01
218_D 164_H 0.27 0.05 0.01
101_T 89_F 0.27 0.05 0.01
90_K 83_I 0.27 0.05 0.01
189_L 170_I 0.27 0.05 0.01
74_C 3_K 0.27 0.05 0.01
139_Q 129_T 0.27 0.05 0.01
370_T 359_H 0.27 0.05 0.01
215_S 164_H 0.27 0.05 0.01
316_S 306_I 0.26 0.04 0.01
130_I 276_N 0.26 0.04 0.01
146_N 136_G 0.26 0.04 0.01
324_S 303_E 0.26 0.04 0.01
251_G 229_N 0.26 0.04 0.01
10_K 63_L 0.26 0.04 0.01
262_K 249_Y 0.26 0.04 0.01
132_E 293_T 0.26 0.04 0.01
218_D 198_V 0.26 0.04 0.01
290_A 121_L 0.26 0.04 0.01
51_S 45_E 0.26 0.04 0.01
398_D 382_G 0.26 0.04 0.01
120_S 176_D 0.26 0.04 0.01
306_N 123_H 0.26 0.04 0.01
319_K 303_E 0.26 0.04 0.01
362_F 422_G 0.26 0.04 0.01
331_S 319_P 0.26 0.04 0.01
371_G 360_A 0.26 0.04 0.01
283_A 120_L 0.26 0.04 0.01
192_T 111_A 0.26 0.04 0.01
447_S 400_V 0.26 0.04 0.01
163_T 280_M 0.26 0.04 0.01
180_R 200_K 0.25 0.04 0.01
130_I 169_I 0.25 0.04 0.01
349_V 333_Y 0.25 0.04 0.01
182_H 200_K 0.25 0.04 0.01
434_F 156_Y 0.25 0.04 0.01
146_N 137_D 0.25 0.04 0.01
55_E 49_V 0.25 0.04 0.01
104_E 92_Y 0.25 0.04 0.01
243_F 272_A 0.25 0.04 0.01
293_A 148_Y 0.25 0.04 0.01
296_S 284_M 0.25 0.04 0.01
147_I 138_G 0.25 0.04 0.01
302_E 127_N 0.25 0.04 0.01
260_F 246_K 0.25 0.04 0.01
418_V 333_Y 0.24 0.04 0.01
173_L 194_Y 0.24 0.04 0.01
50_Q 44_L 0.24 0.04 0.01
378_L 369_L 0.24 0.04 0.01
448_L 407_P 0.24 0.04 0.01
297_N 283_D 0.24 0.04 0.01
270_D 258_H 0.24 0.04 0.01
130_I 106_L 0.24 0.04 0.01
366_I 355_D 0.24 0.04 0.01
129_M 270_A 0.24 0.04 0.01
333_N 112_H 0.24 0.04 0.01
271_D 257_F 0.24 0.04 0.01
56_G 20_L 0.24 0.04 0.01
384_R 348_T 0.24 0.04 0.01
344_F 415_V 0.24 0.04 0.01
446_E 305_I 0.24 0.04 0.01
237_K 219_P 0.24 0.04 0.01
115_I 121_L 0.24 0.04 0.01
185_V 121_L 0.24 0.04 0.01
165_V 125_L 0.24 0.04 0.01
344_F 312_I 0.24 0.04 0.01
403_R 398_D 0.24 0.04 0.01
134_L 150_V 0.24 0.04 0.01
430_M 370_A 0.24 0.04 0.01
136_A 289_E 0.24 0.04 0.01
279_N 269_N 0.24 0.04 0.01
52_L 20_L 0.24 0.04 0.01
205_A 185_E 0.24 0.04 0.01
23_A 140_G 0.23 0.04 0.01
250_D 230_D 0.23 0.04 0.01
202_D 183_G 0.23 0.04 0.01
273_G 295_S 0.23 0.04 0.01
308_G 260_P 0.23 0.04 0.01
282_N 266_N 0.23 0.04 0.01
387_R 388_D 0.23 0.04 0.01
387_R 391_A 0.23 0.04 0.01
322_G 306_I 0.23 0.04 0.01
23_A 143_S 0.23 0.04 0.01
201_E 189_N 0.23 0.04 0.01
141_G 122_A 0.23 0.04 0.01
397_S 405_V 0.23 0.04 0.01
62_G 51_I 0.23 0.04 0.01
325_F 309_T 0.23 0.04 0.01
197_H 155_E 0.23 0.04 0.01
401_D 400_V 0.23 0.04 0.01
196_Y 181_F 0.23 0.04 0.01
173_L 156_Y 0.23 0.04 0.01
170_S 181_F 0.23 0.04 0.01
121_N 318_H 0.23 0.04 0.01
444_T 403_E 0.23 0.04 0.01
245_T 268_L 0.22 0.04 0.01
52_L 46_Q 0.22 0.04 0.01
378_L 427_Y 0.22 0.04 0.01
184_A 194_Y 0.22 0.04 0.01
387_R 378_E 0.22 0.04 0.01
390_Q 391_A 0.22 0.04 0.01
413_A 416_Y 0.22 0.04 0.01
149_F 140_G 0.22 0.04 0.01
150_P 17_A 0.22 0.04 0.01
76_M 79_L 0.22 0.04 0.01
122_G 113_G 0.22 0.04 0.01
326_Y 303_E 0.22 0.04 0.01
139_Q 147_N 0.22 0.04 0.01
199_S 186_D 0.22 0.04 0.01
145_G 136_G 0.22 0.04 0.01
372_L 361_L 0.22 0.04 0.01
131_A 131_T 0.22 0.04 0.01
333_N 176_D 0.22 0.04 0.01
219_F 279_I 0.22 0.04 0.01
153_E 17_A 0.22 0.04 0.01
210_I 168_S 0.22 0.04 0.01
197_H 180_Y 0.22 0.04 0.01
214_M 200_K 0.22 0.04 0.01
29_A 49_V 0.22 0.04 0.01
197_H 182_T 0.22 0.04 0.01
428_W 347_F 0.22 0.04 0.01
281_E 225_F 0.22 0.04 0.01
384_R 382_G 0.22 0.04 0.01
323_I 311_I 0.22 0.04 0.01
36_T 62_D 0.22 0.04 0.01
108_L 96_L 0.22 0.04 0.01
419_I 410_N 0.22 0.04 0.01
220_L 195_A 0.22 0.04 0.01
198_G 181_F 0.22 0.04 0.01
385_V 383_E 0.22 0.04 0.01
325_F 416_Y 0.22 0.04 0.01
399_A 405_V 0.22 0.04 0.01
408_K 396_H 0.22 0.04 0.01
316_S 312_I 0.22 0.04 0.01
211_Q 202_L 0.21 0.04 0.01
286_T 121_L 0.21 0.04 0.01
385_V 389_L 0.21 0.04 0.01
128_T 137_D 0.21 0.04 0.01
73_F 30_Q 0.21 0.04 0.01
351_L 364_A 0.21 0.04 0.01
387_R 377_R 0.21 0.04 0.01
288_A 231_F 0.21 0.04 0.01
11_K 63_L 0.21 0.04 0.01
259_L 245_F 0.21 0.04 0.01
292_L 201_G 0.21 0.04 0.01
419_I 311_I 0.21 0.04 0.01
186_I 202_L 0.21 0.04 0.01
323_I 416_Y 0.21 0.04 0.01
397_S 366_S 0.21 0.04 0.01
321_H 407_P 0.21 0.04 0.01
278_H 266_N 0.21 0.04 0.01
386_K 384_V 0.21 0.04 0.01
75_Y 5_Y 0.21 0.04 0.01
376_V 367_V 0.21 0.04 0.01
65_P 32_S 0.21 0.04 0.01
279_N 265_H 0.21 0.04 0.01
431_Y 399_L 0.21 0.04 0.01
319_K 308_D 0.21 0.04 0.01
380_E 384_V 0.21 0.04 0.01
223_N 268_L 0.21 0.04 0.01
12_V 64_E 0.21 0.04 0.01
38_N 54_F 0.21 0.04 0.01
252_A 243_S 0.21 0.04 0.01
182_H 104_T 0.21 0.04 0.01
378_L 396_H 0.21 0.04 0.01
128_T 123_H 0.20 0.03 0.01
94_E 82_V 0.20 0.03 0.01
117_I 118_T 0.20 0.03 0.01
281_E 205_Y 0.20 0.03 0.01
386_K 369_L 0.20 0.03 0.01
252_A 275_A 0.20 0.03 0.01
132_E 119_G 0.20 0.03 0.01
89_V 65_I 0.20 0.03 0.01
354_G 345_H 0.20 0.03 0.01
193_H 177_H 0.20 0.03 0.01
388_A 389_L 0.20 0.03 0.01
131_A 126_K 0.20 0.03 0.01
127_T 108_V 0.20 0.03 0.01
135_N 122_A 0.20 0.03 0.01
293_A 106_L 0.20 0.03 0.01
402_V 428_E 0.20 0.03 0.01
335_L 174_D 0.20 0.03 0.01
278_H 269_N 0.20 0.03 0.01
419_I 309_T 0.20 0.03 0.01
28_L 5_Y 0.20 0.03 0.01
192_T 318_H 0.20 0.03 0.01
220_L 170_I 0.20 0.03 0.01
14_V 29_V 0.20 0.03 0.01
132_E 290_H 0.20 0.03 0.01
254_V 245_F 0.20 0.03 0.01
20_S 18_L 0.20 0.03 0.01
109_V 98_D 0.20 0.03 0.01
74_C 4_T 0.20 0.03 0.01
97_I 88_Q 0.20 0.03 0.01
190_M 320_T 0.20 0.03 0.01
113_Q 166_E 0.20 0.03 0.01
13_L 32_S 0.20 0.03 0.01
211_Q 170_I 0.20 0.03 0.01
186_I 195_A 0.20 0.03 0.01
373_K 364_A 0.20 0.03 0.01
200_F 210_K 0.20 0.03 0.01
385_V 376_A 0.20 0.03 0.01
12_V 22_L 0.20 0.03 0.01
303_T 123_H 0.20 0.03 0.01
98_P 87_Y 0.20 0.03 0.01
386_K 387_E 0.20 0.03 0.01
445_F 305_I 0.20 0.03 0.01
24_A 13_S 0.20 0.03 0.01
282_N 265_H 0.20 0.03 0.00
9_N 3_K 0.20 0.03 0.00
360_N 351_I 0.20 0.03 0.00
385_V 354_L 0.20 0.03 0.00
399_A 370_A 0.20 0.03 0.00
250_D 241_N 0.19 0.03 0.00
398_D 376_A 0.19 0.03 0.00
394_V 394_V 0.19 0.03 0.00
30_K 25_M 0.19 0.03 0.00
259_L 247_V 0.19 0.03 0.00
38_N 6_H 0.19 0.03 0.00
425_N 354_L 0.19 0.03 0.00
184_A 198_V 0.19 0.03 0.00
310_V 119_G 0.19 0.03 0.00
130_I 273_V 0.19 0.03 0.00
108_L 88_Q 0.19 0.03 0.00
75_Y 90_K 0.19 0.03 0.00
15_L 71_F 0.19 0.03 0.00
128_T 297_V 0.19 0.03 0.00
224_F 212_H 0.19 0.03 0.00
389_A 381_N 0.19 0.03 0.00
31_L 24_Q 0.19 0.03 0.00
418_V 336_K 0.19 0.03 0.00
133_V 277_L 0.19 0.03 0.00
357_D 378_E 0.19 0.03 0.00
228_I 184_L 0.19 0.03 0.00
290_A 124_V 0.19 0.03 0.00
9_N 27_H 0.19 0.03 0.00
255_Q 228_S 0.19 0.03 0.00
143_L 134_L 0.19 0.03 0.00
198_G 183_G 0.19 0.03 0.00
116_G 163_Y 0.19 0.03 0.00
244_S 226_E 0.19 0.03 0.00
82_I 8_I 0.19 0.03 0.00
330_K 112_H 0.19 0.03 0.00
382_A 377_R 0.19 0.03 0.00
28_L 95_F 0.19 0.03 0.00
98_P 98_D 0.19 0.03 0.00
49_A 43_G 0.19 0.03 0.00
276_G 265_H 0.19 0.03 0.00
22_E 20_L 0.19 0.03 0.00
101_T 159_H 0.18 0.03 0.00
230_K 206_G 0.18 0.03 0.00
179_F 107_G 0.18 0.03 0.00
362_F 348_T 0.18 0.03 0.00
170_S 154_D 0.18 0.03 0.00
100_L 64_E 0.18 0.03 0.00
115_I 280_M 0.18 0.03 0.00
199_S 182_T 0.18 0.03 0.00
391_K 388_D 0.18 0.03 0.00
303_T 127_N 0.18 0.03 0.00
256_D 240_V 0.18 0.03 0.00
136_A 290_H 0.18 0.03 0.00
433_N 426_L 0.18 0.03 0.00
376_V 396_H 0.18 0.03 0.00
237_K 199_Q 0.18 0.03 0.00
337_T 357_F 0.18 0.03 0.00
278_H 263_G 0.18 0.03 0.00
35_V 7_F 0.18 0.03 0.00
389_A 367_V 0.18 0.03 0.00
25_A 31_G 0.18 0.03 0.00
214_M 168_S 0.18 0.03 0.00
14_V 22_L 0.18 0.03 0.00
202_D 190_A 0.18 0.03 0.00
232_L 192_N 0.18 0.03 0.00
389_A 390_A 0.18 0.03 0.00
56_G 50_T 0.18 0.03 0.00
404_D 398_D 0.18 0.03 0.00
274_V 270_A 0.18 0.03 0.00
338_Q 360_A 0.18 0.03 0.00
242_P 204_I 0.18 0.03 0.00
283_A 259_V 0.18 0.03 0.00
26_R 43_G 0.18 0.03 0.00
351_L 342_F 0.18 0.03 0.00
28_L 7_F 0.18 0.03 0.00
153_E 144_A 0.18 0.03 0.00
326_Y 333_Y 0.18 0.03 0.00
390_Q 382_G 0.18 0.03 0.00
401_D 401_T 0.18 0.03 0.00
169_S 155_E 0.18 0.03 0.00
37_V 19_A 0.18 0.03 0.00
355_G 346_T 0.18 0.03 0.00
309_G 297_V 0.18 0.03 0.00
383_S 376_A 0.18 0.03 0.00
173_L 158_R 0.18 0.03 0.00
142_L 131_T 0.18 0.03 0.00
363_D 352_A 0.18 0.03 0.00
107_Y 163_Y 0.17 0.03 0.00
206_A 186_D 0.17 0.03 0.00
399_A 368_Y 0.17 0.03 0.00
161_K 130_D 0.17 0.03 0.00
179_F 97_G 0.17 0.03 0.00
353_A 340_A 0.17 0.03 0.00
381_S 347_F 0.17 0.03 0.00
222_L 222_Y 0.17 0.03 0.00
114_L 151_F 0.17 0.03 0.00
382_A 395_K 0.17 0.03 0.00
356_L 425_Q 0.17 0.03 0.00
342_S 264_K 0.17 0.03 0.00
7_F 2_S 0.17 0.03 0.00
225_N 225_F 0.17 0.03 0.00
176_V 196_K 0.17 0.03 0.00
212_N 160_F 0.17 0.03 0.00
392_A 389_L 0.17 0.03 0.00
77_I 18_L 0.17 0.03 0.00
283_A 261_A 0.17 0.03 0.00
253_Y 244_D 0.17 0.03 0.00
26_R 16_S 0.17 0.03 0.00
171_F 179_D 0.17 0.03 0.00
24_A 66_I 0.17 0.03 0.00
98_P 161_M 0.17 0.03 0.00
195_D 156_Y 0.17 0.03 0.00
175_G 91_R 0.17 0.03 0.00
150_P 141_R 0.17 0.03 0.00
224_F 222_Y 0.17 0.03 0.00
310_V 296_G 0.17 0.03 0.00
175_G 180_Y 0.17 0.03 0.00
202_D 189_N 0.17 0.03 0.00
356_L 423_D 0.17 0.03 0.00
208_W 214_I 0.17 0.03 0.00
153_E 20_L 0.17 0.03 0.00
10_K 27_H 0.17 0.03 0.00
10_K 2_S 0.17 0.03 0.00
166_M 134_L 0.17 0.03 0.00
237_K 217_E 0.17 0.03 0.00
244_S 207_E 0.17 0.03 0.00
33_A 2_S 0.17 0.03 0.00
249_V 240_V 0.17 0.03 0.00
272_I 270_A 0.17 0.03 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
ID Seq/Len Name Options I_Prob Status
11333 0.59 murmurs Δgene:(1, 5) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: HHblits (2015_06) 0.00 Done - Shared
11322 0.66 murmurs Δgene:(1, ∞) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: HHblits (2015_06) 0.00 Done - Shared
11321 0.01 murmurs Δgene:(1, 1) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: HHblits (2015_06) Killed - Shared
11320 3.23 murmurs Δgene:(0, 1) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: HHblits (2015_06) 1.00 Done - Shared
Page generated in 0.3255 seconds.