May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org

UVRB - UVRC
UniProt:
Length: 1283
Sequences: 1411
Seq/Len: 1.11
I_Prob: 0.24
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
644_M 219_Q 1.68 0.24
647_A 218_S 1.46 0.14
300_L 55_K 1.45 0.14
644_M 223_F 1.45 0.14
648_Q 219_Q 1.42 0.12
437_S 580_Q 1.41 0.12
432_V 170_Q 1.19 0.06
292_F 496_V 1.17 0.06
279_K 523_D 1.13 0.05
364_Y 528_H 1.10 0.04
648_Q 215_E 1.10 0.04
663_H 221_L 1.08 0.04
428_V 170_Q 1.08 0.04
445_I 88_Y 1.07 0.04
441_Q 580_Q 1.06 0.04
137_V 428_Y 1.04 0.04
437_S 578_G 1.03 0.03
556_K 404_M 1.00 0.03
108_F 444_Q 0.96 0.03
138_V 298_T 0.95 0.03
433_D 556_S 0.94 0.03
473_V 104_F 0.94 0.03
464_E 225_E 0.94 0.03
656_A 227_A 0.94 0.02
650_L 214_M 0.94 0.02
36_T 375_T 0.92 0.02
425_V 60_V 0.92 0.02
254_E 47_F 0.91 0.02
583_G 223_F 0.91 0.02
349_G 493_L 0.90 0.02
640_E 38_D 0.87 0.02
428_V 164_R 0.87 0.02
404_S 94_V 0.87 0.02
120_E 475_A 0.86 0.02
412_V 136_Y 0.86 0.02
63_L 604_I 0.85 0.02
550_A 412_C 0.85 0.02
202_I 600_L 0.85 0.02
519_A 132_F 0.84 0.02
62_V 518_F 0.84 0.02
573_E 516_E 0.84 0.02
212_L 525_P 0.83 0.02
457_R 562_E 0.83 0.02
138_V 172_G 0.83 0.02
464_E 147_K 0.83 0.02
461_D 168_Q 0.83 0.02
31_G 251_D 0.82 0.01
124_L 450_Y 0.82 0.01
175_R 233_I 0.82 0.01
343_T 271_I 0.82 0.01
176_L 243_Q 0.81 0.01
292_F 59_L 0.81 0.01
136_V 428_Y 0.81 0.01
336_V 464_L 0.81 0.01
172_I 37_K 0.81 0.01
453_T 132_F 0.80 0.01
218_D 412_C 0.80 0.01
344_I 38_D 0.80 0.01
291_Q 104_F 0.79 0.01
281_L 303_F 0.79 0.01
666_R 183_V 0.79 0.01
489_I 465_I 0.78 0.01
272_K 91_R 0.78 0.01
449_V 221_L 0.78 0.01
292_F 55_K 0.78 0.01
83_E 598_Q 0.78 0.01
108_F 300_V 0.78 0.01
347_I 187_E 0.78 0.01
472_R 187_E 0.78 0.01
276_E 193_E 0.78 0.01
391_Y 578_G 0.78 0.01
423_I 598_Q 0.78 0.01
169_Q 349_G 0.77 0.01
118_H 398_F 0.77 0.01
627_M 251_D 0.77 0.01
442_R 94_V 0.77 0.01
428_V 147_K 0.77 0.01
451_V 88_Y 0.77 0.01
344_I 73_T 0.77 0.01
205_A 233_I 0.77 0.01
644_M 221_L 0.77 0.01
273_V 574_K 0.77 0.01
11_F 17_Q 0.77 0.01
118_H 412_C 0.76 0.01
214_V 420_P 0.76 0.01
216_L 398_F 0.76 0.01
154_Y 272_R 0.76 0.01
108_F 537_S 0.76 0.01
550_A 31_I 0.75 0.01
106_D 76_E 0.75 0.01
583_G 26_A 0.75 0.01
349_G 586_S 0.75 0.01
78_K 422_R 0.74 0.01
471_E 510_F 0.74 0.01
437_S 581_G 0.74 0.01
497_F 128_Y 0.74 0.01
238_I 115_L 0.74 0.01
215_E 69_T 0.74 0.01
593_V 254_V 0.74 0.01
286_L 152_R 0.74 0.01
179_L 439_Y 0.74 0.01
662_L 223_F 0.74 0.01
216_L 328_L 0.74 0.01
398_N 183_V 0.74 0.01
318_P 111_T 0.74 0.01
589_L 243_Q 0.74 0.01
300_L 56_T 0.73 0.01
560_S 545_H 0.73 0.01
62_V 560_T 0.73 0.01
489_I 578_G 0.73 0.01
328_Y 158_V 0.73 0.01
26_E 317_I 0.73 0.01
479_D 45_S 0.73 0.01
573_E 343_V 0.73 0.01
158_M 40_K 0.73 0.01
294_L 303_F 0.73 0.01
208_D 30_V 0.73 0.01
482_T 302_Q 0.73 0.01
271_R 222_E 0.73 0.01
22_R 218_S 0.73 0.01
216_L 354_Y 0.73 0.01
199_V 353_R 0.73 0.01
262_E 57_E 0.73 0.01
90_V 302_Q 0.73 0.01
473_V 25_D 0.72 0.01
11_F 473_A 0.72 0.01
458_M 362_A 0.72 0.01
124_L 82_H 0.72 0.01
440_R 577_G 0.72 0.01
65_P 432_G 0.72 0.01
149_G 437_D 0.72 0.01
211_A 531_Q 0.72 0.01
272_K 266_V 0.72 0.01
113_A 71_T 0.72 0.01
117_E 554_N 0.72 0.01
565_I 186_E 0.72 0.01
300_L 132_F 0.71 0.01
108_F 293_S 0.71 0.01
241_F 207_L 0.71 0.01
433_D 542_I 0.71 0.01
186_Q 218_S 0.71 0.01
337_V 238_R 0.71 0.01
173_L 452_K 0.71 0.01
501_V 70_V 0.71 0.01
141_S 94_V 0.70 0.01
476_L 239_V 0.70 0.01
11_F 209_Q 0.70 0.01
580_E 73_T 0.70 0.01
68_T 517_G 0.70 0.01
501_V 40_K 0.70 0.01
286_L 135_G 0.70 0.01
23_R 176_G 0.70 0.01
548_G 563_G 0.70 0.01
335_L 297_E 0.70 0.01
281_L 218_S 0.70 0.01
446_N 604_I 0.70 0.01
410_D 539_D 0.70 0.01
490_R 349_G 0.70 0.01
466_L 480_A 0.70 0.01
244_Y 73_T 0.70 0.01
74_Y 198_F 0.69 0.01
51_N 218_S 0.69 0.01
533_R 441_A 0.69 0.01
110_E 520_L 0.69 0.01
229_P 170_Q 0.69 0.01
278_N 242_K 0.69 0.01
316_R 422_R 0.69 0.01
47_F 564_V 0.69 0.01
63_L 121_A 0.69 0.01
380_E 248_T 0.69 0.01
331_A 592_K 0.69 0.01
11_F 172_G 0.69 0.01
120_E 96_L 0.69 0.01
528_F 437_D 0.69 0.01
159_L 329_L 0.68 0.01
208_D 142_L 0.68 0.01
237_T 446_L 0.68 0.01
451_V 30_V 0.68 0.01
225_S 94_V 0.68 0.01
299_E 92_Y 0.68 0.01
470_G 589_E 0.68 0.01
425_V 584_N 0.68 0.01
286_L 415_F 0.68 0.01
591_K 442_M 0.68 0.01
302_Y 198_F 0.68 0.01
264_K 208_T 0.68 0.01
657_Q 266_V 0.68 0.01
443_A 271_I 0.68 0.01
583_G 440_A 0.67 0.01
83_E 590_I 0.67 0.01
650_L 230_R 0.67 0.01
583_G 388_K 0.67 0.01
577_K 588_E 0.67 0.01
640_E 221_L 0.67 0.01
439_I 409_V 0.67 0.01
665_L 223_F 0.67 0.01
62_V 447_R 0.67 0.01
464_E 228_R 0.67 0.01
63_L 384_A 0.67 0.01
137_V 269_L 0.67 0.01
254_E 132_F 0.67 0.01
392_V 470_G 0.67 0.01
24_L 148_I 0.67 0.01
181_Y 94_V 0.67 0.01
294_L 248_T 0.67 0.01
274_L 87_L 0.67 0.01
413_V 403_T 0.67 0.01
574_K 44_S 0.67 0.01
662_L 383_L 0.67 0.01
326_F 419_G 0.66 0.01
516_S 48_R 0.66 0.01
7_L 123_H 0.66 0.01
668_L 176_G 0.66 0.01
583_G 171_I 0.66 0.01
11_F 247_N 0.66 0.01
64_A 381_T 0.66 0.01
176_L 13_T 0.66 0.01
479_D 108_S 0.66 0.01
412_V 73_T 0.66 0.01
398_N 141_T 0.66 0.01
429_A 182_L 0.66 0.01
324_T 303_F 0.66 0.01
401_L 548_K 0.66 0.01
653_E 231_D 0.66 0.01
647_A 223_F 0.66 0.01
148_L 55_K 0.66 0.01
145_I 108_S 0.66 0.01
314_S 94_V 0.66 0.01
436_L 573_L 0.66 0.01
444_A 564_V 0.66 0.01
58_R 548_K 0.66 0.01
556_K 225_E 0.66 0.01
500_L 151_I 0.66 0.01
237_T 108_S 0.65 0.01
136_V 303_F 0.65 0.01
552_L 379_R 0.65 0.01
418_L 495_G 0.65 0.01
565_I 129_F 0.65 0.01
43_S 267_H 0.65 0.01
270_R 233_I 0.65 0.01
140_A 97_R 0.65 0.01
360_T 444_Q 0.65 0.01
364_Y 473_A 0.65 0.01
662_L 542_I 0.65 0.01
324_T 544_G 0.65 0.01
278_N 446_L 0.65 0.01
5_F 574_K 0.65 0.01
113_A 268_V 0.65 0.01
205_A 420_P 0.65 0.01
479_D 191_Q 0.65 0.01
646_H 354_Y 0.65 0.01
120_E 441_A 0.65 0.01
457_R 176_G 0.65 0.01
108_F 184_S 0.65 0.01
443_A 543_G 0.65 0.01
639_L 268_V 0.65 0.01
117_E 381_T 0.65 0.01
443_A 493_L 0.65 0.01
28_L 367_T 0.65 0.01
63_L 150_P 0.65 0.01
474_R 229_I 0.65 0.01
437_S 579_L 0.64 0.01
546_V 213_R 0.64 0.01
254_E 114_R 0.64 0.01
471_E 356_K 0.64 0.01
443_A 87_L 0.64 0.01
351_Y 493_L 0.64 0.01
286_L 452_K 0.64 0.01
479_D 430_I 0.64 0.01
137_V 181_G 0.64 0.01
120_E 408_T 0.64 0.01
136_V 358_A 0.64 0.01
328_Y 107_L 0.64 0.01
382_F 419_G 0.64 0.01
6_K 343_V 0.64 0.01
292_F 97_R 0.64 0.01
580_E 271_I 0.64 0.01
11_F 476_K 0.64 0.01
306_I 97_R 0.64 0.01
391_Y 275_K 0.64 0.01
402_E 112_H 0.63 0.01
409_V 220_N 0.63 0.01
457_R 471_Q 0.63 0.01
653_E 227_A 0.63 0.01
445_I 341_I 0.63 0.01
122_M 383_L 0.63 0.01
14_S 582_L 0.63 0.01
501_V 209_Q 0.63 0.01
200_I 560_T 0.63 0.01
336_V 295_V 0.63 0.01
299_E 41_K 0.63 0.01
224_L 208_T 0.63 0.01
389_T 222_E 0.63 0.01
476_L 23_M 0.63 0.01
646_H 349_G 0.63 0.01
391_Y 148_I 0.63 0.01
461_D 217_A 0.63 0.01
336_V 320_D 0.63 0.01
274_L 26_A 0.63 0.01
335_L 40_K 0.63 0.01
378_K 291_E 0.63 0.01
616_P 235_A 0.63 0.01
74_Y 168_Q 0.63 0.01
451_V 590_I 0.63 0.01
224_L 25_D 0.63 0.01
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

Page generated in 0.0398 seconds.