May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org

NUOH - NUOJ
UniProt:
Length: 509
Sequences: 1175
Seq/Len: 2.45
I_Prob: 1.00
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
114_I 53_A 2.54 1.00
314_L 20_I 1.50 0.87
79_D 27_H 1.50 0.87
297_V 52_G 1.45 0.84
82_I 27_H 1.43 0.83
294_Y 70_V 1.20 0.66
273_L 143_L 1.18 0.63
150_S 143_L 1.05 0.48
251_L 26_V 1.03 0.46
39_L 141_V 1.02 0.45
95_L 153_V 1.01 0.44
277_F 58_V 1.00 0.43
158_V 43_F 1.00 0.43
245_I 20_I 0.99 0.42
161_G 65_V 0.99 0.41
188_N 18_R 0.99 0.41
93_S 57_I 0.98 0.41
160_L 26_V 0.97 0.39
115_G 130_G 0.97 0.39
168_V 19_V 0.94 0.36
128_Y 74_L 0.94 0.36
319_V 135_G 0.93 0.34
306_L 129_V 0.92 0.33
52_V 52_G 0.91 0.33
294_Y 67_F 0.91 0.33
11_I 3_F 0.90 0.31
85_L 32_L 0.90 0.31
120_L 29_L 0.90 0.31
219_Q 60_A 0.90 0.31
132_F 51_A 0.90 0.31
159_F 67_F 0.89 0.30
273_L 94_I 0.89 0.30
162_L 46_L 0.89 0.30
294_Y 134_F 0.89 0.29
125_L 37_L 0.88 0.29
279_M 32_L 0.88 0.29
128_Y 70_V 0.88 0.28
18_A 58_V 0.87 0.27
129_A 23_T 0.86 0.27
308_L 121_G 0.86 0.27
294_Y 25_P 0.86 0.27
65_I 90_P 0.86 0.27
128_Y 68_V 0.86 0.27
116_I 13_I 0.85 0.26
23_L 109_Y 0.85 0.26
159_F 35_S 0.85 0.26
61_V 14_L 0.85 0.26
281_M 136_P 0.85 0.25
126_A 140_A 0.84 0.25
235_G 158_V 0.84 0.25
294_Y 74_L 0.84 0.25
251_L 63_I 0.84 0.24
50_N 67_F 0.83 0.24
136_S 35_S 0.83 0.24
83_F 23_T 0.83 0.24
169_A 114_V 0.83 0.24
128_Y 25_P 0.82 0.23
119_F 126_A 0.82 0.23
319_V 138_V 0.82 0.23
297_V 154_V 0.82 0.23
281_M 58_V 0.82 0.23
159_F 152_L 0.81 0.22
257_F 136_P 0.81 0.22
90_A 17_L 0.81 0.21
128_Y 134_F 0.80 0.21
228_E 133_L 0.80 0.21
51_R 64_M 0.80 0.21
64_M 42_V 0.80 0.21
217_A 155_A 0.80 0.21
125_L 33_I 0.80 0.21
158_V 57_I 0.80 0.21
14_T 4_A 0.79 0.20
41_G 21_T 0.79 0.20
133_A 29_L 0.79 0.20
197_I 12_A 0.79 0.20
86_A 5_F 0.79 0.20
127_V 64_M 0.79 0.20
198_T 13_I 0.78 0.19
103_V 161_E 0.78 0.19
254_T 152_L 0.78 0.19
189_V 79_S 0.78 0.19
122_M 37_L 0.78 0.19
130_V 30_L 0.78 0.19
163_S 13_I 0.78 0.19
214_Q 28_A 0.77 0.19
236_L 115_N 0.77 0.18
98_F 36_L 0.77 0.18
57_S 105_V 0.77 0.18
54_W 2_E 0.77 0.18
317_A 54_L 0.77 0.18
226_H 38_A 0.77 0.18
265_L 15_A 0.77 0.18
97_A 58_V 0.76 0.18
175_N 20_I 0.76 0.18
158_V 34_I 0.76 0.18
253_V 17_L 0.76 0.18
22_L 29_L 0.76 0.18
255_L 66_L 0.76 0.18
129_A 68_V 0.76 0.17
215_P 145_S 0.76 0.17
298_M 64_M 0.76 0.17
248_I 152_L 0.76 0.17
87_P 61_G 0.75 0.17
151_A 29_L 0.75 0.17
99_A 5_F 0.74 0.16
292_P 3_F 0.74 0.16
292_P 144_A 0.74 0.16
190_I 4_A 0.74 0.16
84_T 146_M 0.74 0.16
86_A 14_L 0.74 0.16
114_I 127_K 0.74 0.16
169_A 144_A 0.74 0.16
289_L 15_A 0.74 0.16
82_I 30_L 0.74 0.16
275_T 97_A 0.74 0.16
309_T 132_T 0.74 0.16
72_D 38_A 0.74 0.16
309_T 154_V 0.74 0.16
239_V 14_L 0.74 0.16
257_F 85_R 0.73 0.16
308_L 129_V 0.73 0.15
196_F 31_Y 0.73 0.15
57_S 120_D 0.73 0.15
197_I 22_H 0.73 0.15
243_I 92_V 0.73 0.15
254_T 105_V 0.73 0.15
308_L 13_I 0.72 0.15
276_A 139_L 0.72 0.15
163_S 134_F 0.72 0.15
158_V 27_H 0.72 0.15
133_A 112_L 0.72 0.15
30_A 60_A 0.72 0.15
76_K 96_P 0.72 0.14
95_L 126_A 0.72 0.14
306_L 37_L 0.72 0.14
244_G 102_I 0.72 0.14
25_V 139_L 0.72 0.14
166_G 57_I 0.71 0.14
69_F 57_I 0.71 0.14
51_R 60_A 0.71 0.14
116_I 127_K 0.71 0.14
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

Page generated in 0.2681 seconds.