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OPENSEQ.org
YBHK - YHBJ
UniProt: P75767 - P0A894
Length: 586
Sequences: 398
Seq/Len: 0.70
I_Prob: 0.08
YBHK - UPF0052 protein YbhK
Paralog alert: 0.01 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: YBHK 		YHBJ - UPF0042 nucleotide-binding protein YhbJ
Paralog alert: 0.00 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: YHBJ
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
114_A 36_L 1.78 0.08
10_D 71_M 1.71 0.07
36_T 137_S 1.64 0.06
246_Y 186_L 1.63 0.06
110_R 208_F 1.52 0.04
13_V 92_L 1.42 0.03
19_H 191_W 1.34 0.03
181_N 190_H 1.34 0.03
290_L 127_R 1.32 0.02
63_M 55_I 1.31 0.02
198_M 171_H 1.29 0.02
81_F 145_A 1.27 0.02
101_L 26_F 1.27 0.02
193_F 191_W 1.26 0.02
29_S 232_M 1.26 0.02
81_F 225_Y 1.25 0.02
12_V 47_R 1.23 0.02
209_A 272_V 1.21 0.02
217_M 127_R 1.20 0.02
155_D 242_T 1.18 0.01
117_L 225_Y 1.15 0.01
177_V 108_K 1.14 0.01
86_G 86_D 1.12 0.01
54_S 274_S 1.11 0.01
71_I 160_L 1.11 0.01
246_Y 179_Y 1.11 0.01
104_L 74_L 1.11 0.01
195_T 96_Y 1.11 0.01
101_L 9_R 1.10 0.01
193_F 98_D 1.10 0.01
220_I 9_R 1.10 0.01
216_P 21_L 1.09 0.01
296_K 4_M 1.09 0.01
122_L 244_A 1.09 0.01
258_G 191_W 1.08 0.01
180_I 96_Y 1.08 0.01
298_L 55_I 1.08 0.01
243_M 62_E 1.07 0.01
117_L 37_L 1.06 0.01
44_N 209_L 1.06 0.01
38_I 245_I 1.06 0.01
64_R 185_F 1.06 0.01
22_G 21_L 1.05 0.01
138_L 27_Y 1.05 0.01
77_A 229_W 1.05 0.01
243_M 51_A 1.05 0.01
114_A 241_L 1.04 0.01
208_Q 245_I 1.04 0.01
286_D 137_S 1.04 0.01
252_I 244_A 1.04 0.01
225_R 258_A 1.04 0.01
179_A 130_A 1.03 0.01
151_E 14_K 1.02 0.01
187_I 86_D 1.02 0.01
219_Y 99_T 1.02 0.01
28_L 5_I 1.02 0.01
119_R 71_M 1.02 0.01
50_R 94_R 1.01 0.01
290_L 93_I 1.01 0.01
163_E 183_V 1.01 0.01
206_I 137_S 1.01 0.01
136_V 193_P 1.00 0.01
38_I 155_K 1.00 0.01
183_A 130_A 1.00 0.01
220_I 258_A 1.00 0.01
221_G 96_Y 1.00 0.01
194_Y 29_V 0.99 0.01
246_Y 89_R 0.99 0.01
294_L 70_A 0.99 0.01
51_I 153_L 0.99 0.01
246_Y 67_F 0.99 0.01
95_N 6_V 0.98 0.01
19_H 28_C 0.98 0.01
93_G 112_L 0.98 0.01
131_M 215_V 0.97 0.01
180_I 203_K 0.97 0.01
240_L 96_Y 0.97 0.01
167_T 124_E 0.97 0.01
195_T 99_T 0.96 0.01
155_D 212_H 0.96 0.01
58_I 160_L 0.96 0.01
287_R 87_A 0.96 0.01
294_L 145_A 0.96 0.01
183_A 118_K 0.96 0.01
175_E 162_M 0.96 0.01
66_C 28_C 0.96 0.01
48_T 115_A 0.96 0.01
124_V 213_T 0.95 0.01
99_L 120_S 0.95 0.01
174_R 17_A 0.95 0.01
187_I 88_D 0.95 0.01
235_K 79_S 0.95 0.01
194_Y 180_V 0.95 0.01
177_V 156_R 0.94 0.01
234_L 145_A 0.94 0.01
83_Y 210_D 0.94 0.01
232_A 216_H 0.94 0.01
66_C 127_R 0.94 0.01
125_D 113_E 0.94 0.01
21_L 12_S 0.94 0.01
95_N 169_F 0.94 0.01
210_L 175_I 0.94 0.01
207_A 85_L 0.94 0.01
179_A 21_L 0.93 0.01
221_G 215_V 0.93 0.01
228_S 27_Y 0.93 0.01
114_A 113_E 0.93 0.01
294_L 17_A 0.92 0.01
140_A 178_D 0.92 0.01
294_L 218_F 0.92 0.01
223_L 67_F 0.92 0.01
72_T 113_E 0.92 0.01
132_S 6_V 0.92 0.01
188_I 88_D 0.92 0.01
66_C 57_V 0.92 0.01
57_G 15_S 0.92 0.01
270_I 226_L 0.92 0.01
256_I 109_N 0.91 0.01
149_Y 86_D 0.91 0.01
224_G 14_K 0.91 0.01
233_N 193_P 0.91 0.01
269_R 137_S 0.91 0.01
290_L 86_D 0.91 0.01
26_S 190_H 0.90 0.01
178_H 139_M 0.90 0.01
204_K 192_D 0.90 0.01
162_Q 219_I 0.90 0.01
223_L 240_Y 0.90 0.01
271_V 241_L 0.90 0.01
204_K 196_R 0.90 0.01
243_M 91_T 0.90 0.01
210_L 218_F 0.89 0.01
127_H 45_A 0.89 0.01
296_K 190_H 0.89 0.01
93_G 226_L 0.89 0.01
64_R 233_L 0.89 0.01
213_T 116_I 0.89 0.01
147_E 228_L 0.89 0.01
203_L 32_L 0.89 0.01
35_L 70_A 0.88 0.01
102_K 183_V 0.88 0.01
27_S 228_L 0.88 0.01
42_T 152_L 0.88 0.01
274_E 86_D 0.88 0.01
182_E 190_H 0.88 0.01
177_V 194_K 0.88 0.01
269_R 272_V 0.88 0.01
270_I 197_P 0.87 0.01
118_I 134_V 0.87 0.01
113_E 130_A 0.87 0.01
197_L 78_F 0.87 0.01
94_H 186_L 0.87 0.01
259_P 29_V 0.87 0.01
158_T 245_I 0.87 0.01
105_D 20_A 0.87 0.01
148_V 243_V 0.87 0.01
260_K 82_L 0.87 0.01
177_V 258_A 0.87 0.01
47_S 1_M 0.86 0.01
223_L 239_S 0.86 0.01
102_K 148_L 0.86 0.01
38_I 27_Y 0.86 0.01
183_A 92_L 0.86 0.01
118_I 261_L 0.86 0.01
120_N 190_H 0.86 0.01
225_R 191_W 0.86 0.01
38_I 281_K 0.86 0.01
101_L 74_L 0.86 0.01
198_M 99_T 0.86 0.01
12_V 162_M 0.86 0.01
118_I 171_H 0.86 0.01
271_V 267_S 0.86 0.01
220_I 180_V 0.86 0.01
195_T 14_K 0.86 0.01
28_L 36_L 0.85 0.01
205_E 199_T 0.85 0.01
249_K 74_L 0.85 0.01
109_V 176_D 0.85 0.01
37_G 208_F 0.85 0.01
109_V 17_A 0.85 0.01
185_L 214_E 0.85 0.01
177_V 114_S 0.85 0.01
254_A 210_D 0.85 0.01
295_E 190_H 0.85 0.01
42_T 9_R 0.85 0.01
228_S 179_Y 0.84 0.01
197_L 274_S 0.84 0.01
167_T 165_E 0.84 0.01
94_H 1_M 0.84 0.00
212_R 83_L 0.84 0.00
232_A 203_K 0.84 0.00
136_V 137_S 0.84 0.00
210_L 137_S 0.84 0.00
176_A 219_I 0.84 0.00
35_L 15_S 0.84 0.00
197_L 107_S 0.84 0.00
66_C 86_D 0.84 0.00
132_S 93_I 0.83 0.00
256_I 7_S 0.83 0.00
68_N 209_L 0.83 0.00
220_I 21_L 0.83 0.00
224_G 191_W 0.83 0.00
148_V 72_S 0.83 0.00
106_H 139_M 0.83 0.00
63_M 202_D 0.83 0.00
261_V 6_V 0.83 0.00
197_L 173_I 0.83 0.00
181_N 24_M 0.83 0.00
11_R 145_A 0.83 0.00
186_I 51_A 0.83 0.00
257_V 15_S 0.82 0.00
11_R 74_L 0.82 0.00
208_Q 157_E 0.82 0.00
80_M 117_D 0.82 0.00
185_L 145_A 0.82 0.00
261_V 243_V 0.82 0.00
152_V 53_V 0.82 0.00
22_G 208_F 0.82 0.00
181_N 197_P 0.82 0.00
289_L 263_D 0.82 0.00
13_V 130_A 0.82 0.00
202_L 47_R 0.82 0.00
87_G 245_I 0.82 0.00
217_M 211_R 0.82 0.00
218_V 273_Q 0.82 0.00
34_R 77_A 0.82 0.00
255_V 159_E 0.82 0.00
197_L 195_L 0.82 0.00
226_E 14_K 0.81 0.00
96_L 96_Y 0.81 0.00
38_I 43_T 0.81 0.00
203_L 186_L 0.81 0.00
288_Q 26_F 0.81 0.00
235_K 224_S 0.81 0.00
66_C 16_V 0.81 0.00
297_A 169_F 0.81 0.00
29_S 228_L 0.81 0.00
34_R 21_L 0.81 0.00
76_V 37_L 0.81 0.00
242_I 67_F 0.81 0.00
138_L 14_K 0.81 0.00
286_D 162_M 0.81 0.00
213_T 175_I 0.81 0.00
246_Y 54_S 0.81 0.00
11_R 257_I 0.80 0.00
67_L 7_S 0.80 0.00
14_A 244_A 0.80 0.00
151_E 191_W 0.80 0.00
177_V 217_N 0.80 0.00
209_A 114_S 0.80 0.00
133_E 16_V 0.80 0.00
23_R 162_M 0.80 0.00
101_L 171_H 0.80 0.00
89_G 178_D 0.80 0.00
101_L 161_T 0.79 0.00
151_E 99_T 0.79 0.00
214_P 196_R 0.79 0.00
289_L 192_D 0.79 0.00
288_Q 235_T 0.79 0.00
201_L 111_S 0.79 0.00
55_E 206_A 0.79 0.00
198_M 241_L 0.79 0.00
119_R 28_C 0.79 0.00
208_Q 143_E 0.79 0.00
256_I 72_S 0.79 0.00
265_A 50_S 0.79 0.00
173_T 244_A 0.79 0.00
38_I 133_I 0.79 0.00
115_I 18_L 0.79 0.00
284_R 15_S 0.79 0.00
48_T 171_H 0.79 0.00
32_G 245_I 0.79 0.00
280_D 130_A 0.79 0.00
226_E 171_H 0.79 0.00
194_Y 237_N 0.79 0.00
187_I 234_E 0.79 0.00
14_A 97_S 0.78 0.00
93_G 261_L 0.78 0.00
116_N 259_E 0.78 0.00
67_L 54_S 0.78 0.00
154_I 14_K 0.78 0.00
215_A 187_P 0.78 0.00
227_L 37_L 0.78 0.00
66_C 191_W 0.78 0.00
135_P 195_L 0.78 0.00
204_K 92_L 0.78 0.00
29_S 265_F 0.78 0.00
38_I 206_A 0.77 0.00
232_A 51_A 0.77 0.00
35_L 165_E 0.77 0.00
202_L 267_S 0.77 0.00
234_L 173_I 0.77 0.00
48_T 54_S 0.77 0.00
148_V 55_I 0.77 0.00
96_L 1_M 0.77 0.00
77_A 256_Y 0.77 0.00
19_H 18_L 0.77 0.00
167_T 73_N 0.77 0.00
198_M 75_P 0.77 0.00
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions (includes both intra and inter preds)
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