May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org

FLIF - FLIG
UniProt: P25798 - P0ABZ1
Length: 883
Sequences: 550
Seq/Len: 0.64
I_Prob: 0.11

FLIF - Flagellar M-ring protein
Paralog alert: 0.11 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIF
FLIG - Flagellar motor switch protein FliG
Paralog alert: 0.15 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIG
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
202_L 321_M 1.84 0.11
208_T 9_K 1.46 0.04
378_S 324_G 1.35 0.03
202_L 331_V 1.33 0.03
542_V 23_A 1.32 0.03
221_N 328_D 1.31 0.03
83_I 37_L 1.30 0.02
263_V 14_L 1.29 0.02
140_T 224_E 1.28 0.02
137_L 294_G 1.25 0.02
147_V 329_T 1.25 0.02
184_D 27_K 1.24 0.02
125_E 35_Q 1.24 0.02
424_V 261_I 1.23 0.02
125_E 129_I 1.21 0.02
253_I 216_T 1.21 0.02
175_V 69_L 1.20 0.02
477_T 215_I 1.19 0.02
422_L 242_V 1.19 0.02
162_F 85_L 1.19 0.02
59_D 135_V 1.19 0.02
140_T 120_D 1.18 0.02
61_G 47_I 1.17 0.02
533_D 21_R 1.16 0.02
41_L 328_D 1.16 0.01
144_I 28_H 1.15 0.01
95_L 145_I 1.13 0.01
258_N 29_L 1.12 0.01
384_N 29_L 1.12 0.01
360_V 80_V 1.11 0.01
367_T 254_V 1.11 0.01
540_A 25_V 1.11 0.01
205_G 296_V 1.11 0.01
543_I 145_I 1.10 0.01
199_V 274_F 1.10 0.01
258_N 227_Q 1.10 0.01
400_Q 229_I 1.09 0.01
134_E 316_A 1.09 0.01
64_V 196_V 1.09 0.01
175_V 108_E 1.09 0.01
75_R 272_E 1.09 0.01
167_K 290_L 1.09 0.01
27_V 113_M 1.08 0.01
28_A 145_I 1.08 0.01
199_V 268_Q 1.08 0.01
88_D 55_V 1.08 0.01
422_L 270_L 1.08 0.01
389_P 23_A 1.07 0.01
168_S 37_L 1.07 0.01
134_E 306_K 1.07 0.01
311_G 162_A 1.06 0.01
232_L 201_E 1.06 0.01
246_I 192_K 1.06 0.01
370_N 149_F 1.05 0.01
424_V 145_I 1.04 0.01
326_S 328_D 1.04 0.01
539_V 317_E 1.04 0.01
147_V 295_P 1.04 0.01
411_A 156_D 1.03 0.01
267_L 206_M 1.03 0.01
403_Q 272_E 1.03 0.01
35_V 138_K 1.03 0.01
306_P 322_V 1.02 0.01
547_I 45_T 1.02 0.01
454_A 269_P 1.01 0.01
523_V 115_P 1.01 0.01
290_L 142_A 1.01 0.01
191_I 146_L 1.01 0.01
351_Q 177_E 1.01 0.01
370_N 215_I 1.01 0.01
542_V 112_F 1.01 0.01
107_A 9_K 1.01 0.01
313_L 175_L 1.01 0.01
39_L 315_L 1.01 0.01
310_P 126_H 1.01 0.01
157_P 55_V 1.01 0.01
388_L 75_D 1.01 0.01
242_I 94_L 1.01 0.01
156_M 40_A 1.00 0.01
261_A 330_Y 1.00 0.01
39_L 14_L 1.00 0.01
79_A 37_L 1.00 0.01
532_S 43_N 1.00 0.01
208_T 141_Q 1.00 0.01
543_I 29_L 1.00 0.01
71_N 163_T 1.00 0.01
216_L 171_A 1.00 0.01
215_H 192_K 0.99 0.01
93_L 66_F 0.99 0.01
370_N 17_I 0.99 0.01
144_I 330_Y 0.99 0.01
310_P 85_L 0.99 0.01
115_Q 288_D 0.99 0.01
461_L 311_I 0.99 0.01
84_E 16_T 0.99 0.01
170_S 12_I 0.98 0.01
459_L 258_S 0.98 0.01
419_G 143_A 0.98 0.01
412_M 56_L 0.98 0.01
69_Q 311_I 0.98 0.01
63_I 239_L 0.98 0.01
399_E 93_L 0.97 0.01
361_D 289_D 0.97 0.01
155_A 129_I 0.97 0.01
63_I 197_R 0.97 0.01
550_D 254_V 0.97 0.01
384_N 182_L 0.97 0.01
359_E 14_L 0.96 0.01
55_L 6_G 0.96 0.01
93_L 315_L 0.96 0.01
399_E 229_I 0.96 0.01
206_N 15_M 0.96 0.01
418_R 85_L 0.96 0.01
125_E 306_K 0.96 0.01
100_Q 328_D 0.96 0.01
238_V 269_P 0.96 0.01
539_V 196_V 0.96 0.01
252_P 171_A 0.96 0.01
204_P 20_D 0.95 0.01
94_R 328_D 0.95 0.01
87_A 311_I 0.95 0.01
122_Q 129_I 0.95 0.01
124_S 298_L 0.95 0.01
72_I 261_I 0.95 0.01
196_S 172_L 0.95 0.01
170_S 257_E 0.95 0.01
279_Y 9_K 0.95 0.01
54_N 157_V 0.95 0.01
75_R 124_D 0.95 0.01
239_E 95_E 0.94 0.01
212_Q 238_N 0.94 0.01
202_L 39_A 0.94 0.01
188_I 288_D 0.94 0.01
72_I 321_M 0.94 0.01
192_V 161_I 0.94 0.01
463_V 145_I 0.94 0.01
51_L 270_L 0.94 0.01
116_E 180_N 0.94 0.01
114_D 288_D 0.94 0.01
133_L 25_V 0.94 0.01
121_S 182_L 0.93 0.01
476_L 297_R 0.93 0.01
428_P 245_R 0.93 0.01
62_A 150_D 0.93 0.01
415_S 24_E 0.93 0.01
147_V 161_I 0.93 0.01
259_I 130_I 0.93 0.01
384_N 180_N 0.93 0.01
95_L 156_D 0.93 0.01
272_K 296_V 0.93 0.01
266_Q 290_L 0.93 0.01
22_K 254_V 0.92 0.01
59_D 175_L 0.92 0.01
270_A 270_L 0.92 0.01
378_S 215_I 0.92 0.01
155_A 299_S 0.92 0.01
292_S 289_D 0.92 0.01
421_S 48_S 0.92 0.01
543_I 13_L 0.92 0.01
311_G 86_G 0.92 0.01
414_F 250_L 0.92 0.01
400_Q 275_L 0.92 0.01
129_Y 317_E 0.92 0.01
168_S 300_Q 0.92 0.01
458_L 209_Q 0.92 0.01
40_I 13_L 0.91 0.01
262_Q 14_L 0.91 0.01
423_N 179_L 0.91 0.01
151_R 146_L 0.91 0.01
50_T 200_A 0.91 0.01
308_G 90_A 0.91 0.01
407_L 171_A 0.91 0.01
111_E 183_L 0.91 0.01
61_G 83_K 0.90 0.01
194_L 275_L 0.90 0.01
468_W 115_P 0.90 0.01
251_S 142_A 0.90 0.01
154_L 193_M 0.90 0.01
39_L 142_A 0.90 0.01
272_K 108_E 0.90 0.01
205_G 276_R 0.90 0.01
296_N 189_K 0.90 0.01
200_A 316_A 0.90 0.01
101_G 281_R 0.90 0.01
543_I 285_I 0.90 0.01
544_R 33_E 0.90 0.01
292_S 85_L 0.89 0.01
88_D 124_D 0.89 0.01
422_L 241_D 0.89 0.01
95_L 93_L 0.89 0.01
199_V 251_L 0.89 0.01
73_P 328_D 0.89 0.01
291_R 167_V 0.89 0.01
36_M 94_L 0.89 0.01
282_N 29_L 0.89 0.01
242_I 61_Q 0.88 0.01
305_Y 287_R 0.88 0.01
428_P 275_L 0.88 0.01
455_G 47_I 0.88 0.01
76_F 139_R 0.88 0.01
22_K 182_L 0.88 0.01
252_P 31_Q 0.88 0.01
49_R 93_L 0.88 0.01
256_N 271_R 0.88 0.01
71_N 26_F 0.88 0.01
204_P 161_I 0.88 0.01
404_I 40_A 0.88 0.01
374_V 303_N 0.88 0.01
132_A 217_A 0.87 0.01
196_S 258_S 0.87 0.01
438_E 276_R 0.87 0.01
175_V 13_L 0.87 0.01
33_V 250_L 0.87 0.01
52_F 53_T 0.87 0.01
169_P 17_I 0.87 0.01
195_V 42_A 0.87 0.01
164_R 34_V 0.87 0.01
130_Q 203_I 0.87 0.01
39_L 37_L 0.87 0.01
46_P 75_D 0.87 0.01
151_R 137_L 0.87 0.01
49_R 309_L 0.87 0.01
63_I 215_I 0.87 0.01
341_T 272_E 0.87 0.01
121_S 26_F 0.87 0.01
469_R 298_L 0.87 0.01
540_A 10_S 0.86 0.01
267_L 208_T 0.86 0.01
181_R 78_R 0.86 0.01
193_H 224_E 0.86 0.01
361_D 106_G 0.86 0.01
465_W 224_E 0.86 0.01
208_T 172_L 0.86 0.01
548_N 296_V 0.86 0.01
542_V 15_M 0.86 0.01
138_S 328_D 0.85 0.01
14_L 44_V 0.85 0.01
431_S 44_V 0.85 0.01
47_D 154_R 0.85 0.01
120_I 172_L 0.85 0.01
174_T 173_A 0.85 0.01
113_L 22_A 0.85 0.01
469_R 165_G 0.85 0.01
198_A 76_Y 0.85 0.01
203_P 201_E 0.85 0.01
98_A 259_L 0.85 0.01
450_Q 266_A 0.85 0.01
198_A 287_R 0.85 0.01
412_M 140_A 0.85 0.01
134_E 230_I 0.85 0.01
43_A 286_L 0.85 0.01
294_Q 229_I 0.85 0.01
464_A 20_D 0.85 0.01
444_Q 328_D 0.85 0.01
378_S 52_L 0.85 0.01
374_V 144_D 0.85 0.01
295_L 196_V 0.85 0.01
204_P 139_R 0.85 0.01
456_R 144_D 0.84 0.01
193_H 240_V 0.84 0.01
525_S 167_V 0.84 0.01
128_N 180_N 0.84 0.01
295_L 119_A 0.84 0.01
253_I 224_E 0.84 0.01
260_H 44_V 0.84 0.01
21_P 15_M 0.84 0.01
417_K 145_I 0.84 0.01
430_N 317_E 0.84 0.01
121_S 202_I 0.84 0.01
507_D 142_A 0.84 0.01
442_W 199_A 0.84 0.01
296_N 4_L 0.84 0.01
28_A 227_Q 0.84 0.01
31_A 36_T 0.84 0.01
202_L 296_V 0.84 0.01
289_A 199_A 0.84 0.01
462_L 167_V 0.84 0.01
137_L 282_A 0.84 0.01
421_S 47_I 0.84 0.01
116_E 143_A 0.84 0.01
193_H 108_E 0.83 0.01
68_T 268_Q 0.83 0.01
26_I 247_I 0.83 0.01
119_G 270_L 0.83 0.01
196_S 196_V 0.83 0.01
91_H 273_K 0.83 0.01
95_L 288_D 0.83 0.01
410_E 171_A 0.83 0.01
127_V 132_T 0.83 0.01
132_A 130_I 0.83 0.01
128_N 41_M 0.83 0.01
414_F 300_Q 0.83 0.01
141_I 209_Q 0.83 0.01
52_F 93_L 0.83 0.01
28_A 75_D 0.83 0.01
202_L 157_V 0.83 0.01
169_P 290_L 0.83 0.01
148_K 75_D 0.83 0.01
125_E 107_I 0.83 0.01
30_S 235_L 0.83 0.01
137_L 305_Q 0.82 0.01
74_Y 247_I 0.82 0.01
132_A 203_I 0.82 0.00
142_E 53_T 0.82 0.00
324_P 176_T 0.82 0.00
265_A 298_L 0.82 0.00
261_A 121_L 0.82 0.00
308_G 76_Y 0.82 0.00
414_F 267_E 0.82 0.00
370_N 320_E 0.82 0.00
537_R 143_A 0.82 0.00
69_Q 271_R 0.82 0.00
279_Y 88_E 0.82 0.00
491_Q 216_T 0.82 0.00
245_R 117_S 0.82 0.00
468_W 274_F 0.82 0.00
208_T 126_H 0.82 0.00
202_L 219_R 0.82 0.00
162_F 110_L 0.82 0.00
416_E 311_I 0.82 0.00
415_S 216_T 0.82 0.00
280_R 304_E 0.82 0.00
390_D 311_I 0.82 0.00
198_A 139_R 0.82 0.00
98_A 69_L 0.82 0.00
378_S 313_R 0.82 0.00
323_A 254_V 0.81 0.00
317_P 265_G 0.81 0.00
114_D 316_A 0.81 0.00
461_L 237_E 0.81 0.00
380_A 18_G 0.81 0.00
207_V 315_L 0.81 0.00
384_N 304_E 0.81 0.00
219_Q 149_F 0.81 0.00
124_S 59_F 0.81 0.00
113_L 129_I 0.81 0.00
422_L 256_S 0.81 0.00
392_K 257_E 0.81 0.00
442_W 175_L 0.81 0.00
197_S 183_L 0.81 0.00
164_R 316_A 0.81 0.00
449_D 13_L 0.81 0.00
423_N 18_G 0.81 0.00
437_G 266_A 0.81 0.00
276_E 8_D 0.81 0.00
444_Q 237_E 0.81 0.00
64_V 203_I 0.81 0.00
315_N 76_Y 0.81 0.00
95_L 237_E 0.81 0.00
39_L 250_L 0.81 0.00
163_V 59_F 0.81 0.00
249_I 85_L 0.81 0.00
544_R 211_E 0.81 0.00
190_A 108_E 0.81 0.00
299_E 214_V 0.80 0.00
548_N 39_A 0.80 0.00
542_V 30_S 0.80 0.00
246_I 245_R 0.80 0.00
128_N 190_R 0.80 0.00
529_R 222_D 0.80 0.00
93_L 222_D 0.80 0.00
81_G 33_E 0.80 0.00
279_Y 12_I 0.80 0.00
23_I 269_P 0.80 0.00
83_I 284_D 0.80 0.00
30_S 201_E 0.80 0.00
411_A 224_E 0.80 0.00
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

Page generated in 0.0553 seconds.