OPENSEQ.org
AzoTY_coevo

Genes: A B A+B
Length: 469 445 829
Sequences: 63 966 58
Seq/Len: 0.13 2.17 0.07
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.92
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show HHblits results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.

Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.00 0.01 0.06
2 0.00 0.01 0.06
5 0.00 0.02 0.06
10 0.00 0.02 0.06
20 0.00 0.03 0.06
100 0.00 0.03 0.06
0.05 0.05 0.07
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!

GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.
Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
207_L 202_N 1.85 0.27 0.00
94_I 308_V 1.74 0.23 0.00
99_V 201_T 1.61 0.19 0.00
173_I 41_F 1.54 0.17 0.00
110_G 71_D 1.53 0.17 0.00
132_L 284_A 1.51 0.17 0.00
10_T 201_T 1.51 0.17 0.00
78_S 159_P 1.48 0.16 0.00
78_S 407_R 1.47 0.15 0.00
46_I 387_G 1.46 0.15 0.00
162_R 351_A 1.39 0.14 0.00
132_L 71_D 1.39 0.14 0.00
14_E 39_R 1.38 0.14 0.00
335_E 62_A 1.37 0.13 0.00
5_V 322_L 1.36 0.13 0.00
156_V 82_T 1.36 0.13 0.00
359_L 206_S 1.35 0.13 0.00
60_W 387_G 1.34 0.13 0.00
78_S 102_S 1.34 0.13 0.00
58_S 134_D 1.34 0.13 0.00
356_L 90_S 1.34 0.13 0.00
46_I 383_L 1.32 0.12 0.00
118_H 282_Y 1.32 0.12 0.00
428_L 217_G 1.32 0.12 0.00
11_M 82_T 1.31 0.12 0.00
72_I 336_D 1.30 0.12 0.00
327_A 259_N 1.29 0.12 0.00
67_A 165_G 1.28 0.12 0.00
131_P 217_G 1.28 0.12 0.00
58_S 82_T 1.28 0.11 0.00
60_W 383_L 1.27 0.11 0.00
99_V 62_A 1.27 0.11 0.00
127_P 392_L 1.26 0.11 0.00
135_L 52_E 1.25 0.11 0.00
34_I 387_G 1.25 0.11 0.00
187_L 258_L 1.25 0.11 0.00
110_G 311_C 1.24 0.11 0.00
145_A 221_V 1.23 0.11 0.00
80_M 405_V 1.23 0.10 0.00
166_P 78_V 1.22 0.10 0.00
130_E 66_I 1.22 0.10 0.00
299_F 372_F 1.21 0.10 0.00
132_L 219_C 1.21 0.10 0.00
194_G 383_L 1.21 0.10 0.00
204_E 96_S 1.20 0.10 0.00
284_G 114_G 1.20 0.10 0.00
118_H 405_V 1.19 0.10 0.00
77_A 90_S 1.19 0.10 0.00
248_P 360_D 1.19 0.10 0.00
55_Q 64_C 1.18 0.10 0.00
357_N 246_L 1.18 0.10 0.00
100_A 241_T 1.18 0.10 0.00
144_A 265_G 1.17 0.10 0.00
183_E 334_R 1.17 0.10 0.00
34_I 209_H 1.17 0.10 0.00
35_L 92_T 1.16 0.10 0.00
164_Y 108_V 1.16 0.10 0.00
88_C 318_V 1.16 0.09 0.00
34_I 292_R 1.16 0.09 0.00
72_I 215_V 1.15 0.09 0.00
369_A 328_S 1.15 0.09 0.00
187_L 72_V 1.15 0.09 0.00
61_H 87_R 1.15 0.09 0.00
61_H 329_R 1.15 0.09 0.00
61_H 331_D 1.15 0.09 0.00
114_V 87_R 1.15 0.09 0.00
114_V 329_R 1.15 0.09 0.00
114_V 331_D 1.15 0.09 0.00
227_S 286_V 1.15 0.09 0.00
230_F 179_T 1.15 0.09 0.00
336_R 308_V 1.15 0.09 0.00
23_A 201_T 1.14 0.09 0.00
258_L 94_A 1.14 0.09 0.00
48_L 176_A 1.14 0.09 0.00
32_A 81_H 1.14 0.09 0.00
318_N 420_F 1.14 0.09 0.00
273_R 258_L 1.14 0.09 0.00
216_P 377_T 1.14 0.09 0.00
78_S 80_I 1.14 0.09 0.00
10_T 90_S 1.13 0.09 0.00
3_I 94_A 1.12 0.09 0.00
46_I 391_V 1.12 0.09 0.00
422_F 72_V 1.12 0.09 0.00
118_H 38_K 1.12 0.09 0.00
93_M 321_R 1.12 0.09 0.00
168_R 321_R 1.12 0.09 0.00
108_L 307_A 1.11 0.09 0.00
44_D 92_T 1.11 0.09 0.00
94_I 94_A 1.11 0.09 0.00
190_F 186_V 1.11 0.09 0.00
150_G 279_L 1.11 0.09 0.00
165_F 44_T 1.10 0.09 0.00
57_L 302_S 1.10 0.09 0.00
260_R 145_R 1.10 0.09 0.00
120_G 257_L 1.10 0.09 0.00
33_D 53_T 1.10 0.09 0.00
370_E 90_S 1.10 0.09 0.00
209_H 201_T 1.10 0.09 0.00
397_L 190_R 1.10 0.09 0.00
214_I 280_P 1.10 0.09 0.00
80_M 328_S 1.10 0.09 0.00
6_F 100_G 1.09 0.09 0.00
6_F 225_D 1.09 0.09 0.00
34_I 141_I 1.09 0.08 0.00
190_F 248_S 1.09 0.08 0.00
422_F 397_T 1.09 0.08 0.00
48_L 169_I 1.08 0.08 0.00
232_V 210_I 1.08 0.08 0.00
160_A 322_L 1.08 0.08 0.00
48_L 428_H 1.08 0.08 0.00
88_C 216_S 1.08 0.08 0.00
143_V 233_A 1.07 0.08 0.00
91_F 112_M 1.07 0.08 0.00
366_E 157_D 1.07 0.08 0.00
116_L 266_V 1.07 0.08 0.00
229_Y 407_R 1.07 0.08 0.00
52_V 284_A 1.07 0.08 0.00
148_I 214_V 1.07 0.08 0.00
37_A 391_V 1.07 0.08 0.00
286_K 252_P 1.07 0.08 0.00
72_I 118_Y 1.07 0.08 0.00
119_A 184_H 1.07 0.08 0.00
108_L 423_A 1.06 0.08 0.00
187_L 308_V 1.06 0.08 0.00
417_A 249_I 1.06 0.08 0.00
256_A 192_G 1.06 0.08 0.00
238_R 218_L 1.06 0.08 0.00
134_N 52_E 1.06 0.08 0.00
337_A 150_K 1.06 0.08 0.00
24_V 40_F 1.06 0.08 0.00
276_A 194_R 1.06 0.08 0.00
359_L 282_Y 1.06 0.08 0.00
60_W 54_L 1.06 0.08 0.00
308_P 348_G 1.05 0.08 0.00
134_N 43_G 1.05 0.08 0.00
44_D 288_D 1.05 0.08 0.00
31_Q 230_W 1.05 0.08 0.00
57_L 251_H 1.05 0.08 0.00
2_K 281_S 1.05 0.08 0.00
131_P 97_A 1.05 0.08 0.00
64_I 115_I 1.04 0.08 0.00
153_R 51_E 1.04 0.08 0.00
160_A 95_G 1.04 0.08 0.00
199_K 396_L 1.04 0.08 0.00
35_L 383_L 1.04 0.08 0.00
72_I 332_F 1.04 0.08 0.00
257_A 186_V 1.04 0.08 0.00
230_F 110_A 1.04 0.08 0.00
163_C 114_G 1.04 0.08 0.00
78_S 94_A 1.04 0.08 0.00
99_V 91_S 1.04 0.08 0.00
414_D 36_A 1.03 0.08 0.00
99_V 221_V 1.03 0.08 0.00
62_K 90_S 1.03 0.08 0.00
266_I 176_A 1.03 0.08 0.00
58_S 123_M 1.03 0.08 0.00
95_P 81_H 1.03 0.08 0.00
129_S 279_L 1.03 0.08 0.00
108_L 381_G 1.03 0.08 0.00
52_V 228_S 1.03 0.08 0.00
33_D 396_L 1.03 0.08 0.00
340_H 221_V 1.02 0.07 0.00
112_D 109_S 1.02 0.07 0.00
112_D 204_L 1.02 0.07 0.00
112_D 207_G 1.02 0.07 0.00
112_D 212_E 1.02 0.07 0.00
68_L 202_N 1.02 0.07 0.00
70_R 179_T 1.02 0.07 0.00
234_Y 80_I 1.02 0.07 0.00
192_D 222_M 1.02 0.07 0.00
18_T 286_V 1.02 0.07 0.00
177_A 214_V 1.02 0.07 0.00
148_I 320_A 1.02 0.07 0.00
45_V 361_G 1.02 0.07 0.00
170_R 403_I 1.01 0.07 0.00
293_T 257_L 1.01 0.07 0.00
10_T 78_V 1.01 0.07 0.00
152_L 222_M 1.01 0.07 0.00
108_L 106_A 1.01 0.07 0.00
108_L 258_L 1.01 0.07 0.00
139_L 43_G 1.01 0.07 0.00
408_R 268_P 1.01 0.07 0.00
431_D 273_V 1.01 0.07 0.00
35_L 154_F 1.01 0.07 0.00
141_A 173_R 1.01 0.07 0.00
189_R 279_L 1.01 0.07 0.00
173_I 249_I 1.00 0.07 0.00
252_I 157_D 1.00 0.07 0.00
291_A 233_A 1.00 0.07 0.00
78_S 143_L 1.00 0.07 0.00
248_P 102_S 1.00 0.07 0.00
240_V 395_D 1.00 0.07 0.00
47_A 306_P 1.00 0.07 0.00
53_F 405_V 1.00 0.07 0.00
339_R 246_L 1.00 0.07 0.00
126_L 160_E 0.99 0.07 0.00
424_D 404_P 0.99 0.07 0.00
122_E 52_E 0.99 0.07 0.00
338_M 182_G 0.99 0.07 0.00
110_G 284_A 0.99 0.07 0.00
373_A 107_T 0.99 0.07 0.00
422_F 248_S 0.99 0.07 0.00
336_R 393_V 0.99 0.07 0.00
365_Y 426_R 0.99 0.07 0.00
72_I 219_C 0.99 0.07 0.00
60_W 288_D 0.99 0.07 0.00
220_A 343_A 0.98 0.07 0.00
122_E 125_L 0.98 0.07 0.00
34_I 391_V 0.98 0.07 0.00
107_R 59_P 0.98 0.07 0.00
190_F 41_F 0.98 0.07 0.00
212_S 326_A 0.98 0.07 0.00
253_A 176_A 0.98 0.07 0.00
79_S 87_R 0.98 0.07 0.00
79_S 329_R 0.98 0.07 0.00
79_S 331_D 0.98 0.07 0.00
330_A 176_A 0.98 0.07 0.00
118_H 45_H 0.98 0.07 0.00
69_S 272_D 0.97 0.07 0.00
157_V 128_V 0.97 0.07 0.00
99_V 241_T 0.97 0.07 0.00
4_C 57_I 0.97 0.07 0.00
152_L 261_F 0.97 0.07 0.00
263_F 361_G 0.97 0.07 0.00
367_A 256_D 0.97 0.07 0.00
155_R 131_A 0.97 0.07 0.00
4_C 285_M 0.97 0.07 0.00
46_I 388_L 0.97 0.07 0.00
380_E 272_D 0.96 0.07 0.00
201_R 71_D 0.96 0.07 0.00
31_Q 387_G 0.96 0.07 0.00
164_Y 58_T 0.96 0.07 0.00
43_P 272_D 0.96 0.07 0.00
99_V 71_D 0.96 0.07 0.00
171_D 286_V 0.96 0.07 0.00
74_V 208_N 0.96 0.07 0.00
68_L 244_V 0.96 0.07 0.00
106_G 321_R 0.96 0.07 0.00
376_Q 221_V 0.96 0.07 0.00
197_D 401_M 0.96 0.07 0.00
133_V 87_R 0.96 0.07 0.00
133_V 329_R 0.96 0.07 0.00
133_V 331_D 0.96 0.07 0.00
197_D 52_E 0.95 0.07 0.00
115_A 165_G 0.95 0.07 0.00
72_I 122_T 0.95 0.07 0.00
335_E 134_D 0.95 0.07 0.00
397_L 192_G 0.95 0.07 0.00
130_E 277_L 0.95 0.07 0.00
160_A 318_V 0.95 0.07 0.00
272_G 245_D 0.95 0.07 0.00
34_I 287_Y 0.95 0.07 0.00
151_D 402_G 0.95 0.07 0.00
384_G 55_A 0.95 0.07 0.00
46_I 276_D 0.95 0.07 0.00
101_R 374_G 0.95 0.07 0.00
58_S 97_A 0.95 0.07 0.00
338_M 322_L 0.94 0.07 0.00
186_R 249_I 0.94 0.07 0.00
143_V 80_I 0.94 0.07 0.00
108_L 406_V 0.94 0.07 0.00
158_T 259_N 0.94 0.07 0.00
434_R 335_R 0.94 0.07 0.00
121_P 168_L 0.94 0.07 0.00
35_L 110_A 0.94 0.07 0.00
160_A 83_V 0.94 0.07 0.00
35_L 410_V 0.94 0.07 0.00
164_Y 194_R 0.94 0.07 0.00
300_C 123_M 0.94 0.07 0.00
162_R 373_E 0.94 0.07 0.00
359_L 375_D 0.94 0.07 0.00
338_M 110_A 0.94 0.07 0.00
431_D 93_L 0.94 0.07 0.00
93_M 106_A 0.94 0.07 0.00
168_R 106_A 0.94 0.07 0.00
254_L 186_V 0.94 0.07 0.00
131_P 80_I 0.94 0.07 0.00
256_A 387_G 0.94 0.07 0.00
290_E 159_P 0.94 0.07 0.00
371_E 101_F 0.94 0.07 0.00
169_T 240_P 0.94 0.07 0.00
151_D 373_E 0.94 0.07 0.00
86_A 213_A 0.94 0.07 0.00
121_P 244_V 0.94 0.07 0.00
228_H 420_F 0.94 0.07 0.00
367_A 386_V 0.94 0.07 0.00
332_L 82_T 0.94 0.07 0.00
52_V 382_L 0.94 0.07 0.00
143_V 243_R 0.94 0.07 0.00
145_A 56_R 0.94 0.07 0.00
71_G 312_R 0.93 0.07 0.00
433_V 300_Y 0.93 0.07 0.00
77_A 43_G 0.93 0.07 0.00
67_A 74_G 0.93 0.06 0.00
315_C 184_H 0.93 0.06 0.00
391_Q 222_M 0.93 0.06 0.00
432_L 285_M 0.93 0.06 0.00
435_T 365_A 0.93 0.06 0.00
146_G 136_P 0.93 0.06 0.00
139_L 82_T 0.93 0.06 0.00
396_E 90_S 0.93 0.06 0.00
17_R 200_G 0.93 0.06 0.00
43_P 388_L 0.93 0.06 0.00
221_P 82_T 0.93 0.06 0.00
355_V 266_V 0.93 0.06 0.00
120_G 143_L 0.93 0.06 0.00
315_C 118_Y 0.93 0.06 0.00
125_Y 94_A 0.93 0.06 0.00
25_Y 343_A 0.93 0.06 0.00
48_L 66_I 0.93 0.06 0.00
284_G 399_P 0.93 0.06 0.00
210_L 108_V 0.93 0.06 0.00
188_E 428_H 0.93 0.06 0.00
445_L 349_I 0.93 0.06 0.00
120_G 218_L 0.92 0.06 0.00
133_V 321_R 0.92 0.06 0.00
110_G 123_M 0.92 0.06 0.00
194_G 389_S 0.92 0.06 0.00
276_A 110_A 0.92 0.06 0.00
31_Q 101_F 0.92 0.06 0.00
131_P 182_G 0.92 0.06 0.00
153_R 61_L 0.92 0.06 0.00
309_E 360_D 0.92 0.06 0.00
32_A 216_S 0.92 0.06 0.00
53_F 282_Y 0.92 0.06 0.00
12_A 71_D 0.92 0.06 0.00
139_L 337_M 0.92 0.06 0.00
62_K 97_A 0.92 0.06 0.00
329_M 165_G 0.92 0.06 0.00
270_A 276_D 0.92 0.06 0.00
12_A 219_C 0.92 0.06 0.00
238_R 221_V 0.92 0.06 0.00
229_Y 326_A 0.92 0.06 0.00
198_Q 332_F 0.91 0.06 0.00
432_L 93_L 0.91 0.06 0.00
91_F 175_A 0.91 0.06 0.00
103_Y 193_P 0.91 0.06 0.00
147_A 104_V 0.91 0.06 0.00
25_Y 118_Y 0.91 0.06 0.00
138_S 185_S 0.91 0.06 0.00
208_N 365_A 0.91 0.06 0.00
327_A 263_A 0.91 0.06 0.00
64_I 302_S 0.91 0.06 0.00
311_L 201_T 0.91 0.06 0.00
394_T 343_A 0.91 0.06 0.00
45_V 306_P 0.91 0.06 0.00
43_P 383_L 0.91 0.06 0.00
72_I 61_L 0.91 0.06 0.00
96_I 386_V 0.91 0.06 0.00
335_E 286_V 0.91 0.06 0.00
270_A 375_D 0.91 0.06 0.00
332_L 222_M 0.91 0.06 0.00
318_N 77_R 0.91 0.06 0.00
253_A 163_T 0.91 0.06 0.00
31_Q 276_D 0.91 0.06 0.00
430_I 308_V 0.90 0.06 0.00
376_Q 71_D 0.90 0.06 0.00
118_H 328_S 0.90 0.06 0.00
308_P 221_V 0.90 0.06 0.00
314_W 404_P 0.90 0.06 0.00
31_Q 161_Y 0.90 0.06 0.00
228_H 199_A 0.90 0.06 0.00
94_I 45_H 0.90 0.06 0.00
103_Y 244_V 0.90 0.06 0.00
214_I 166_W 0.90 0.06 0.00
392_E 326_A 0.90 0.06 0.00
368_I 219_C 0.90 0.06 0.00
112_D 205_A 0.90 0.06 0.00
112_D 303_H 0.90 0.06 0.00
426_L 227_V 0.90 0.06 0.00
120_G 395_D 0.90 0.06 0.00
331_E 51_E 0.90 0.06 0.00
206_L 421_Y 0.90 0.06 0.00
216_P 247_T 0.90 0.06 0.00
137_A 271_F 0.90 0.06 0.00
24_V 200_G 0.90 0.06 0.00
16_A 209_H 0.90 0.06 0.00
56_S 161_Y 0.89 0.06 0.00
88_C 81_H 0.89 0.06 0.00
140_E 172_R 0.89 0.06 0.00
364_L 62_A 0.89 0.06 0.00
208_N 221_V 0.89 0.06 0.00
71_G 301_G 0.89 0.06 0.00
195_A 361_G 0.89 0.06 0.00
100_A 71_D 0.89 0.06 0.00
128_L 94_A 0.89 0.06 0.00
175_A 407_R 0.89 0.06 0.00
417_A 391_V 0.89 0.06 0.00
248_P 328_S 0.89 0.06 0.00
399_L 72_V 0.89 0.06 0.00
311_L 69_L 0.89 0.06 0.00
50_D 68_R 0.89 0.06 0.00
50_D 73_T 0.89 0.06 0.00
50_D 75_L 0.89 0.06 0.00
50_D 76_D 0.89 0.06 0.00
50_D 79_G 0.89 0.06 0.00
50_D 88_P 0.89 0.06 0.00
50_D 98_G 0.89 0.06 0.00
50_D 113_E 0.89 0.06 0.00
50_D 116_E 0.89 0.06 0.00
50_D 121_E 0.89 0.06 0.00
50_D 162_W 0.89 0.06 0.00
50_D 177_P 0.89 0.06 0.00
50_D 203_G 0.89 0.06 0.00
50_D 220_E 0.89 0.06 0.00
50_D 223_E 0.89 0.06 0.00
50_D 224_R 0.89 0.06 0.00
50_D 299_G 0.89 0.06 0.00
50_D 309_A 0.89 0.06 0.00
50_D 313_A 0.89 0.06 0.00
50_D 316_E 0.89 0.06 0.00
50_D 319_Q 0.89 0.06 0.00
50_D 327_G 0.89 0.06 0.00
51_G 68_R 0.89 0.06 0.00
51_G 73_T 0.89 0.06 0.00
51_G 75_L 0.89 0.06 0.00
51_G 76_D 0.89 0.06 0.00
51_G 79_G 0.89 0.06 0.00
51_G 88_P 0.89 0.06 0.00
51_G 98_G 0.89 0.06 0.00
51_G 113_E 0.89 0.06 0.00
51_G 116_E 0.89 0.06 0.00
51_G 121_E 0.89 0.06 0.00
51_G 162_W 0.89 0.06 0.00
51_G 177_P 0.89 0.06 0.00
51_G 203_G 0.89 0.06 0.00
51_G 220_E 0.89 0.06 0.00
51_G 223_E 0.89 0.06 0.00
51_G 224_R 0.89 0.06 0.00
51_G 299_G 0.89 0.06 0.00
51_G 309_A 0.89 0.06 0.00
51_G 313_A 0.89 0.06 0.00
51_G 316_E 0.89 0.06 0.00
51_G 319_Q 0.89 0.06 0.00
51_G 327_G 0.89 0.06 0.00
63_E 68_R 0.89 0.06 0.00
63_E 73_T 0.89 0.06 0.00
63_E 75_L 0.89 0.06 0.00
63_E 76_D 0.89 0.06 0.00
63_E 79_G 0.89 0.06 0.00
63_E 88_P 0.89 0.06 0.00
63_E 98_G 0.89 0.06 0.00
63_E 113_E 0.89 0.06 0.00
63_E 116_E 0.89 0.06 0.00
63_E 121_E 0.89 0.06 0.00
63_E 162_W 0.89 0.06 0.00
63_E 177_P 0.89 0.06 0.00
63_E 203_G 0.89 0.06 0.00
63_E 220_E 0.89 0.06 0.00
63_E 223_E 0.89 0.06 0.00
63_E 224_R 0.89 0.06 0.00
63_E 299_G 0.89 0.06 0.00
63_E 309_A 0.89 0.06 0.00
63_E 313_A 0.89 0.06 0.00
63_E 316_E 0.89 0.06 0.00
63_E 319_Q 0.89 0.06 0.00
63_E 327_G 0.89 0.06 0.00
76_G 68_R 0.89 0.06 0.00
76_G 73_T 0.89 0.06 0.00
76_G 75_L 0.89 0.06 0.00
76_G 76_D 0.89 0.06 0.00
76_G 79_G 0.89 0.06 0.00
76_G 88_P 0.89 0.06 0.00
76_G 98_G 0.89 0.06 0.00
76_G 113_E 0.89 0.06 0.00
76_G 116_E 0.89 0.06 0.00
76_G 121_E 0.89 0.06 0.00
76_G 162_W 0.89 0.06 0.00
76_G 177_P 0.89 0.06 0.00
76_G 203_G 0.89 0.06 0.00
76_G 220_E 0.89 0.06 0.00
76_G 223_E 0.89 0.06 0.00
76_G 224_R 0.89 0.06 0.00
76_G 299_G 0.89 0.06 0.00
76_G 309_A 0.89 0.06 0.00
76_G 313_A 0.89 0.06 0.00
76_G 316_E 0.89 0.06 0.00
76_G 319_Q 0.89 0.06 0.00
76_G 327_G 0.89 0.06 0.00
81_G 68_R 0.89 0.06 0.00
81_G 73_T 0.89 0.06 0.00
81_G 75_L 0.89 0.06 0.00
81_G 76_D 0.89 0.06 0.00
81_G 79_G 0.89 0.06 0.00
81_G 88_P 0.89 0.06 0.00
81_G 98_G 0.89 0.06 0.00
81_G 113_E 0.89 0.06 0.00
81_G 116_E 0.89 0.06 0.00
81_G 121_E 0.89 0.06 0.00
81_G 162_W 0.89 0.06 0.00
81_G 177_P 0.89 0.06 0.00
81_G 203_G 0.89 0.06 0.00
81_G 220_E 0.89 0.06 0.00
81_G 223_E 0.89 0.06 0.00
81_G 224_R 0.89 0.06 0.00
81_G 299_G 0.89 0.06 0.00
81_G 309_A 0.89 0.06 0.00
81_G 313_A 0.89 0.06 0.00
81_G 316_E 0.89 0.06 0.00
81_G 319_Q 0.89 0.06 0.00
81_G 327_G 0.89 0.06 0.00
82_A 68_R 0.89 0.06 0.00
82_A 73_T 0.89 0.06 0.00
82_A 75_L 0.89 0.06 0.00
82_A 76_D 0.89 0.06 0.00
82_A 79_G 0.89 0.06 0.00
82_A 88_P 0.89 0.06 0.00
82_A 98_G 0.89 0.06 0.00
82_A 113_E 0.89 0.06 0.00
82_A 116_E 0.89 0.06 0.00
82_A 121_E 0.89 0.06 0.00
82_A 162_W 0.89 0.06 0.00
82_A 177_P 0.89 0.06 0.00
82_A 203_G 0.89 0.06 0.00
82_A 220_E 0.89 0.06 0.00
82_A 223_E 0.89 0.06 0.00
82_A 224_R 0.89 0.06 0.00
82_A 299_G 0.89 0.06 0.00
82_A 309_A 0.89 0.06 0.00
82_A 313_A 0.89 0.06 0.00
82_A 316_E 0.89 0.06 0.00
82_A 319_Q 0.89 0.06 0.00
82_A 327_G 0.89 0.06 0.00
83_L 68_R 0.89 0.06 0.00
83_L 73_T 0.89 0.06 0.00
83_L 75_L 0.89 0.06 0.00
83_L 76_D 0.89 0.06 0.00
83_L 79_G 0.89 0.06 0.00
83_L 88_P 0.89 0.06 0.00
83_L 98_G 0.89 0.06 0.00
83_L 113_E 0.89 0.06 0.00
83_L 116_E 0.89 0.06 0.00
83_L 121_E 0.89 0.06 0.00
83_L 162_W 0.89 0.06 0.00
83_L 177_P 0.89 0.06 0.00
83_L 203_G 0.89 0.06 0.00
83_L 220_E 0.89 0.06 0.00
83_L 223_E 0.89 0.06 0.00
83_L 224_R 0.89 0.06 0.00
83_L 299_G 0.89 0.06 0.00
83_L 309_A 0.89 0.06 0.00
83_L 313_A 0.89 0.06 0.00
83_L 316_E 0.89 0.06 0.00
83_L 319_Q 0.89 0.06 0.00
83_L 327_G 0.89 0.06 0.00
84_R 68_R 0.89 0.06 0.00
84_R 73_T 0.89 0.06 0.00
84_R 75_L 0.89 0.06 0.00
84_R 76_D 0.89 0.06 0.00
84_R 79_G 0.89 0.06 0.00
84_R 88_P 0.89 0.06 0.00
84_R 98_G 0.89 0.06 0.00
84_R 113_E 0.89 0.06 0.00
84_R 116_E 0.89 0.06 0.00
84_R 121_E 0.89 0.06 0.00
84_R 162_W 0.89 0.06 0.00
84_R 177_P 0.89 0.06 0.00
84_R 203_G 0.89 0.06 0.00
84_R 220_E 0.89 0.06 0.00
84_R 223_E 0.89 0.06 0.00
84_R 224_R 0.89 0.06 0.00
84_R 299_G 0.89 0.06 0.00
84_R 309_A 0.89 0.06 0.00
84_R 313_A 0.89 0.06 0.00
84_R 316_E 0.89 0.06 0.00
84_R 319_Q 0.89 0.06 0.00
84_R 327_G 0.89 0.06 0.00
92_G 68_R 0.89 0.06 0.00
92_G 73_T 0.89 0.06 0.00
92_G 75_L 0.89 0.06 0.00
92_G 76_D 0.89 0.06 0.00
92_G 79_G 0.89 0.06 0.00
92_G 88_P 0.89 0.06 0.00
92_G 98_G 0.89 0.06 0.00
92_G 113_E 0.89 0.06 0.00
92_G 116_E 0.89 0.06 0.00
92_G 121_E 0.89 0.06 0.00
92_G 162_W 0.89 0.06 0.00
92_G 177_P 0.89 0.06 0.00
92_G 203_G 0.89 0.06 0.00
92_G 220_E 0.89 0.06 0.00
92_G 223_E 0.89 0.06 0.00
92_G 224_R 0.89 0.06 0.00
92_G 299_G 0.89 0.06 0.00
92_G 309_A 0.89 0.06 0.00
92_G 313_A 0.89 0.06 0.00
92_G 316_E 0.89 0.06 0.00
92_G 319_Q 0.89 0.06 0.00
92_G 327_G 0.89 0.06 0.00
97_G 68_R 0.89 0.06 0.00
97_G 73_T 0.89 0.06 0.00
97_G 75_L 0.89 0.06 0.00
97_G 76_D 0.89 0.06 0.00
97_G 79_G 0.89 0.06 0.00
97_G 88_P 0.89 0.06 0.00
97_G 98_G 0.89 0.06 0.00
97_G 113_E 0.89 0.06 0.00
97_G 116_E 0.89 0.06 0.00
97_G 121_E 0.89 0.06 0.00
97_G 162_W 0.89 0.06 0.00
97_G 177_P 0.89 0.06 0.00
97_G 203_G 0.89 0.06 0.00
97_G 220_E 0.89 0.06 0.00
97_G 223_E 0.89 0.06 0.00
97_G 224_R 0.89 0.06 0.00
97_G 299_G 0.89 0.06 0.00
97_G 309_A 0.89 0.06 0.00
97_G 313_A 0.89 0.06 0.00
97_G 316_E 0.89 0.06 0.00
97_G 319_Q 0.89 0.06 0.00
97_G 327_G 0.89 0.06 0.00
111_D 68_R 0.89 0.06 0.00
111_D 73_T 0.89 0.06 0.00
111_D 75_L 0.89 0.06 0.00
111_D 76_D 0.89 0.06 0.00
111_D 79_G 0.89 0.06 0.00
111_D 88_P 0.89 0.06 0.00
111_D 98_G 0.89 0.06 0.00
111_D 113_E 0.89 0.06 0.00
111_D 116_E 0.89 0.06 0.00
111_D 121_E 0.89 0.06 0.00
111_D 162_W 0.89 0.06 0.00
111_D 177_P 0.89 0.06 0.00
111_D 203_G 0.89 0.06 0.00
111_D 220_E 0.89 0.06 0.00
111_D 223_E 0.89 0.06 0.00
111_D 224_R 0.89 0.06 0.00
111_D 299_G 0.89 0.06 0.00
111_D 309_A 0.89 0.06 0.00
111_D 313_A 0.89 0.06 0.00
111_D 316_E 0.89 0.06 0.00
111_D 319_Q 0.89 0.06 0.00
111_D 327_G 0.89 0.06 0.00
203_A 68_R 0.89 0.06 0.00
203_A 73_T 0.89 0.06 0.00
203_A 75_L 0.89 0.06 0.00
203_A 76_D 0.89 0.06 0.00
203_A 79_G 0.89 0.06 0.00
203_A 88_P 0.89 0.06 0.00
203_A 98_G 0.89 0.06 0.00
203_A 113_E 0.89 0.06 0.00
203_A 116_E 0.89 0.06 0.00
203_A 121_E 0.89 0.06 0.00
203_A 162_W 0.89 0.06 0.00
203_A 177_P 0.89 0.06 0.00
203_A 203_G 0.89 0.06 0.00
203_A 220_E 0.89 0.06 0.00
203_A 223_E 0.89 0.06 0.00
203_A 224_R 0.89 0.06 0.00
203_A 299_G 0.89 0.06 0.00
203_A 309_A 0.89 0.06 0.00
203_A 313_A 0.89 0.06 0.00
203_A 316_E 0.89 0.06 0.00
203_A 319_Q 0.89 0.06 0.00
203_A 327_G 0.89 0.06 0.00
71_G 325_I 0.89 0.06 0.00
99_V 138_D 0.89 0.06 0.00
160_A 227_V 0.89 0.06 0.00
255_H 383_L 0.89 0.06 0.00
120_G 330_D 0.89 0.06 0.00
232_V 379_L 0.89 0.06 0.00
268_N 337_M 0.89 0.06 0.00
143_V 393_V 0.89 0.06 0.00
102_Q 47_T 0.89 0.06 0.00
130_E 184_H 0.88 0.06 0.00
416_W 266_V 0.88 0.06 0.00
318_N 141_I 0.88 0.06 0.00
93_M 67_T 0.88 0.06 0.00
168_R 67_T 0.88 0.06 0.00
424_D 72_V 0.88 0.06 0.00
12_A 378_V 0.88 0.06 0.00
100_A 114_G 0.88 0.06 0.00
428_L 326_A 0.88 0.06 0.00
173_I 295_G 0.88 0.06 0.00
138_S 197_Y 0.88 0.06 0.00
204_E 350_A 0.88 0.06 0.00
112_D 312_R 0.88 0.06 0.00
46_I 105_A 0.88 0.06 0.00
256_A 95_G 0.88 0.06 0.00
188_E 259_N 0.88 0.06 0.00
46_I 167_D 0.88 0.06 0.00
123_D 114_G 0.88 0.06 0.00
211_A 55_A 0.88 0.06 0.00
68_L 49_T 0.88 0.06 0.00
132_L 218_L 0.88 0.06 0.00
78_S 248_S 0.88 0.06 0.00
177_A 326_A 0.88 0.06 0.00
197_D 308_V 0.88 0.06 0.00
155_R 128_V 0.88 0.06 0.00
367_A 49_T 0.88 0.06 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Page generated in 0.0715 seconds.