May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
DK
Genes: A B A+B
Length: 492 523 936
Sequences: 1512 1524 242
Seq/Len: 3.07 2.91 0.26
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.92
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show Jackhmmer results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.35 0.36 0.21
2 0.46 0.43 0.23
5 0.48 0.46 0.24
10 0.48 0.46 0.24
20 0.49 0.47 0.24
100 0.50 0.48 0.24
∞ 0.51 0.48 0.24
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
247_L 266_D 1.69 0.50 0.00
383_H 161_D 1.64 0.47 0.00
436_I 182_P 1.59 0.43 0.00
63_A 189_F 1.52 0.39 0.00
370_L 161_D 1.50 0.38 0.00
273_V 226_I 1.47 0.36 0.00
243_E 350_R 1.41 0.33 0.00
87_G 382_F 1.41 0.32 0.00
453_F 511_G 1.38 0.31 0.00
180_P 109_E 1.35 0.29 0.00
81_I 380_V 1.34 0.29 0.00
173_E 310_K 1.34 0.29 0.00
467_L 369_L 1.34 0.29 0.00
223_V 167_N 1.33 0.28 0.00
294_W 161_D 1.32 0.28 0.00
81_I 291_V 1.31 0.27 0.00
175_S 366_R 1.30 0.27 0.00
201_A 291_V 1.30 0.27 0.00
383_H 209_T 1.28 0.26 0.00
350_R 306_E 1.28 0.26 0.00
257_G 369_L 1.28 0.26 0.00
79_I 366_R 1.28 0.26 0.00
76_K 340_I 1.27 0.25 0.00
82_S 108_R 1.25 0.24 0.00
198_A 81_G 1.25 0.24 0.00
257_G 310_K 1.25 0.24 0.00
81_I 226_I 1.25 0.24 0.00
261_E 189_F 1.24 0.24 0.00
322_K 342_A 1.24 0.24 0.00
85_P 72_P 1.23 0.23 0.00
130_K 127_G 1.22 0.23 0.00
134_L 62_L 1.20 0.22 0.00
147_G 161_D 1.19 0.22 0.00
150_V 382_F 1.19 0.22 0.00
468_N 293_L 1.19 0.21 0.00
331_Y 161_D 1.19 0.21 0.00
275_C 471_F 1.19 0.21 0.00
247_L 292_L 1.18 0.21 0.00
190_S 192_S 1.17 0.21 0.00
75_I 387_G 1.17 0.21 0.00
305_T 452_Q 1.17 0.21 0.00
467_L 325_T 1.17 0.21 0.00
127_G 420_T 1.17 0.21 0.00
223_V 181_V 1.16 0.20 0.00
329_A 240_I 1.16 0.20 0.00
147_G 224_I 1.16 0.20 0.00
92_S 188_S 1.16 0.20 0.00
225_I 332_V 1.15 0.20 0.00
383_H 302_K 1.15 0.20 0.00
295_M 386_L 1.15 0.20 0.00
350_R 366_R 1.15 0.20 0.00
286_M 58_Q 1.14 0.19 0.00
329_A 249_V 1.14 0.19 0.00
346_L 244_L 1.13 0.19 0.00
252_Q 147_I 1.13 0.19 0.00
70_V 116_D 1.12 0.19 0.00
208_G 106_H 1.12 0.19 0.00
179_V 146_M 1.12 0.19 0.00
242_L 366_R 1.12 0.18 0.00
286_M 203_G 1.12 0.18 0.00
454_D 169_S 1.11 0.18 0.00
75_I 386_L 1.11 0.18 0.00
448_G 372_D 1.11 0.18 0.00
120_E 486_G 1.11 0.18 0.00
207_L 82_F 1.11 0.18 0.00
295_M 189_F 1.11 0.18 0.00
415_R 242_R 1.10 0.18 0.00
288_E 342_A 1.10 0.18 0.00
119_Q 166_I 1.10 0.18 0.00
207_L 383_L 1.09 0.18 0.00
178_I 275_G 1.09 0.18 0.00
333_P 473_I 1.09 0.17 0.00
153_E 348_R 1.08 0.17 0.00
273_V 281_M 1.08 0.17 0.00
363_V 97_A 1.08 0.17 0.00
159_I 321_G 1.07 0.17 0.00
146_K 277_T 1.07 0.17 0.00
169_V 410_L 1.07 0.17 0.00
471_C 224_I 1.07 0.17 0.00
178_I 242_R 1.06 0.17 0.00
326_E 288_L 1.06 0.16 0.00
386_D 161_D 1.06 0.16 0.00
203_R 329_L 1.06 0.16 0.00
467_L 452_Q 1.06 0.16 0.00
287_E 161_D 1.06 0.16 0.00
364_I 253_L 1.06 0.16 0.00
299_F 161_D 1.05 0.16 0.00
158_L 321_G 1.05 0.16 0.00
147_G 151_T 1.05 0.16 0.00
150_V 201_F 1.05 0.16 0.00
92_S 191_G 1.05 0.16 0.00
242_L 228_P 1.05 0.16 0.00
278_S 81_G 1.05 0.16 0.00
286_M 277_T 1.04 0.16 0.00
281_Y 347_E 1.04 0.16 0.00
437_P 286_N 1.04 0.16 0.00
350_R 334_E 1.04 0.16 0.00
372_M 371_G 1.04 0.16 0.00
370_L 510_R 1.04 0.16 0.00
226_I 116_D 1.04 0.16 0.00
347_E 380_V 1.03 0.15 0.00
172_A 306_E 1.03 0.15 0.00
265_T 354_M 1.03 0.15 0.00
420_L 242_R 1.03 0.15 0.00
453_F 191_G 1.03 0.15 0.00
370_L 240_I 1.03 0.15 0.00
388_D 285_P 1.02 0.15 0.00
339_V 391_V 1.02 0.15 0.00
178_I 280_E 1.02 0.15 0.00
420_L 325_T 1.02 0.15 0.00
138_V 205_A 1.02 0.15 0.00
278_S 135_L 1.02 0.15 0.00
374_V 188_S 1.01 0.15 0.00
223_V 207_Y 1.01 0.15 0.00
142_F 372_D 1.01 0.15 0.00
270_L 124_V 1.01 0.15 0.00
63_A 304_F 1.01 0.15 0.00
373_E 436_T 1.01 0.15 0.00
347_E 240_I 1.01 0.15 0.00
244_E 328_F 1.01 0.15 0.00
185_G 94_G 1.01 0.15 0.00
343_R 163_N 1.00 0.14 0.00
227_G 110_P 1.00 0.14 0.00
247_L 85_T 1.00 0.14 0.00
247_L 133_D 1.00 0.14 0.00
336_E 198_D 1.00 0.14 0.00
290_Y 224_I 1.00 0.14 0.00
327_V 483_T 1.00 0.14 0.00
118_F 291_V 1.00 0.14 0.00
329_A 344_L 1.00 0.14 0.00
118_F 203_G 1.00 0.14 0.00
119_Q 258_E 0.99 0.14 0.00
387_Y 151_T 0.99 0.14 0.00
331_Y 302_K 0.99 0.14 0.00
119_Q 134_G 0.99 0.14 0.00
124_V 203_G 0.99 0.14 0.00
344_P 411_A 0.99 0.14 0.00
350_R 205_A 0.99 0.14 0.00
215_T 395_C 0.99 0.14 0.00
201_A 181_V 0.99 0.14 0.00
255_G 91_G 0.99 0.14 0.00
386_D 302_K 0.99 0.14 0.00
369_D 69_A 0.99 0.14 0.00
178_I 274_G 0.98 0.14 0.00
316_F 493_I 0.98 0.14 0.00
58_T 226_I 0.98 0.14 0.00
150_V 219_G 0.98 0.14 0.00
420_L 385_E 0.98 0.14 0.00
387_Y 161_D 0.98 0.14 0.00
190_S 92_S 0.98 0.14 0.00
339_V 243_M 0.98 0.14 0.00
457_A 267_G 0.98 0.14 0.00
308_S 325_T 0.98 0.14 0.00
173_E 342_A 0.98 0.14 0.00
239_R 237_F 0.97 0.14 0.00
66_G 225_N 0.97 0.14 0.00
84_G 434_V 0.97 0.14 0.00
227_G 465_P 0.97 0.13 0.00
82_S 275_G 0.97 0.13 0.00
262_I 207_Y 0.97 0.13 0.00
316_F 440_D 0.97 0.13 0.00
160_G 186_T 0.97 0.13 0.00
438_F 77_L 0.97 0.13 0.00
225_I 494_L 0.97 0.13 0.00
40_T 378_G 0.97 0.13 0.00
177_T 261_L 0.96 0.13 0.00
188_G 91_G 0.96 0.13 0.00
231_I 93_Q 0.96 0.13 0.00
179_V 287_A 0.96 0.13 0.00
289_K 64_V 0.96 0.13 0.00
255_G 353_D 0.96 0.13 0.00
242_L 378_G 0.96 0.13 0.00
299_F 285_P 0.96 0.13 0.00
307_E 329_L 0.96 0.13 0.00
432_Q 70_C 0.96 0.13 0.00
127_G 379_L 0.96 0.13 0.00
204_D 287_A 0.96 0.13 0.00
293_P 87_P 0.96 0.13 0.00
299_F 143_K 0.96 0.13 0.00
114_F 259_E 0.96 0.13 0.00
163_I 146_M 0.96 0.13 0.00
343_R 136_Q 0.96 0.13 0.00
465_M 92_S 0.96 0.13 0.00
420_L 420_T 0.95 0.13 0.00
331_Y 515_T 0.95 0.13 0.00
241_L 112_S 0.95 0.13 0.00
206_V 97_A 0.95 0.13 0.00
158_L 109_E 0.95 0.13 0.00
350_R 405_A 0.95 0.13 0.00
233_G 341_P 0.95 0.13 0.00
370_L 302_K 0.95 0.13 0.00
322_K 408_A 0.95 0.13 0.00
179_V 317_N 0.94 0.13 0.00
436_I 136_Q 0.94 0.13 0.00
371_G 426_D 0.94 0.13 0.00
453_F 188_S 0.94 0.13 0.00
127_G 131_M 0.94 0.13 0.00
137_E 131_M 0.94 0.13 0.00
343_R 405_A 0.94 0.13 0.00
294_W 302_K 0.94 0.13 0.00
260_S 291_V 0.94 0.12 0.00
233_G 106_H 0.94 0.12 0.00
392_K 103_F 0.94 0.12 0.00
178_I 409_I 0.94 0.12 0.00
352_M 249_V 0.94 0.12 0.00
327_V 400_K 0.94 0.12 0.00
240_I 181_V 0.93 0.12 0.00
292_I 366_R 0.93 0.12 0.00
405_T 146_M 0.93 0.12 0.00
372_M 379_L 0.93 0.12 0.00
244_E 420_T 0.93 0.12 0.00
338_V 497_L 0.93 0.12 0.00
243_E 291_V 0.93 0.12 0.00
375_V 182_P 0.93 0.12 0.00
200_D 161_D 0.93 0.12 0.00
287_E 190_V 0.93 0.12 0.00
330_K 427_L 0.93 0.12 0.00
412_F 145_D 0.93 0.12 0.00
242_L 452_Q 0.93 0.12 0.00
290_Y 383_L 0.93 0.12 0.00
375_V 310_K 0.93 0.12 0.00
281_Y 125_F 0.93 0.12 0.00
398_T 108_R 0.93 0.12 0.00
211_D 291_V 0.92 0.12 0.00
169_V 146_M 0.92 0.12 0.00
420_L 84_K 0.92 0.12 0.00
176_K 444_G 0.92 0.12 0.00
396_D 328_F 0.92 0.12 0.00
353_L 182_P 0.92 0.12 0.00
342_Y 291_V 0.92 0.12 0.00
75_I 437_D 0.92 0.12 0.00
328_I 340_I 0.92 0.12 0.00
242_L 237_F 0.92 0.12 0.00
321_Q 167_N 0.92 0.12 0.00
370_L 168_N 0.92 0.12 0.00
418_P 329_L 0.92 0.12 0.00
347_E 253_L 0.92 0.12 0.00
396_D 212_S 0.91 0.12 0.00
70_V 93_Q 0.91 0.12 0.00
314_A 464_V 0.91 0.12 0.00
434_M 186_T 0.91 0.12 0.00
33_A 227_V 0.91 0.12 0.00
364_I 308_T 0.91 0.12 0.00
372_M 208_F 0.91 0.12 0.00
287_E 203_G 0.91 0.12 0.00
122_D 148_A 0.91 0.12 0.00
223_V 421_V 0.91 0.12 0.00
353_L 62_L 0.91 0.12 0.00
236_W 262_D 0.91 0.12 0.00
234_D 247_M 0.91 0.12 0.00
175_S 216_K 0.91 0.12 0.00
260_S 424_G 0.91 0.12 0.00
369_D 323_D 0.91 0.12 0.00
10_E 64_V 0.91 0.12 0.00
313_A 75_A 0.91 0.12 0.00
367_Y 146_M 0.90 0.12 0.00
367_Y 356_T 0.90 0.12 0.00
334_E 325_T 0.90 0.12 0.00
14_Q 249_V 0.90 0.12 0.00
81_I 372_D 0.90 0.12 0.00
349_K 336_S 0.90 0.12 0.00
326_E 250_G 0.90 0.12 0.00
229_Y 187_P 0.90 0.11 0.00
165_S 366_R 0.90 0.11 0.00
91_Y 298_L 0.90 0.11 0.00
87_G 61_A 0.90 0.11 0.00
168_K 342_A 0.90 0.11 0.00
316_F 161_D 0.90 0.11 0.00
350_R 64_V 0.90 0.11 0.00
168_K 81_G 0.90 0.11 0.00
259_I 406_V 0.90 0.11 0.00
482_S 253_L 0.90 0.11 0.00
37_P 243_M 0.90 0.11 0.00
130_K 320_M 0.90 0.11 0.00
221_Y 303_K 0.89 0.11 0.00
435_G 193_H 0.89 0.11 0.00
323_K 335_I 0.89 0.11 0.00
460_A 488_E 0.89 0.11 0.00
249_C 366_R 0.89 0.11 0.00
120_E 347_E 0.89 0.11 0.00
370_L 292_L 0.89 0.11 0.00
201_A 246_E 0.89 0.11 0.00
299_F 144_P 0.89 0.11 0.00
342_Y 262_D 0.89 0.11 0.00
200_D 131_M 0.89 0.11 0.00
279_M 344_L 0.89 0.11 0.00
87_G 70_C 0.89 0.11 0.00
158_L 373_P 0.89 0.11 0.00
59_I 112_S 0.89 0.11 0.00
386_D 292_L 0.89 0.11 0.00
309_L 426_D 0.89 0.11 0.00
74_P 487_Y 0.88 0.11 0.00
159_I 160_D 0.88 0.11 0.00
239_R 358_S 0.88 0.11 0.00
94_A 235_G 0.88 0.11 0.00
397_S 204_I 0.88 0.11 0.00
268_V 85_T 0.88 0.11 0.00
260_S 493_I 0.88 0.11 0.00
160_G 159_G 0.88 0.11 0.00
244_E 182_P 0.88 0.11 0.00
292_I 241_K 0.88 0.11 0.00
293_P 191_G 0.88 0.11 0.00
302_P 111_V 0.88 0.11 0.00
326_E 210_L 0.88 0.11 0.00
369_D 103_F 0.88 0.11 0.00
321_Q 195_T 0.88 0.11 0.00
162_D 248_G 0.88 0.11 0.00
340_A 145_D 0.88 0.11 0.00
284_R 310_K 0.88 0.11 0.00
144_L 145_D 0.88 0.11 0.00
396_D 464_V 0.88 0.11 0.00
222_D 109_E 0.88 0.11 0.00
55_G 353_D 0.88 0.11 0.00
173_E 309_W 0.88 0.11 0.00
378_G 225_N 0.88 0.11 0.00
227_G 156_E 0.88 0.11 0.00
436_I 258_E 0.87 0.11 0.00
242_L 411_A 0.87 0.11 0.00
239_R 189_F 0.87 0.11 0.00
244_E 515_T 0.87 0.11 0.00
106_V 270_R 0.87 0.11 0.00
258_S 208_F 0.87 0.11 0.00
372_M 225_N 0.87 0.11 0.00
300_F 395_C 0.87 0.11 0.00
127_G 442_M 0.87 0.11 0.00
459_F 98_Y 0.87 0.11 0.00
171_G 145_D 0.87 0.11 0.00
391_M 366_R 0.87 0.11 0.00
453_F 112_S 0.87 0.11 0.00
262_I 277_T 0.87 0.11 0.00
124_V 389_E 0.87 0.11 0.00
262_I 488_E 0.87 0.11 0.00
278_S 117_S 0.87 0.11 0.00
356_G 186_T 0.87 0.11 0.00
242_L 284_A 0.87 0.11 0.00
460_A 123_A 0.87 0.11 0.00
417_K 380_V 0.87 0.11 0.00
138_V 312_E 0.87 0.11 0.00
454_D 209_T 0.87 0.11 0.00
233_G 326_D 0.86 0.11 0.00
58_T 344_L 0.86 0.11 0.00
188_G 326_D 0.86 0.11 0.00
190_S 372_D 0.86 0.10 0.00
446_Y 434_V 0.86 0.10 0.00
221_Y 107_F 0.86 0.10 0.00
119_Q 151_T 0.86 0.10 0.00
252_Q 376_V 0.86 0.10 0.00
354_Y 147_I 0.86 0.10 0.00
467_L 483_T 0.86 0.10 0.00
353_L 424_G 0.86 0.10 0.00
305_T 372_D 0.86 0.10 0.00
357_G 274_G 0.86 0.10 0.00
222_D 133_D 0.86 0.10 0.00
178_I 111_V 0.86 0.10 0.00
122_D 424_G 0.86 0.10 0.00
44_K 189_F 0.86 0.10 0.00
119_Q 369_L 0.86 0.10 0.00
347_E 416_G 0.86 0.10 0.00
212_E 98_Y 0.86 0.10 0.00
319_S 493_I 0.86 0.10 0.00
466_T 261_L 0.86 0.10 0.00
383_H 119_T 0.86 0.10 0.00
357_G 353_D 0.86 0.10 0.00
186_F 117_S 0.86 0.10 0.00
163_I 186_T 0.86 0.10 0.00
292_I 378_G 0.86 0.10 0.00
178_I 502_L 0.85 0.10 0.00
220_P 350_R 0.85 0.10 0.00
179_V 334_E 0.85 0.10 0.00
255_G 106_H 0.85 0.10 0.00
151_Q 478_H 0.85 0.10 0.00
321_Q 162_L 0.85 0.10 0.00
130_K 120_E 0.85 0.10 0.00
207_L 436_T 0.85 0.10 0.00
471_C 474_F 0.85 0.10 0.00
107_N 444_G 0.85 0.10 0.00
421_I 515_T 0.85 0.10 0.00
124_V 272_Y 0.85 0.10 0.00
463_M 449_K 0.85 0.10 0.00
369_D 306_E 0.85 0.10 0.00
273_V 72_P 0.85 0.10 0.00
119_Q 183_F 0.85 0.10 0.00
435_G 319_P 0.85 0.10 0.00
169_V 306_E 0.85 0.10 0.00
340_A 342_A 0.85 0.10 0.00
309_L 83_E 0.85 0.10 0.00
386_D 81_G 0.85 0.10 0.00
383_H 292_L 0.85 0.10 0.00
385_D 216_K 0.85 0.10 0.00
290_Y 496_T 0.84 0.10 0.00
118_F 134_G 0.84 0.10 0.00
415_R 442_M 0.84 0.10 0.00
87_G 120_E 0.84 0.10 0.00
270_L 281_M 0.84 0.10 0.00
378_G 110_P 0.84 0.10 0.00
349_K 217_V 0.84 0.10 0.00
242_L 269_F 0.84 0.10 0.00
240_I 452_Q 0.84 0.10 0.00
179_V 387_G 0.84 0.10 0.00
431_F 369_L 0.84 0.10 0.00
281_Y 70_C 0.84 0.10 0.00
314_A 241_K 0.84 0.10 0.00
294_W 164_A 0.84 0.10 0.00
448_G 434_V 0.84 0.10 0.00
94_A 469_I 0.84 0.10 0.00
47_I 240_I 0.84 0.10 0.00
408_E 436_T 0.84 0.10 0.00
107_N 166_I 0.84 0.10 0.00
364_I 380_V 0.84 0.10 0.00
111_T 477_H 0.84 0.10 0.00
218_S 173_G 0.84 0.10 0.00
442_H 186_T 0.84 0.10 0.00
342_Y 314_P 0.84 0.10 0.00
354_Y 161_D 0.84 0.10 0.00
120_E 161_D 0.84 0.10 0.00
234_D 246_E 0.84 0.10 0.00
96_R 68_K 0.84 0.10 0.00
453_F 253_L 0.83 0.10 0.00
347_E 203_G 0.83 0.10 0.00
117_D 468_R 0.83 0.10 0.00
173_E 311_H 0.83 0.10 0.00
472_W 130_N 0.83 0.10 0.00
122_D 182_P 0.83 0.10 0.00
52_S 325_T 0.83 0.10 0.00
312_I 443_I 0.83 0.10 0.00
322_K 218_V 0.83 0.10 0.00
334_E 244_L 0.83 0.10 0.00
354_Y 104_N 0.83 0.10 0.00
184_E 153_C 0.83 0.10 0.00
117_D 475_D 0.83 0.10 0.00
458_I 113_C 0.83 0.10 0.00
353_L 452_Q 0.83 0.10 0.00
299_F 110_P 0.83 0.10 0.00
338_V 277_T 0.83 0.10 0.00
446_Y 236_N 0.83 0.10 0.00
35_N 328_F 0.83 0.10 0.00
168_K 161_D 0.83 0.10 0.00
39_V 205_A 0.83 0.10 0.00
29_N 146_M 0.83 0.10 0.00
417_K 366_R 0.83 0.10 0.00
436_I 291_V 0.83 0.10 0.00
71_V 188_S 0.83 0.10 0.00
43_K 490_A 0.83 0.10 0.00
356_G 471_F 0.83 0.10 0.00
85_P 160_D 0.83 0.10 0.00
92_S 149_V 0.83 0.10 0.00
283_S 227_V 0.83 0.10 0.00
372_M 391_V 0.83 0.10 0.00
225_I 326_D 0.83 0.10 0.00
188_G 348_R 0.82 0.10 0.00
292_I 143_K 0.82 0.10 0.00
241_L 134_G 0.82 0.10 0.00
257_G 164_A 0.82 0.10 0.00
327_V 377_M 0.82 0.10 0.00
247_L 134_G 0.82 0.10 0.00
211_D 329_L 0.82 0.10 0.00
123_I 179_F 0.82 0.10 0.00
287_E 314_P 0.82 0.10 0.00
93_R 78_C 0.82 0.10 0.00
300_F 188_S 0.82 0.10 0.00
80_H 262_D 0.82 0.10 0.00
223_V 477_H 0.82 0.10 0.00
256_D 262_D 0.82 0.10 0.00
294_W 209_T 0.82 0.10 0.00
178_I 243_M 0.82 0.10 0.00
257_G 262_D 0.82 0.10 0.00
243_E 170_K 0.82 0.10 0.00
445_D 93_Q 0.82 0.10 0.00
403_D 490_A 0.82 0.10 0.00
149_S 387_G 0.82 0.10 0.00
347_E 306_E 0.82 0.10 0.00
80_H 355_M 0.82 0.10 0.00
197_I 291_V 0.82 0.10 0.00
327_V 151_T 0.82 0.10 0.00
228_D 344_L 0.82 0.10 0.00
222_D 279_E 0.82 0.10 0.00
120_E 313_V 0.82 0.10 0.00
425_I 426_D 0.82 0.10 0.00
148_I 446_S 0.82 0.10 0.00
223_V 440_D 0.82 0.10 0.00
262_I 262_D 0.82 0.10 0.00
275_C 159_G 0.82 0.09 0.00
64_Y 499_N 0.82 0.09 0.00
134_L 167_N 0.82 0.09 0.00
120_E 359_H 0.82 0.09 0.00
150_V 136_Q 0.82 0.09 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
WARNING: The input alignment may be corrupted!
  • For sequence A, there is a high ratio (0.49 > 0.4) of paralogs.
  • For sequence B, there is a high ratio (0.47 > 0.4) of paralogs.
ID Seq/Len Name Options I_Prob Status
4432 0.26 DK Δgene:(1, 20) A:(1E-04, 2) B:(1E-04, 2) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done - Shared
4431 0.5 DK Δgene:(1, 20) A:(1E-10, 1) B:(1E-10, 1) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.00 Done - Shared
4430 0 DK Δgene:(1, 20) A:(1E-10, 8) B:(1E-10, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
4429 0 DK Δgene:(1, 20) A:(1E-20, 8) B:(1E-20, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
3662 0.48 DK Δgene:(1, 20) A:(1E-20, 1) B:(1E-20, 1) msa: Jackhmmer (2015_06) 0.01 Done - Shared
3617 0 DK Δgene:(1, 20) A:(1E-04, 8) B:(1E-04, 8) msa: Jackhmmer (2015_06) Killed - Shared
Page generated in 0.3185 seconds.