May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
Meth_TfuA2_YcaO
Genes: A B A+B
Length: 465 394 821
Sequences: 64 1145 60
Seq/Len: 0.14 2.91 0.07
MirrorTree (Pazo et al. 2001) 0.90
Download Alignment
We filter this alignment to remove positions that have > 75% gaps before running GREMLIN.

[Show HHblits results] - Maybe useful in deciding what regions to trim.
Δgene Ratio of paralogs Joined
A B Seq/Len
1 0.00 0.01 0.07
2 0.00 0.02 0.07
5 0.00 0.02 0.07
10 0.00 0.03 0.07
20 0.00 0.03 0.07
100 0.00 0.03 0.07
∞ 0.05 0.06 0.07
Paired alignment generation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
Sequence A E-value:
Iterations:
Sequence B E-value:
Iterations:
Δgene MSA
Figure 1: The effect of Δgene on ratio of paralogs in the genome for each gene, and the number of sequences in the resulting joined alignment. Figure 2: Distribution of Δgene across all genomes. Figure 3: Current parameters. You can use the form to adjust the parameters and resubmit the job!
GREMLIN results (Scaled_score > 1):
Figure 4: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. 		Inter Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score Prob I_Prob
440_L 197_G 1.83 0.26 0.00
210_L 182_N 1.73 0.23 0.00
99_I 181_S 1.71 0.22 0.00
94_E 281_V 1.67 0.21 0.00
11_S 181_S 1.62 0.20 0.00
110_A 51_E 1.56 0.18 0.00
132_L 259_T 1.54 0.17 0.00
440_L 299_A 1.45 0.15 0.00
72_V 195_L 1.44 0.15 0.00
78_A 140_T 1.44 0.15 0.00
78_A 383_H 1.42 0.14 0.00
173_L 21_F 1.42 0.14 0.00
46_V 363_T 1.38 0.14 0.00
72_V 309_P 1.38 0.14 0.00
131_P 197_G 1.38 0.14 0.00
58_A 62_V 1.37 0.13 0.00
132_L 51_E 1.36 0.13 0.00
15_A 19_V 1.36 0.13 0.00
347_I 42_P 1.34 0.13 0.00
118_H 257_F 1.33 0.12 0.00
145_D 201_T 1.32 0.12 0.00
78_A 82_S 1.31 0.12 0.00
420_V 284_S 1.31 0.12 0.00
367_I 70_A 1.30 0.12 0.00
6_L 295_A 1.30 0.12 0.00
67_L 146_A 1.29 0.12 0.00
162_G 324_S 1.29 0.12 0.00
110_A 284_S 1.29 0.12 0.00
60_R 363_T 1.29 0.12 0.00
309_H 348_L 1.28 0.11 0.00
144_E 240_R 1.27 0.11 0.00
207_L 76_S 1.27 0.11 0.00
438_D 255_P 1.27 0.11 0.00
46_V 359_I 1.26 0.11 0.00
434_L 52_V 1.26 0.11 0.00
156_L 62_V 1.26 0.11 0.00
166_G 58_I 1.26 0.11 0.00
80_M 381_V 1.25 0.11 0.00
255_G 336_P 1.25 0.11 0.00
130_E 46_I 1.24 0.11 0.00
135_M 32_Q 1.24 0.11 0.00
118_H 381_V 1.22 0.10 0.00
212_A 181_S 1.22 0.10 0.00
99_I 42_P 1.22 0.10 0.00
24_V 181_S 1.22 0.10 0.00
190_L 233_L 1.21 0.10 0.00
370_L 186_S 1.20 0.10 0.00
419_G 310_Y 1.20 0.10 0.00
60_R 359_I 1.20 0.10 0.00
55_Q 44_L 1.20 0.10 0.00
77_A 70_A 1.20 0.10 0.00
368_Q 221_P 1.20 0.10 0.00
12_L 62_V 1.20 0.10 0.00
88_L 291_A 1.20 0.10 0.00
444_A 263_S 1.20 0.10 0.00
91_F 92_M 1.18 0.10 0.00
35_L 363_T 1.18 0.10 0.00
233_T 261_I 1.18 0.10 0.00
434_L 223_T 1.18 0.10 0.00
68_L 219_V 1.17 0.10 0.00
301_T 325_P 1.17 0.10 0.00
120_T 232_L 1.16 0.10 0.00
58_A 115_E 1.16 0.10 0.00
35_L 267_P 1.16 0.10 0.00
328_L 181_S 1.16 0.09 0.00
11_S 70_A 1.15 0.09 0.00
263_C 173_L 1.15 0.09 0.00
348_T 281_V 1.15 0.09 0.00
412_D 103_P 1.15 0.09 0.00
190_L 52_V 1.15 0.09 0.00
61_H 67_R 1.14 0.09 0.00
61_H 302_R 1.14 0.09 0.00
61_H 304_D 1.14 0.09 0.00
114_V 67_R 1.14 0.09 0.00
114_V 302_R 1.14 0.09 0.00
114_V 304_D 1.14 0.09 0.00
127_P 368_L 1.14 0.09 0.00
291_G 94_A 1.13 0.09 0.00
72_V 305_I 1.13 0.09 0.00
132_L 199_Y 1.13 0.09 0.00
36_P 72_T 1.13 0.09 0.00
57_G 275_A 1.13 0.09 0.00
93_M 294_R 1.13 0.09 0.00
168_R 294_R 1.13 0.09 0.00
35_L 189_T 1.13 0.09 0.00
377_K 138_D 1.12 0.09 0.00
418_W 268_A 1.12 0.09 0.00
421_A 126_D 1.12 0.09 0.00
126_R 141_L 1.12 0.09 0.00
80_M 301_A 1.11 0.09 0.00
265_L 74_S 1.11 0.09 0.00
88_L 196_H 1.11 0.09 0.00
4_C 74_S 1.11 0.09 0.00
94_E 74_S 1.11 0.09 0.00
197_H 359_I 1.10 0.09 0.00
116_L 241_V 1.10 0.09 0.00
170_Y 379_I 1.10 0.09 0.00
150_S 254_I 1.10 0.09 0.00
264_Q 167_R 1.09 0.08 0.00
48_I 157_V 1.08 0.08 0.00
165_F 24_T 1.08 0.08 0.00
118_H 18_K 1.08 0.08 0.00
108_L 233_L 1.08 0.08 0.00
33_G 61_P 1.08 0.08 0.00
160_L 75_V 1.08 0.08 0.00
315_L 208_A 1.08 0.08 0.00
236_L 175_P 1.07 0.08 0.00
236_L 90_A 1.07 0.08 0.00
131_P 77_Q 1.07 0.08 0.00
46_V 367_P 1.07 0.08 0.00
58_A 103_P 1.07 0.08 0.00
53_F 381_V 1.07 0.08 0.00
235_F 383_H 1.07 0.08 0.00
38_L 367_P 1.07 0.08 0.00
129_S 254_I 1.07 0.08 0.00
190_L 281_V 1.07 0.08 0.00
72_V 98_W 1.07 0.08 0.00
160_L 295_A 1.07 0.08 0.00
44_D 72_T 1.07 0.08 0.00
35_L 122_Y 1.06 0.08 0.00
134_C 32_Q 1.06 0.08 0.00
380_R 301_A 1.06 0.08 0.00
448_Y 39_P 1.06 0.08 0.00
48_I 150_D 1.06 0.08 0.00
139_L 23_G 1.06 0.08 0.00
164_P 88_V 1.06 0.08 0.00
142_A 92_M 1.06 0.08 0.00
121_P 219_V 1.06 0.08 0.00
134_C 23_G 1.06 0.08 0.00
433_G 388_G 1.06 0.08 0.00
7_F 80_G 1.06 0.08 0.00
7_F 205_D 1.06 0.08 0.00
72_V 199_Y 1.05 0.08 0.00
44_D 263_S 1.05 0.08 0.00
25_E 20_V 1.05 0.08 0.00
267_A 126_D 1.05 0.08 0.00
351_V 221_P 1.05 0.08 0.00
78_A 60_I 1.05 0.08 0.00
412_D 199_Y 1.05 0.08 0.00
62_K 70_A 1.05 0.08 0.00
426_E 16_S 1.05 0.08 0.00
52_Y 259_T 1.05 0.08 0.00
108_L 280_A 1.05 0.08 0.00
112_D 89_S 1.04 0.08 0.00
112_D 184_L 1.04 0.08 0.00
112_D 187_G 1.04 0.08 0.00
112_D 192_E 1.04 0.08 0.00
3_R 256_V 1.04 0.08 0.00
60_R 34_W 1.04 0.08 0.00
104_R 208_A 1.04 0.08 0.00
339_T 234_D 1.04 0.08 0.00
273_F 157_V 1.03 0.08 0.00
99_I 71_R 1.03 0.08 0.00
245_G 58_I 1.03 0.08 0.00
403_N 335_L 1.03 0.08 0.00
313_R 70_A 1.03 0.08 0.00
72_V 102_H 1.03 0.08 0.00
139_L 62_V 1.03 0.08 0.00
100_Y 216_P 1.03 0.08 0.00
32_A 210_A 1.03 0.08 0.00
140_S 153_A 1.02 0.07 0.00
213_L 88_V 1.02 0.07 0.00
163_W 94_A 1.02 0.07 0.00
148_C 293_S 1.02 0.07 0.00
186_V 307_K 1.02 0.07 0.00
143_V 60_I 1.02 0.07 0.00
34_D 33_T 1.02 0.07 0.00
78_A 74_S 1.02 0.07 0.00
45_V 337_F 1.01 0.07 0.00
108_L 86_A 1.01 0.07 0.00
127_P 317_G 1.01 0.07 0.00
259_A 138_D 1.01 0.07 0.00
215_R 299_A 1.01 0.07 0.00
57_G 226_N 1.01 0.07 0.00
72_V 194_L 1.01 0.07 0.00
99_I 313_A 1.01 0.07 0.00
68_L 220_D 1.01 0.07 0.00
104_R 301_A 1.01 0.07 0.00
391_D 95_V 1.00 0.07 0.00
64_I 95_V 1.00 0.07 0.00
193_Y 167_R 1.00 0.07 0.00
195_V 202_V 1.00 0.07 0.00
260_L 157_V 1.00 0.07 0.00
270_Y 337_F 1.00 0.07 0.00
108_L 227_A 1.00 0.07 0.00
236_L 160_D 1.00 0.07 0.00
153_A 31_E 1.00 0.07 0.00
177_G 299_A 1.00 0.07 0.00
157_V 108_T 1.00 0.07 0.00
43_G 247_F 1.00 0.07 0.00
234_S 179_A 1.00 0.07 0.00
19_V 261_I 1.00 0.07 0.00
280_R 233_L 0.99 0.07 0.00
100_Y 94_A 0.99 0.07 0.00
173_L 224_I 0.99 0.07 0.00
72_V 154_A 0.99 0.07 0.00
109_E 87_R 0.99 0.07 0.00
369_R 77_Q 0.98 0.07 0.00
443_A 90_A 0.98 0.07 0.00
5_L 260_R 0.98 0.07 0.00
217_S 255_P 0.98 0.07 0.00
342_P 157_V 0.98 0.07 0.00
191_R 234_D 0.98 0.07 0.00
237_Y 243_V 0.98 0.07 0.00
26_V 98_W 0.98 0.07 0.00
118_H 25_H 0.98 0.07 0.00
95_G 61_P 0.98 0.07 0.00
429_A 367_P 0.98 0.07 0.00
160_L 291_A 0.97 0.07 0.00
226_A 316_F 0.97 0.07 0.00
79_S 67_R 0.97 0.07 0.00
79_S 302_R 0.97 0.07 0.00
79_S 304_D 0.97 0.07 0.00
106_G 294_R 0.97 0.07 0.00
193_Y 21_F 0.97 0.07 0.00
423_A 234_D 0.97 0.07 0.00
5_L 37_I 0.97 0.07 0.00
277_V 251_P 0.97 0.07 0.00
69_S 247_F 0.97 0.07 0.00
349_F 131_G 0.97 0.07 0.00
58_A 77_Q 0.97 0.07 0.00
120_T 124_V 0.97 0.07 0.00
119_S 165_D 0.96 0.07 0.00
292_P 319_R 0.96 0.07 0.00
36_P 135_L 0.96 0.07 0.00
112_D 276_H 0.96 0.07 0.00
142_A 372_L 0.96 0.07 0.00
52_Y 208_A 0.96 0.07 0.00
100_Y 386_C 0.96 0.07 0.00
350_L 163_R 0.96 0.07 0.00
78_A 124_V 0.96 0.07 0.00
99_I 201_T 0.96 0.07 0.00
67_L 54_W 0.96 0.07 0.00
283_A 175_P 0.96 0.07 0.00
133_V 67_R 0.95 0.07 0.00
133_V 302_R 0.95 0.07 0.00
133_V 304_D 0.95 0.07 0.00
48_I 46_I 0.95 0.07 0.00
77_A 23_G 0.95 0.07 0.00
141_Q 154_A 0.95 0.07 0.00
93_M 86_A 0.95 0.07 0.00
168_R 86_A 0.95 0.07 0.00
344_E 202_V 0.95 0.07 0.00
71_G 285_R 0.95 0.07 0.00
341_G 146_A 0.95 0.07 0.00
348_T 369_Y 0.95 0.07 0.00
122_E 32_Q 0.95 0.07 0.00
99_I 216_P 0.95 0.07 0.00
151_A 349_D 0.95 0.07 0.00
132_L 293_S 0.95 0.07 0.00
408_E 70_A 0.95 0.07 0.00
30_V 84_T 0.95 0.07 0.00
60_R 263_S 0.95 0.07 0.00
164_P 175_P 0.95 0.07 0.00
45_V 279_A 0.95 0.07 0.00
98_R 368_L 0.94 0.07 0.00
99_I 51_E 0.94 0.07 0.00
322_P 373_T 0.94 0.07 0.00
33_G 196_H 0.94 0.07 0.00
200_D 377_I 0.94 0.07 0.00
200_D 32_Q 0.94 0.07 0.00
219_G 153_A 0.94 0.07 0.00
171_G 261_I 0.94 0.07 0.00
436_S 380_P 0.94 0.07 0.00
118_H 301_A 0.94 0.07 0.00
309_H 124_V 0.94 0.07 0.00
380_R 111_G 0.94 0.07 0.00
131_P 163_R 0.94 0.07 0.00
193_Y 223_T 0.94 0.07 0.00
122_E 105_P 0.94 0.07 0.00
32_A 81_M 0.94 0.07 0.00
62_K 89_S 0.94 0.07 0.00
62_K 184_L 0.94 0.07 0.00
62_K 187_G 0.94 0.07 0.00
62_K 192_E 0.94 0.07 0.00
47_G 279_A 0.94 0.07 0.00
133_V 294_R 0.94 0.07 0.00
230_V 36_W 0.94 0.07 0.00
123_E 94_A 0.94 0.07 0.00
13_P 199_Y 0.93 0.07 0.00
62_K 77_Q 0.93 0.07 0.00
151_A 378_A 0.93 0.07 0.00
132_L 198_M 0.93 0.07 0.00
86_A 193_A 0.93 0.06 0.00
35_L 262_W 0.93 0.06 0.00
283_A 90_A 0.93 0.06 0.00
112_D 185_A 0.93 0.06 0.00
146_G 117_E 0.93 0.06 0.00
160_L 63_F 0.93 0.06 0.00
69_S 82_S 0.93 0.06 0.00
120_T 303_D 0.93 0.06 0.00
350_L 295_A 0.93 0.06 0.00
152_T 161_L 0.93 0.06 0.00
145_D 36_W 0.93 0.06 0.00
131_P 60_I 0.93 0.06 0.00
207_L 323_E 0.93 0.06 0.00
121_P 149_V 0.93 0.06 0.00
110_A 103_P 0.93 0.06 0.00
202_K 372_L 0.93 0.06 0.00
200_D 197_G 0.93 0.06 0.00
217_S 147_H 0.92 0.06 0.00
322_P 201_T 0.92 0.06 0.00
330_Q 31_E 0.92 0.06 0.00
198_R 337_F 0.92 0.06 0.00
263_C 75_V 0.92 0.06 0.00
125_Y 121_G 0.92 0.06 0.00
120_T 198_M 0.92 0.06 0.00
446_A 308_A 0.92 0.06 0.00
46_V 364_G 0.92 0.06 0.00
7_F 372_L 0.92 0.06 0.00
138_T 257_F 0.92 0.06 0.00
74_V 188_N 0.92 0.06 0.00
32_A 363_T 0.92 0.06 0.00
331_W 186_S 0.92 0.06 0.00
35_L 367_P 0.92 0.06 0.00
36_P 90_A 0.92 0.06 0.00
130_E 252_F 0.92 0.06 0.00
219_G 378_A 0.92 0.06 0.00
342_P 352_V 0.92 0.06 0.00
223_T 281_V 0.92 0.06 0.00
366_S 241_V 0.92 0.06 0.00
11_S 58_I 0.92 0.06 0.00
277_V 351_E 0.92 0.06 0.00
148_C 194_L 0.92 0.06 0.00
143_V 213_G 0.92 0.06 0.00
187_V 367_P 0.92 0.06 0.00
332_L 165_D 0.91 0.06 0.00
177_G 194_L 0.91 0.06 0.00
122_E 240_R 0.91 0.06 0.00
418_W 72_T 0.91 0.06 0.00
201_P 305_I 0.91 0.06 0.00
135_M 119_V 0.91 0.06 0.00
279_L 220_D 0.91 0.06 0.00
66_A 88_V 0.91 0.06 0.00
62_K 288_T 0.91 0.06 0.00
25_E 180_S 0.91 0.06 0.00
359_G 119_V 0.91 0.06 0.00
26_V 316_F 0.91 0.06 0.00
45_V 197_G 0.91 0.06 0.00
204_D 51_E 0.91 0.06 0.00
115_T 146_A 0.91 0.06 0.00
43_G 364_G 0.91 0.06 0.00
156_L 202_V 0.91 0.06 0.00
447_F 284_S 0.91 0.06 0.00
193_Y 318_V 0.91 0.06 0.00
127_P 232_L 0.91 0.06 0.00
449_L 278_D 0.90 0.06 0.00
117_L 32_Q 0.90 0.06 0.00
418_W 386_C 0.90 0.06 0.00
52_Y 358_R 0.90 0.06 0.00
70_E 160_D 0.90 0.06 0.00
99_I 240_R 0.90 0.06 0.00
128_L 60_I 0.90 0.06 0.00
34_D 372_L 0.90 0.06 0.00
328_L 254_I 0.90 0.06 0.00
102_D 27_S 0.90 0.06 0.00
214_Q 35_Q 0.90 0.06 0.00
118_H 75_V 0.90 0.06 0.00
235_F 299_A 0.90 0.06 0.00
278_V 165_D 0.90 0.06 0.00
138_T 174_P 0.90 0.06 0.00
339_T 41_L 0.90 0.06 0.00
132_L 152_N 0.90 0.06 0.00
155_R 108_T 0.90 0.06 0.00
420_V 383_H 0.90 0.06 0.00
158_A 234_D 0.90 0.06 0.00
71_G 298_I 0.90 0.06 0.00
32_A 383_H 0.90 0.06 0.00
54_H 356_A 0.90 0.06 0.00
263_C 363_T 0.89 0.06 0.00
32_A 142_T 0.89 0.06 0.00
53_F 206_A 0.89 0.06 0.00
131_P 245_M 0.89 0.06 0.00
270_Y 371_D 0.89 0.06 0.00
139_L 310_Y 0.89 0.06 0.00
189_R 224_I 0.89 0.06 0.00
164_P 38_R 0.89 0.06 0.00
103_Y 174_P 0.89 0.06 0.00
36_P 359_I 0.89 0.06 0.00
137_A 246_R 0.89 0.06 0.00
170_Y 297_A 0.89 0.06 0.00
148_C 353_A 0.89 0.06 0.00
50_D 68_P 0.89 0.06 0.00
50_D 78_G 0.89 0.06 0.00
50_D 93_E 0.89 0.06 0.00
50_D 96_E 0.89 0.06 0.00
50_D 101_E 0.89 0.06 0.00
50_D 143_W 0.89 0.06 0.00
50_D 158_P 0.89 0.06 0.00
50_D 183_G 0.89 0.06 0.00
50_D 200_E 0.89 0.06 0.00
50_D 203_E 0.89 0.06 0.00
50_D 204_R 0.89 0.06 0.00
50_D 272_G 0.89 0.06 0.00
50_D 282_A 0.89 0.06 0.00
50_D 286_A 0.89 0.06 0.00
50_D 289_E 0.89 0.06 0.00
50_D 292_Q 0.89 0.06 0.00
50_D 300_G 0.89 0.06 0.00
51_G 68_P 0.89 0.06 0.00
51_G 78_G 0.89 0.06 0.00
51_G 93_E 0.89 0.06 0.00
51_G 96_E 0.89 0.06 0.00
51_G 101_E 0.89 0.06 0.00
51_G 143_W 0.89 0.06 0.00
51_G 158_P 0.89 0.06 0.00
51_G 183_G 0.89 0.06 0.00
51_G 200_E 0.89 0.06 0.00
51_G 203_E 0.89 0.06 0.00
51_G 204_R 0.89 0.06 0.00
51_G 272_G 0.89 0.06 0.00
51_G 282_A 0.89 0.06 0.00
51_G 286_A 0.89 0.06 0.00
51_G 289_E 0.89 0.06 0.00
51_G 292_Q 0.89 0.06 0.00
51_G 300_G 0.89 0.06 0.00
63_E 68_P 0.89 0.06 0.00
63_E 78_G 0.89 0.06 0.00
63_E 93_E 0.89 0.06 0.00
63_E 96_E 0.89 0.06 0.00
63_E 101_E 0.89 0.06 0.00
63_E 143_W 0.89 0.06 0.00
63_E 158_P 0.89 0.06 0.00
63_E 183_G 0.89 0.06 0.00
63_E 200_E 0.89 0.06 0.00
63_E 203_E 0.89 0.06 0.00
63_E 204_R 0.89 0.06 0.00
63_E 272_G 0.89 0.06 0.00
63_E 282_A 0.89 0.06 0.00
63_E 286_A 0.89 0.06 0.00
63_E 289_E 0.89 0.06 0.00
63_E 292_Q 0.89 0.06 0.00
63_E 300_G 0.89 0.06 0.00
76_G 68_P 0.89 0.06 0.00
76_G 78_G 0.89 0.06 0.00
76_G 93_E 0.89 0.06 0.00
76_G 96_E 0.89 0.06 0.00
76_G 101_E 0.89 0.06 0.00
76_G 143_W 0.89 0.06 0.00
76_G 158_P 0.89 0.06 0.00
76_G 183_G 0.89 0.06 0.00
76_G 200_E 0.89 0.06 0.00
76_G 203_E 0.89 0.06 0.00
76_G 204_R 0.89 0.06 0.00
76_G 272_G 0.89 0.06 0.00
76_G 282_A 0.89 0.06 0.00
76_G 286_A 0.89 0.06 0.00
76_G 289_E 0.89 0.06 0.00
76_G 292_Q 0.89 0.06 0.00
76_G 300_G 0.89 0.06 0.00
81_G 68_P 0.89 0.06 0.00
81_G 78_G 0.89 0.06 0.00
81_G 93_E 0.89 0.06 0.00
81_G 96_E 0.89 0.06 0.00
81_G 101_E 0.89 0.06 0.00
81_G 143_W 0.89 0.06 0.00
81_G 158_P 0.89 0.06 0.00
81_G 183_G 0.89 0.06 0.00
81_G 200_E 0.89 0.06 0.00
81_G 203_E 0.89 0.06 0.00
81_G 204_R 0.89 0.06 0.00
81_G 272_G 0.89 0.06 0.00
81_G 282_A 0.89 0.06 0.00
81_G 286_A 0.89 0.06 0.00
81_G 289_E 0.89 0.06 0.00
81_G 292_Q 0.89 0.06 0.00
81_G 300_G 0.89 0.06 0.00
82_A 68_P 0.89 0.06 0.00
82_A 78_G 0.89 0.06 0.00
82_A 93_E 0.89 0.06 0.00
82_A 96_E 0.89 0.06 0.00
82_A 101_E 0.89 0.06 0.00
82_A 143_W 0.89 0.06 0.00
82_A 158_P 0.89 0.06 0.00
82_A 183_G 0.89 0.06 0.00
82_A 200_E 0.89 0.06 0.00
82_A 203_E 0.89 0.06 0.00
82_A 204_R 0.89 0.06 0.00
82_A 272_G 0.89 0.06 0.00
82_A 282_A 0.89 0.06 0.00
82_A 286_A 0.89 0.06 0.00
82_A 289_E 0.89 0.06 0.00
82_A 292_Q 0.89 0.06 0.00
82_A 300_G 0.89 0.06 0.00
83_L 68_P 0.89 0.06 0.00
83_L 78_G 0.89 0.06 0.00
83_L 93_E 0.89 0.06 0.00
83_L 96_E 0.89 0.06 0.00
83_L 101_E 0.89 0.06 0.00
83_L 143_W 0.89 0.06 0.00
83_L 158_P 0.89 0.06 0.00
83_L 183_G 0.89 0.06 0.00
83_L 200_E 0.89 0.06 0.00
83_L 203_E 0.89 0.06 0.00
83_L 204_R 0.89 0.06 0.00
83_L 272_G 0.89 0.06 0.00
83_L 282_A 0.89 0.06 0.00
83_L 286_A 0.89 0.06 0.00
83_L 289_E 0.89 0.06 0.00
83_L 292_Q 0.89 0.06 0.00
83_L 300_G 0.89 0.06 0.00
84_R 68_P 0.89 0.06 0.00
84_R 78_G 0.89 0.06 0.00
84_R 93_E 0.89 0.06 0.00
84_R 96_E 0.89 0.06 0.00
84_R 101_E 0.89 0.06 0.00
84_R 143_W 0.89 0.06 0.00
84_R 158_P 0.89 0.06 0.00
84_R 183_G 0.89 0.06 0.00
84_R 200_E 0.89 0.06 0.00
84_R 203_E 0.89 0.06 0.00
84_R 204_R 0.89 0.06 0.00
84_R 272_G 0.89 0.06 0.00
84_R 282_A 0.89 0.06 0.00
84_R 286_A 0.89 0.06 0.00
84_R 289_E 0.89 0.06 0.00
84_R 292_Q 0.89 0.06 0.00
84_R 300_G 0.89 0.06 0.00
92_G 68_P 0.89 0.06 0.00
92_G 78_G 0.89 0.06 0.00
92_G 93_E 0.89 0.06 0.00
92_G 96_E 0.89 0.06 0.00
92_G 101_E 0.89 0.06 0.00
92_G 143_W 0.89 0.06 0.00
92_G 158_P 0.89 0.06 0.00
92_G 183_G 0.89 0.06 0.00
92_G 200_E 0.89 0.06 0.00
92_G 203_E 0.89 0.06 0.00
92_G 204_R 0.89 0.06 0.00
92_G 272_G 0.89 0.06 0.00
92_G 282_A 0.89 0.06 0.00
92_G 286_A 0.89 0.06 0.00
92_G 289_E 0.89 0.06 0.00
92_G 292_Q 0.89 0.06 0.00
92_G 300_G 0.89 0.06 0.00
96_V 362_V 0.89 0.06 0.00
97_G 68_P 0.89 0.06 0.00
97_G 78_G 0.89 0.06 0.00
97_G 93_E 0.89 0.06 0.00
97_G 96_E 0.89 0.06 0.00
97_G 101_E 0.89 0.06 0.00
97_G 143_W 0.89 0.06 0.00
97_G 158_P 0.89 0.06 0.00
97_G 183_G 0.89 0.06 0.00
97_G 200_E 0.89 0.06 0.00
97_G 203_E 0.89 0.06 0.00
97_G 204_R 0.89 0.06 0.00
97_G 272_G 0.89 0.06 0.00
97_G 282_A 0.89 0.06 0.00
97_G 286_A 0.89 0.06 0.00
97_G 289_E 0.89 0.06 0.00
97_G 292_Q 0.89 0.06 0.00
97_G 300_G 0.89 0.06 0.00
111_D 68_P 0.89 0.06 0.00
111_D 78_G 0.89 0.06 0.00
111_D 93_E 0.89 0.06 0.00
111_D 96_E 0.89 0.06 0.00
111_D 101_E 0.89 0.06 0.00
111_D 143_W 0.89 0.06 0.00
111_D 158_P 0.89 0.06 0.00
111_D 183_G 0.89 0.06 0.00
111_D 200_E 0.89 0.06 0.00
111_D 203_E 0.89 0.06 0.00
111_D 204_R 0.89 0.06 0.00
111_D 272_G 0.89 0.06 0.00
111_D 282_A 0.89 0.06 0.00
111_D 286_A 0.89 0.06 0.00
111_D 289_E 0.89 0.06 0.00
111_D 292_Q 0.89 0.06 0.00
111_D 300_G 0.89 0.06 0.00
206_A 68_P 0.89 0.06 0.00
206_A 78_G 0.89 0.06 0.00
206_A 93_E 0.89 0.06 0.00
206_A 96_E 0.89 0.06 0.00
206_A 101_E 0.89 0.06 0.00
206_A 143_W 0.89 0.06 0.00
206_A 158_P 0.89 0.06 0.00
206_A 183_G 0.89 0.06 0.00
206_A 200_E 0.89 0.06 0.00
206_A 203_E 0.89 0.06 0.00
206_A 204_R 0.89 0.06 0.00
206_A 272_G 0.89 0.06 0.00
206_A 282_A 0.89 0.06 0.00
206_A 286_A 0.89 0.06 0.00
206_A 289_E 0.89 0.06 0.00
206_A 292_Q 0.89 0.06 0.00
206_A 300_G 0.89 0.06 0.00
18_L 180_S 0.89 0.06 0.00
162_G 349_D 0.89 0.06 0.00
38_L 246_R 0.89 0.06 0.00
329_A 308_A 0.89 0.06 0.00
380_R 349_D 0.89 0.06 0.00
155_R 112_T 0.88 0.06 0.00
125_Y 323_E 0.88 0.06 0.00
416_R 280_A 0.88 0.06 0.00
101_A 350_E 0.88 0.06 0.00
161_A 58_I 0.88 0.06 0.00
426_E 208_A 0.88 0.06 0.00
36_P 206_A 0.88 0.06 0.00
428_A 241_V 0.88 0.06 0.00
344_E 62_V 0.88 0.06 0.00
395_T 98_W 0.88 0.06 0.00
197_H 240_R 0.88 0.06 0.00
400_R 174_P 0.88 0.06 0.00
11_S 240_R 0.88 0.06 0.00
343_A 31_E 0.88 0.06 0.00
390_N 51_E 0.88 0.06 0.00
134_C 384_V 0.88 0.06 0.00
57_G 197_G 0.88 0.06 0.00
115_T 116_V 0.88 0.06 0.00
210_L 383_H 0.88 0.06 0.00
238_L 73_L 0.88 0.06 0.00
26_V 189_T 0.88 0.06 0.00
284_T 94_A 0.88 0.06 0.00
148_C 60_I 0.88 0.06 0.00
261_R 167_R 0.88 0.06 0.00
131_P 347_T 0.88 0.06 0.00
70_E 146_A 0.88 0.06 0.00
445_R 66_V 0.88 0.06 0.00
53_F 257_F 0.87 0.06 0.00
227_V 62_V 0.87 0.06 0.00
193_Y 380_P 0.87 0.06 0.00
46_V 251_P 0.87 0.06 0.00
236_L 72_T 0.87 0.06 0.00
53_F 388_G 0.87 0.06 0.00
412_D 107_P 0.87 0.06 0.00
418_W 66_V 0.87 0.06 0.00
418_W 160_D 0.87 0.06 0.00
132_L 384_V 0.87 0.06 0.00
94_E 25_H 0.87 0.06 0.00
409_K 102_H 0.87 0.06 0.00
13_P 51_E 0.87 0.06 0.00
380_R 49_V 0.87 0.06 0.00
267_A 174_P 0.87 0.06 0.00
386_A 25_H 0.87 0.06 0.00
379_A 277_L 0.87 0.06 0.00
Figure 5: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the query sequences.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
Prob = P(contact | scaled_score, seq/len)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)
Page generated in 0.7248 seconds.