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4HEA_K - 4HEA_N
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GREMLIN Results (Scaled_score > 1): Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. Blue filled circles are GREMLIN results (Scaled_score >1). The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment confidence. Inter-chain contacts in the pdb are in shades of red.
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Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
Scaled Score = raw_score/average(raw_scores) I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score) Text file of predictions (includes both intra and inter preds) |