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OPENSEQ.org
FLIP - FLIR
UniProt: P0AC05 - P33135
Length: 506
Sequences: 721
Seq/Len: 1.50
I_Prob: 0.90
FLIP - Flagellar biosynthetic protein FliP
Paralog alert: 0.32 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIP 		FLIR - Flagellar biosynthetic protein FliR
Paralog alert: 0.33 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIR
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
78_L 187_A 1.95 0.90
97_T 13_L 1.59 0.71
189_I 200_A 1.41 0.56
225_L 194_L 1.32 0.46
176_T 144_L 1.28 0.43
93_A 86_F 1.27 0.42
207_L 193_L 1.27 0.41
145_A 141_N 1.26 0.41
90_L 206_R 1.25 0.39
189_I 74_A 1.24 0.38
80_T 95_V 1.24 0.38
213_P 208_A 1.23 0.38
212_V 202_G 1.23 0.38
195_I 154_F 1.22 0.36
107_K 150_L 1.16 0.31
24_P 92_F 1.16 0.31
218_A 220_L 1.15 0.30
239_L 38_V 1.15 0.30
88_V 54_I 1.15 0.30
76_N 103_G 1.14 0.29
189_I 243_L 1.13 0.28
91_G 86_F 1.12 0.28
99_F 102_I 1.12 0.28
217_I 193_L 1.10 0.26
72_G 74_A 1.10 0.26
206_A 142_G 1.10 0.26
213_P 185_M 1.10 0.26
223_L 101_I 1.09 0.25
93_A 238_P 1.07 0.23
89_L 118_S 1.04 0.21
228_L 217_G 1.03 0.20
180_K 143_H 1.02 0.20
85_P 93_A 1.02 0.20
212_V 129_M 1.02 0.19
48_I 115_D 1.02 0.19
142_T 214_F 1.00 0.18
48_I 43_K 1.00 0.18
109_Y 221_T 1.00 0.18
88_V 120_L 1.00 0.18
46_V 146_L 1.00 0.18
224_M 203_L 0.99 0.18
176_T 110_F 0.99 0.17
44_T 114_V 0.99 0.17
80_T 75_V 0.97 0.16
92_L 201_L 0.97 0.16
52_T 228_L 0.97 0.16
173_A 229_M 0.97 0.16
85_P 201_L 0.96 0.16
154_A 25_A 0.96 0.16
216_T 110_F 0.96 0.15
175_V 200_A 0.96 0.15
213_P 212_S 0.96 0.15
205_M 108_L 0.96 0.15
98_F 192_T 0.96 0.15
53_F 105_Q 0.96 0.15
138_M 225_G 0.96 0.15
243_F 103_G 0.95 0.15
78_L 177_S 0.95 0.15
107_K 141_N 0.95 0.15
215_A 119_H 0.95 0.15
94_L 84_L 0.95 0.15
88_V 112_T 0.95 0.14
198_L 211_L 0.94 0.14
73_L 148_S 0.94 0.14
125_E 150_L 0.94 0.14
135_R 211_L 0.94 0.14
213_P 239_F 0.94 0.14
93_A 97_T 0.93 0.14
74_L 226_I 0.93 0.14
135_R 56_P 0.93 0.13
184_Q 138_L 0.93 0.13
78_L 199_L 0.92 0.13
94_L 31_P 0.92 0.13
71_F 236_I 0.92 0.13
51_L 75_V 0.92 0.13
155_N 51_T 0.92 0.13
68_I 133_A 0.91 0.13
174_Y 43_K 0.91 0.13
195_I 176_G 0.91 0.12
224_M 229_M 0.90 0.12
100_I 75_V 0.90 0.12
203_V 124_V 0.90 0.12
114_Q 199_L 0.90 0.12
45_L 183_G 0.90 0.12
118_E 46_L 0.89 0.12
71_F 43_K 0.89 0.12
189_I 35_E 0.89 0.12
206_A 239_F 0.89 0.12
129_K 26_L 0.89 0.11
125_E 229_M 0.89 0.11
189_I 105_Q 0.89 0.11
58_L 222_L 0.89 0.11
126_A 143_H 0.88 0.11
224_M 154_F 0.88 0.11
213_P 64_P 0.88 0.11
113_Y 211_L 0.88 0.11
221_F 222_L 0.88 0.11
100_I 149_L 0.88 0.11
59_L 197_L 0.88 0.11
61_M 109_S 0.88 0.11
191_I 141_N 0.88 0.11
59_L 106_M 0.88 0.11
227_V 49_M 0.88 0.11
93_A 13_L 0.88 0.11
100_I 50_I 0.87 0.11
206_A 104_L 0.87 0.11
56_A 194_L 0.87 0.11
73_L 88_M 0.87 0.11
236_V 51_T 0.87 0.11
41_P 207_M 0.87 0.11
52_T 232_L 0.87 0.11
149_L 194_L 0.87 0.10
174_Y 190_L 0.87 0.10
199_V 192_T 0.87 0.10
154_A 26_L 0.87 0.10
189_I 131_M 0.86 0.10
174_Y 126_A 0.86 0.10
104_V 213_I 0.86 0.10
170_L 46_L 0.86 0.10
164_A 177_S 0.85 0.10
136_E 164_L 0.85 0.10
152_R 224_V 0.85 0.10
58_L 141_N 0.85 0.10
146_D 144_L 0.85 0.10
59_L 224_V 0.85 0.10
189_I 168_A 0.85 0.10
76_N 92_F 0.85 0.10
118_E 249_N 0.84 0.09
65_T 144_L 0.84 0.09
216_T 205_N 0.84 0.09
77_A 101_I 0.84 0.09
53_F 58_L 0.84 0.09
191_I 26_L 0.84 0.09
147_L 75_V 0.84 0.09
243_F 84_L 0.84 0.09
212_V 168_A 0.84 0.09
69_I 171_A 0.84 0.09
90_L 82_I 0.84 0.09
150_F 216_I 0.84 0.09
223_L 205_N 0.84 0.09
85_P 120_L 0.84 0.09
188_T 105_Q 0.84 0.09
139_L 226_I 0.84 0.09
210_M 119_H 0.83 0.09
121_I 191_I 0.83 0.09
244_Y 84_L 0.83 0.09
63_S 185_M 0.83 0.09
166_P 48_M 0.83 0.09
229_V 34_S 0.83 0.09
93_A 157_L 0.83 0.09
119_E 123_P 0.83 0.09
216_T 212_S 0.83 0.09
99_F 210_Q 0.83 0.09
164_A 78_I 0.83 0.09
145_A 229_M 0.83 0.09
45_L 217_G 0.83 0.09
72_G 237_A 0.83 0.09
153_L 195_L 0.83 0.09
131_A 47_A 0.83 0.09
184_Q 144_L 0.82 0.09
54_I 67_S 0.82 0.09
201_A 80_I 0.82 0.09
133_P 56_P 0.82 0.08
66_R 108_L 0.82 0.08
223_L 164_L 0.82 0.08
47_F 125_L 0.82 0.08
195_I 71_L 0.81 0.08
76_N 198_N 0.81 0.08
80_T 216_I 0.81 0.08
143_R 219_P 0.81 0.08
66_R 106_M 0.81 0.08
169_I 90_F 0.81 0.08
35_G 136_L 0.81 0.08
88_V 224_V 0.81 0.08
102_S 136_L 0.80 0.08
100_I 72_W 0.80 0.08
212_V 212_S 0.80 0.08
26_I 126_A 0.80 0.08
130_G 120_L 0.80 0.08
60_M 45_G 0.80 0.08
42_V 224_V 0.80 0.08
205_M 222_L 0.80 0.08
142_T 119_H 0.80 0.08
149_L 144_L 0.79 0.07
180_K 217_G 0.79 0.07
89_L 206_R 0.79 0.07
135_R 23_V 0.79 0.07
152_R 80_I 0.79 0.07
98_F 244_F 0.79 0.07
104_V 99_G 0.79 0.07
215_A 105_Q 0.79 0.07
180_K 141_N 0.79 0.07
161_G 199_L 0.79 0.07
89_L 131_M 0.79 0.07
195_I 193_L 0.78 0.07
169_I 8_Q 0.78 0.07
118_E 90_F 0.78 0.07
140_R 178_L 0.78 0.07
42_V 174_K 0.78 0.07
91_G 211_L 0.78 0.07
107_K 253_D 0.78 0.07
227_V 191_I 0.78 0.07
53_F 77_Q 0.78 0.07
108_I 14_N 0.78 0.07
30_P 176_G 0.78 0.07
198_L 50_I 0.78 0.07
195_I 158_P 0.78 0.07
48_I 131_M 0.77 0.07
68_I 43_K 0.77 0.07
236_V 97_T 0.77 0.07
89_L 101_I 0.77 0.07
176_T 215_V 0.77 0.07
72_G 201_L 0.77 0.07
135_R 198_N 0.77 0.07
76_N 172_L 0.77 0.07
142_T 33_L 0.77 0.07
57_I 246_E 0.77 0.07
199_V 24_L 0.77 0.07
66_R 97_T 0.77 0.07
128_E 11_S 0.77 0.07
127_L 34_S 0.77 0.06
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions (includes both intra and inter preds)
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