May 4, 2021 - We are working on upgrading the webserver, some pages may not work.
OPENSEQ.org
FLIG - FLIP
UniProt: P0ABZ1 - P0AC05
Length: 576
Sequences: 380
Seq/Len: 0.69
I_Prob: 0.01
FLIG - Flagellar motor switch protein FliG
Paralog alert: 0.15 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIG 		FLIP - Flagellar biosynthetic protein FliP
Paralog alert: 0.32 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: FLIP
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
112_F 213_P 1.62 0.01
278_M 184_Q 1.49 0.01
94_L 228_L 1.44 0.01
278_M 180_K 1.38 0.01
230_I 213_P 1.37 0.01
133_I 72_G 1.35 0.01
14_L 191_I 1.34 0.01
114_E 134_L 1.34 0.01
133_I 116_F 1.32 0.01
284_D 104_V 1.29 0.01
268_Q 153_L 1.27 0.00
47_I 121_I 1.26 0.00
255_D 56_A 1.26 0.00
95_E 198_L 1.25 0.00
251_L 190_F 1.25 0.00
156_D 86_N 1.25 0.00
240_V 189_I 1.23 0.00
150_D 53_F 1.23 0.00
171_A 176_T 1.23 0.00
34_V 216_T 1.22 0.00
275_L 52_T 1.22 0.00
318_T 217_I 1.22 0.00
25_V 199_V 1.21 0.00
75_D 217_I 1.21 0.00
14_L 24_P 1.18 0.00
233_M 45_L 1.17 0.00
211_E 99_F 1.15 0.00
266_A 26_I 1.15 0.00
94_L 147_L 1.15 0.00
259_L 146_D 1.15 0.00
112_F 76_N 1.14 0.00
300_Q 56_A 1.14 0.00
118_A 121_I 1.13 0.00
6_G 71_F 1.13 0.00
59_F 71_F 1.13 0.00
77_L 149_L 1.12 0.00
136_H 100_I 1.11 0.00
122_I 181_T 1.11 0.00
130_I 80_T 1.11 0.00
227_Q 71_F 1.11 0.00
107_I 109_Y 1.11 0.00
162_A 225_L 1.10 0.00
229_I 42_V 1.10 0.00
25_V 113_Y 1.09 0.00
23_A 47_F 1.07 0.00
13_L 81_P 1.07 0.00
218_V 105_I 1.06 0.00
196_V 191_I 1.05 0.00
29_L 85_P 1.05 0.00
33_E 169_I 1.05 0.00
259_L 143_R 1.04 0.00
271_R 217_I 1.04 0.00
271_R 72_G 1.04 0.00
137_L 181_T 1.04 0.00
259_L 99_F 1.04 0.00
29_L 238_S 1.04 0.00
305_Q 150_F 1.03 0.00
277_N 191_I 1.03 0.00
42_A 135_R 1.03 0.00
133_I 238_S 1.03 0.00
250_L 89_L 1.03 0.00
93_L 50_S 1.03 0.00
223_G 223_L 1.02 0.00
10_S 118_E 1.02 0.00
331_V 201_A 1.02 0.00
196_V 154_A 1.02 0.00
275_L 164_A 1.02 0.00
53_T 132_Q 1.01 0.00
93_L 147_L 1.01 0.00
80_V 71_F 1.01 0.00
151_E 120_K 1.01 0.00
109_T 52_T 1.01 0.00
121_L 59_L 1.00 0.00
69_L 199_V 1.00 0.00
268_Q 189_I 1.00 0.00
224_E 171_L 1.00 0.00
8_D 153_L 1.00 0.00
25_V 71_F 0.99 0.00
119_A 121_I 0.99 0.00
90_A 225_L 0.99 0.00
112_F 48_I 0.99 0.00
252_Q 205_M 0.98 0.00
161_I 45_L 0.98 0.00
278_M 228_L 0.98 0.00
133_I 121_I 0.98 0.00
80_V 47_F 0.98 0.00
203_I 181_T 0.98 0.00
35_Q 213_P 0.98 0.00
10_S 100_I 0.97 0.00
280_Q 42_V 0.97 0.00
45_T 129_K 0.97 0.00
179_L 144_E 0.97 0.00
259_L 182_A 0.97 0.00
73_A 52_T 0.97 0.00
317_E 47_F 0.97 0.00
120_D 54_I 0.97 0.00
293_R 38_W 0.96 0.00
177_E 154_A 0.96 0.00
235_L 95_F 0.96 0.00
156_D 32_P 0.96 0.00
8_D 195_I 0.96 0.00
245_R 189_I 0.96 0.00
156_D 237_G 0.96 0.00
118_A 165_V 0.96 0.00
274_F 216_T 0.95 0.00
215_I 78_L 0.95 0.00
147_A 135_R 0.95 0.00
241_D 135_R 0.95 0.00
171_A 34_G 0.95 0.00
43_N 105_I 0.95 0.00
93_L 242_S 0.95 0.00
160_R 228_L 0.94 0.00
58_E 88_V 0.94 0.00
284_D 154_A 0.94 0.00
202_I 165_V 0.93 0.00
266_A 60_M 0.93 0.00
167_V 237_G 0.93 0.00
191_S 81_P 0.93 0.00
216_T 167_M 0.93 0.00
218_V 93_A 0.93 0.00
195_G 225_L 0.93 0.00
331_V 59_L 0.93 0.00
115_P 56_A 0.93 0.00
132_T 73_L 0.93 0.00
323_I 124_Q 0.93 0.00
135_V 119_E 0.93 0.00
41_M 48_I 0.92 0.00
152_R 71_F 0.92 0.00
110_L 74_L 0.92 0.00
303_N 127_L 0.92 0.00
199_A 93_A 0.92 0.00
99_E 72_G 0.92 0.00
107_I 225_L 0.92 0.00
285_I 190_F 0.92 0.00
16_T 39_S 0.92 0.00
215_I 194_L 0.91 0.00
266_A 228_L 0.91 0.00
174_E 201_A 0.91 0.00
48_S 60_M 0.91 0.00
293_R 195_I 0.91 0.00
276_R 191_I 0.91 0.00
261_I 163_E 0.91 0.00
216_T 135_R 0.90 0.00
113_M 237_G 0.90 0.00
25_V 139_L 0.90 0.00
109_T 217_I 0.90 0.00
79_S 189_I 0.90 0.00
284_D 190_F 0.90 0.00
86_G 181_T 0.90 0.00
202_I 118_E 0.90 0.00
200_A 176_T 0.90 0.00
283_A 235_L 0.90 0.00
318_T 153_L 0.90 0.00
115_P 38_W 0.90 0.00
170_A 153_L 0.90 0.00
225_L 225_L 0.90 0.00
200_A 74_L 0.90 0.00
253_E 141_Q 0.89 0.00
170_A 161_G 0.89 0.00
304_E 188_T 0.89 0.00
230_I 129_K 0.89 0.00
40_A 201_A 0.89 0.00
253_E 184_Q 0.89 0.00
253_E 135_R 0.89 0.00
80_V 142_T 0.89 0.00
133_I 85_P 0.89 0.00
176_T 53_F 0.89 0.00
227_Q 206_A 0.89 0.00
77_L 93_A 0.89 0.00
136_H 175_V 0.88 0.00
53_T 189_I 0.88 0.00
20_D 148_G 0.88 0.00
160_R 143_R 0.88 0.00
83_K 85_P 0.88 0.00
247_I 59_L 0.88 0.00
149_F 203_V 0.88 0.00
324_G 199_V 0.88 0.00
17_I 206_A 0.88 0.00
157_V 182_A 0.88 0.00
289_D 175_V 0.88 0.00
18_G 171_L 0.88 0.00
286_L 70_V 0.87 0.00
317_E 124_Q 0.87 0.00
106_G 224_M 0.87 0.00
93_L 113_Y 0.87 0.00
34_V 238_S 0.87 0.00
67_A 81_P 0.87 0.00
184_D 93_A 0.87 0.00
132_T 85_P 0.87 0.00
218_V 78_L 0.87 0.00
302_E 204_L 0.87 0.00
36_T 206_A 0.86 0.00
252_Q 204_L 0.86 0.00
180_N 238_S 0.86 0.00
244_D 96_L 0.86 0.00
174_E 181_T 0.86 0.00
130_I 188_T 0.86 0.00
323_I 79_G 0.86 0.00
134_L 194_L 0.86 0.00
214_V 206_A 0.86 0.00
237_E 99_F 0.86 0.00
261_I 185_I 0.85 0.00
271_R 135_R 0.85 0.00
237_E 229_V 0.85 0.00
75_D 158_P 0.85 0.00
238_N 54_I 0.85 0.00
305_Q 95_F 0.85 0.00
213_A 142_T 0.85 0.00
25_V 123_M 0.85 0.00
150_D 111_D 0.85 0.00
35_Q 54_I 0.85 0.00
149_F 124_Q 0.85 0.00
69_L 151_A 0.85 0.00
139_R 216_T 0.84 0.00
295_P 87_Q 0.84 0.00
175_L 45_L 0.84 0.00
165_G 154_A 0.84 0.00
248_Q 205_M 0.84 0.00
226_A 149_L 0.84 0.00
157_V 31_L 0.84 0.00
77_L 206_A 0.84 0.00
174_E 74_L 0.84 0.00
84_A 43_Q 0.84 0.00
288_D 113_Y 0.84 0.00
274_F 141_Q 0.84 0.00
115_P 135_R 0.84 0.00
33_E 210_M 0.84 0.00
245_R 95_F 0.84 0.00
247_I 56_A 0.84 0.00
316_A 213_P 0.83 0.00
57_A 153_L 0.83 0.00
170_A 162_P 0.83 0.00
203_I 80_T 0.83 0.00
298_L 236_V 0.83 0.00
327_E 52_T 0.83 0.00
147_A 153_L 0.83 0.00
197_R 50_S 0.83 0.00
95_E 213_P 0.83 0.00
93_L 39_S 0.83 0.00
138_K 42_V 0.83 0.00
322_V 206_A 0.83 0.00
264_K 190_F 0.83 0.00
129_I 54_I 0.83 0.00
265_G 153_L 0.83 0.00
205_L 125_E 0.83 0.00
328_D 196_I 0.83 0.00
165_G 121_I 0.83 0.00
5_T 169_I 0.83 0.00
137_L 199_V 0.82 0.00
47_I 46_V 0.82 0.00
200_A 191_I 0.82 0.00
267_E 238_S 0.82 0.00
328_D 23_L 0.82 0.00
199_A 76_N 0.82 0.00
258_S 135_R 0.82 0.00
239_L 76_N 0.82 0.00
168_Q 224_M 0.82 0.00
218_V 35_G 0.82 0.00
47_I 135_R 0.82 0.00
215_I 42_V 0.82 0.00
274_F 202_S 0.82 0.00
175_L 76_N 0.82 0.00
117_S 217_I 0.82 0.00
203_I 130_G 0.82 0.00
293_R 88_V 0.81 0.00
138_K 54_I 0.81 0.00
207_K 59_L 0.81 0.00
41_M 43_Q 0.81 0.00
4_L 130_G 0.81 0.00
37_L 164_A 0.81 0.00
145_I 127_L 0.81 0.00
328_D 142_T 0.81 0.00
216_T 108_I 0.81 0.00
143_A 113_Y 0.81 0.00
35_Q 185_I 0.81 0.00
218_V 50_S 0.81 0.00
194_G 225_L 0.81 0.00
329_T 109_Y 0.81 0.00
209_Q 200_I 0.81 0.00
276_R 100_I 0.81 0.00
73_A 73_L 0.81 0.00
134_L 99_F 0.81 0.00
207_K 223_L 0.80 0.00
323_I 110_V 0.80 0.00
287_R 41_P 0.80 0.00
179_L 213_P 0.80 0.00
61_Q 31_L 0.80 0.00
302_E 191_I 0.80 0.00
134_L 104_V 0.80 0.00
206_M 165_V 0.80 0.00
299_S 213_P 0.80 0.00
288_D 166_P 0.80 0.00
284_D 126_A 0.80 0.00
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions (includes both intra and inter preds)
Page generated in 0.3088 seconds.