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OPENSEQ.org

CCMC - CCME
UniProt: P0ABM1 - P69490
Length: 404
Sequences: 311
Seq/Len: 0.82
I_Prob: 0.95

CCMC - Heme exporter protein C
Paralog alert: 0.03 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: CCMC
CCME - Cytochrome c-type biogenesis protein CcmE
Paralog alert: 0.03 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: CCME
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
49_Q 104_R 2.43 0.95
49_Q 107_Q 1.57 0.53
195_D 139_V 1.43 0.39
234_W 46_G 1.31 0.29
14_L 85_Y 1.25 0.24
157_R 93_V 1.20 0.20
146_W 42_E 1.20 0.20
235_V 46_G 1.18 0.19
65_I 36_L 1.18 0.18
187_S 142_A 1.17 0.18
48_Y 104_R 1.15 0.16
13_R 16_L 1.13 0.16
107_A 80_V 1.13 0.15
209_F 141_K 1.11 0.14
93_V 93_V 1.11 0.14
62_P 80_V 1.11 0.14
185_Q 130_H 1.11 0.14
59_L 2_N 1.10 0.14
69_G 60_L 1.10 0.14
169_N 108_G 1.10 0.14
59_L 111_V 1.08 0.13
124_V 36_L 1.08 0.13
146_W 111_V 1.07 0.12
71_Y 125_E 1.07 0.12
24_W 41_G 1.06 0.12
209_F 121_I 1.06 0.12
116_K 129_K 1.06 0.12
9_A 62_V 1.04 0.11
173_I 105_E 1.04 0.11
80_I 44_L 1.03 0.10
87_K 5_R 1.03 0.10
107_A 37_F 1.01 0.10
129_L 104_R 1.01 0.10
182_T 41_G 1.01 0.10
59_L 22_T 1.01 0.10
239_I 124_K 1.01 0.09
175_Y 43_I 1.00 0.09
9_A 4_R 1.00 0.09
155_A 68_P 1.00 0.09
5_L 5_R 1.00 0.09
163_V 109_V 0.99 0.09
183_L 127_L 0.99 0.09
164_L 19_L 0.99 0.09
83_V 114_E 0.99 0.09
183_L 63_G 0.98 0.09
52_N 65_M 0.98 0.09
90_N 144_E 0.98 0.09
178_E 139_V 0.98 0.08
188_T 140_E 0.97 0.08
129_L 107_Q 0.97 0.08
8_L 54_P 0.97 0.08
110_T 125_E 0.97 0.08
91_L 26_V 0.96 0.08
90_N 14_A 0.96 0.08
26_A 93_V 0.95 0.07
219_M 57_G 0.95 0.07
18_C 121_I 0.95 0.07
103_F 141_K 0.95 0.07
173_I 127_L 0.94 0.07
93_V 34_I 0.94 0.07
146_W 47_K 0.94 0.07
156_G 26_V 0.94 0.07
205_S 16_L 0.94 0.07
14_L 121_I 0.94 0.07
24_W 135_T 0.93 0.07
204_W 91_V 0.93 0.07
185_Q 63_G 0.93 0.07
91_L 16_L 0.93 0.07
9_A 144_E 0.93 0.07
154_L 19_L 0.93 0.07
177_V 63_G 0.92 0.07
223_N 121_I 0.92 0.07
27_I 75_P 0.92 0.07
44_A 47_K 0.92 0.06
110_T 26_V 0.92 0.06
157_R 89_G 0.91 0.06
240_L 145_A 0.91 0.06
66_W 87_A 0.90 0.06
164_L 7_N 0.90 0.06
214_A 91_V 0.90 0.06
70_I 133_N 0.90 0.06
224_L 20_A 0.90 0.06
163_V 135_T 0.90 0.06
63_A 75_P 0.90 0.06
231_R 62_V 0.90 0.06
134_V 89_G 0.90 0.06
206_I 42_E 0.90 0.06
78_A 38_Y 0.90 0.06
30_V 17_A 0.90 0.06
127_A 142_A 0.89 0.06
191_Q 36_L 0.89 0.06
200_S 94_S 0.89 0.06
109_V 94_S 0.89 0.06
185_Q 132_E 0.89 0.06
107_A 115_L 0.89 0.06
162_L 18_G 0.88 0.05
107_A 106_G 0.88 0.05
214_A 23_I 0.88 0.05
164_L 120_H 0.88 0.05
112_S 88_E 0.88 0.05
121_T 127_L 0.88 0.05
192_Q 32_S 0.87 0.05
105_F 93_V 0.87 0.05
160_G 118_G 0.87 0.05
173_I 27_L 0.87 0.05
96_M 72_Q 0.86 0.05
58_Y 146_N 0.86 0.05
31_V 13_C 0.86 0.05
79_F 12_A 0.86 0.05
133_L 123_A 0.86 0.05
106_I 14_A 0.86 0.05
186_G 133_N 0.85 0.05
58_Y 145_A 0.85 0.05
136_L 130_H 0.85 0.05
67_S 58_Q 0.85 0.05
84_W 98_I 0.85 0.04
137_F 131_D 0.84 0.04
185_Q 131_D 0.84 0.04
217_T 77_S 0.84 0.04
185_Q 40_P 0.84 0.04
164_L 145_A 0.84 0.04
12_P 109_V 0.84 0.04
133_L 128_A 0.84 0.04
238_L 111_V 0.84 0.04
153_R 60_L 0.84 0.04
159_A 19_L 0.84 0.04
85_Q 74_D 0.83 0.04
198_M 142_A 0.83 0.04
210_L 55_E 0.83 0.04
178_E 104_R 0.83 0.04
17_I 28_Y 0.83 0.04
46_A 16_L 0.83 0.04
218_L 11_I 0.83 0.04
235_V 80_V 0.83 0.04
154_L 20_A 0.83 0.04
85_Q 58_Q 0.83 0.04
141_G 69_G 0.82 0.04
10_I 54_P 0.82 0.04
27_I 91_V 0.82 0.04
50_Q 63_G 0.82 0.04
58_Y 117_K 0.82 0.04
27_I 76_N 0.82 0.04
196_P 68_P 0.82 0.04
107_A 5_R 0.82 0.04
68_M 57_G 0.81 0.04
208_G 84_I 0.81 0.04
239_I 118_G 0.81 0.04
31_V 94_S 0.81 0.04
7_Q 42_E 0.81 0.04
31_V 72_Q 0.81 0.04
156_G 68_P 0.81 0.04
21_F 65_M 0.81 0.04
34_T 144_E 0.81 0.04
68_M 29_A 0.81 0.04
156_G 15_V 0.81 0.04
70_I 17_A 0.81 0.04
90_N 18_G 0.81 0.04
74_M 69_G 0.81 0.04
234_W 78_L 0.81 0.04
80_I 18_G 0.80 0.04
178_E 125_E 0.80 0.04
212_L 77_S 0.80 0.04
226_L 46_G 0.80 0.04
122_W 126_V 0.80 0.04
167_V 20_A 0.80 0.04
62_P 63_G 0.80 0.04
174_H 104_R 0.80 0.04
98_P 126_V 0.80 0.04
94_A 84_I 0.80 0.04
150_D 42_E 0.80 0.04
208_G 59_R 0.80 0.04
237_E 140_E 0.80 0.04
136_L 84_I 0.79 0.04
27_I 122_L 0.79 0.04
164_L 31_R 0.79 0.03
94_A 37_F 0.79 0.03
116_K 21_L 0.79 0.03
225_I 20_A 0.79 0.03
220_R 71_V 0.79 0.03
21_F 69_G 0.79 0.03
41_F 84_I 0.79 0.03
131_S 128_A 0.79 0.03
108_L 100_P 0.79 0.03
144_A 37_F 0.79 0.03
57_I 135_T 0.79 0.03
8_L 42_E 0.79 0.03
224_L 109_V 0.78 0.03
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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